cluster # 13428

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Oryza sativa
cluster # 13428 cluster # 13428 Sequences # 13 consensus # 4

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consensus_13428#0 length = 1298 sequences # 3
consensus_13428#1 length = 1179 sequences # 6

consensus_13428#2 length = 1177 sequences # 3
consensus_13428#3 length = 550 sequences # 1

consensusID : consensus_13428#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1298
fasta sequence

                              [ATTCCTCGAGCACTGTTGGCCTACTGGAAAGAGAAGGATAGTGGCTTGGTGCAAGTGCGATCCCCCCCCCC-CCCCCCCACATCTCCCGCAGAGTCCACGGCCGATCCATCCCCTCGTGCAGGCCGCCGGCGGCGGGGAGGAGGAGGAGGAGGCGATGGCGTCGTCGCAGGCCAACCTCGACAAGATGCAGCTCCGCCAGAGCTACCGCAACCTCTGGCACTCCGATCTCACCAGCACCATCCAGGCCGACTTCCCATATTGCTGCCTCGCGCTCTGGTGTGGACCATGTGTGTCATACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTGTATAATGACATGTCAAGATATGTCTGCTGTGCTGGGTACATGCCATGCAGTGGGAAGTGTGGTGAAAGCCGATGCCCAGAGTTCTGTCTTGCTACTGAGGTGTTTCTGTGCTTTGGTAATTCAGTTGCTTCAACCCGCTTCTTGCTCCAAGATGAATTCAACATACAGACAACTAAATGCGATAACTGCATCATTGGCTTCATGTTCTGCCTCCAACAAATTGCTTGTATCTTCTCTATAGTTGCCGCTATTGTTGGTAGTGAAGAGCTTTCAGAGGCTTCCCAAATCCTTTCCTGCTTGTCTGATATGGTCTACTGCTCGGTTTGCGCCTGTATGCAGACCCAACACAAAATTGAAATGGACAAGAGAGATGGGAAGTTCGGCCCACAGCCCATGGCAGTGCCTCCAATGCAGCAAATGTCGCGCATCGATCAGCCTATTCCACCTCCTGTTGGGTACACACCACAACAGCCAGCATACGGTCAGCCTTATGGTGGCTATCCTCCTGCTCCGCCTGCTCAAGGTTATCCACCAGCTGCTTACCCTCCGGCAGGTTACCCCCAGGGTGGTGCATACCCTCCCCCTGGCTCTTATCCCCCACCTGGTTCCTACCCGCCTCAGGGCTCCTACCCTCCTCCACAAGGTTACTACGGCAAGTAAAGGAAATGCAGAAATTGGAGATATGTCTTTGTGACGAAATCGGTATATTGTGAACAATGTAAACATTAGGGTGGTTGTAGTGTTATTATAGGTGATGTCGATATATTAATCGATCTGTGACTGGTCTGGGTGGTAAACTGCAAACATAATTTGGATTCCTCCGGGTGTGGTATACTGTGAACCCGTTTCGTAGAAATTATCAGCTCCCCGTGTTGATCATTCTTGAATACGTTCTTCTCTGAATAAAGGATCGCCATGAAATGTCAACTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACAT]

