These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_131#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 883 fasta sequence [GACAAGGGGCTAGATTAGATATGTGAAAATGGTAGGTGGTGAAACATATCATTCCATCAAAGATAAAATGATAAATCAAGTCCGTTTTTGAATGTGTTTCAATGGTCCTATTGGGTTTACATCTATATGCAATTTCAGTCCTGTCTAAGACTCTGAAGCAGATAACCAGAAATAAGCTAATTGGGCGATGACAATGAAAAATATGGAGTTTCAATGACCGGATAAACCA-CAGTTGTTATTTATTATGGCTAATATTCACATTATCTCGTAGTATTATTAATATTCAGAATCACTGAGTTAACAAATCCTTTTAATGGATGGAAATCATCGCCA-TATCTCATATCACCTATAGTATTATTTGCATCTATGCCTCGGTGCTACTAGAACGTACCTGGAACTAGCTCAATAGCCACTTATAAAAAATACCACCATTAAACTAGGAGATTCAAGCATATATGCTGGTTCATTGTCATATTTTGATTGGCATTCTAAAAAAGTCAGCGAAAATGCGCTAATTATCACTGTCCATGTCACATATAAATTGCGCAACTTGCATATTAGGGAAGGGGATTGCTGGCCCAGTTCTTGTGGAGGGGAATACGTTTGGATATTTGGAGGGCCCTGAACTGCACTTATGCATGATCCTCACCAGCCACCATGATCAGCCTATTCAGATTGGGATTCTCANGCCTGAGCTGACCTCAATGAAGCCCTATTTTGGCACATTCCTATTAGTTGGTTGGGGTTGACCTCTTACAGGGTGTCAGCTCACTCTCCNTATGGGCATTGGCATGCATTTTCCTCTGGTGAATTAAGATGTNCGGACATCATTGGCCCATGGTTTAAATCCTANAACCATTTGGACCTGTGTGTTGAAAAAAAA] [+] EMBL CA767014 [GACAAGGGGCTAGATTAGATATGTGAAAATGGTAGGTGGTGAAACATATCATTCCATCAAAGATAAAATGATAAATCAAGTCCGTTTTTGAATGTGTTTCAATGGTCCTATTGGGTTTACATCTATATGCAATTTCAGTCCTGTCTAAGACTCTGAAGCAGATAACCAGAAATAAGCTAATTGGGCGATGACAATGAAAAATATGGAGTTTCAATGACCGGATAAACCA CAGTTGTTATTTATTATGGCTAATATTCACATTATCTCGTAGTATTATTAATATTCAGAATCACTGAGTTAACAAATCCTTTTAATGGATGGAAATCATCGCCA TATCTCATATCACCTATAGTATTATTTGCATCTATGCCTCGGTGCTACTAGAACGTACCTGGAACTAGCTCAATAGCCACTTATAAAAAATACCACCATTAAACTAGGAGATTCAAGCATATATGCTGGTTCATTGTCATATTTTGATTGGCATTCTAAAAAAGTCAGCGAAAATGCGCTAATTATCACTGTCCATGTCACATATAAATTGCGCAACTTGCATATTAGGGAAGGGGATTGCTGGCCCAGTTCTTGTGGAGGGGAATACGTTTGGATATTTGGAGGGCCCTGAACTGCACTTATGCATGATCCTCACCAGCCACCATGATCAGCCTATTCAGATTGGGATTCTCANGCCTGAGCTGACCTCAATGAAGCCCTATTTTGGCACATTCCTATTAGTTGGTTGGGGTTGACCTCTTACAGGGTGTCAGCTCACTCTCCNTATGGGCATTGGCATGCATTTTCCTCTGGTGAATTAAGATGTNCGGACATCATTGGCCCATGGTTTAAATCCTANAACCATTTGGAC ] [-] EMBL CA761018 [ GCGATGACAATGAAAAATATGGAGTTTCAATGACCGGATAAACCACCAGTTGTTATTTATTATGGCTAATATTCACATTATCTCGTAGTATTATTAATATTCAGAATCACTGAGTTAACAAATCCTTNTAATGGATGGAAATCATCGCCACTATCTCATATCACCTATAGTATTATTTGCATCTATGCCTCGGTGCTACTAGAACGTACCTGGAACTAGCTCAATAGCCACTTATAAAAAATACCACCATTAAACTAGGAGATTCAAGCATATATGCTGGTTCATTGTCATATTTTGATTGGCATTCTAAAAAAGTCAGCGAAAATGCGCTAATTATCACTGTCCATGTCACATATAAATTGCGCAACTTGCATATTAGGGAAGGGGATTGCTGGCCCAGTTCTTGTGGAGGGGAATACGTTTGGATATTTGGAGGGCCCTGAACTGCACTTATGCATGATCCTCACCAGCCACCATGATCAGCCTATTCAGATTGGGATTCTCAGGCCTGAGCTGACCTCAATGAAGCCCTATTTTGGCACATTCCTATTAGTT GTTTGGGTTGACCTCTTACA GGTGTCAGCTCACTCTCCTTATTGTCATTGTCATGCATTTTCCTTTGATGAATTAAGATGTACGGACATCATT GCACAT GTATAAATCCTAGAACCATTTGAACCTGTGTGTTGAAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||