cluster # 1474

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 1474 cluster # 1474 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1474#0 length = 2887 sequences # 2
consensusID : consensus_1474#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2887
fasta sequence
                              [AGGCCCCACCGCCACCGCCACCGCCCACGCCGCCGCTCCATGATCCGCCGCCGCGCGGCGGCGGTAGCGACACTACGCGCCTCCCTGCGCCGCACCCGCTCCCACGCCGCCGGCGACTCCGAGGACCCCCTGAAGGACTTTGGGTACAGGCCGTCTAAGGTGACCTACAATGCACTGGTCCAGGTGCTCTCGAGCGCGGGGCAGGTGGACTTGGGGTTCCGGGTTCAGAAGGAGATGTCCGAGTCGGGGTTCTGCATGGACCGGTTCACCGTTGGGTGCTTTGCGCACGCTCTGTGCAAAGAGGGGCGGTGGGCTGATGCACTAGACATGATAGAGAGGGAGGATTTCAAGCTTGATACAGTATTATGCACACATATGATCAGCGGGCTGATGGAGGCATCGTATTTTGACGAGGCCATGTCATTCCTCCATAGGATGCGATGCAACTCATGTATTCCAAATGTGGTCACATATAGGACGTTGCTCTCAGGATTTTTGAAAAAGAAACAGCTTGGCTGGTGCAAGAGGATCATTAATATGATGATGACTGAGGGCTGCAATCCAAATCCATCCTTGTTTAATTCCCTTGTGCATAGTTATTGCAATGAAAAGGATTATGCGTATGCCTATAAACTTTTAAATAGGATGACTACTTGTGGTTGCCCTCCTGGTTATGTTGTGTACAATATTTTTATTGGAAGTATATGTGGTCAGGAGAAATTACCAAGCCCTGATTTGCTGGATTTAGCTGAGAAAATTTATGGAGAGATGCTGGCTGCTAATTGTGTTCTTAATAAGGTTAACGTTGCCAATTTTGCTCGATGCCTTTGTGGTGTCGGGAAGTTTGACAAGGCATTTCAGCTCATAAAGGAGATGATGAGGAAAGGTTTTGTCCCTGATACAAGTACATACTCTAAGGTGATCACTTTTCTCTGCCATGCTACTAAGGTAGAGAAAGCTTTCCTTCTGTTCCAAGAGATGAAGATGGTCGGTGTAACTCCTGATGTGTATACATACACAATTTTGATTGACAGCTTTTGTAAAGCTGGACTCATTGAACAAGCCCAGTGGTTGTTTGAGGAGATGAGGAGTGTGGGTTGCTCCCCAACTGTGGTGACATATACTGCACTTATTCATGCTTACCTCAAAGCTAAGCAGGTACCTCAGGCTAATGATATTTTTCACCGAATGGTTGATGCTGGCTGTCGTCCAAATGATGTTACTTATGGTGCATTGGTAGATGGTCTCTGTAAAGCAGGCAACATCAGTAAGGCTTTTGAAGTCTATGCCAAATTAATTGGAACTTCTGATAGCGCCGATTCTGATTTTTACTTTCCATGTGAGGACAGACACACACTTGCTCCAAATGTTGTGACATATGGTGCACTAGTAGATGGTTTATGCAAAGCTCACAAAGTGGACCATGCTCATGAATTACTAGATGCTATGTTATCTTCTGGTTGCGAGCCCAATCACATTGTGTACGATGCTCTTATTGATGGCTTTTGCAAAGCTGGAAAAATTGACAGTGCTCAGGAGGTATTTCTGCAGATGACAAAGTGTGGGTACCTTCCCAGTGTACATACGTACACCTCGTTGATTGACAGGATGTTCAAGGATGGAAGACTTGATCTTGCAATGAAAGTTCTCTCTCAGATGTTAAAGGATTCTTGTACTCCTAATGTTGTTACGTACACAGCTATGATTGATGGTCTTTGTAGGATAGGTGAAAGTGAGAAGGCACTAAAGCTTCTGTCATTGATGGAAGAGAAAGGATGCAGTCCGAATGTTGTAACTTACACTGCTCTAATAGATGGATTAGGCAAAGCTGGCAAGATTGATCTGAGTCTTGACCTTTTTACACAAATGAGCAGAAAAGGATGTTCTCCCAATTATGTTACGTACAGAGTTCTGATAAACCACTTGTGTGCTGCTGGCCTTTTGGATAAGGCTCGTTTACTGCTTGGTGAAATGAAGCAGACTTACTGGCCAAAGTACTTACAAGGATACCGTTGTGCAATTCAAGGTTTCAGCAAGAGCTTTATCGCTTCTCTGGGTATTCTGGAGGAGATGGAATCATATGGCACAGTACCAATTGCACCTGTTTATGGAATGCTGATCGATTGTTTCTCCAAAGCTGGCAGGCTGGAGATAGCTATGGAGTTGCACAAAGAGATGATGGAAGTTCCGTCATCTGTAAAAACTGACAATGACATGTACGCTTCATTGATCCAGGCACTTTGTTTAGCATCTCAAGTTGAGGAAGCATTTCGATTGTATAGTGAAATGACAAGGAGAGGCTTTGTACCTGAGTTAAGTGTCTTTGTTTGCCTCATAAAGGGATTAGTTGAAGTAAAAAAGTGGGACGAAGCCCTCCAGTTGTGCTATGGCATATGTCATGAGGGTGTGAACTGGCAGGGTAACAAATCTTTTCATGGAGGCTAGAGCTGTTTTGTCTTACTGCATCATAAATCATGCAAATGACAACACTTCCACCTAAGGAGTCATGTTCTTGTATCTCAAGATTGTTGCGAGATGTGGTGACTCAGAGACCTAAAGTGCAATTCATGATGACTCAAGAAAAATAACTCGGAGGCCATGGAATAACACTACAGAATGAACAATCCTGCATGAAAAGATGTACCATGGATAGCTGATTCATCTTCAGATGGGCAAAGCCACAAAGGAATCTCGCTATGGTTATCAAGTTCAACATTTGTATATAAGGCAACGATGGTTATACAAAAGGCATTTGACTGAAAATAATCTCAAAGTTTCATAGTTCCTTTATTCATCAAATTAACTGATATTTTCACCCTTCTATTTCCTTAAATTTCTTCTTCAGTGATAGAGTAATGGAGATATACTATCAGCCTTTTTGTTCGTT]

[+] EMBL AK069116             [AGGCCCCACCGCCACCGCCACCGCCCACGCCGCCGCTCCATGATCCGCCGCCGCGCGGCGGCGGTAGCGACACTACGCGCCTCCCTGCGCCGCACCCGCTCCCACGCCGCCGGCGACTCCGAGGACCCCCTGAAGGACTTTGGGTACAGGCCGTCTAAGGTGACCTACAATGCACTGGTCCAGGTGCTCTCGAGCGCGGGGCAGGTGGACTTGGGGTTCCGGGTTCAGAAGGAGATGTCCGAGTCGGGGTTCTGCATGGACCGGTTCACCGTTGGGTGCTTTGCGCACGCTCTGTGCAAAGAGGGGCGGTGGGCTGATGCACTAGACATGATAGAGAGGGAGGATTTCAAGCTTGATACAGTATTATGCACACATATGATCAGCGGGCTGATGGAGGCATCGTATTTTGACGAGGCCATGTCATTCCTCCATAGGATGCGATGCAACTCATGTATTCCAAATGTGGTCACATATAGGACGTTGCTCTCAGGATTTTTGAAAAAGAAACAGCTTGGCTGGTGCAAGAGGATCATTAATATGATGATGACTGAGGGCTGCAATCCAAATCCATCCTTGTTTAATTCCCTTGTGCATAGTTATTGCAATGAAAAGGATTATGCGTATGCCTATAAACTTTTAAATAGGATGACTACTTGTGGTTGCCCTCCTGGTTATGTTGTGTACAATATTTTTATTGGAAGTATATGTGGTCAGGAGAAATTACCAAGCCCTGATTTGCTGGATTTAGCTGAGAAAATTTATGGAGAGATGCTGGCTGCTAATTGTGTTCTTAATAAGGTTAACGTTGCCAATTTTGCTCGATGCCTTTGTGGTGTCGGGAAGTTTGACAAGGCATTTCAGCTCATAAAGGAGATGATGAGGAAAGGTTTTGTCCCTGATACAAGTACATACTCTAAGGTGATCACTTTTCTCTGCCATGCTACTAAGGTAGAGAAAGCTTTCCTTCTGTTCCAAGAGATGAAGATGGTCGGTGTAACTCCTGATGTGTATACATACACAATTTTGATTGACAGCTTTTGTAAAGCTGGACTCATTGAACAAGCCCAGTGGTTGTTTGAGGAGATGAGGAGTGTGGGTTGCTCCCCAACTGTGGTGACATATACTGCACTTATTCATGCTTACCTCAAAGCTAAGCAGGTACCTCAGGCTAATGATATTTTTCACCGAATGGTTGATGCTGGCTGTCGTCCAAATGATGTTACTTATGGTGCATTGGTAGATGGTCTCTGTAAAGCAGGCAACATCAGTAAGGCTTTTGAAGTCTATGCCAAATTAATTGGAACTTCTGATAGCGCCGATTCTGATTTTTACTTTCCATGTGAGGACAGACACACACTTGCTCCAAATGTTGTGACATATGGTGCACTAGTAGATGGTTTATGCAAAGCTCACAAAGTGGACCATGCTCATGAATTACTAGATGCTATGTTATCTTCTGGTTGCGAGCCCAATCACATTGTGTACGATGCTCTTATTGATGGCTTTTGCAAAGCTGGAAAAATTGACAGTGCTCAGGAGGTATTTCTGCAGATGACAAAGTGTGGGTACCTTCCCAGTGTACATACGTACACCTCGTTGATTGACAGGATGTTCAAGGATGGAAGACTTGATCTTGCAATGAAAGTTCTCTCTCAGATGTTAAAGGATTCTTGTACTCCTAATGTTGTTACGTACACAGCTATGATTGATGGTCTTTGTAGGATAGGTGAAAGTGAGAAGGCACTAAAGCTTCTGTCATTGATGGAAGAGAAAGGATGCAGTCCGAATGTTGTAACTTACACTGCTCTAATAGATGGATTAGGCAAAGCTGGCAAGATTGATCTGAGTCTTGACCTTTTTACACAAATGAGCAGAAAAGGATGTTCTCCCAATTATGTTACGTACAGAGTTCTGATAAACCACTTGTGTGCTGCTGGCCTTTTGGATAAGGCTCGTTTACTGCTTGGTGAAATGAAGCAGACTTACTGGCCAAAGTACTTACAAGGATACCGTTGTGCAATTCAAGGTTTCAGCAAGAGCTTTATCGCTTCTCTGGGTATTCTGGAGGAGATGGAATCATATGGCACAGTACCAATTGCACCTGTTTATGGAATGCTGATCGATTGTTTCTCCAAAGCTGGCAGGCTGGAGATAGCTATGGAGTTGCACAAAGAGATGATGGAAGTTCCGTCATCTGTAAAAACTGACAATGACATGTACGCTTCATTGATCCAGGCACTTTGTTTAGCATCTCAAGTTGAGGAAGCATTTCGATTGTATAGTGAAATGACAAGGAGAGGCTTTGTACCTGAGTTAAGTGTCTTTGTTTGCCTCATAAAGGGATTAGTTGAAGTAAAAAAGTGGGACGAAGCCCTCCAGTTGTGCTATGGCATATGTCATGAGGGTGTGAACTGGCAGGGTAACAAATCTTTTCATGGAGGCTAGAGCTGTTTTGTCTTACTGCATCATAAATCATGCAAATGACAACACTTCCACCTAAGGAGTCATGTTCTTGTATCTCAAGATTGTTGCGAGATGTGGTGACTCAGAGACCTAAAGTGCAATTCATGATGACTCAAGAAAAATAACTCGGAGGCCATGGAATAACACTACAGAATGAACAATCCTGCATGAAAAGATGTACCATGGATAGCTGATTCATCTTCAGATGGGCAAAGCCACAAAGGAATCTCGCTATGGTTATCAAGTTCAACATTTGTATATAAGGCAACGATGGTTATACAAAAGG                                                                                                                                          ]
[-] EMBL BG101703             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCCTTTCATGGAGGCTAGAGCTGTTTTGTCTTACTGCATCATAAATCATGCAAATGACAACACTTCCACCTAAGGAGTCATGTTCTTGTATCTCAAGATTGTTGCGAGATGTGGTGACTCAGAGACCTAAAGTGCAATTCATGATGACTCAAGAAAAATAACTCGGAGGCCATGGAATAACACTACAGAATGAACAATCCTGCATGAAAAGATGTACCATGGATAGCTGATTCATCTTCAGATGGGCAAAGCCACAAAGGAATCTCGCTATGGTTATCAAGTTCAACATTTGTATATAAGGCAACGATGGTTATACAAAAGGCATTTGACTGAAAATAATCTCAAAGTTTCATAGTTCCTTTATTCATCAAATTAACTGATATTTTCACCCTTCTATTTCCTTAAATTTCTTCTTCAGTGATAGAGTAATGGAGATATACTATCAGCCTTTTTGTTCGTT]




>consensus_1474#0
AGGCCCCACCGCCACCGCCACCGCCCACGCCGCCGCTCCATGATCCGCCGCCGCGCGGCG
GCGGTAGCGACACTACGCGCCTCCCTGCGCCGCACCCGCTCCCACGCCGCCGGCGACTCC
GAGGACCCCCTGAAGGACTTTGGGTACAGGCCGTCTAAGGTGACCTACAATGCACTGGTC
CAGGTGCTCTCGAGCGCGGGGCAGGTGGACTTGGGGTTCCGGGTTCAGAAGGAGATGTCC
GAGTCGGGGTTCTGCATGGACCGGTTCACCGTTGGGTGCTTTGCGCACGCTCTGTGCAAA
GAGGGGCGGTGGGCTGATGCACTAGACATGATAGAGAGGGAGGATTTCAAGCTTGATACA
GTATTATGCACACATATGATCAGCGGGCTGATGGAGGCATCGTATTTTGACGAGGCCATG
TCATTCCTCCATAGGATGCGATGCAACTCATGTATTCCAAATGTGGTCACATATAGGACG
TTGCTCTCAGGATTTTTGAAAAAGAAACAGCTTGGCTGGTGCAAGAGGATCATTAATATG
ATGATGACTGAGGGCTGCAATCCAAATCCATCCTTGTTTAATTCCCTTGTGCATAGTTAT
TGCAATGAAAAGGATTATGCGTATGCCTATAAACTTTTAAATAGGATGACTACTTGTGGT
TGCCCTCCTGGTTATGTTGTGTACAATATTTTTATTGGAAGTATATGTGGTCAGGAGAAA
TTACCAAGCCCTGATTTGCTGGATTTAGCTGAGAAAATTTATGGAGAGATGCTGGCTGCT
AATTGTGTTCTTAATAAGGTTAACGTTGCCAATTTTGCTCGATGCCTTTGTGGTGTCGGG
AAGTTTGACAAGGCATTTCAGCTCATAAAGGAGATGATGAGGAAAGGTTTTGTCCCTGAT
ACAAGTACATACTCTAAGGTGATCACTTTTCTCTGCCATGCTACTAAGGTAGAGAAAGCT
TTCCTTCTGTTCCAAGAGATGAAGATGGTCGGTGTAACTCCTGATGTGTATACATACACA