[+] EMBL AK105012             [ATTCCTCGAGCACTGTTGGCCTACTGGAAAGAGAAGGATAGTGGCTTGGTGCAAGTGCGATCCCCCCCCCC CCCCCCCACATCTCCCGCAGAGTCCACGGCCGATCCATCCCCTCGTGCAGGCCGCCGGCGGCGGGGAGGAGGAGGAGGAGGCGATGGCGTCGTCGCAGGCCAACCTCGACAAGATGCAGCTCCGCCAGAGCTACCGCAACCTCTGGCACTCCGATCTCACCAGCACCATCCAGGCCGACTTCCCATATTGCTGCCTCGCGCTCTGGTGTGGACCATGTGTGTCATACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTGTATAATGACATGTCAAGATATGTCTGCTGTGCTGGGTACATGCCATGCAGTGGGAAGTGTGGTGAAAGCCGATGCCCAGAGTTCTGTCTTGCTACTGAGGTGTTTCTGTGCTTTGGTAATTCAGTTGCTTCAACCCGCTTCTTGCTCCAAGATGAATTCAACATACAGACAACTAAATGCGATAACTGCATCATTGGCTTCATGTTCTGCCTCCAACAAATTGCTTGTATCTTCTCTATAGTTGCCGCTATTGTTGGTAGTGAAGAGCTTTCAGAGGCTTCCCAAATCCTTTCCTGCTTGTCTGATATGGTCTACTGCTCGGTTTGCGCCTGTATGCAGACCCAACACAAAATTGAAATGGACAAGAGAGATGGGAAGTTCGGCCCACAGCCCATGGCAGTGCCTCCAATGCAGCAAATGTCGCGCATCGATCAGCCTATTCCACCTCCTGTTGGGTACACACCACAACAGCCAGCATACGGTCAGCCTTATGGTGGCTATCCTCCTGCTCCGCCTGCTCAAGGTTATCCACCAGCTGCTTACCCTCCGGCAGGTTACCCCCAGGGTGGTGCATACCCTCCCCCTGGCTCTTATCCCCCACCTGGTTCCTACCCGCCTCAGGGCTCCTACCCTCCTCCACAAGGTTACTACGGCAAGTAAAGGAAATGCAGAAATTGGAGATATGTCTTTGTGACGAAATCGGTATATTGTGAACAATGTAAACATTAGGGTGGTTGTAGTGTTATTATAGGTGATGTCGATATATTAATCGATCTGTGACTGGTCTGGGTGGTAAACTGCAAACATAATTTGGATTCCTCCGGGTGTGGTATACTGTGAACCCGTTTCGTAGAAATTATCAGCTCCCCGTGTTGATCATTCTTGAATACGTTCTTCTCTGAATAAAGGATCGCCATGAAATGTCAACTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACAT]
[+] EMBL CB653033             [                                                     AGTGCCATCCCCCCCCCCACCCCCCCAGATCTCCCGCAGAGTCCACGGGCGATCCATCCCCTCGTGCAGGCCGCCGGCGGCGGGGAGGAGGAGGAGGAGGCGATGGCGTCATCCCAGGCCAACCTCGACAAGATGCACCTCCGCCAGAGCTACCGCAACCTCTGGCACTCCGATCTCACCAGCACCATCCAGGCCGACTTCCCATATTGCTGCCTCGCGCTCTGGTGTGGACCATGTGTGACATACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTGTATAATGACATGTCAAGATATGTCTGCTGTGCTGGGTACATGCCATGCAGTGGGAAGTGTGGTGAAAGCCGATGCCCAGAGTTCTGTCTTGCTACTGAGGGGTTTCTGTGCTTTGGGAATTCAGTTGCTTCAACCCGCTTCTTGCTCCAAGATGAATTCAACATACAGACAACTAAATGCGATAACTGCATCATTGGCTTCATGTTCTGCCTCCAACAAATTGCTTGTATCTTCTCTATAGTTGCCCCTATTGTTGGTAGTGAAGAGCTTTCAGAGGCTTCCCAAATCCTTTCCTGCTTGTCTGATATGGTCTACTGCTCGGTTTGCGCCTGTATGCACACCCAACACAAAATTGAAATGGACAAGAGAGATGGGAAGTTCGGCCCACAGCCCATGGCAGTGCCTCCAATGCAGCAAATGTCGCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL AK101248             [                                                                                          AGAGTCCACGGCCGATCCATCCCCTCGTGCAGGCCGCCGGCGGCGGGGAGGAGGAGGAGGAGGCGATGGCGTCGTCGCAGGCCAACCTCGACAAGATGCAGCTCCGCCAGAGCTACCGCAACCTCTGGCACTCCGATCTCACCAGCACCATCCAGGCCGACTTCCCATATTGCTGCCTCGCGCTCTGGTGTGGACCATGTGTGTCATACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTGTATAATGACATGTCAAGATATGTCTGCTGTGCTGGGTACATGCCATGCAGTGGGAAGTGTGGTGAAAGCCGATGCCCAGAGTTCTGTCTTGCTACTGAGGTGTTTCTGTGCTTTGGTAATTCAGTTGCTTCAACCCGCTTCTTGCTCCAAGATGAATTCAACATACAGACAACTAAATGCGATAACTGCATCATTGGCTTCATGTTCTGCCTCCAACAAATTGCTTGTATCTTCTCTATAGTTGCCGCTATTGTTGGTAGTGAAGAGCTTTCAGAGGCTTCCCAAATCCTTTCCTGCTTGTCTGATATGGTCTACTGCTCGGTTTGCGCCTGTATGCAGACCCAACACAAAATTGAAATGGACAAGAGAGATGGGAAGTTCGGCCCACAGCCCATGGCAGTGCCTCCAATGCAGCAAATGTCGCGCATCGATCAGCCTATTCCACCTCCTGTTGGGTACACACCACAACAGCCAGCATACGGTCAGCCTTATGGTGGCTATCCTCCTGCTCCGCCTGCTCAAGGTTATCCACCAGCTGCTTACCCTCCGGCAGGTTACCCCCAGGGTGGTGCATACCCTCCCCCTGGCTCTTATCCCCCACCTGGTTCCTACCCGCCTCAGGGCTCCTACCCTCCTCCACAAGGTTACTACGGCAAGTAAAGGAAATGCAGAAATTGGAGATATGTCTTTGTGACGAAATCGGTATATTGTGAACAATGTAAACATTAGGGTGGTTGTAGTGTTATTATAGGTGATGTCGATATATTAATCGATCTGTGACTGGTCTGGGTGGTAAACTGCAAACATAATTTGGATTCCTCCGGGTGTGGTATACTGTGAACCCGTTTCGTAGAAATTATCAGCTCCCCGTGTTGATCATTCTTGAATACGTTCTTCTCTGAATAAAGGATCGCCATGAAATGTCAACTTAg                                               ]




>consensus_13428#0
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TCCCCCCCCCCCCCCCCCACATCTCCCGCAGAGTCCACGGCCGATCCATCCCCTCGTGCA
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CCAGGCCGACTTCCCATATTGCTGCCTCGCGCTCTGGTGTGGACCATGTGTGTCATACAT
GCTTCGCAAAAGGGCTCTGTATAATGACATGTCAAGATATGTCTGCTGTGCTGGGTACAT
GCCATGCAGTGGGAAGTGTGGTGAAAGCCGATGCCCAGAGTTCTGTCTTGCTACTGAGGT
GTTTCTGTGCTTTGGTAATTCAGTTGCTTCAACCCGCTTCTTGCTCCAAGATGAATTCAA
CATACAGACAACTAAATGCGATAACTGCATCATTGGCTTCATGTTCTGCCTCCAACAAAT
TGCTTGTATCTTCTCTATAGTTGCCGCTATTGTTGGTAGTGAAGAGCTTTCAGAGGCTTC
CCAAATCCTTTCCTGCTTGTCTGATATGGTCTACTGCTCGGTTTGCGCCTGTATGCAGAC
CCAACACAAAATTGAAATGGACAAGAGAGATGGGAAGTTCGGCCCACAGCCCATGGCAGT
GCCTCCAATGCAGCAAATGTCGCGCATCGATCAGCCTATTCCACCTCCTGTTGGGTACAC
ACCACAACAGCCAGCATACGGTCAGCCTTATGGTGGCTATCCTCCTGCTCCGCCTGCTCA
AGGTTATCCACCAGCTGCTTACCCTCCGGCAGGTTACCCCCAGGGTGGTGCATACCCTCC
CCCTGGCTCTTATCCCCCACCTGGTTCCTACCCGCCTCAGGGCTCCTACCCTCCTCCACA
AGGTTACTACGGCAAGTAAAGGAAATGCAGAAATTGGAGATATGTCTTTGTGACGAAATC
GGTATATTGTGAACAATGTAAACATTAGGGTGGTTGTAGTGTTATTATAGGTGATGTCGA
TATATTAATCGATCTGTGACTGGTCTGGGTGGTAAACTGCAAACATAATTTGGATTCCTC
CGGGTGTGGTATACTGTGAACCCGTTTCGTAGAAATTATCAGCTCCCCGTGTTGATCATT
CTTGAATACGTTCTTCTCTGAATAAAGGATCGCCATGAAATGTCAACTTAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACAT

consensusID : consensus_13428#1
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NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1179
fasta sequence

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[+] EMBL AK109354             [TTCCTCGAGCACTGTTGGCCTACTGGGGTGCAAGTGCGATCCCCCCCCCCCCCCCCACATCTCCCGCAGAGTCCACGGCCGATCCATCCCCTCGTGCAGGCCGCCGGCGGCGGGGAGGAGGAGGAGGAGGCGATGGCGTCGTCGCAGGCCAACCTCGACAAGATGCAGCTCCGCCAGAGCTACCGCAACCTCTGGCACTCCGATCTCACCAGCACCATCCAGGCCGACTTCCCATATTGCTGCCTCGCGCTCTGGTGTGGACCATGTGTGTCATACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTGTATAATGACATGTCAAGATATGTCTGCTGTGCTGGGTACATGCCATGCAGTGGGAAGTGTGGTGAAAGCCGATGCCCAGAGTTCTGTCTTGCTACTGAGGTGTTTCTGTGCTTTGGTAATTCAGTTGCTTCAACCCGCTTCTTGCTCCAAGATGAATTCAACATACAGACAACTAAATGCGATAACTGCATCATTGGCTTCATGTTCTGCCTCCAACAAATTGCTTGTATCTTCTCTATAGTTGCCGCTATTGTTGGTAGTGAAGAGCTTTCAGAGGCTTCCCAAATCCTTTCCTGCTTGTCTGATATGGTCTACTGCTCGGTTTGCGCCTGTA TGCAGACCCAACACAAAATTGAAATGGACAAGAGAGATGGGAAGTTCGGCCCACAGCCCATGGCAGTGCCTCCAATGCAGCAAATGTCGCGCATCGATCAGCCTATTCCACCTCCTGTTGGGTACACACCACAACAGCCAGCATACGGTCAGCCTTATGGTGGCTATCCTCCTGCTCCGCCTGCTCAAGGTTATCCACCAGCTGCTTACCCTCCGGCAGGTTACCCCCAGGGTGGTGCATACCCTCCCCCTGGCTCTTATCCCCCACCTGGTTCCTACCCGCCTCAGGGCTCCTACCCTCCTCCACAAGGTTACTACGGCAAGTAAAGGAAATGCAGAAATTGGAGATATGTCTTTGTGACGAAATCGGTATATTGTGAACAATGTAAACATTAGGGTGGTTGTAGTGTTATTATAGGTGATGTCGATATATTAATCGATCTGTGACTGGTCTGGGTGGTAAACTGCAAACATAATTTGGATTCCTCCGGGTGTGGTATACTGTGAACCCGTTTCGTAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACAT]
[+] EMBL CF321804             [                                                                CGCAGAGTCCACGGCCGATCCATCCCCTCGTGCAGGCCGCCGGCGGCGGGGAGGAGGAGGAGGAGGCGATGGCGTCGTCGCAGGCCAACCTCGACAAGATGCAGCTCCGCCAGAGCTACCGCAACCTCTGGCACTCCGATCTCACCAGCTCTTTCCAGGCCGACTTCCCATATTGCTGCCTCGCGCTCTGGTGTGGACCATGTGTGTCATACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTGTATAATGACATGTCAAGATATGTCTGCTGTGCTGGGTACATGCCATGCAGTGGGAAGTGTGGTGAAAGCCGATGCCCAGAGTTCTGTCTTGCTACTGAGGTGTTTCTGTGCTTTGGTAATTCAGTTGCTTCAACCCGCTTCTTGCTCCAAGATGAATTCAACATACAGACAACTAAATGCGATAACTGCATCATTGGCTTCATGTTCTGCCTCCAACAAATTGCTTGTATCTTCTCTATAGTTGCCGCTATTGTTGGTAGTGAAGAGCTTTCAGAGGCTTCCCAAATCCTTTCCTGCTTGTCTGATATGGTCTACTGCTCGGTTTGCGCCTGTA TGCAGACCCAACACAAAATTGAAATGGACAAGAGAGATGGGAAGTTCGGCCCACAGCCCATGGCAGTGCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL C27154               [                                                                                                                                               GCAGGCCAACCTCGACAAGATGCAGCTCCGCCAGAGCTACCGCAACCTCTGGCACTCCGATCTCACCAGCACCATCCAGGCCGACTTCCCATATTGCTGCCTCGCGCTCTGGTGTGGACCATGTGTGTCATACATGCTTCG AAAAGGGCTCTGTATAATGACATGTCAAGATATGTCTGCTGTGCTGGGTACATGCCATGCAGTGGGAAGTGTGGTGAAAGCCGATGCCCAGAGTTCTGTCTTGCTACTGAGGTGTTTCTGTGCTTTGGTAATTCAGTTGCTTCAACCCGCTTCTTGCTCCAAGATGAATTCAACATACAGACAACTAAATGCGATAACTGCATCATTGGCTTCATGTTCTGCCTCCAACAAATTGCTTGTATCTTCTCTATAGTTGCCGCTATTGTTGGNAGTG AGAGC TTCAGAGGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CA753041             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AACCCGCTTCTTGCTCCAAGATGAATTCAACATACAGACAACTAAATGCGATAACTGCATCATTGGCTTCATGTTCTGCCTCCAACAAATTGCTTGTATCTTCTCTATAGTTGCCGCTATTGTTGGTAGTGAAGAGCTTTCAGAGGCTTCCCAAATCCTTTCCTGCTTGTCTGATATGGTCTACTGCTCGGTTTGCGCCTGTA TGCAGACCCAACACAAAATTGAAATGGACAAGAGAGATGGGAAGTTCGGCCCACAGCCCATGGCAGTGCCTCCAATGCAGCAAATGTCGCGCATCGATCAGCCTATTCCACCTCCTGTTGGGTACACACCACAACAGCCAGCATACGGTCAGCCTTATGGTGGCTATCCTCCTGCTCCGCCTGCTCAAGGTTATCCACCAGCTGCTTACCCTCCGGCAGGTTACCCCCAGGGTGGTGCATACCCTCCTCCTGGCTCTTATCCCCCACCTGGTTCCTACCCGCCTCAGGGCTCCTACCCTCCTCCACAAGGTNACTACNGCAAGTAAAGGAAATGCAGAAATTGGAGATATGTCTNTGTGACGAAATCGGTAT                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BI795634             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tcCTCGTTTTGCCCCTGTATTGCAGACCC ACACAAAATTGAAATGGACAAGAGAGATGGGAAGTTCGGCCCACAGCCCAT GCAGTGCCTCCAATGCAGCAAATGTCGCGCATCGATCAGCCTATTCCACCTCCTGTTGGGTACACACCACAACAGCCAGCATACGGTCAGCCTTATGGTGGCTATCCTCCTGCTCCGCCTGCTCAAGGTTATCCACCAGCTGCTTACCCTCCGGCAGGTTACCCCCAGGGTGGTGCATACCCTCCTCCTGGCTCTTATCCCCCACCTGGTTCCTACCCGCCTCAGGGCTCCTACCCTCCTCCACAAGGTTACTACGGCAAGTAAAGGAAATGCAGAAATTGGAGATATGTCTTTGTGACGAAATCGGTATATTGTGAAC ATGTAAACATTAGGGTGGTTGTAGTGTTATTATAGGTGATGTCGATATATTAATCGATCTGTGACTGGTCTGGGTGGTAAACTGCAAACATAATTTGGATTCCTCCGGGTGTGGTATACTGTGAACCCGTTTCGTAGAAAAA                        ]
[+] EMBL AU100796             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACCCGCCTCAGGGCTCCTACCCTCCTCNACAAGGTTNCTACGGCAAGTAAAGGAAATGCAGAAATTGGNGATATGTCTTTGTGACGAAATCGGTATATTGTGAACAATGTAAACATTAGGGTGGTTNTAGTGTTATTATAGGTGATGTCGATATATTAATCGATCTGTGACTGGTCTGGGTGGTAAACTGCAAACATAATTTGGATTCCTCCGGGTGTGGTATACTGTGAACCCGTTTCGTAAAAAAA                        ]




