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Oryza sativa
cluster # 1517 cluster # 1517       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1517#0 length = 2981 sequences # 2  

consensusID : consensus_1517#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2981
fasta sequence
                              [AAGGAAAATATTAAAGAAATTGCTTCTCTCTCGCGCATGCGCCCTGGGCGTTGGCCGGCCGGCCGCCGGCGAGGTGTCGTCGGCGCCGGGCCCGCCGGCCGCCGCGCTAGCCGGAGACACTACTAGTAGTCAGTAGCCCGCCGCCGCTGTATTCCCTACTGGCGTGTCGTCGTCTGAGTCCCAATTCCCAACAGCAACGGCTGCACGCACCCAAGGTGTTCGAGGGATTGCCACGCCGGTGGCCGGCCCAAGTCTCCGGGAAATCTCCGTCCTTCTCCGGGGGGCCTCGCCGGTAAGCCGCGGCATAGCAGCGGAAAGCTCGATCGAATGGCCCAGGCGCTGCAGATACTGTGCTGGGTTCAGAGGCAGCATACGCTCGCCATGGCTGCTCATTGGCTGTCCGGACCTTGAAGCCATAGAAAGATCTGCTTGCTGTAGGCTGCACAAGGTGGCGCGGATGAATGTATGCATGATCGCCTCTTCATCCAATCTGAGCATCAGGTATGGATTTCAAATTATCCACCGGACTTGGGTGCAGGATTTTGCGTTTTGTGTTTTCCTCGCTTCTTGGGTTTCTCCGATATCTGATGGAGAATATCAGGCAGCTGCTGATATAAAAGACTCAGGTAGTGAGTACTCAGTTTGAGCGGAACCTCACTTTCAACCTGATATAAAAAAGACAGTCAAAATTTTGGCAGTAGCTAGACAAAACATTTTTTTTTAGAGGCAGATCAACATTACTATTGACCCGGCTTTTGGGAGAAAGCCAAATGTGAAATCAGGAACCAGACAGAACATATAGTTTTGAGTTCCGTAAATATTATTGTCAAATATTTAGAAACGGAAGGAGTATATGATTTTGGACTCTCAGAAGAATAAATTCCTAACGAACTTTTGTTGGCACAAGAATTCAAAATAGATAGTGCTAATAGGCTAATAGCCTAGTCCGCGTAGTAAGATAACATTTCAGTGGAAAAGGTCCCAAAAAAATCCTTTTGAACTTTCTAAGCAGATTTAACATGGTACTATTGCACTATACCTGTATCATCCACAGATTTAGCCACTGTTAGTTGGTTGGTGCTCCACTGAACTTCAGTGACTGAACCACTGGTGCACTGTACAGTGTACACCACACAGTAGTGTCTCTGCAGTTACAGTGCAGCTGCAACCAGGTTTAGCCAACAAAAGAAGTACTCCCTTCGTTCTAAAATATAGCAATATAGTATAGAATTGGATATACCTAGCACTTTCTAAAATATAGCAATATAGTATAGAATTGGATATACCCTAGCACTATGATTCATGGATGGAGGAGTGGTATTCAGATGGAATAAGTTGTCTCAAGAAAGTTTTATCTGTTTGTTTGGGAGAGCAAATTAGTACATTTTTATGTCGCATCAGAAAGATTGTGGCGAACAAATGCAAAATCGTCAGGAGCTGTCACTTTTATGATAATGCACTACTGTGCTGCACAATCCATGCATATAAGAGACAGATTATTCGCCTGAATTTAATAGCATCTGTCGTTTCATTTTGAAAGGGTAGGCACACCTGCAGATTGGGCTGTGATGCCAGGCTTGCCAGCTATATAGCTCACTAAAGAGAGAATTGTGATCAAGCCTAGCCAGCTATTAGGGAGTTAGTTAAGTATAATTGCATCAGGAGAGACGCGTACGCTTAAGATTATGATATATTGAGCTTTCAGGGTTATCATATCATGTGCAGGCTTAATTGTGGACGGACATATCATTCACAGACAAATCGGGATCACTCATGTATTAGGTTTAATTAGGGTGCATCACCTGCAGACAAGGACTGCATAATGCTAGAATTTCGGATGTAAAAAGTATTTAATGGAAAAAAGATTTATACGTAGTCAAATTACAACTCTTCCCATGTAGAGAGCACACTAGTGAAAGGTGAGAGGTGAAAATAAGTTTTAAATAAATTTCTGCCTCAATTAGTTTATGAGTAGCTAGGCTAGCTTATAATGAAATATCTTTTTATTCCTGCTTGCTATCGCTTTATTACCACTAGTATATTATGATGAAATATATTTTTTATTCCTGCTTGCTACTTCTTTATTACCACTAGTATAAGGTGATAAGAATAATTTGAATGTGCTTATTGGCTCAACGAGTGACATTGATTTGTCTCCTCTTTATGGCCTGATCGCATCGTCTTAGCATCGTAGCAAGGGGAGAAGTAGTGGCATTGATCATTAAAGTGATGGTAAAATATATTTGTTTCTTTCTGGAATCATTTGCTTTGCACATTTGATAAGTTGCCAATTTGATGAAGCATATCATTTATAGATTTAACATGCCGGTCAGTAACTTGTAATGTTTCTGTTCCATTTAAACGCATCATGTGTGCATATATATTTATAGAAATTCTCCAGCTTGCTTAATTATGTCAGAATACGTTATATTTACAACCAATTATTGACCATGTTGGTTTGCGCATCTTAGTTATACAGAGGTGAAGTGTTCTCAATAAACGCATCATGTGTGCATATATACTTATAGAAATTCTCCAGCTTGCTTAATTATGTCAGAATACGTTATATTTGCAACCAATTATTGACCATGTTGGTTTGCGCATCTTAGTTATACAGAGGTGAAGTGTTCTCAATATGATTCTATCACCTTTATGTAATCGTCTAAGATCAATAAAAACTTTCTTTATCTTGAAAAAAAATATTTCACCATGGGAGCAAATTAAGTACAAAAGTATATAGCAATTTCAAATTTCAGGTCTCAAAGAACGCTATCCTAGAGTTTGTATGCTAGGTGAACCCCACAAAAACAGGGGAATATTGTAGGTGATGGACAGTTGGTGGTCTCCGGCCCTTACATTGTCGAGTTCATGAGACCTAACATAACAAAGGCAGATGGTCACGAAGAATCAATACCTGTGGAAATGCAATGTATGTTTATACGAAACTTGTTAAAACTTTTCTGTGATGTTGTATACCATCG]

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>consensus_1517#0 AAGGAAAATATTAAAGAAATTGCTTCTCTCTCGCGCATGCGCCCTGGGCGTTGGCCGGCC GGCCGCCGGCGAGGTGTCGTCGGCGCCGGGCCCGCCGGCCGCCGCGCTAGCCGGAGACAC TACTAGTAGTCAGTAGCCCGCCGCCGCTGTATTCCCTACTGGCGTGTCGTCGTCTGAGTC CCAATTCCCAACAGCAACGGCTGCACGCACCCAAGGTGTTCGAGGGATTGCCACGCCGGT GGCCGGCCCAAGTCTCCGGGAAATCTCCGTCCTTCTCCGGGGGGCCTCGCCGGTAAGCCG CGGCATAGCAGCGGAAAGCTCGATCGAATGGCCCAGGCGCTGCAGATACTGTGCTGGGTT CAGAGGCAGCATACGCTCGCCATGGCTGCTCATTGGCTGTCCGGACCTTGAAGCCATAGA AAGATCTGCTTGCTGTAGGCTGCACAAGGTGGCGCGGATGAATGTATGCATGATCGCCTC TTCATCCAATCTGAGCATCAGGTATGGATTTCAAATTATCCACCGGACTTGGGTGCAGGA TTTTGCGTTTTGTGTTTTCCTCGCTTCTTGGGTTTCTCCGATATCTGATGGAGAATATCA GGCAGCTGCTGATATAAAAGACTCAGGTAGTGAGTACTCAGTTTGAGCGGAACCTCACTT TCAACCTGATATAAAAAAGACAGTCAAAATTTTGGCAGTAGCTAGACAAAACATTTTTTT TTAGAGGCAGATCAACATTACTATTGACCCGGCTTTTGGGAGAAAGCCAAATGTGAAATC AGGAACCAGACAGAACATATAGTTTTGAGTTCCGTAAATATTATTGTCAAATATTTAGAA ACGGAAGGAGTATATGATTTTGGACTCTCAGAAGAATAAATTCCTAACGAACTTTTGTTG