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Oryza sativa
cluster # 131 cluster # 131       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_131#0 length = 883 sequences # 2  

consensusID : consensus_131#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 883
fasta sequence
                              [GACAAGGGGCTAGATTAGATATGTGAAAATGGTAGGTGGTGAAACATATCATTCCATCAAAGATAAAATGATAAATCAAGTCCGTTTTTGAATGTGTTTCAATGGTCCTATTGGGTTTACATCTATATGCAATTTCAGTCCTGTCTAAGACTCTGAAGCAGATAACCAGAAATAAGCTAATTGGGCGATGACAATGAAAAATATGGAGTTTCAATGACCGGATAAACCA-CAGTTGTTATTTATTATGGCTAATATTCACATTATCTCGTAGTATTATTAATATTCAGAATCACTGAGTTAACAAATCCTTTTAATGGATGGAAATCATCGCCA-TATCTCATATCACCTATAGTATTATTTGCATCTATGCCTCGGTGCTACTAGAACGTACCTGGAACTAGCTCAATAGCCACTTATAAAAAATACCACCATTAAACTAGGAGATTCAAGCATATATGCTGGTTCATTGTCATATTTTGATTGGCATTCTAAAAAAGTCAGCGAAAATGCGCTAATTATCACTGTCCATGTCACATATAAATTGCGCAACTTGCATATTAGGGAAGGGGATTGCTGGCCCAGTTCTTGTGGAGGGGAATACGTTTGGATATTTGGAGGGCCCTGAACTGCACTTATGCATGATCCTCACCAGCCACCATGATCAGCCTATTCAGATTGGGATTCTCANGCCTGAGCTGACCTCAATGAAGCCCTATTTTGGCACATTCCTATTAGTTGGTTGGGGTTGACCTCTTACAGGGTGTCAGCTCACTCTCCNTATGGGCATTGGCATGCATTTTCCTCTGGTGAATTAAGATGTNCGGACATCATTGGCCCATGGTTTAAATCCTANAACCATTTGGACCTGTGTGTTGAAAAAAAA]

[+] EMBL CA767014             [GACAAGGGGCTAGATTAGATATGTGAAAATGGTAGGTGGTGAAACATATCATTCCATCAAAGATAAAATGATAAATCAAGTCCGTTTTTGAATGTGTTTCAATGGTCCTATTGGGTTTACATCTATATGCAATTTCAGTCCTGTCTAAGACTCTGAAGCAGATAACCAGAAATAAGCTAATTGGGCGATGACAATGAAAAATATGGAGTTTCAATGACCGGATAAACCA CAGTTGTTATTTATTATGGCTAATATTCACATTATCTCGTAGTATTATTAATATTCAGAATCACTGAGTTAACAAATCCTTTTAATGGATGGAAATCATCGCCA TATCTCATATCACCTATAGTATTATTTGCATCTATGCCTCGGTGCTACTAGAACGTACCTGGAACTAGCTCAATAGCCACTTATAAAAAATACCACCATTAAACTAGGAGATTCAAGCATATATGCTGGTTCATTGTCATATTTTGATTGGCATTCTAAAAAAGTCAGCGAAAATGCGCTAATTATCACTGTCCATGTCACATATAAATTGCGCAACTTGCATATTAGGGAAGGGGATTGCTGGCCCAGTTCTTGTGGAGGGGAATACGTTTGGATATTTGGAGGGCCCTGAACTGCACTTATGCATGATCCTCACCAGCCACCATGATCAGCCTATTCAGATTGGGATTCTCANGCCTGAGCTGACCTCAATGAAGCCCTATTTTGGCACATTCCTATTAGTTGGTTGGGGTTGACCTCTTACAGGGTGTCAGCTCACTCTCCNTATGGGCATTGGCATGCATTTTCCTCTGGTGAATTAAGATGTNCGGACATCATTGGCCCATGGTTTAAATCCTANAACCATTTGGAC                  ]
[-] EMBL CA761018             [                                                                                                                                                                                        GCGATGACAATGAAAAATATGGAGTTTCAATGACCGGATAAACCACCAGTTGTTATTTATTATGGCTAATATTCACATTATCTCGTAGTATTATTAATATTCAGAATCACTGAGTTAACAAATCCTTNTAATGGATGGAAATCATCGCCACTATCTCATATCACCTATAGTATTATTTGCATCTATGCCTCGGTGCTACTAGAACGTACCTGGAACTAGCTCAATAGCCACTTATAAAAAATACCACCATTAAACTAGGAGATTCAAGCATATATGCTGGTTCATTGTCATATTTTGATTGGCATTCTAAAAAAGTCAGCGAAAATGCGCTAATTATCACTGTCCATGTCACATATAAATTGCGCAACTTGCATATTAGGGAAGGGGATTGCTGGCCCAGTTCTTGTGGAGGGGAATACGTTTGGATATTTGGAGGGCCCTGAACTGCACTTATGCATGATCCTCACCAGCCACCATGATCAGCCTATTCAGATTGGGATTCTCAGGCCTGAGCTGACCTCAATGAAGCCCTATTTTGGCACATTCCTATTAGTT GTTTGGGTTGACCTCTTACA GGTGTCAGCTCACTCTCCTTATTGTCATTGTCATGCATTTTCCTTTGATGAATTAAGATGTACGGACATCATT GCACAT GTATAAATCCTAGAACCATTTGAACCTGTGTGTTGAAAAAAAA]


>consensus_131#0 GACAAGGGGCTAGATTAGATATGTGAAAATGGTAGGTGGTGAAACATATCATTCCATCAA AGATAAAATGATAAATCAAGTCCGTTTTTGAATGTGTTTCAATGGTCCTATTGGGTTTAC ATCTATATGCAATTTCAGTCCTGTCTAAGACTCTGAAGCAGATAACCAGAAATAAGCTAA TTGGGCGATGACAATGAAAAATATGGAGTTTCAATGACCGGATAAACCACAGTTGTTATT TATTATGGCTAATATTCACATTATCTCGTAGTATTATTAATATTCAGAATCACTGAGTTA ACAAATCCTTTTAATGGATGGAAATCATCGCCATATCTCATATCACCTATAGTATTATTT GCATCTATGCCTCGGTGCTACTAGAACGTACCTGGAACTAGCTCAATAGCCACTTATAAA AAATACCACCATTAAACTAGGAGATTCAAGCATATATGCTGGTTCATTGTCATATTTTGA TTGGCATTCTAAAAAAGTCAGCGAAAATGCGCTAATTATCACTGTCCATGTCACATATAA ATTGCGCAACTTGCATATTAGGGAAGGGGATTGCTGGCCCAGTTCTTGTGGAGGGGAATA CGTTTGGATATTTGGAGGGCCCTGAACTGCACTTATGCATGATCCTCACCAGCCACCATG ATCAGCCTATTCAGATTGGGATTCTCANGCCTGAGCTGACCTCAATGAAGCCCTATTTTG GCACATTCCTATTAGTTGGTTGGGGTTGACCTCTTACAGGGTGTCAGCTCACTCTCCNTA TGGGCATTGGCATGCATTTTCCTCTGGTGAATTAAGATGTNCGGACATCATTGGCCCATG GTTTAAATCCTANAACCATTTGGACCTGTGTGTTGAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)