>consensus_13428#1
TTCCTCGAGCACTGTTGGCCTACTGGGGTGCAAGTGCGATCCCCCCCCCCCCCCCCACAT
CTCCCGCAGAGTCCACGGCCGATCCATCCCCTCGTGCAGGCCGCCGGCGGCGGGGAGGAG
GAGGAGGAGGCGATGGCGTCGTCGCAGGCCAACCTCGACAAGATGCAGCTCCGCCAGAGC
TACCGCAACCTCTGGCACTCCGATCTCACCAGCACCATCCAGGCCGACTTCCCATATTGC
TGCCTCGCGCTCTGGTGTGGACCATGTGTGTCATACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTGTAT
AATGACATGTCAAGATATGTCTGCTGTGCTGGGTACATGCCATGCAGTGGGAAGTGTGGT
GAAAGCCGATGCCCAGAGTTCTGTCTTGCTACTGAGGTGTTTCTGTGCTTTGGTAATTCA
GTTGCTTCAACCCGCTTCTTGCTCCAAGATGAATTCAACATACAGACAACTAAATGCGAT
AACTGCATCATTGGCTTCATGTTCTGCCTCCAACAAATTGCTTGTATCTTCTCTATAGTT
GCCGCTATTGTTGGTAGTGAAGAGCTTTCAGAGGCTTCCCAAATCCTTTCCTGCTTGTCT
GATATGGTCTACTGCTCGGTTTGCGCCTGTATGCAGACCCAACACAAAATTGAAATGGAC
AAGAGAGATGGGAAGTTCGGCCCACAGCCCATGGCAGTGCCTCCAATGCAGCAAATGTCG
CGCATCGATCAGCCTATTCCACCTCCTGTTGGGTACACACCACAACAGCCAGCATACGGT
CAGCCTTATGGTGGCTATCCTCCTGCTCCGCCTGCTCAAGGTTATCCACCAGCTGCTTAC
CCTCCGGCAGGTTACCCCCAGGGTGGTGCATACCCTCCTCCTGGCTCTTATCCCCCACCT
GGTTCCTACCCGCCTCAGGGCTCCTACCCTCCTCCACAAGGTTACTACGGCAAGTAAAGG
AAATGCAGAAATTGGAGATATGTCTTTGTGACGAAATCGGTATATTGTGAACAATGTAAA
CATTAGGGTGGTTGTAGTGTTATTATAGGTGATGTCGATATATTAATCGATCTGTGACTG
GTCTGGGTGGTAAACTGCAAACATAATTTGGATTCCTCCGGGTGTGGTATACTGTGAACC
CGTTTCGTAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACAT

consensusID : consensus_13428#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1177
fasta sequence

                              [ACGCCCTTATAATCCCCTCGTGCAGGCCGCCGGCGGCGGGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGCGATGGCGTCGTCGCAGGCCAACCTCGACAAGATGCAGCTCCGCCAGAGCTACCGCAACCTCTGGCACTCCGATCTCACCAACACCATCCAGGCCGACTTCCCATATTGCTGCCTCGCGCTCTGGTGTGGACCATGTGTGTCATACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTGTATAATGACATGTCAAGATATGTCTGCTGTGCTGGGTACATGCCATGCAGTGGGAAGTGTGGTGAAAGCCGATGCCCAGAGTTCTGTCTTGCTACTGAGGTGTTTCTGTGCTTTGGTAATTCAGTTGCTTCAACCCGCTTCTTGCTCCAAGATGAATTCAACATACAGACAACTAAATGCGATAACTGCATCATTGGC-TTCATGTTCTGCCTCCAACAAATTGCTTGTATCTTCTCTATAGTTGCCGCTATTGTTGGTAGTGAAGAGCTTTCAGAGGCTTCCCAAATCCTTTCCTGCTTGTCTGATATGGTCTACTGCTCGGTTTGCGCCTGTATGCAGACCCAACACAAAATTGAAATGGACAAGAGAGATGGGAAGTTCGGCCCACAGCCCATGGCAGTGCCTCCAATGCAGCAAATGTCGCGCATCGATCAGCCTATTCCACCTCCTGTTGGGTACACACCACAACAGCCAGCATACGGTCAGCCTTATGGTGGCTATCCTCCTGCTCCGCCTGCTCAAGGTTATCCACCAGCTGCTTACCCTCCGGCAGGTTACCCCCAGGGTGGTGCATACCCTCCCCCTGGCTCTTATCCCCCACCTGGTTCCTACCCGCCTCAGGGCTCCTACCCTCCTCCACAAGGTTACTACGGCAAGTAAAGGAAATGCAGAAATTGGAGATATGTCTTTGTGACGAAATCGGTATATTGTGAACAATGTAAACATTAGGGTGGTTGTAGTGTTATTATAGGTGATGTCGATATATTAATCGATCTGTGACTGGTCTGGGTGGTAAACTGCAAACATAATTTGGATTCCTCCGGGTGTGGTATACTGTGAACCCGTTTCGTAGAAATTATCAGCTCCCCGTGTTGATCATTCTTGAATACGTTCTTCTCTGAATAAAGGATCGCCATGAAATGTCAACTTAGATTTGGAACTTTTTATCAG]

[+] EMBL CB628030             [ACGCCCTTATAATCCCCTCGTGCAGGCCGCCGGCGGCGGGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGCGATGGCGTCGTCGCAGGCCAACCTCGACAAGATGCAGCTCCGCCAGAGCTACCGCAACCTCTGGCACTCCGATCTCACCAACACCATCCAGGCCGACTTCCCATATTGCTGCCTCGCGCTCTGGTGTGGACCATGTGTGTCATACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTGTATAATGACATGTCAAGATATGTCTGCTGTGCTGGGTACATGCCATGCAGTGGGAAGTGTGGTGAAAGCCGATGCCCAGAGTTCTGTCTTGCTACTGAGGTGTTTCTGTGCTTTGGTAATTCAGTTGCTTCAACCCGCTTCTTGCTCCAAGATGAATTCAACATACAGACAACTAAATGCGATAACTGCATCATTGGC TTCATGTTCTGCCTCCAACAAATTGCTTGTATCTTCTCTATAGTTGCCGCTATTGTTGGTAGTGAAGAGCTTTCAGAGGCTTCCCAAATCCTTTCCTGCTTGTCTGATATGGTCTACTGCTCGGTTTGCGCCTGTATGCAGACCCAACACAAAATTGAAATGGACAAGAGAGATGGGAAGTTCGGCCCACAGCCCATGGCAGTGCCTCCAATGCAGCAAATGTCGCGCATCGATCAGCCTATTCCACCTCCTGTTGGGTACACACCACAACAGCCAGCATACGGTCAGCCTTATGGTGGCTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CB653034             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GCTCCAAGATGAATTCACCATACAGACAACTAAATGCGATAACTGCATCA TGGCTTTCATGTTCTGCCTCCAACAAATTGCTTGTATCTTCTCTATAGTTGCCGCTATTGTTGGTAGTGAAGAGCTTTCAGAGGCTTCCCAAATCCTTTCCTGCTTGTCTGATATGGTCTACTGCTCGGTTTGCGCCTGTATGCAGACCCAACACAAAATTGAAATGGACAAGAGAGATGGGAAGTTCGGCCCACAGCCCATGGCAGTGCCTCCAATGCAGCAAATGTCGCGCATCGATCAGCCTATTCCACCTCCTGTTGGGTACACACCACAACAGCCAGCATACGGTCAGCCTTATGGTGGCTATCCTCCTGCTCCGCCTGCTCAAGGTTATCCACCAGCTGCTTACCCTCCGGCAGGTTACCCCCAGGGTGGTGCATACCCTCCCCCTGGCTCTTATCCCCCACCTGGTTCCTACCCGCCTCAGGGCTCCTACCCTCCTCCACAAGGTTACTACGGCAAGTAAAGGAAATGCAGAAATTGGAGATATGTCTTTGTGACGAAATCGGTATATTGTGAACAATGTAAACATTAGGGTGGTTGTAGTGTTATTATAGGTGATGTCGATATATTAATCGATCTGTGACTGGTCTGGGTGGTAAACTGCAAACATAATTTGGATTCCTCCGGGTGTGGTATACTGTGAACCCGTTTCGTAGAAATTATCAGCTCCCCGTGTTGATCATTCTTGAATACGTTCTTCTCTGAATAAAGGATCGCCATGAAATGTCAACTTAGATTTGGAACTTTTTATCAG]
[-] EMBL CB628031             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTGTATTTTTTCTATAGTTGCCCCTATTGTTGGTAGTGAAGAGCTTTCAGAGGCTTCCCAAATCCTTTCCTGCTTGTTTGATATGGTTTACTGCTCGGTTTGCGCCTGTATGCAGACCCAACCCAAAATTGAAATGGACAAGAGAGATGGGAAGTTCGGCCCCCAGCCCATGGCAGTGCCTCCAATGCAGCAAATGTCGCGCATCGATCAGCCTATTCCCCCTCCTGTTGGGTACACACCACAACAGCCAGCATACGGTCAGCCTTATGGTGGGTATCCTCCTGCTCCGCCTGCTCAAGGTTATCCCCCAGCTGCTTACCCTCCGGCAGGTTACCCCCAGGGTGGTGCATACCCTCCTCCTGGCTTTTATCCCCCCCCTGGTTCCTACCCGCCTCAGGGCTCCTACCCTCCTCCACAAGGTTATTTCGGCAAGTAAAGGAAATGCAGAAATTGGAGATATGTTTTTGTGACGAAATCGGTATATTGTGAACAATGTAAACATTAGGGTGGTTGTAGTGTTATTATAGGTGATGTCGATATATTAATCGATTTGTGACTGGTTTGGGTGGGGGACTGCAAACATAATTTGGATTCCTCCGGGTGTGGTATACTGTGAACCCCTTTTTTAGAAATTATCAtt                                                                                       ]




