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consensusID : consensus_13093#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 643 fasta sequence
[AAGTGAGATCGAGGGAGCTAA-TTAATC-AACTAGCTAGCTTGCAC-AAATTAATGGCGT-CCAAC-AAGGCTTTCGTTGTGTTCACTCTCCTGATGCTGGTGGCTGCATCTGCCGTCGTCGACGTCGCCTCTGCCGACGGCAAGTGCGGGCCTTGCAACTGTAAAGGCTGCTGCGACTATGACGGCAAGTGCAT-GAGCTACTGCAGCGGCCATAGCGGCCCATGCTGCAAGTGGAAAGGCAAGTGCCACGGCTGCTGCTCATGAGCACGACGAGGCAAGAACCGAACGAATAATGGATTATGACAAATAAAAACGCACACATAAAACCTTACAGATATATGTATCTGCTATACATGCATGATGATGTGCTTGTATAGCTACTTAATTATCCCTATAGCTGTTTGCTTGGTCAATAAAGGATTGCATCTGCTGTGTGTATACTGT-GTACACACGGCTAGCTA----GTATGTATGTATGTATATGCTCTTATA-CAA-GGGCTATACGTACGCAACAATCCGTGCCTTTGGT-GTCGT-CAGTCGTAGT-GTCGTGTCAGGTATTGTAGT-ATT-GT-AATTTGTGCTGATCTATGAATAAAATGCGTTAT-AAT-AACGCTTCTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
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[+] EMBL AU070701 [AAGTGAGATCGAGGGAGCTAA TTAATC AACTAGCTAGCTTGCAC AAATTAATGGCGT CCAAC AAGGCTTTCGTTGTGTTCACTCTCCTGATGCTGGTGGCTGCATCTGCCGTCGTCGACGTCGCCTCTGCCGACGGCAAGTGCGGGCCTTGCAACTGTAAAGGCTGCTGCGACTATGACGGCAAGTGCAT GAGCTACTGCAGCGGCCATAGCGGCCCATGCTGCAAGTGGAAAGGCAAGTGCCACGGCTGCTGCTCATGAGCACGACGAGGCAAGAACCGAACGAATAATGGATTATGACAAATAAAAACGCACACATAAAACCTTACAGATATATGTATCTGCTATACATGna ]
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[+] EMBL AU095601 [ AGGGNGCTAATTTAATCAAACTAGCTNGCTTGCACAAAATTAATGGCGTCCCAACAAAGGCTTTCNTTGTGTTCACTCTCCTGATGCTGGTGGCTGCATCTGCCGTCGTCGACGTCGCCTCTGCCGACGGCAAGTGCGGGCCTTGCAACTGTAAAGGCTGCTGCGACTATGACGGCAAGTGCATNGAGCTACTGCAGCGGCCATNGCGGCCCATGCTGCAAGTGGAAAGGCAAGTGCCACGGCTGCTGCTCATGAGCACGACGAGGCAAGAACCGAACGAATAATGGATTATGACAAATAAAAACGCACACATAAAACCTTACAGATATATGTATCTGCTATACATGCATGATGATGTGCTTGTATAGCTACTTAATTATCCCTATAGCTGTTTGCTTGGTCAATAAAGGATTGCATCTGCTGTGTGTATACTGT GTACACACGGCTAGCTA GTATGTATGTATATGCTCTTATA CAA GGGCTATACGTACGCAACAATCCGTGCCTTTGGT GTCGT CAGTCGTAGT GTCGTGTCAGGTATTGTAGT ATT GT AATTTGTGCTGATCTATGAATAAAATGCGTTAT AAT AACGCTTCTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL AU071074 [ AGGGAGCTAA TTAATC AACTAGCTAGCTTGCAC AAATTAATGGCGT CCAAC AAGGCTTTCGTTGTGTTCACTCTCCTGATGCTGGTGGCTGCATCTGCCGTCGTCGACGTCGCCTCTGCCGACGGCAAGTGCGGGCCTTGCAACTGTAAAGGCTGCTGCGACTATGACGGCAAGTGCAT