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consensusID : consensus_13330#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 1470 fasta sequence
[TACCTTTCCCTTCCCTTCTTTCCAGTAGTTTCCACCTTTCCCGCATCTTCCGCCGTGGGGAAGGGAGCAATCGGCAAGCCAATCCAATCCGGTTGCTTCTCCTCCAATCCAACCTCGTCGGCGGCGGCGGCGACCCGCGCCGCGCAGGCTGTTGAGTTATCACGTATTTGATTATGGATCTGCCATTGATGGCTGCTAAAGCCTATAAGTACAAAGCAGAACTACTTGTTAAGGACTACCTGCTAGCAGATTCGTATGTTCCATACGCTTCTGTGCTTGGCGGAATTCTGATGTGCAAGTTGTCATATGATTTCACACGCTTTATCAGTTCATTCTACTTCAAAGGCTATGGTTCTCTCACAAAGATGCAAAAGGTTGAATGGAATAACAGGGGCATGTCCACCGTCCATGCAATATTCATTACACTTATGTCAGCATACTTAGTCTTCTTCTCGGGTTTATTCTCTGACCAGCAGGATGGACCAGTAACATTTAGAAGTTCGAGCCTCTCCAATTTCACGCTAGGGGTCTCAGTTGGGTATTTCATTGCGGACCTTGCCATGATACTATGGTTTTACCCTTCACTCGGTGGAATGGAGTATCTTGTCCACCATGTATTGTCACTTACTGCTGTAACGTATACTATGCTTTCTGGGGAAGGACAGTTATACACATACATGAGTCTCATCTCAGAGACTACTACACCTGGAATCAACCTAAGATGGTTCCTTGATGTTGCTGGAATGAAAAGATCCAAAAGATACGTTGTTAATGGAGTTGCAATGTTTCTTACTTGGCTGGTTGCAAGGATAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAGATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCATACTGTTCGTGATGAATATGATATGGTTTTCCAAGATCTTAAGGGGCCTCAAGAAGACACTGGCCAAGAGGCATTGAGTGGGGCAAGGGGTATGCATGTACAGCCACGACAAACCACCTATCTGTAAATTCACTCAGCAGGCCAGCAGCCTATAGCTTCTCATTAGTCACGATGGCTAATCCTGGTAATATCAGCTTGGCCATTAAGATCCAGATTTATGATTGAATGCCCAGCTTTTTATGCATGGATGATATATTAATTTGTATATATG-TTCCGCTATGGCTGTATGTTCTTAATACCCATCTTCTTTTTCTCGGTATAAATGATTATATCTTAGTTTTAACTTAAACAACTATTTGCCCCAATTTCAGTCACATTGTCAACACATTGCTGTAATTTGCCATCAGCTTTGGCCATCATTCCCAAGAATAGTTTGATCATCAACTTTTAGTCTCCCTGGACTAAACTGCCTTTCTTTAGATCTGGCTTCACAATGATGCCCGAGTTTTTAAAACATGTATAGGCTGAAGAATTTTGGAATTTGGAATTTGGAATCAA]
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[+] EMBL CF320065 [ TTCCACCTTTCCCGCATCTTCCGCCGTGGGGAAGGGAGCAATCGGCAAGCCAATCCAATCCGGTTGCTTCTCCTCCAATCCAACCTCGTCGGCGGCGGCGGCGACCCGCGCCGCGCAGGCTGTTGAGTTATCACATATTTGATTATGGATCTGCCATTGATGGCTGCTAAAGCCTATAAGTACAAAGCAGAACTACTTGTTAAGGACTACCTGCTAGCAGATTCGTATGTTCCATACGCTTCTGTGCTTGGCGGAATTCTGATGTGCAAGTTGTCATATGATTTCACACGCTNTATCAGTTCATTCTACTTCAAAGGCTATGGTTCTCTCACAAAGATGCAAAAGGTTGAATGGAATAACAAGGGCATGTCCACCGTCCATGCAATATTCATTACACTTATGTCAGCATACTTAGTCTTCTTCTCGGGTTTATTCTCTGACCAGCAGGATGGACCAGTAACATTTAGAAGTTCGAGCCTCTCCAATTTCACGCTAGGGGTCTCAGTTGGGTATTTCATTGCGGACCTTGCCATGATACTATGGTTTTACCCTTCACTCGGTGGAATGGAGTATCTTGTCCACCATGTATTGTCACTTACTGCTGTAACGTATACTATG ]