>consensus_13428#2
ACGCCCTTATAATCCCCTCGTGCAGGCCGCCGGCGGCGGGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGC
GATGGCGTCGTCGCAGGCCAACCTCGACAAGATGCAGCTCCGCCAGAGCTACCGCAACCT
CTGGCACTCCGATCTCACCAACACCATCCAGGCCGACTTCCCATATTGCTGCCTCGCGCT
CTGGTGTGGACCATGTGTGTCATACATGCTTCGCAAAAGGGCTCTGTATAATGACATGTC
AAGATATGTCTGCTGTGCTGGGTACATGCCATGCAGTGGGAAGTGTGGTGAAAGCCGATG
CCCAGAGTTCTGTCTTGCTACTGAGGTGTTTCTGTGCTTTGGTAATTCAGTTGCTTCAAC
CCGCTTCTTGCTCCAAGATGAATTCAACATACAGACAACTAAATGCGATAACTGCATCAT
TGGCTTCATGTTCTGCCTCCAACAAATTGCTTGTATCTTCTCTATAGTTGCCGCTATTGT
TGGTAGTGAAGAGCTTTCAGAGGCTTCCCAAATCCTTTCCTGCTTGTCTGATATGGTCTA
CTGCTCGGTTTGCGCCTGTATGCAGACCCAACACAAAATTGAAATGGACAAGAGAGATGG
GAAGTTCGGCCCACAGCCCATGGCAGTGCCTCCAATGCAGCAAATGTCGCGCATCGATCA
GCCTATTCCACCTCCTGTTGGGTACACACCACAACAGCCAGCATACGGTCAGCCTTATGG
TGGCTATCCTCCTGCTCCGCCTGCTCAAGGTTATCCACCAGCTGCTTACCCTCCGGCAGG
TTACCCCCAGGGTGGTGCATACCCTCCCCCTGGCTCTTATCCCCCACCTGGTTCCTACCC
GCCTCAGGGCTCCTACCCTCCTCCACAAGGTTACTACGGCAAGTAAAGGAAATGCAGAAA
TTGGAGATATGTCTTTGTGACGAAATCGGTATATTGTGAACAATGTAAACATTAGGGTGG
TTGTAGTGTTATTATAGGTGATGTCGATATATTAATCGATCTGTGACTGGTCTGGGTGGT
AAACTGCAAACATAATTTGGATTCCTCCGGGTGTGGTATACTGTGAACCCGTTTCGTAGA
AATTATCAGCTCCCCGTGTTGATCATTCTTGAATACGTTCTTCTCTGAATAAAGGATCGC
CATGAAATGTCAACTTAGATTTGGAACTTTTTATCAG

consensusID : consensus_13428#3
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 550
fasta sequence

                              [TGGACAAGAGAGATGGGAAGTTCGGCCCACAGCCCATGGCAGTGCCTCCAATGCAGCAAATGTCGCGCATCGATCAGCCTATTCCACCTCCTGTTGGGTACACACCACAACAGCCAGCATACGGTCAGCCTTATGGTGGCTATCCTCCTGCTCCGCCTGCTCAAGGTTATCCACCAGCTGCTTACCCTCCGGCAGGTTACCCCCAGGGTGGTGCATACCCTCCCCCTGGCTCTTATCCCCCACCTGGTTCCTACCCGCCTCAGGGCTCCTACCCTCCTCCACAAGGTTACTACGGCAAGTAAAGGAAATGCAGAAATTGGAGATATGTCTTTGTGACGAAATCGGTATATTGTGAACAATGTAAACATTAGGGTGGATATAGTGTTATTATAGGTGATGTCGATATATTAATCGATCTGTGACTGGTCTGGGTGGTAAACTGCAAACATAATTTGGATTCCTCCGGGTGTGGTATATTGTGAACCCGTTTCGTAGAAATTATCAGCTCCCCCGTGTTGATCATTCTTGAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAC]

[-] EMBL CF321805             [TGGACAAGAGAGATGGGAAGTTCGGCCCACAGCCCATGGCAGTGCCTCCAATGCAGCAAATGTCGCGCATCGATCAGCCTATTCCACCTCCTGTTGGGTACACACCACAACAGCCAGCATACGGTCAGCCTTATGGTGGCTATCCTCCTGCTCCGCCTGCTCAAGGTTATCCACCAGCTGCTTACCCTCCGGCAGGTTACCCCCAGGGTGGTGCATACCCTCCCCCTGGCTCTTATCCCCCACCTGGTTCCTACCCGCCTCAGGGCTCCTACCCTCCTCCACAAGGTTACTACGGCAAGTAAAGGAAATGCAGAAATTGGAGATATGTCTTTGTGACGAAATCGGTATATTGTGAACAATGTAAACATTAGGGTGGATATAGTGTTATTATAGGTGATGTCGATATATTAATCGATCTGTGACTGGTCTGGGTGGTAAACTGCAAACATAATTTGGATTCCTCCGGGTGTGGTATATTGTGAACCCGTTTCGTAGAAATTATCAGCTCCCCCGTGTTGATCATTCTTGAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAC]




>consensus_13428#3
TGGACAAGAGAGATGGGAAGTTCGGCCCACAGCCCATGGCAGTGCCTCCAATGCAGCAAA
TGTCGCGCATCGATCAGCCTATTCCACCTCCTGTTGGGTACACACCACAACAGCCAGCAT
ACGGTCAGCCTTATGGTGGCTATCCTCCTGCTCCGCCTGCTCAAGGTTATCCACCAGCTG
CTTACCCTCCGGCAGGTTACCCCCAGGGTGGTGCATACCCTCCCCCTGGCTCTTATCCCC
CACCTGGTTCCTACCCGCCTCAGGGCTCCTACCCTCCTCCACAAGGTTACTACGGCAAGT
AAAGGAAATGCAGAAATTGGAGATATGTCTTTGTGACGAAATCGGTATATTGTGAACAAT
GTAAACATTAGGGTGGATATAGTGTTATTATAGGTGATGTCGATATATTAATCGATCTGT
GACTGGTCTGGGTGGTAAACTGCAAACATAATTTGGATTCCTCCGGGTGTGGTATATTGT
GAACCCGTTTCGTAGAAATTATCAGCTCCCCCGTGTTGATCATTCTTGAATAAAAAAAAA
AAAAAAAAAC