GAGCTACTGCAGCGGCCATAGCGGCCCATGCTGCAAGTGGAAAGGCAAGTGCCACGGCTGCTGCTCATGAGCACGACGAGGCAAGAACCGAACGAATAATGGATTATGACAAATAAAAACGCACACATAAAACCTTACAGATATATGTATCTGCTATACATGCATGATGATGTGCTTGTATAGCTACTTAATTATCCCTATAGCTGTTTGCTTGGTCAATAAAGGATTGCATCTGCTGTGTGTATACTGTGGTACACACGGCTAGCTA GTATGTATG GTATATGCTCTTATACCAAGGGGCTATACGTACGCAACAATCCGTGCCTTTGGTGGTCGTCCAGTCGTAGTGGTCGTGTCAGGTATTGTAGTAATTGGTAAATTTGTGCTGATCTATGAATAANATGCGTTATAAATAAACGCT ]
[-] EMBL BI305967 [ TTAATC AACTAGCTAGCTTGCAC AAATTAATGGCGT CCAAC AAGGCTTTCGTTGTGTTCGCTCTCCTGATGCTGGTGGCTGCATCTGCCGTCGTCGACGTCGCCTCTGCCGACGGCAAGTGCGGGCCTTGCAACTGTAAAGGCTGCTGCGACTATGACGGCAAGTGCAT GAGCTACTGCAGCGGCCATAGCGGCCCATGCTGCAAGTGGAAAGGCAAGTGCCACGGCTGCTGCTCATGAGCACGACGAGGCAAGAACCGAACGAATAATGGATTATGACAAATAAAAACGCACACATAAAACCTTACAGATATATGTATCTGCTATACATGCATGATGATGTGCTTGTATAGCTACTTAATTATCCCTATAGCTGTTTGCTTGGTCAATAAAGGATTGCATCTGCTGTGTGTATACTGT GTACACACGGCTAGCTAGTATGTATGTATGTATGTATATGCTCTTATA CAA GAGCTATACGTACGCAAC ATCCGTGCCTTTGGT GTCGT CAGTCGTAGT GTCGTGTCAGGTATTGTAGT ATT GT AATTTGTGCTGATCTATGAATAAAATGCGTTAT AAT AA ]
[+] EMBL AU071189 [ TGTGTTCACTCTCCTGATGCTGGTGGCTGCATCTGCCGTCGTCGACGTCGCCTCTGCCGACGGCAAGTGCGGGCCTTGCAACTGTAAAGGCTGCTGCGACTATGACGGCAAGTGCAT GAGCTACTGCAGCGGCCATAGCGGCCCATGCTGCAAGTGGAAAGGCAAGTGCCACGGCTGCTGCTCATGAGCACGACGAGGCAAGAACCGAACGAATAATGGATTATGACAAATAAAAACGCACACATAAAACCTTACAGATATATGTATCTGCTATACATGCATGATGATGTGCTTGTATAGCTACTTAATTATCCCTATAGCTGTTTGCTTGGTCAATAAAGGATTGCATCTGCTGTGTGTATACTGT ]
[+] EMBL AU173842 [ ACGGCAAGTGCAT GAGCTACTGCAGCGGCCATAGCGGCCCATGCTGCAAGTGGAAAGGCAAGTGCCACGGCTGCTGCTCATGAGCACGACGAGGCAAGAACCGAACGAATAATGGATTATGACAAATAAAAACGCACACATAAAACCTTACAGATATATGTATCTGCTATACATGCATGATGATGTGCTTGTATAGCTACTTAATTATCCCTATAGCTGTTTGCTTGGTCAATAAAGGATTGCATCTGCTGTGTGTATACTGT GTACACACGGCTAGCTA GTATGTATGTATGTATATGCTCTTATA CAA GGGCTATACGTACGCAACAATCCGTGCCTTTGGT GTCGT CAGTCGTAGT GTCGTGTCAGGTATTGTAGT ATT GT AATTTGTGCTGATCTATGAATAAAATGCGTTAT AAT AACGCTTCTATAAAAAAAA ]
[-] EMBL BI306318 [ GCAAGAACCGAACGAATAATGGATTATGACAAATAAAAACGCACACATAAAACCTTACAGATATATGTATCTGCTATACATGCATGATGATGTGCTTGTATAGCTACTTAATTATCCCTATAGCTGTTTGCTTGGTCAATAAAGGATTGCATCTGCTGTGTGTATACTGT GTACACACGGCTAGCTAGTATGTATGTATGTATGTATATGCTCTTATA CAA GAGCTATACGTACGCAAC ATCCGTGCCTTTGGT GTCGT CAGTCGTAGT GTCGTGTCAGGTATTGTAGT ATT GT AATTTGTGCTGATCTATGAATAAAATGCGTTAT AAT AA ]