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[+] EMBL AK061738 [ TCCAATCCGGTTGCTTCTCCTCCAATCCAACCTCGTCGGCGGCGGCGGCGACCCGCGCCGCGCAGGCTGTTGAGTTATCACGTATTTGATTATGGATCTGCCATTGATGGCTGCTAAAGCCTATAAGTACAAAGCAGAACTACTTGTTAAGGACTACCTGCTAGCAGATTCGTATGTTCCATACGCTTCTGTGCTTGGCGGAATTCTGATGTGCAAGTTGTCATATGATTTCACACGCTTTATCAGTTCATTCTACTTCAAAGGCTATGGTTCTCTCACAAAGATGCAAAAGGTTGAATGGAATAACAGGGGCATGTCCACCGTCCATGCAATATTCATTACACTTATGTCAGCATACTTAGTCTTCTTCTCGGGTTTATTCTCTGACCAGCAGGATGGACCAGTAACATTTAGAAGTTCGAGCCTCTCCAATTTCACGCTAGGGGTCTCAGTTGGGTATTTCATTGCGGACCTTGCCATGATACTATGGTTTTACCCTTCACTCGGTGGAATGGAGTATCTTGTCCACCATGTATTGTCACTTACTGCTGTAACGTATACTATGCTTTCTGGGGAAGGACAGTTATACACATACATGAGTCTCATCTCAGAGACTACTACACCTGGAATCAACCTAAGATGGTTCCTTGATGTTGCTGGAATGAAAAGATCCAAAAGATACGTTGTTAATGGAGTTGCAATGTTTCTTACTTGGCTGGTTGCAAGGATAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAGATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCATACTGTTCGTGATGAATATGATATGGTTTTCCAAGATCTTAAGGGGCCTCAAGAAGACACTGGCCAAGAGGCATTGAGTGGGGCAAGGGGTATGCATGTACAGCCACGACAAACCACCTATCTGTAAATTCACTCAGCAGGCCAGCAGCCTATAGCTTCTCATTAGTCACGATGGCTAATCCTGGTAATATCAGCTTGGCCATTAAGATCCAGATTTATGATTGAATGCCCAGCTTTTTATGCATGGATGATATATTAATTTGTATATATG TTCCGCTATGGCTGTATGTTCTTAATACCCATCTTCTTTTTCTCGGTATAAATGATTATATCTTAGTTTTAACTTAAACAACTATTTGCCCCAATTTCAGTCACATTGTCAAC ]
[+] EMBL AK104247 [ TCCAATCCGGTTGCTTCTCCTCCAATCCAACCTCGTCGGCGGCGGCGGCGACCCGCGCCGCGCAGGCTGTTGAGTTATCACGTATTTGATTATGGATCTGCCATTGATGGCTGCTAAAGCCTATAAGTACAAAGCAGAACTACTTGTTAAGGACTACCTGCTAGCAGATTCGTATGTTCCATACGCTTCTGTGCTTGGCGGAATTCTGATGTGCAAGTTGTCATATGATTTCACACGCTTTATCAGTTCATTCTACTTCAAAGGCTATGGTTCTCTCACAAAGATGCAAAAGGTTGAATGGAATAACAGGGGCATGTCCACCGTCCATGCAATATTCATTACACTTATGTCAGCATACTTAGTCTTCTTCTCGGGTTTATTCTCTGACCAGCAGGATGGACCAGTAACATTTAGAAGTTCGAGCCTCTCCAATTTCACGCTAGGGGTCTCAGTTGGGTATTTCATTGCGGACCTTGCCATGATACTATGGTTTTACCCTTCACTCGGTGGAATGGAGTATCTTGTCCACCATGTATTGTCACTTACTGCTGTAACGTATACTATGCTTTCTGGGGAAGGACAGTTATACACATACATGAGTCTCATCTCAGAGACTACTACACCTGGAATCAACCTAAGATGGTTCCTTGATGTTGCTGGAATGAAAAGATCCAAAAGATACGTTGTTAATGGAGTTGCAATGTTTCTTACTTGGCTGGTTGCAAGGATAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAGATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCATACTGTTCGTGATGAATATGATATGGTTTTCCAAGATCTTAAGGGGCCTCAAGAAGACACTGGCCAAGAGGCATTGAGTGGGGCAAGGGGTATGCATGTACAGCCACGACAAACCACCTATCTGTAAATTCACTCAGCAGGCCAGCAGCCTATAGCTTCTCATTAGTCACGATGGCTAATCCTGGTAATATCAGCTTGGCCATTAAGATCCAGATTTATGATTGAATGCCCAGCTTTTTATGCATGGATGATATATTAATTTGTATATATG TTCCGCTATGGCTGTATGTTCTTAATACCCATCTTCTTTTTCTCGGTATAAATGATTATATCTTAGTTTTAACTTAAACAACTATTTGCCCCAATTTCAGTCACATTGTCAAC ]
