These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_13264#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 12 consensus length = 1612 fasta sequence [GACGAAGAAGAAGAACTGTTGGCACGTGTGCGCTACCGAACTCCCGAAGCCGATAAGCCGCCCGCCTCCTCTCCTTCT--CGTCGCCGTCGCCGGCGCCGGCTCAGCGCCTCCGCCCTCTCCCCCCACGCCGCCGCCTCCCCCTTCACCCTCTACCCCCACCGCGGGCGCCTCCCCTCCCACTGCCGCCGCCTCCTCCTGCTCCTCCTCCTCCACGTCACCGACGCCGGAGCTTCTTCGATCCATGGCAACGGCCATTTCCGTCGGCGTCGCAGTGCCAGCCGCCAGCAGGAGGCGCGAGGATGGGGCAGGGCCGCCGCTGCTTCTGCGGCGGCGG-TGCCTCGTGGAAGGACAAGTGAGATGTAGGTTACCATGGTTGAGACCAATACGGCACAATGTTAGAGTGCAGACATCCAATGTAAATGTTGGAGCTGGAAGCTATGAAGGTGGCGAAGCAGGTAGCCATGGGGAACATTTGGATAGTTCTGCTACCAGAGATTCAAACAAACCAACAAAACCACCTTCAGGATCTCGTTACCCTCAATCCATTGCTGCAGTGCTACTTCTATGTGCTCTGGCATCCGCTTTTATTGTTTTCTTTAAAGGACAACCATCTGCAGTTGTAGCGATGCTTGCAAAGTCAGGTTTCACGGCAGCATTTACACTGATTTTTGTATCTGAGATTGGGGATAAGACATTTTTCATTGCTGCACTTCTTGCGATGCAATATCAGAGAGCATTGGTTTTACTTGGGTCAATGGCTGCTCTTTCCCTAATGACTATTGTGAGTGTTATAATTGGAAGGATTTTTCAGTCTGTACCAGCACAATTTCAAACAACACTACCTATAGGAGAGTATGCTGCGATTGCTCTCCTGGCATTTTTTGGTTTCAAGTCAATAAAAGATGCATGGCAACTTCCAGATAATGCAAATGGAAACCTTCAGGGAAACTCTGAATCTGGGGAGCTGGCTGAGGCTGAGGAGCTTGTCAAGGAGAAGGTGGCT-AAAAAGTTGACTAGTCCTCTTGAGGTCCTTTGGAAGTCTTTCAGCCTTGTTTTCTTTGCAGAATGGGGAGATCGCTCTATGCTGGCTACAATTGCGTTAGGTGCTGCTCAGTCTCCTTTTGGTGTCGCAAGCGGAGCCATAGCTGGACACTTGGTTGCAACTTTCCTTGCAATTGTTGGGGGAGCATTCCTTGCCAACTACCTATCTGAGAAGCTGGTTGGCCTGATAGGAGGAGTACTTTTTTTGCTGTTTGCTGTTGCCACATTTTTTGGTGTATTCTAATATCTGAAGAATTTGTAGCTTGTAAAGGATTCTGTAGGTCAATTTAATCCTATTTTAAGGTTTTAAGGGCAAAACTGGGCCTTGTCCTTGTT-GTTTGTAACTAGTAGGCATTATCCTCCTTTTCAGGAGCGATTCCTTTACTATTGGAAAACAAATTGACGTGAACACAATCAACACACACGCAAGCTGAGCTGCAGCACGCAAACTATCAGCTATATGCCCTAGAGAGACGAATTGTATCATATACTATAGAGTATATACTATGTTTATAATGAAATGAATAAAGTATTATTCTGTTTTGTGAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL AK071982 [GACGAAGAAGAAGAACTGTTGGCACGTGTGCGCTACCGAACTCCCGAAGCCGATAAGCCGCCCGCCTCCTCTCCTTCT CGTCGCCGTCGCCGGCGCCGGCTCAGCGCCTCCGCCCTCTCCCCCCACGCCGCCGCCTCCCCCTTCACCCTCTACCCCCACCGCGGGCGCCTCCCCTCCCACTGCCGCCGCCTCCTCCTGCTCCTCCTCCTCCACGTCACCGACGCCGGAGCTTCTTCGATCCATGGCAACGGCCATTTCCGTCGGCGTCGCAGTGCCAGCCGCCAGCAGGAGGCGCGAGGATGGGGCAGGGCCGCCGCTGCTTCTGCGGCGGCGG