consensusID : consensus_13093#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 575 fasta sequence
[AGGGAGCTGATTAATCAACTAGCTAGCTTGCAAAAATGGCGTCCAACAAGGCTTTCGTTGTGTTCACTCTCCTGATGCTGGTGGCTGCATCTGCCATCGTCGACGTCGCCTCTGCCGATCACGGCGATCATGACGGCAAGAAGTGCGGGCCTTGCAAGTGTAAAGGCTGCTGCCACTATGACAAGTGCTACGAGTACTGCAGCGGCGACAGGGTCCATGCTGTAAATGGGGCAAGTGCCATTCGTGCTGCTCATGAAGACGATGAATGGATCGATGGCAAATTAAACGCACGTAAACCTTATACAAATATATATCTGCTATATATACATGAATGACGATGTGCTTGTCCAGCTACTTCTCCCTATAGTTGTTTGCTTTGGTCAATAAAGGATTGCATCGATCTNTGCTGTGTGTACATGTGTACACACGGCTAGTGCTACTATGTATATGCTCTTATACAAGGGCTATACGTACGCAACAATCCGTGCCTTTGGTGTCGTCAGTCGTAGGGTCGTGTCAGGTATTGTAGTATTGTAATTTGTGCTGATCTNTAATAAAATGCGTTATAATAAAAA]
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[+] EMBL AU101647 [ ATACATGAATGACGATGTGCTTGTCCAGCTACTTCTCCCTATAGTTGTTTNCTTTGGTCAATAAAGGATTGCATCGATCTNTGCTGTGTGTACATGTGTACACACGGCTAGTGCTACTATGTATATGCTCTTATACAAGGGCTATACGTACGCAACAATCCGTGCCTTTGGTGTCGTCAGTCGTAGGGTCGTGTCAGGTATTGTAGTATTGTAATTTGTGCTGATCTNTAATAAAATGCGTTATAATAAAAA]
consensusID : consensus_13093#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 556 fasta sequence
[ATTAATGGGGTCCAACAAGGCTTTCGTTGTGTTCGCTTTCCTGAGGCTGGTGGCGGCATCTCCCGTTGTNAACGTCGCCTTTCCCGACGGCAAGTGGGGGCCTTGCAACTGTAAAGGCTGCTGCGACTATGACGGCAAGTGCATGAGTTATTGCAGCGGCCATAACGGCCCATGTTGCAAGTGGAAAGGCAAGTGCCCCGGTTGTTGTTCATGAGCCCGACGAGGCAAGACCCGAACGAATAATGGATTATGCCAAATAAAAACGCCCCCATAAACCCTTACAAATATATGTATTTGCTAAACATGCATGATAATGTGCTTGTAAAGCTACTTAATTATCCCTAAAGCTGTTTGCTTGGTCAATAAAGGATTGCATTTGCTGTGTGTAAACTGGGTACCCCCGGCTAGTTAGTATGTATGTATGTATGTATATGTTTTTAAACAAAAGCTATAGGTACGCAACATCCGTGCCTTTGGTGTTGTCAGTTGTAGTTTTGTGTCAGGTATTGTAGTATTGTAATTTGTGCTGATCTATGAATAAAATGGGTTATAATAA]
[-] EMBL BI306265 [ATTAATGGGGTCCAACAAGGCTTTCGTTGTGTTCGCTTTCCTGAGGCTGGTGGCGGCATCTCCCGTTGTNAACGTCGCCTTTCCCGACGGCAAGTGGGGGCCTTGCAACTGTAAAGGCTGCTGCGACTATGACGGCAAGTGCATGAGTTATTGCAGCGGCCATAACGGCCCATGTTGCAAGTGGAAAGGCAAGTGCCCCGGTTGTTGTTCATGAGCCCGACGAGGCAAGACCCGAACGAATAATGGATTATGCCAAATAAAAACGCCCCCATAAACCCTTACAAATATATGTATTTGCTAAACATGCATGATAATGTGCTTGTAAAGCTACTTAATTATCCCTAAAGCTGTTTGCTTGGTCAATAAAGGATTGCATTTGCTGTGTGTAAACTGGGTACCCCCGGCTAGTTAGTATGTATGTATGTATGTATATGTTTTTAAACAAAAGCTATAGGTACGCAACATCCGTGCCTTTGGTGTTGTCAGTTGTAGTTTTGTGTCAGGTATTGTAGTATTGTAATTTGTGCTGATCTATGAATAAAATGGGTTATAATAA]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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consensus_13093#2 ----------------------------------------------ATTAATGGGGTCCA 14
