These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_13571#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 13 consensus length = 633 fasta sequence [CTCTGCTTTTCTCGCCGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGGTTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAACGCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAATACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGATTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTG-AAGCGGTTAACCAGCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGTCGTTGCCGGTACAGTGGGATGCCTGCTGCGTCTTCCTTCCGGCACGATGCTCATCCCGATGCTGGCGGGCGCAGTGCTCCAGTCTGGTCAGCTCATCACCATCGAACTACCGGAATGGCTGCTGGCGATGGCGTATATGGCAATTGGCTGGCGGATTGGTCTTGGTTTCGATAAACAAATCTTACTGCGGGCACTACGCCCGCTACCGCAAAT] [+] EMBL CF338270 [CTCTGCTTTTCTCGCCGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGGTTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAACGCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAATACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGATTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTG AAGCGGTTAACCAGCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGTCGTTGCCGGTACAGTGGGATGCCTGCTGCGTCTTCCTTCCGGCACGATGCTCATCCCGATGCTGGCGGGCGCAGTGCTCCAGTCTGGTCAGCTCATCACCATCGAACTACCGGAATGGCTGCTGGCGATGGCGTATAT ] [+] EMBL CF338602 [CTCTGCTTTTCTCGCCGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGGTTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAACGCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAATACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGATTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTG AAGCGGTTAACCAGCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGTCGTTGCCGGTACAGTGGGATGCCTGCTGCGTCTTCCTTTCCGCACGATGCTCATCCCGATGCTGGCGGGCGCAGTGCTCCAGTCTGGTCAGCTCATCA ] [+] EMBL CF340075 [ CGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGGTTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAACGCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAATACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGATTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTG AAGCGGTTAACCAGCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGTCGTTGCCGGTACAGTGGGATGCCTGCTGCGTCTTCCTTCCGGCACGATGCTCATCCCGATGCTGGCGGGCGCAGTGCTCCAGTCTGGTCAGCTCATCACCATCGAACTACCGGAATGGCTGCTGGCGATGGCGTATATGGCAATTGGCTGGCGGATTGGTCTTGGTTTCGATAAACAAATCTTACTGCGGGCACTAC ] [+] EMBL CF340055 [ CGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGGTTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAACGCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAATACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGATTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTG AAGCGGTTAACCAGCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGTCGTTGCCGGTACAGTGGGATGCCTGCTGCGTCTTCCTTCCGGCACGATGCTCATCCCGATGCTGGCGGGCGCAGTGCTCCAGTCTGGTCAGCTCATCACCATCGAACTACCGGAATGGCTGCTGGCGATGGCGTATATGGCAATTGGCTGGCGGATTGG ] [+] EMBL CF340050 [ CGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGGTTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAACGCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAATACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGATTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTG AAGCGGTTAACCAGCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGTCGTTGCCGGTACAGTGGGATGCCTGCTGCGTCTTCCTTCCGGCACGATGCTCATCCCGATGCTGGCGGGCGCAGTGCTCCAGTCTGGTCAGCTCATCACCATCGAACTACCGGAATGGCTGCTGGCGATGGCGTATATGGCAATTGGCTGGCGGATTG ] [+] EMBL CF339560 [ CGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGGTTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAACGCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAATACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGATTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTG AAGCGGTTAACCAGCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGTCGTTGCCGGTACAGTGGGATGCCTGCTGCGTCTTCCTTCCGGCACGATGCTCATCCCGATGCTGGCGGGCGCAGTGCTCCAGTCTGGTCAGCTCATCACCATCGAACTACCGGAATGGCTGCTGGCGATGGCGTATATGGCAATTGGCTGGCGGA ] [+] EMBL CF340205 [ CGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGGTTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAACGCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAATACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGATTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTG AAGCGGTTAACCAGCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGTCGTTGCCGGTACAGTGGGATGCCTGCTGCGTCTTCCTTCCGGCACGATGCTCATCCCGATGCTGGCGGGCGCAGTGCTCCAGTCTGGTCAGCTCATCACCATCGAACTACCGGAATGGCTGCTGGCGATGGCGTATATGGCAATTGGCTGG ] [+] EMBL CF338460 [ CGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGGTTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAACGCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAATACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGATTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTG AAGCGGTTAACCAGCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGTCGTTGCCGGTACAGTGGGATGCCTGCTGCGTCTTCCTTCCGGCACGATGCTCATCCCGATGCTGGCGGGCGCAGTGCTCCAGTCTGGTCAGCTCATCACCATCGAACTACCGGAATGGCTGCTGGCGATGGCGTATAT ] [+] EMBL CF340467 [ CGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGGTTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAACGCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAATACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGATTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTG AAGCGGTTAACCAGCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGTCGTTGCCGGTACAGTGGGATGCCTGCTGCGTCTTCCTTCCGGCACGATGCTCATCCCGATGCTGGCGGGCGCAGTGCTCCAGTCTGGTCAGCTCATCACCATCGAACTACCGGAATGGCTGCTGGCGATGGCGTATATGGCAATTGGCTGGCGGATTGGTCTTGGTTTCGAT AACAAATCTTACTGCGGGCACTACGCCCGCTACCGCAAAT] [+] EMBL CF338383 [ 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CF338242 [ CGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGGTTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAACGCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAATACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGATTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTG AAGCGGTTAACCAGCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGTCGTTGCCGGTACAGTGGGATGC ] [-] EMBL CF305776 [ TTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||