TGCCTCGTGGAAGGACAAGTGAGATGTAGGTTACCATGGTTGAGACCAATACGGCACAATGTTAGAGTGCAGACATCCAATGTAAATGTTGGAGCTGGAAGCTATGAAGGTGGCGAAGCAGGTAGCCATGGGGAACATTTGGATAGTTCTGCTACCAGAGATTCAAACAAACCAACAAAACCACCTTCAGGATCTCGTTACCCTCAATCCATTGCTGCAGTGCTACTTCTATGTGCTCTGGCATCCGCTTTTATTGTTTTCTTTAAAGGACAACCATCTGCAGTTGTAGCGATGCTTGCAAAGTCAGGTTTCACGGCAGCATTTACACTGATTTTTGTATCTGAGATTGGGGATAAGACATTTTTCATTGCTGCACTTCTTGCGATGCAATATCAGAGAGCATTGGTTTTACTTGGGTCAATGGCTGCTCTTTCCCTAATGACTATTGTGAGTGTTATAATTGGAAGGATTTTTCAGTCTGTACCAGCACAATTTCAAACAACACTACCTATAGGAGAGTATGCTGCGATTGCTCTCCTGGCATTTTTTGGTTTCAAGTCAATAAAAGATGCATGGCAACTTCCAGATAATGCAAATGGAAACCTTCAGGGAAACTCTGAATCTGGGGAGCTGGCTGAGGCTGAGGAGCTTGTCAAGGAGAAGGTGGCT AAAAAGTTGACTAGTCCTCTTGAGGTCCTTTGGAAGTCTTTCAGCCTTGTTTTCTTTGCAGAATGGGGAGATCGCTCTATGCTGGCTACAATTGCGTTAGGTGCTGCTCAGTCTCCTTTTGGTGTCGCAAGCGGAGCCATAGCTGGACACTTGGTTGCAACTTTCCTTGCAATTGTTGGGGGAGCATTCCTTGCCAACTACCTATCTGAGAAGCTGGTTGGCCTGATAGGAGGAGTACTTTTTTTGCTGTTTGCTGTTGCCACATTTTTTGGTGTATTCTAATATCTGAAGAATTTGTAGCTTGTAAAGGATTCTGTAGGTCAATTTAATCCTATTTTAAGGTTTTAAGGGCAAAACTGGGCCTTGTCCTTGTT GTTTGTAACTAGTAGGCATTATCCTCCTTTTCAGGAGCGATTCCTTTACTATTGGAAAACAAATTGACGTGAACACAATCAACACACACGCAAGCTGAGCTGCAGCACGCAAACTATCAGCTATATGCCCTAGAGAGACGAATTGTATCATATACTATAGAGTATATACTATGTTTATAATGAAATGAATAAAGTATTATT ] [+] EMBL AK099080 [ GCTACCGAACTCCCGAAGCCGATAAGCCGCCCGCCTCCTCTCCTTCT CGTCGCCGTCGCCGGCGCCGGCTCAGCGCCTCCGCCCTCTCCCCCCACGCCGCCGCCTCCCCCTTCACCCTCTACCCCCACCGCGGGCGCCTCCCCTCCCACTGCCGCCGCCTCCTCCTGCTCCTCCTCCTCCACGTCACCGACGCCGGAGCTTCTTCGATCCATGGCAACGGCCATTTCCGTCGGCGTCGCAGTGCCAGCCGCCAGCAGGAGGCGCGAGGATGGGGCAGGGCCGCCGCTGCTTCTGCGGCGGCGG TGCCTCGTGGAAGGACAAGTGAGATGTAGGTTACCATGGTTGAGACCAATACGGCACAATGTTAGAGTGCAGACATCCAATGTAAATGTTGGAGCTGGAAGCTATGAAGGTGGCGAAGCAGGTAGCCATGGGGAACATTTGGATAGTTCTGCTACCAGAGATTCAAACAAACCAACAAAACCACCTTCAGGATCTCGTTACCCTCAATCCATTGCTGCAGTGCTACTTCTATGTGCTCTGGCATCCGCTTTTATTGTTTTCTTTAAAGGACAACCATCTGCAGTTGTAGCGATGCTTGCAAAGTCAGGTTTCACGGCAGCATTTACACTGATTTTTGTATCTGAGATTGGGGATAAGACATTTTTCATTGCTGCACTTCTTGCGATGCAATATCAGAGAGCATTGGTTTTACTTGGGTCAATGGCTGCTCTTTCCCTAATGACTATTGTGAGTGTTATAATTGGAAGGATTTTTCAGTCTGTACCAGCACAATTTCAAACAACACTACCTATAGGAGAGTATGCTGCGATTGCTCTCCTGGCATTTTTTGGTTTCAAGTCAATAAAAGATGCATGGCAACTTCCAGATAATGCAAATGGAAACCTTCAGGGAAACTCTGAATCTGGGGAGCTGGCTGAGGCTGAGGAGCTTGTCAAGGAGAAGGTGGCT