GCACAAGAATTCAAAATAGATAGTGCTAATAGGCTAATAGCCTAGTCCGCGTAGTAAGAT AACATTTCAGTGGAAAAGGTCCCAAAAAAATCCTTTTGAACTTTCTAAGCAGATTTAACA TGGTACTATTGCACTATACCTGTATCATCCACAGATTTAGCCACTGTTAGTTGGTTGGTG CTCCACTGAACTTCAGTGACTGAACCACTGGTGCACTGTACAGTGTACACCACACAGTAG TGTCTCTGCAGTTACAGTGCAGCTGCAACCAGGTTTAGCCAACAAAAGAAGTACTCCCTT CGTTCTAAAATATAGCAATATAGTATAGAATTGGATATACCTAGCACTTTCTAAAATATA GCAATATAGTATAGAATTGGATATACCCTAGCACTATGATTCATGGATGGAGGAGTGGTA TTCAGATGGAATAAGTTGTCTCAAGAAAGTTTTATCTGTTTGTTTGGGAGAGCAAATTAG TACATTTTTATGTCGCATCAGAAAGATTGTGGCGAACAAATGCAAAATCGTCAGGAGCTG TCACTTTTATGATAATGCACTACTGTGCTGCACAATCCATGCATATAAGAGACAGATTAT TCGCCTGAATTTAATAGCATCTGTCGTTTCATTTTGAAAGGGTAGGCACACCTGCAGATT GGGCTGTGATGCCAGGCTTGCCAGCTATATAGCTCACTAAAGAGAGAATTGTGATCAAGC CTAGCCAGCTATTAGGGAGTTAGTTAAGTATAATTGCATCAGGAGAGACGCGTACGCTTA AGATTATGATATATTGAGCTTTCAGGGTTATCATATCATGTGCAGGCTTAATTGTGGACG GACATATCATTCACAGACAAATCGGGATCACTCATGTATTAGGTTTAATTAGGGTGCATC ACCTGCAGACAAGGACTGCATAATGCTAGAATTTCGGATGTAAAAAGTATTTAATGGAAA AAAGATTTATACGTAGTCAAATTACAACTCTTCCCATGTAGAGAGCACACTAGTGAAAGG TGAGAGGTGAAAATAAGTTTTAAATAAATTTCTGCCTCAATTAGTTTATGAGTAGCTAGG CTAGCTTATAATGAAATATCTTTTTATTCCTGCTTGCTATCGCTTTATTACCACTAGTAT ATTATGATGAAATATATTTTTTATTCCTGCTTGCTACTTCTTTATTACCACTAGTATAAG GTGATAAGAATAATTTGAATGTGCTTATTGGCTCAACGAGTGACATTGATTTGTCTCCTC TTTATGGCCTGATCGCATCGTCTTAGCATCGTAGCAAGGGGAGAAGTAGTGGCATTGATC ATTAAAGTGATGGTAAAATATATTTGTTTCTTTCTGGAATCATTTGCTTTGCACATTTGA TAAGTTGCCAATTTGATGAAGCATATCATTTATAGATTTAACATGCCGGTCAGTAACTTG TAATGTTTCTGTTCCATTTAAACGCATCATGTGTGCATATATATTTATAGAAATTCTCCA GCTTGCTTAATTATGTCAGAATACGTTATATTTACAACCAATTATTGACCATGTTGGTTT GCGCATCTTAGTTATACAGAGGTGAAGTGTTCTCAATAAACGCATCATGTGTGCATATAT ACTTATAGAAATTCTCCAGCTTGCTTAATTATGTCAGAATACGTTATATTTGCAACCAAT TATTGACCATGTTGGTTTGCGCATCTTAGTTATACAGAGGTGAAGTGTTCTCAATATGAT TCTATCACCTTTATGTAATCGTCTAAGATCAATAAAAACTTTCTTTATCTTGAAAAAAAA TATTTCACCATGGGAGCAAATTAAGTACAAAAGTATATAGCAATTTCAAATTTCAGGTCT CAAAGAACGCTATCCTAGAGTTTGTATGCTAGGTGAACCCCACAAAAACAGGGGAATATT GTAGGTGATGGACAGTTGGTGGTCTCCGGCCCTTACATTGTCGAGTTCATGAGACCTAAC ATAACAAAGGCAGATGGTCACGAAGAATCAATACCTGTGGAAATGCAATGTATGTTTATA CGAAACTTGTTAAAACTTTTCTGTGATGTTGTATACCATCG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)