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_13428#2      ------------------------------------------------------------
consensus_13428#3      ------------------------------------------------------------
consensus_13428#0      ATTCCTCGAGCACTGTTGGCCTACTGGAAAGAGAAGGATAGTGGCTTGGTGCAAGTGCGA 60
consensus_13428#1      ----------------------TTCCTCGAGCACTGTTGGCCTACTGGGGTGCAAGTGCG 38
                                                                                   

consensus_13428#2      ------------------------------------ACGCCCTTATAATCCCCTCGTGCA 24
consensus_13428#3      ------------------------------------------------------------
consensus_13428#0      TCCCCCCCCCCCCCCCCCACATCTCCCGCAGAGTCCACGGCCGATCCATCCCCTCGTGCA 120
consensus_13428#1      ATCCCCCCCCCCCCCCCCACATCTCCCGCAGAGTCCACGGCCGATCCATCCCCTCGTGCA 98
                                                                                   

consensus_13428#2      GGCCGCCGGCGGCGGGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGCGATGGCGTCGTCGCAGGCCAACCT 84
consensus_13428#3      ------------------------------------------------------------
consensus_13428#0      GGCCGCCGGCGGCGGGGAGGAGGAGGAGGAG---GCGATGGCGTCGTCGCAGGCCAACCT 177
consensus_13428#1      GGCCGCCGGCGGCGGGGAGGAGGAGGAGGAG---GCGATGGCGTCGTCGCAGGCCAACCT 155
                                                                                   

consensus_13428#2      CGACAAGATGCAGCTCCGCCAGAGCTACCGCAACCTCTGGCACTCCGATCTCACCAACAC 144
consensus_13428#3      ------------------------------------------------------------
consensus_13428#0      CGACAAGATGCAGCTCCGCCAGAGCTACCGCAACCTCTGGCACTCCGATCTCACCAGCAC 237
consensus_13428#1      CGACAAGATGCAGCTCCGCCAGAGCTACCGCAACCTCTGGCACTCCGATCTCACCAGCAC 215
                                                                                   

consensus_13428#2      CATCCAGGCCGACTTCCCATATTGCTGCCTCGCGCTCTGGTGTGGACCATGTGTGTCATA 204
consensus_13428#3      ------------------------------------------------------------
consensus_13428#0      CATCCAGGCCGACTTCCCATATTGCTGCCTCGCGCTCTGGTGTGGACCATGTGTGTCATA 297
consensus_13428#1      CATCCAGGCCGACTTCCCATATTGCTGCCTCGCGCTCTGGTGTGGACCATGTGTGTCATA 275
                                                                                   

consensus_13428#2      CATGCTTCGCAAAAGGGCTCTGTATAATGACATGTCAAGATATGTCTGCTGTGCTGGGTA 264
consensus_13428#3      ------------------------------------------------------------
consensus_13428#0      CATGCTTCGCAAAAGGGCTCTGTATAATGACATGTCAAGATATGTCTGCTGTGCTGGGTA 357
consensus_13428#1      CATGCTTCGCAAAAGGGCTCTGTATAATGACATGTCAAGATATGTCTGCTGTGCTGGGTA 335
                                                                                   

consensus_13428#2      CATGCCATGCAGTGGGAAGTGTGGTGAAAGCCGATGCCCAGAGTTCTGTCTTGCTACTGA 324
consensus_13428#3      ------------------------------------------------------------
consensus_13428#0      CATGCCATGCAGTGGGAAGTGTGGTGAAAGCCGATGCCCAGAGTTCTGTCTTGCTACTGA 417
consensus_13428#1      CATGCCATGCAGTGGGAAGTGTGGTGAAAGCCGATGCCCAGAGTTCTGTCTTGCTACTGA 395
                                                                                   

consensus_13428#2      GGTGTTTCTGTGCTTTGGTAATTCAGTTGCTTCAACCCGCTTCTTGCTCCAAGATGAATT 384
consensus_13428#3      ------------------------------------------------------------
consensus_13428#0      GGTGTTTCTGTGCTTTGGTAATTCAGTTGCTTCAACCCGCTTCTTGCTCCAAGATGAATT 477
consensus_13428#1      GGTGTTTCTGTGCTTTGGTAATTCAGTTGCTTCAACCCGCTTCTTGCTCCAAGATGAATT 455
                                                                                   

consensus_13428#2      CAACATACAGACAACTAAATGCGATAACTGCATCATTGGCTTCATGTTCTGCCTCCAACA 444
consensus_13428#3      ------------------------------------------------------------
consensus_13428#0      CAACATACAGACAACTAAATGCGATAACTGCATCATTGGCTTCATGTTCTGCCTCCAACA 537
consensus_13428#1      CAACATACAGACAACTAAATGCGATAACTGCATCATTGGCTTCATGTTCTGCCTCCAACA 515
                                                                                   

consensus_13428#2      AATTGCTTGTATCTTCTCTATAGTTGCCGCTATTGTTGGTAGTGAAGAGCTTTCAGAGGC 504
consensus_13428#3      ------------------------------------------------------------
consensus_13428#0      AATTGCTTGTATCTTCTCTATAGTTGCCGCTATTGTTGGTAGTGAAGAGCTTTCAGAGGC 597
consensus_13428#1      AATTGCTTGTATCTTCTCTATAGTTGCCGCTATTGTTGGTAGTGAAGAGCTTTCAGAGGC 575
                                                                                   

consensus_13428#2      TTCCCAAATCCTTTCCTGCTTGTCTGATATGGTCTACTGCTCGGTTTGCGCCTGTATGCA 564
consensus_13428#3      ------------------------------------------------------------
consensus_13428#0      TTCCCAAATCCTTTCCTGCTTGTCTGATATGGTCTACTGCTCGGTTTGCGCCTGTATGCA 657
consensus_13428#1      TTCCCAAATCCTTTCCTGCTTGTCTGATATGGTCTACTGCTCGGTTTGCGCCTGTATGCA 635
                                                                                   

consensus_13428#2      GACCCAACACAAAATTGAAATGGACAAGAGAGATGGGAAGTTCGGCCCACAGCCCATGGC 624
consensus_13428#3      --------------------TGGACAAGAGAGATGGGAAGTTCGGCCCACAGCCCATGGC 40
consensus_13428#0      GACCCAACACAAAATTGAAATGGACAAGAGAGATGGGAAGTTCGGCCCACAGCCCATGGC 717
consensus_13428#1      GACCCAACACAAAATTGAAATGGACAAGAGAGATGGGAAGTTCGGCCCACAGCCCATGGC 695
                                           ****************************************