AAAAAGTTGACTAGTCCTCTTGAGGTCCTTTGGAAGTCTTTCAGCCTTGTTTTCTTTGCAGAATGGGGAGATCGCTCTATGCTGGCTACAATTGCGTTAGGTGCTGCTCAGTCTCCTTTTGGTGTCGCAAGCGGAGCCATAGCTGGACACTTGGTTGCAACTTTCCTTGCAATTGTTGGGGGAGCATTCCTTGCCAACTACCTATCTGAGAAGCTGGTTGGCCTGATAGGAGGAGTACTTTTTTTGCTGTTTGCTGTTGCCACATTTTTTGGTGTATTCTAATATCTGAAGAATTTGTAGCTTGTAAAGGATTCTGTAGGTCAATTTAATCCTATTTTAAGGTTTTAAGGGCAAAACTGGGCCTTGTCCTTGTT GTTTGTAACTAGTAGGCATTATCCTCCTTTTCAGGAGCGATTCCTTTACTATTGGAAAACAAATTGACGTGAACACAATCAACACACACGCAAGCTGAGCTGCAGCACGCAAACTATCAGCTATATGCCCTAGAGAGACGAATTGTATCATATACTATAGAGTATATACTATGTTTATAATGAAATGAATAAAGTATTAT ] [+] EMBL CB643484 [ GCCCGCCTCCTCTCCTTCT CGTCGCCGTCGCCGGCGCCGGCTCAGCGCCTCCGCCCTCTCCCCCCACGCCGCCGCCTCCCCCTTCACCCTCTACCCCCACCGCGGGCGCCTCCCCTCCCACTGCCGCCGCCTCCTCCTGCTCCTCCTCCTCCACGTCACCGACGCCGGAGCTTCTTCGATCCATGGCAACGGCCATTTCCGTCGGCGTCGCAGTGCCAGCCGCCAGCAGGAGGCGCGAGGATGGGGCAGGGCCGCCGCTGCTTCTGCGGCGGCGG TGCCTCGTGGAAGGACAAGTGAGATGTAGGTTACCATGGTTGAGACCAATACGGCACAATGTTAGAGTGCAGACATCCAATGTAAATGTTGGAGCTGGAAGCTATGAAGGTGGCGAAGCAGGTAGCCATGGGGAACATTTGGATAGTTCTGCTACCAGAGATTCAAACAAACCAACAAAACCACCTTCAGGATCTCGTTACCCTCAATCCATTGCTGCAGTGCTACTTCTATGTGCTCTGGCATCCGCTTTTATTGTTTTCTTTAAAGGACAACCATCTGCAGTTGTAGCGATGCTTGCAAAGTCAGGTTTCACGGCAGCATTTACACTGATTTTTGTATCTGAGATTGGGGATAAGACATTTTTCATTGCTGCACTTCTTGCGATGCAATATCAGAGAGCATTGGTTTTACTTGGGTCAATGGCTGCTCTTTCCCTAATGACTATTGTGAGTGTTATAATTGGAAGGATTTTTCAGTCTGTACCAGCACAATTTCAAACAACACTACCTATAGGAGAGTATGCTGCGATTGC ] [+] EMBL CB652093 [ cCTCCTTTTAAAGTCGCCGTCGCCGGCGCCGGCTCAGCGCCTCCGCCCTCTCCCCCCACGCCGCCGCCTCCCCCTTCACCCTCTACCCCCACCGCGGGCGCCTCCCCTCCCACTGCCGCCGCCTCCTCCTGCTCCTCCTCCTCCACGTCACCGACGCCGGAGCTTCTTCGATCCATGGCAACGGCCATTTCCGTCGGCGTCGCAGTGCCAGCCGCCAGCAGGAGGCGCGAGGATGGGGCAGGGCCGCCGCTGCTTCTGCGGCGGCGG