cluster # 1570

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 1570 cluster # 1570 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1570#0 length = 806 sequences # 2

consensusID : consensus_1570#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 806
fasta sequence

                              [CTACACACCNAAAATNNGTTGGAAATNGTGTGGAAGCCCCTGTTTCCGGCTCAATAGCGACTTCTGGAGCGTGTCCTGTTGGATGCCTATTCCTATGACCATTTCAAACCGTGGCCACGGCCGTGTATAAGGCCTTTGAAGGCCCACCCACGTTTGTGGTCNTAATTGTGCGTAGCCTCGCGATGACAANGCCCACAGATACATATTACACNTAGGTGCNTACACCACGTTTGGTGTNCTNGGACAGGGCTGTATCCTTNCGTCTCACATCGGCCCACGCTGGCCCCACATGTGTGTGTGTNTGTCCACTGTTGTGCTGTGTGATTGGGATGGCCGTGGAAAACCTGATTGTCTNTGTGAAGACTGGTGAAGATTNACTGACTTGGAGTGTGATGGGGGACAGGNGAGTGAGAGAGGTGTGGCCACACTGTGGACCCCCTGCGAGGGCGCGGGTGTGTCTCTCTTCTCCGCACGCCACGGANNAAAATCTGAATGATGGGGAGGTGTGTGCTGTGTGTGGTGAGTGTTGCACCTATGTGTGAAAAAGCACCACTGTGATGCACCTGTGGTGATGGGGAGGGGTGATACACACCTGTTGACCTTGATGGCACAGGCCCGTGGTGTGTGTGNCTGTGTGCTGTGTGAAGCCAAATTGGATGAGTGTTTTGATGCTTGGTGTGTTGCTATGAGCGTGCTGAATATTGGCCCATGGCTCACCATTGTGCGAACTGGCCATTCTGAGAATGGTGAGCTGGGATGGATGTGGAACCTGTGTAAGGCATTTGGCGAACTNGCCAAAAAAAAAA]

[+] EMBL BI805510             [CTACACACCNAAAATNNGTTGGAAATNGTGTGGAAGCCCCTGTTTCCGGCTCAATAGCGACTTCTGGAGCGTGTCCTGTTGGATGCCTATTCCTATGACCATTTCAAACCGTGGCCACGGCCGTGTATAAGGCCTTTGAAGGCCCACCCACGTTTGTGGTCNTAATTGTGCGTAGCCTCGCGATGACAANGCCCACAGATACATATTACACNTAGGTGCNTACACCACGTTTGGTGTNCTNGGACAGGGCTGTATCCTTNCGTCTCACATCGGCCCACGCTGGCCCCACATGTGTGTGTGTNTGTCCACTGTTGTGCTGTGTGATTGGGATGGCCGTGGAAAACCTGATTGTCTNTGTGAAGACTGGTGAAGATTNACTGACTTGGAGTGTGATGGGGGACAGGNGAGTGAGAGAGGTGTGGCCACACTGTGGACCCCCTGCGAGGGCGCGGGTGTGTCTCTCTTCTCCGCACGCCACGGANNAAAATCTGAATGATGGGGAGGTGTGTGCTGTGTGTGGTGAGTGTTGCACCTATGTGTGAAAAAGCACCACTGTGATGCACCTGTGGTGATGGGGAGGGGTGATACACACCTGTTGACCTTGATGGCACAGGCCCGTGGTGTGTGTGNCTGTGTGCTGTGTGAAGCCAAATTGGATGAGTGTTTTGATGCTTGGTGTGTTGCTATGAGCGTGCTGAATATTGGCCCATGGCTCACCATTGTGCGAACTGGCCATTCTGAGAATGGTGAGCTGGGATGGATGTGGAACCTGTGTAAGGCATTTGGCGAACTNGCCAAAAAAAAAA]
[+] EMBL BI805511             [                                                                                 GATGCCTATTCCTATGACCATTTCAAACCGTGGCCACGGCCGTGTATAAGGCCTTTGAAGGCCCACCCACGTTTGTGGTCNTAATTGTGCGTAGCCTCGCGATGACAANGCCCACAGATACATATTACACNTAGGTGCNTACACCACGTTTGGTGTNCTNGGACAGGGCTGTATCCTTNCGTCTCACATCGGCCCACGCTGGCCCCACATGTGTGTGTGTNTGTCCACTGTTGTGCTGTGTGATTGGGATGGCCGTGGAAAACCTGATTGTCTNTGTGAAGACTGGTGAAGATTNACTGACTTGGAGTGTGATGGGGGACAGGNGAGTGAGAGAGGTGTGGCCACACTGTGGACCCCCTGCGAGGGCGCGGGTGTGTCTCTCTTCTCCGCACGCCACGGANNAAAATCTGAATGATGGGGAGGTGTGTGCTGTGTGTGGTGAGTGTTGCACCTATGTGTGAAAAAGCACCACTGTGATGCACCTGTGGTGATGGGGAGGGGTGATACACACCTGTTGACCTTGATGGCACAGGCCCGTGGTGTGTGTGNCTGTGTGCTGTGTGAAGCCAAATTGGATGAGTGTTTTGATGCTTGGTGTGTTGCTATGAGCGTGCTGAATATTGGCCCATGGCTCACCATTGTGCGAACTGGCCATTCTGAGAATGGTGAGCTGGGATGGATGTGGAACCTGTGTAAGGCATTTGGCGAACTNGCCAAAAAAAAAA]




>consensus_1570#0
CTACACACCNAAAATNNGTTGGAAATNGTGTGGAAGCCCCTGTTTCCGGCTCAATAGCGA
CTTCTGGAGCGTGTCCTGTTGGATGCCTATTCCTATGACCATTTCAAACCGTGGCCACGG
CCGTGTATAAGGCCTTTGAAGGCCCACCCACGTTTGTGGTCNTAATTGTGCGTAGCCTCG
CGATGACAANGCCCACAGATACATATTACACNTAGGTGCNTACACCACGTTTGGTGTNCT
NGGACAGGGCTGTATCCTTNCGTCTCACATCGGCCCACGCTGGCCCCACATGTGTGTGTG
TNTGTCCACTGTTGTGCTGTGTGATTGGGATGGCCGTGGAAAACCTGATTGTCTNTGTGA
AGACTGGTGAAGATTNACTGACTTGGAGTGTGATGGGGGACAGGNGAGTGAGAGAGGTGT
GGCCACACTGTGGACCCCCTGCGAGGGCGCGGGTGTGTCTCTCTTCTCCGCACGCCACGG
ANNAAAATCTGAATGATGGGGAGGTGTGTGCTGTGTGTGGTGAGTGTTGCACCTATGTGT
GAAAAAGCACCACTGTGATGCACCTGTGGTGATGGGGAGGGGTGATACACACCTGTTGAC
CTTGATGGCACAGGCCCGTGGTGTGTGTGNCTGTGTGCTGTGTGAAGCCAAATTGGATGA
GTGTTTTGATGCTTGGTGTGTTGCTATGAGCGTGCTGAATATTGGCCCATGGCTCACCAT
TGTGCGAACTGGCCATTCTGAGAATGGTGAGCTGGGATGGATGTGGAACCTGTGTAAGGC
ATTTGGCGAACTNGCCAAAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case