ATTTTGATTGACAGCTTTTGTAAAGCTGGACTCATTGAACAAGCCCAGTGGTTGTTTGAG
GAGATGAGGAGTGTGGGTTGCTCCCCAACTGTGGTGACATATACTGCACTTATTCATGCT
TACCTCAAAGCTAAGCAGGTACCTCAGGCTAATGATATTTTTCACCGAATGGTTGATGCT
GGCTGTCGTCCAAATGATGTTACTTATGGTGCATTGGTAGATGGTCTCTGTAAAGCAGGC
AACATCAGTAAGGCTTTTGAAGTCTATGCCAAATTAATTGGAACTTCTGATAGCGCCGAT
TCTGATTTTTACTTTCCATGTGAGGACAGACACACACTTGCTCCAAATGTTGTGACATAT
GGTGCACTAGTAGATGGTTTATGCAAAGCTCACAAAGTGGACCATGCTCATGAATTACTA
GATGCTATGTTATCTTCTGGTTGCGAGCCCAATCACATTGTGTACGATGCTCTTATTGAT
GGCTTTTGCAAAGCTGGAAAAATTGACAGTGCTCAGGAGGTATTTCTGCAGATGACAAAG
TGTGGGTACCTTCCCAGTGTACATACGTACACCTCGTTGATTGACAGGATGTTCAAGGAT
GGAAGACTTGATCTTGCAATGAAAGTTCTCTCTCAGATGTTAAAGGATTCTTGTACTCCT
AATGTTGTTACGTACACAGCTATGATTGATGGTCTTTGTAGGATAGGTGAAAGTGAGAAG
GCACTAAAGCTTCTGTCATTGATGGAAGAGAAAGGATGCAGTCCGAATGTTGTAACTTAC
ACTGCTCTAATAGATGGATTAGGCAAAGCTGGCAAGATTGATCTGAGTCTTGACCTTTTT
ACACAAATGAGCAGAAAAGGATGTTCTCCCAATTATGTTACGTACAGAGTTCTGATAAAC
CACTTGTGTGCTGCTGGCCTTTTGGATAAGGCTCGTTTACTGCTTGGTGAAATGAAGCAG
ACTTACTGGCCAAAGTACTTACAAGGATACCGTTGTGCAATTCAAGGTTTCAGCAAGAGC
TTTATCGCTTCTCTGGGTATTCTGGAGGAGATGGAATCATATGGCACAGTACCAATTGCA
CCTGTTTATGGAATGCTGATCGATTGTTTCTCCAAAGCTGGCAGGCTGGAGATAGCTATG
GAGTTGCACAAAGAGATGATGGAAGTTCCGTCATCTGTAAAAACTGACAATGACATGTAC
GCTTCATTGATCCAGGCACTTTGTTTAGCATCTCAAGTTGAGGAAGCATTTCGATTGTAT
AGTGAAATGACAAGGAGAGGCTTTGTACCTGAGTTAAGTGTCTTTGTTTGCCTCATAAAG
GGATTAGTTGAAGTAAAAAAGTGGGACGAAGCCCTCCAGTTGTGCTATGGCATATGTCAT
GAGGGTGTGAACTGGCAGGGTAACAAATCTTTTCATGGAGGCTAGAGCTGTTTTGTCTTA
CTGCATCATAAATCATGCAAATGACAACACTTCCACCTAAGGAGTCATGTTCTTGTATCT
CAAGATTGTTGCGAGATGTGGTGACTCAGAGACCTAAAGTGCAATTCATGATGACTCAAG
AAAAATAACTCGGAGGCCATGGAATAACACTACAGAATGAACAATCCTGCATGAAAAGAT
GTACCATGGATAGCTGATTCATCTTCAGATGGGCAAAGCCACAAAGGAATCTCGCTATGG
TTATCAAGTTCAACATTTGTATATAAGGCAACGATGGTTATACAAAAGGCATTTGACTGA
AAATAATCTCAAAGTTTCATAGTTCCTTTATTCATCAAATTAACTGATATTTTCACCCTT
CTATTTCCTTAAATTTCTTCTTCAGTGATAGAGTAATGGAGATATACTATCAGCCTTTTT
GTTCGTT
clustalw multiple alignements is not computed in this case