TGCCTCGTGGAAGGACAAGTGAGATGTAGGTTACCATGGTTGAGACCAATACGGCACAATGTTAGAGTGCAGACATCCAATGTAAATGTTGGAGCTGGAAGCTATGAAGGTAACGAAGCAGGTAGCCATGGGGAACATTTGGATAGTTCTGCTACCAGAGATTCAAACAAACCAACAAAACCACCTTCAGGATCTCGTTACCCTCAATCCATTGCTGCAGTGCTACTTCTATGTGCTCTGGCATCCGCTTTTATTGTTTTCTTTAAAGGACAACCATCTGCAGTTGTAGCGATGCTTGCAAAGTCAGGTTTCACGGCAGCATTTACACTGATTTTTGTATCTGAGATTGGGGATAAGACATTTTTCATTGCTGCACTTCTTGCGATGCAATATCAGAGAGCATTGGTTTTACTTGGGTCAATGGCTGCTCTTTCCCTAATGACTATTGTGAGTGTTATAATTGGAAGGATTTTTCAG ] [+] EMBL AU083435 [ GTCGCCGTCGCCGGCGCCGGCTCAGCGCCTCCGCCCTCTCCCCCCACGCCGCCGCCTCCCCCTTCACCCTCTACCCCCACCGCGGGCGCCTCCCCTCCCACTGCCGCCGCCTCCTCCTGCTCCTCCTCCTCCACGTCACCGACGCCGGAGCTTCTTCGATCCATGGCAACGGCCATTTCCGTCGGCGTCGCAGTGCCAGCCGCCAGCAGGAGGCGCGAGGATGGGGCAGGGCCGCCGCTGCTTCTGCGGCGGCGGTTGCCTCGTGGAAGGACANGTGAGATGTAGGTTANCATGGTTGAGACCAATACGGCACANTGTTAGAGTGCAGACATCCAATGTAAATGTTGGAGCTTGAAAGTATGAAGGTTGCGANGAGGGTAGCCATtg ] [+] EMBL CA757359 [ TTCAGTCTGTACCAGCACAATTTCAAACAACACTACCTATAGGAGAGTATGCTGCGATTGCTCTCCTGGCATTTTTTGGTTTCAAGTCAATAAAAGATGCATGGCAACTTCCAGATAATGCAAATGGAAACCTTCAGGGAAACTCTGAATCTGGGGAGCTGGCTGAGGCTGAGGAGCTTGTCAAGGAGAAGGTGGCT AAAAAGTTGACTAGTCCTCTTGAGGTCCTTTGGAAGTCTTTCAGCCTTGTTTTCTTTGCAGAATGGGGAGATCGCTCTATGCTGGCTACAATTGCGTTAGGTGCTGCTCAGTCTCCTTTTGGTGTCGCAAGCGGAGCCATAGCTGGACACTTGGTTGCAACTTTCCTTGCAATTGTTGGGGGAGCATTCCTTGCCAACTACCTATCTGAGAAGCTGGTTGGCCTGATAGGAGGAGTACTTTTTTTGCTGTTTGCTGTTGCCACATTTTTTGGTGTATTCTAATATCTGAAGAATTTGTAGCTTGTANAGGATTCTGTAGGTCAATTTAATCCTATTTTAAGGTTTTAAGGGC AAACTGGGCCTTGTCCTTGTTGGTTTG AACTAGGAAGCATTATCCTCCTTTT AGGAGCGATTGC TTACTATTGGA ] [-] EMBL CB652094 [ GTCTGTACCAGCACAATTCAAAACAACACTACCTATAGGAGAGTATGCTGCGATTGCTCTCCTGGCATTTTTTGGTTTCAAGTCAATAAAAGATGCATGGCAACTTCCAGATAATGCAAATGGAAACCTTCAGGGAAACTCTGAATCTGGGGAGCTGGCTGAGGCTGAGGAGCTTGTCAAGGAGAAGGTGGCT AAAAAGTTGACTAGTCCTCTTGAGGTCCTTTGGAAGTCTTTCAGCCTTGTTTTCTTTGCAGAATGGGGAGATCGCTCTATGCTGGCTACAATTGCGTTAGGTGCTGCTCAGTCTCCTTTTGGTGTCGCAAGCGGAGCCATAGCTGGACACTTGGTTGCAACTTTCCTTGCAATTGTTGGGGGAACATTCCTTNCC ] [+] EMBL AU083436 [ TGTCAAGGAGAAGGTGGCTAAAAAAGTTGACTAGTCNTCTTGAGGTCCTTTGGAAGTCTTTCAGCCTTGTTTTCTTTGCAGAATGGGGAGATCGCTCTATGCTGGCTACAATTGCGTTAGGTGCTGCTCAGTCTCCTTTTGGTGTCGCAAGCGGAGCCATAGCTGGACACTTGGTTGCAACTTTCCTTGCAATTGTTGGGGGAGCATTCCTTGCCAACTACCTATCTGAGAAGCTGGTTGGCCTGATAGGAGGAGTACTTTTTTTGCTGTTTGCTGTTGCCACATTTTTTGGTGTATTCTAATATCTGAAGAATTTGTAGCTTGTAAAGGATTCTGTAGGTCAATTTAATCCTATTTTAAGGTTTTAAGGGCAAAACTGGGCCTTGTCCTTGTT