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[-] EMBL CF320066 [ GCTGTAACGTATACTATGCTTTCTGGGGAAGGACAGTTATACACATACATGAGTCTCATCTCAGAGACTACTACACCTGGAATCAACCTAAGATGGTTCCTTGATGTTGCTGGAATGAAAAGATCCAAAAGATACGTTGTTAATGGAGTTGCAATGTTTCTTACTTGGCTGGTTGCAAGGATAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAGATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCATACTGTTCGTGATGAATATGATATGGTTTTCCAAGATCTTAAGGGGCCTCAAGAAGACACTGGCCAAGAGGCATTGAGTGGGGCAAGGGGTATGCATGTACAGCCACGACAAACCACCTATCTGTAAATTCACTCAGCAGGCCAGCAGCCTATAGCTTCTCATTAGTCACGATGGCTAATCCTGGTAATATCAGCTTGGCCATTAAGATCCAGATTTATGATTGAATGCCCAGCTTTTTATGCATGGATGATATATTAATTTGTATAaaaa a ]
[+] EMBL AU184261 [ TTGCAAGGATAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTNCATTATGATCAGATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCATACTGTTCGTGATGAATATGATATGGTTTTCCAAGATCTTAAGGGGCCTCAAGAAGACACTGGCCAAGAGGCATTGAGTGGGGCAAGGGGTATGCATGTACAGCCACGACAAACCACCTATCTGTAAATTCACTCAGCAGGCCAGCAGCCTATAGCTTNTCATTAGTCNCGATGGCTAATCCTGGTAATATCAGCTTGGCCNTTAAGATCCAGATTTATGATTGAATGCCCAGCTTTTTATGCATGGATGATATATTAATTTGNATATATGNTCCCGCTATGGCTGTATGTTNTTAATACCCNTNTTNTTTTTNTCGGNATAAAaaaa ]
[+] EMBL AU077739 [ ATNATCAGATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCATACTGTTCGTGATGAATATGATATGGTTTTCCAAGATCTTAAGGGGCCTCAAGAAGACACTGGCCAAGAGGCATTGAGTGGGGCAAGGGGTATGCATGTACAGCCACGACAAACCA CTATCTGTAAATTCACTCAGCAGGCCAGCAGCCTATAGCTTCTCATTAGTCACGATGGCTAATCCTGGTAATATCAGCTTGGCCATTAAGATCCAGATTTATGATTGAATGCCCAGCTTTTTATGCATGGATGATATATTAATNTGTATATATG TTCCGCTATGGCTGTATGTTCTTAATACCCATCTTCTTTTTCTCGGTAT AATG TTATATCTTAGTTTTAACTTAAACAACTATTTGCCCCAATTTCAGTCACANTGTCAACAC ]
consensusID : consensus_13330#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 446 fasta sequence
[ATATGATATGGTTTTCCAAGATCTTAAGGGGCCTCAAGAAGACACTGGCCAAGAGGCATTGAGTGGGGCAAGGGGTATGCATGTACAGCCACGACAAACCACCTATCTGTAAATTCACTCAGCAGGCCAGCAGCCTATAGCTTCTCATTAGTCACGATGGCTAATCCTGGTAATATCAGCTTGGCCATTAAGATCCAGATTTATGATTGAATGCCCAGCTTTTTATGCATGGATGATATATTAATTTGTATATATGTTCCGCTATGGCTGTATGTTCTTAATACCCATCTTCTTTTTCTCGGTATAAATGATTATATCTTAGTTTTAACTTAAACAACTATTTGCCCCAATTTCAGTCACATTGTCAACACATTGCTGTAATTTGCCATCAGCTTTGGCCATCATTCCCAAGAATAGTTTGATCATCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL AU077740 [ATATGATATGGTTTTCCAAGATCTTAAGGGGCCTCAAGAAGACACTGGCCAAGAGGCATTGAGTGGGGCAAGGGGTATGCATGTACAGCCACGACAAACCACCTATCTGTAAATTCACTCAGCAGGCCAGCAGCCTATAGCTTCTCATTAGTCACGATGGCTAATCCTGGTAATATCAGCTTGGCCATTAAGATCCAGATTTATGATTGAATGCCCAGCTTTTTATGCATGGATGATATATTAATTTGTATATATGTTCCGCTATGGCTGTATGTTCTTAATACCCATCTTCTTTTTCTCGGTATAAATGATTATATCTTAGTTTTAACTTAAACAACTATTTGCCCCAATTTCAGTCACATTGTCAACACATTGCTGTAATTTGCCATCAGCTTTGGCCATCATTCCCAAGAATAGTTTGATCATCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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consensus_13330#1 ------------------------------------------------------------
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| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||