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* ***** *****
consensus_13093#0 ACAAGGCTTTCGTTGTGTTCACTCTCCTGATGCTGGTGGCTGCATCTGCCGTCGTCGACG 120
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consensus_13093#1 ACAAGGCTTTCGTTGTGTTCACTCTCCTGATGCTGGTGGCTGCATCTGCCATCGTCGACG 105
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consensus_13093#0 TCGCCTCTGCCGA---------------CGGCAAG---TGCGGGCCTTGCAACTGTAAAG 162
consensus_13093#2 TCGCCTTTCCCGA---------------CGGCAAG---TGGGGGCCTTGCAACTGTAAAG 116
consensus_13093#1 TCGCCTCTGCCGATCACGGCGATCATGACGGCAAGAAGTGCGGGCCTTGCAAGTGTAAAG 165
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consensus_13093#0 GCTGCTGCGACTATGACGGCAAGTGCATGAGCTACTGCAGCGGCCATAGCGGCCCATGCT 222
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consensus_13093#1 GCTGCTGCCACTATGA---CAAGTGCTACGAGTACTGCAGCGGCGACAG-GGTCCATGCT 221
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consensus_13093#1 GTAAATGG---GGCAAGTGCCATTCGTGCTGCTCATGAA---GACGA---------TGAA 266
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consensus_13093#0 CGAATAATGGATTATGACAAATAAAAACGCACACATAAAACCTTACAGATATATGTATCT 342
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consensus_13093#1 TGGATCG------ATGGCAAATTAAA---CGCACGTAAA-CCTTATACAAATATATATCT 316
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consensus_13093#2 GCTAAACATGCATGA----TAATGTGCTTGTAAAGCTACTTAATTATCCCTAAAGCTGTT 352
consensus_13093#1 GCTATATATACATGAATGACGATGTGCTTGTCCAGCTACTT----CTCCCTATAGTTGTT 372
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consensus_13093#0 TGCTT-GGTCAATAAAGGATTGCAT------CTGCTGTGTGTATACTGTGTACACACGGC 451
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consensus_13093#0 AAAAAAAAAAAAAAAA 643
consensus_13093#2 ----------------
consensus_13093#1 ----------------
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| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||