GTTTGTAACTAGTAGGNATTATCCTCCTTTTCAGGAGCGATTCCTTTACTATTGGAAAACAAATTGACGTGAACACAATCAACACACACGCAAGCTGAGCTGCAGCACGCAAACTATCAGCTATATGCCCTAGAGAGACGAATTGTATCATATACTATAGAGTATATACTATGTTTATAATGAAATGAATAAAGTATTATTCTGTTTTGTGAAATAAAAAAA ] [+] EMBL OSC8591 [ TGGCT AAAAAGTTGACTAGTCCTCTTGAGGTCCTTTGGAAGTCTTTCAGCCTTGTTTTCTTTGCAGAATGGGGAGATCGCTCTATGCTGGCTACAATTGCGTTAGGTGCTGCTCAGTCTCCTTTTGGTGTCGCAAGCGGA CCATANCTGGACACTTGGTTGCAACTTNCCTTGCAATTGTTTGGGGAGCATTCCTTGCCAACTACCTATCTGAGAAGCTGGTTGNNCTGATAGGAGGAGTACTTTTTTn ] [+] EMBL AU162102 [ GGCT AAAAAGTTGACTAGTCCTCTTGAGGTCCTTTGGAAGTCTTTCAGCCTTGTTTTCTTTGCAGAATGGGGAGATCGCTCTATGCTGGCTACAATTGCGTTAGGTGCTGCTCAGTCTCCTTTTGGTGTCGCAAGCGGAGCCATAGCTGGACACTTGGTTGCAACTTTCCTTGCAATTGTTGGGGGAGCATTCCTTGCCAACTACCTATCTGAGAAGCTGGTTGGCCTGATAGGAGGAGTACTTTTTTTGCTGTTTGCTGTTGCCACATTTTTTGGTGTA TCTAATATCTGAAGAATTTGTAGCTTGTAAAGGATTCTGTAGGTCAATTTAATCCTATTTTAAGGTTTTAAGGGCAAAACTGGGCCTTGTCCTTGTT GTTTGTAACTAGTAGGCATTATCCTCCTTTTCAGGAGCGATTCCTTTACTATTGGAAAACAAATTGACGTGAACACAATCAACACACACGCAAGCTGAGCTGCAGCACGCAAACTATCAGCTATATGCCCTAGAGAGACGAATTTTATCATATACTATAGAGTATATACTATGTTTATAATGAAATGAATAAAGTATTATTCTGTTTTGTGAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL OSC8681 [ CTAGTCCTCTTGNGGTCCTTTGGAAGTCTTTCAGCCTTGTTTTCTTTGCAGAATGGGGAGATCGCTCTATGCTGGCTACAATTGCGTTAGGTGCTGCTCAGTCTCCTTTTGGTGTCGCAAGCGGA NCATAGCTGGACACTTGGTTGCAACTTTCCTTGCAATTGTTGGGGGAGCATTCCTTGCCAACTACCTATCTGAGAAGCTGGTTGGCCTGATAGGAGGAGTACTTTTTTTGCTGTTTGCTGTTGCCACATTTTTTGGTGTATTCTAATATCTGAAGAATTTGTAGCTTGTAAAGGATTCTGTAGGTCAATTTAATCCTATTTTAAGGTTTTAAGGGCAAAACTGGGCCTTGTCCTTGTT GTTTGTAACTAGTAGGCATTATCCT CTTTTCAGG GCG TT CTTTACTATTGG AAAC AATTGACGNG ACAC ATCAACACACA GCAA CTGAG TGCA ] [+] EMBL AU174103 [ TGTAGCTTGTAAAGGATTNTGTAGGTCAATTTAATCCTATTTTAAGGTTTTAAGGGCAAAACTGGGCCTTGTCCTTGTT GTTTGTAACTAGTAGGCATTATCCTCCTTTTCAGGAGCGATTCCTTTACTATTGGAAAACAAATTGACGTGAACACAATCAACACACACGCAAGNTGAGCTGCAGCACGCAAACTATCAGCTATATGCCCTANANAGACGAATTTTATCATATACTATAGAGTATATACTATGTTTATAATGAAATGAATAAAGTATTATTNTGTTTTGTGAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||