consensus_13428#2      AGTGCCTCCAATGCAGCAAATGTCGCGCATCGATCAGCCTATTCCACCTCCTGTTGGGTA 684
consensus_13428#3      AGTGCCTCCAATGCAGCAAATGTCGCGCATCGATCAGCCTATTCCACCTCCTGTTGGGTA 100
consensus_13428#0      AGTGCCTCCAATGCAGCAAATGTCGCGCATCGATCAGCCTATTCCACCTCCTGTTGGGTA 777
consensus_13428#1      AGTGCCTCCAATGCAGCAAATGTCGCGCATCGATCAGCCTATTCCACCTCCTGTTGGGTA 755
                       ************************************************************

consensus_13428#2      CACACCACAACAGCCAGCATACGGTCAGCCTTATGGTGGCTATCCTCCTGCTCCGCCTGC 744
consensus_13428#3      CACACCACAACAGCCAGCATACGGTCAGCCTTATGGTGGCTATCCTCCTGCTCCGCCTGC 160
consensus_13428#0      CACACCACAACAGCCAGCATACGGTCAGCCTTATGGTGGCTATCCTCCTGCTCCGCCTGC 837
consensus_13428#1      CACACCACAACAGCCAGCATACGGTCAGCCTTATGGTGGCTATCCTCCTGCTCCGCCTGC 815
                       ************************************************************

consensus_13428#2      TCAAGGTTATCCACCAGCTGCTTACCCTCCGGCAGGTTACCCCCAGGGTGGTGCATACCC 804
consensus_13428#3      TCAAGGTTATCCACCAGCTGCTTACCCTCCGGCAGGTTACCCCCAGGGTGGTGCATACCC 220
consensus_13428#0      TCAAGGTTATCCACCAGCTGCTTACCCTCCGGCAGGTTACCCCCAGGGTGGTGCATACCC 897
consensus_13428#1      TCAAGGTTATCCACCAGCTGCTTACCCTCCGGCAGGTTACCCCCAGGGTGGTGCATACCC 875
                       ************************************************************

consensus_13428#2      TCCCCCTGGCTCTTATCCCCCACCTGGTTCCTACCCGCCTCAGGGCTCCTACCCTCCTCC 864
consensus_13428#3      TCCCCCTGGCTCTTATCCCCCACCTGGTTCCTACCCGCCTCAGGGCTCCTACCCTCCTCC 280
consensus_13428#0      TCCCCCTGGCTCTTATCCCCCACCTGGTTCCTACCCGCCTCAGGGCTCCTACCCTCCTCC 957
consensus_13428#1      TCCTCCTGGCTCTTATCCCCCACCTGGTTCCTACCCGCCTCAGGGCTCCTACCCTCCTCC 935
                       *** ********************************************************

consensus_13428#2      ACAAGGTTACTACGGCAAGTAAAGGAAATGCAGAAATTGGAGATATGTCTTTGTGACGAA 924
consensus_13428#3      ACAAGGTTACTACGGCAAGTAAAGGAAATGCAGAAATTGGAGATATGTCTTTGTGACGAA 340
consensus_13428#0      ACAAGGTTACTACGGCAAGTAAAGGAAATGCAGAAATTGGAGATATGTCTTTGTGACGAA 1017
consensus_13428#1      ACAAGGTTACTACGGCAAGTAAAGGAAATGCAGAAATTGGAGATATGTCTTTGTGACGAA 995
                       ************************************************************

consensus_13428#2      ATCGGTATATTGTGAACAATGTAAACATTAGGGTGGTTGTAGTGTTATTATAGGTGATGT 984
consensus_13428#3      ATCGGTATATTGTGAACAATGTAAACATTAGGGTGGATATAGTGTTATTATAGGTGATGT 400
consensus_13428#0      ATCGGTATATTGTGAACAATGTAAACATTAGGGTGGTTGTAGTGTTATTATAGGTGATGT 1077
consensus_13428#1      ATCGGTATATTGTGAACAATGTAAACATTAGGGTGGTTGTAGTGTTATTATAGGTGATGT 1055
                       ************************************ * *********************

consensus_13428#2      CGATATATTAATCGATCTGTGACTGGTCTGGGTGGTAAACTGCAAACATAATTTGGATTC 1044
consensus_13428#3      CGATATATTAATCGATCTGTGACTGGTCTGGGTGGTAAACTGCAAACATAATTTGGATTC 460
consensus_13428#0      CGATATATTAATCGATCTGTGACTGGTCTGGGTGGTAAACTGCAAACATAATTTGGATTC 1137
consensus_13428#1      CGATATATTAATCGATCTGTGACTGGTCTGGGTGGTAAACTGCAAACATAATTTGGATTC 1115
                       ************************************************************

consensus_13428#2      CTCCGGGTGTGGTATACTGTGAACCCGTTTCGTAGAAATTATCAGCTCCCC-GTGTTGAT 1103
consensus_13428#3      CTCCGGGTGTGGTATATTGTGAACCCGTTTCGTAGAAATTATCAGCTCCCCCGTGTTGAT 520
consensus_13428#0      CTCCGGGTGTGGTATACTGTGAACCCGTTTCGTAGAAATTATCAGCTCCCC-GTGTTGAT 1196
consensus_13428#1      CTCCGGGTGTGGTATACTGTGAACCCGTTTCGTAGAAAAAAAAAAAAAAAA-AAAAAGGC 1174
                       **************** *********************  *  *             *  

consensus_13428#2      CATTCTTGAATACGTTCTTCTCTGAATAAAGGATCGCCATGAAATGTCAACTTAGATTTG 1163
consensus_13428#3      CATTCTTGAATAAAAAAA-----AAAAAAAAAAAC------------------------- 550
consensus_13428#0      CATTCTTGAATACGTTCTTCTCTGAATAAAGGATCGCCATGAAATGTCAACTTAAAAAAA 1256
consensus_13428#1      CACAT------------------------------------------------------- 1179
                       **                                                          

consensus_13428#2      GAACTTTTTATCAG---------------------------- 1177
consensus_13428#3      ------------------------------------------
consensus_13428#0      AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACAT 1298
consensus_13428#1      ------------------------------------------