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Oryza sativa
cluster # 17 cluster # 17       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_17#0 length = 4266 sequences # 2  

consensusID : consensus_17#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 4266
fasta sequence
                              [AACCAAACACTACTACTTACTGCTCTGGCTAGCTCCAGGCCAGGCAAATACTCGCCAGGGCAGCAACCAAACACGCCCTACAAATCACAAAATGCCCCAAGTTTCTCTCCGCCTACGAGGCCCCAGGCTGCCCTTTCCCGTCCTCCCTGCAATGCCTCAAGATTGCTGGCTGTAAGGAGGGCGTGCAGACCCTGGATTTCATCTCAAACCTCAACTTCCTCACAGAACTACACATCGATGATTGTGGGGAGGATTTGAGATGCGAGGGTCTGTGGCCTCTCCTCACCCAGGGTCAGCTCAGCGAATTAGATGTCTTTGGAACACCCAGATTCTTTGCTGGTTTGGATCCCATACTCGGGGGGCTGCAGGACGGACAAGAGCAGCAGCTTCCTCCTCCTCTTCAGTGTTCCTCCAAGCTGCAGGAGCTCAGGACGGATGACTTCGCAGGTGTCCTCGTGAAGCCCATCTGCTTGCTCCTCTCTTCCTCCCTCACCGAACTACGCCTTGGATGGAACGACGAGGTGGAGCGCTTCATGAAGGAGCAAGAGGAGGCCCTTCAGCTCCTCACCTCCCTCCGGGACCTCCAATTTTTGAGATGCAGTAAGTTGCAGTGCCTCCCTGCGGGGCTACATAGACTTACCAGCCTCAAGAGATTAAAGATCATCGGCTGTCCATCCATCAGGTCGCTGCCCAAGGGTGGCCTCCCCAGTTCACTGCAAGAACTAGATGTCGGATACTGCAACAACGAGAAGCTCAAACAGCGGTGCGGGAAGCTAAAGGGAACCATCCCAAAAATCATACTAGACTAACAAAGGGCACTGCCTTCAAGTTGTACATTCCTGTAGCCTTGTAGAACTTCACAATCTATCCATGCACTGTTCCCCAACATGTGGATCTCATGTGATATCCTCTACCTGTACATAGATCTTGTGTTCTTATGTGAGTTCCAGTAGACTTCTTAATACTTTGGGTGCATATTTCTGGTCGTCACTCCTGAAGACTTTAGTGGTGTTTAGCTAGTTGAATTGGCATACATTATGGATCAAAATACCATCATGGCTTATTGGCTTAATAACTGTGGAAAATGATAAGTTTGCAGTGTTCTGCAACTGATATTAAGATTTAGATCTGATTATTGGATTGCAAGACAGATGTGGCAGAAACACATCTTTGGAAACCAACAATGTGGCAGTTACATGCTTGAAGGTATAACTCCCATAGTCTCATCTCGAATGGGCCTTCACAAGAATAACCATCTTATCATGTCAGTGTATCATGGAGTCCCTTCAGATTTCAGTCTATTATTATGCTCAATAGGTTCTTATGGAAGATTCATAAGTATGACTTTTGAATTGCTTGCTAGTTGTGCGCTGTAGTACGCTAGCACAGCTTTGAAAGTGAATAGCGTGGCAATAAACAGGCCTGATAGCTGCCATAGACTCAATGTGTGTTCAAGTGCCAAGTAGTCCTGGACACTATTTGCACTTCAAATTATATGAATGCTTTCATGTTATTGAACAGACCATAATTTTCCGCTGCAGCGTTGTACAGGAGTCTTTGGAACACCCAGATTCTTTGCTGGTTTGGATCCCATACTCGGGGGGCTGCAGGACGGACAAGAGCAGCAGCTTTCTCCTCTTCAGTGTTCCTCCAAGCTGCAGGAGCTTCATACGGATGACTTCGCAGGTGTCCACGTGAAGCCCATCTGCAGACTCCTCTCTTCCTCCCTCACCAAGCTAGTCCTTGGATGGAACGACGAGGTGGAGCGTTTCACGAAGGAGCAAGAGGAGGCACTTCAGCTTCTCATCTCCCTCCAGGACCTCCATTTTTGGGGATGCACTAATCTGCAGTGCCTCCCTGCGGGGCTACATAGACTTACCAGCCTCAAGAGATTAGAGATCATCGGCTGTCCATCCATCCGGTCGCTGCCCAAGGGTGGCCTCCCCAGTTCACTGCAAGAACTAGATGTCAGAGCTAGCTGGAACGAGAAGTTCAAACAGCGGTGCAGGAAGCTAAAGGGAACCATCCCAGAAATCATACTAGACTAATAAAGGTGTTCTTTTGTGAGTTCCAGTAGGCTTCTTAATACTTCGGTTGTATTATATTTTGGTCATCACTCCTGAAGAACCAGTGGTGTTCAGCTAGTTGCACTGACATACATTATGGATCAAAATATCATCACGGCATAATAATGGTGGAACATGTTACCATTTCTTAGTGAAATTTAATGGCGTACCGGACCGTCACAAGAAAACCCAATCAAATCATATCAGTGCATCATGGAGTCCCTTCAGACTCTGATTCAGAACTACGATTATTGGATTGCTAGATAGTGCGGCAGCGGCACAGCTTTGGAAACCAACAGTGTGGCAAACTGGCAGTTACATGCTTGAAGGTTTTAGTTCCCATACTCTCAGTGTTCTCAAATGGGAACAAACTGTACAATGGCAAGACAAGTGAACGACACGATGGTCAAAAGAAGAGAAGAAAAACTAGTGTGCCTAGCACACTCTTGAAGCGCAATTGAACCTCTGTAACTCCGGATGCACAGTATTTAACGTGCTGCCCAACTTCATACTTGCAATCTCGCTTAACTAGTGACAGAATGGTAACATTGCAGTCTTCTTCTACTGACAGAGGCATGAAAATGGTACTTTCTGGTGGATGCAACTTTATCTGTTCAAAATGCTAATGTGTCAATGGTAGACGTAATTTTTGGACCACAGGTTGTAAAATCAGTCCTGAATCTCCTAGGACCTTGATGTCTTGGTTGCAGCCTCTGCAAGCTACAAATCTCTTCCCTTGTGCTATCCTCAATGACTTGCTCTTCATTTTGTTCATCCATTTATGCAGTGAACCAAAGCGCCTTAGATTAGACTGTTTGCACTCTATTACCGGGAATTGTTGCAGCGAACTTCCAAACAGGTTGTCACTTATGAGGAATTAGTAGTGTTTGGCTAGTCATGGCATAACAACTGTGGAAAACAATGAGTGTTCAGTGTTTTGCTACTTGGATTAAGAACACTCACAAGAATAGCCATTACATCATATTAGTTCATTGTGGAGTCCCTTCAGATCTCAGGTTAATATTATATGGAACGCGTTAATATGAGAGGTAAATCTTCTATTGACACCAACTACATGAAATCGGTACTGTCCAAGGGATGCAGCTTAATCTGTTCAAGGCGCTAATGTGCCAATGCCAGATGTAATTTTTGAACCACATGTTGCATAATATGTAGGAACAAAAGGCTTAGTTCAATGAACATAAATGACTGGAATTATTGCAATGAACGTCCAAACAGTCTAGCTCCTTCCCTTTATATGAAGAAGACATAATATGGATAAGTGCTCAATTGCACTGTCTCTTCTCAGCGGATAAATGGCAATTGGGCAATTGATCTCCACCCGGTGATCTCCACCCAAGCTCAACTTGAATTAGATATGCTTATGACGACTTTACAATCCCAGCAGATACATCCTGAAAGACCAGATAACAGAAGCTGTACACTGAGCCCGGTTGGATTTACGACAACAGCATACTATGAGCTAATAACATATCATGGCATCCTATGGCGCCCGGCACACTTCATCTGGATTAAAGCAATACCAAACACCTGCAAAATCTTCCTTTGGCTAGCCTTTCGGGGAAGGCTAAACACAAATGATAACAGGGTGAAGAAATGCTGGGCATCTGATCCAC-ATTGTGCGGTTTGCCCGGCTATAGAAACAGCTAATCACATCATTCTACGCTGCAAGTTAGCCACTGAAATCTGGAACAAACTCAACCTCCTTGATCAGGCAATTCAGAGTGCTGACATTCTACAGTTCACCGAGCATGTCCTGGGAATTCTACCGACTCAACTTAAACTGGGATGGCCAATATGCTTCGCTGCCTGTTCACACAGCTTATGAAAAGCACGCAATCATAGAACCTTCAGAGAAGAAGAACTCTCCGTAACTAATGTGACGCATCAAATCAAGGACTGCCTACACTTATGGAAAAACCGAGTTAAACCACAATGTCAGCCGCCAATATGTAGTTGGGCAGCTCTACTAGCATAGATGTTGTTTTTCTGTTTGTTTGTGGTTCTCTCTAATCCCTTTCTTCCTTCTTTTCTACCTCTTCTTTTTCTTGCCTTTCTGCTTGAATGTATTTTTGTTATATCTTTTTTGACCACCATTAATACAATGGTTATAAGGTAGAGCCTCTCTACCTTTTCAGTCAAAAAAAAATTGGATAAATGCAAGCAGTTTTCATCAAAA]

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>consensus_17#0 AACCAAACACTACTACTTACTGCTCTGGCTAGCTCCAGGCCAGGCAAATACTCGCCAGGG CAGCAACCAAACACGCCCTACAAATCACAAAATGCCCCAAGTTTCTCTCCGCCTACGAGG CCCCAGGCTGCCCTTTCCCGTCCTCCCTGCAATGCCTCAAGATTGCTGGCTGTAAGGAGG GCGTGCAGACCCTGGATTTCATCTCAAACCTCAACTTCCTCACAGAACTACACATCGATG ATTGTGGGGAGGATTTGAGATGCGAGGGTCTGTGGCCTCTCCTCACCCAGGGTCAGCTCA GCGAATTAGATGTCTTTGGAACACCCAGATTCTTTGCTGGTTTGGATCCCATACTCGGGG GGCTGCAGGACGGACAAGAGCAGCAGCTTCCTCCTCCTCTTCAGTGTTCCTCCAAGCTGC AGGAGCTCAGGACGGATGACTTCGCAGGTGTCCTCGTGAAGCCCATCTGCTTGCTCCTCT CTTCCTCCCTCACCGAACTACGCCTTGGATGGAACGACGAGGTGGAGCGCTTCATGAAGG AGCAAGAGGAGGCCCTTCAGCTCCTCACCTCCCTCCGGGACCTCCAATTTTTGAGATGCA GTAAGTTGCAGTGCCTCCCTGCGGGGCTACATAGACTTACCAGCCTCAAGAGATTAAAGA TCATCGGCTGTCCATCCATCAGGTCGCTGCCCAAGGGTGGCCTCCCCAGTTCACTGCAAG AACTAGATGTCGGATACTGCAACAACGAGAAGCTCAAACAGCGGTGCGGGAAGCTAAAGG GAACCATCCCAAAAATCATACTAGACTAACAAAGGGCACTGCCTTCAAGTTGTACATTCC TGTAGCCTTGTAGAACTTCACAATCTATCCATGCACTGTTCCCCAACATGTGGATCTCAT GTGATATCCTCTACCTGTACATAGATCTTGTGTTCTTATGTGAGTTCCAGTAGACTTCTT AATACTTTGGGTGCATATTTCTGGTCGTCACTCCTGAAGACTTTAGTGGTGTTTAGCTAG TTGAATTGGCATACATTATGGATCAAAATACCATCATGGCTTATTGGCTTAATAACTGTG GAAAATGATAAGTTTGCAGTGTTCTGCAACTGATATTAAGATTTAGATCTGATTATTGGA TTGCAAGACAGATGTGGCAGAAACACATCTTTGGAAACCAACAATGTGGCAGTTACATGC TTGAAGGTATAACTCCCATAGTCTCATCTCGAATGGGCCTTCACAAGAATAACCATCTTA TCATGTCAGTGTATCATGGAGTCCCTTCAGATTTCAGTCTATTATTATGCTCAATAGGTT CTTATGGAAGATTCATAAGTATGACTTTTGAATTGCTTGCTAGTTGTGCGCTGTAGTACG CTAGCACAGCTTTGAAAGTGAATAGCGTGGCAATAAACAGGCCTGATAGCTGCCATAGAC TCAATGTGTGTTCAAGTGCCAAGTAGTCCTGGACACTATTTGCACTTCAAATTATATGAA TGCTTTCATGTTATTGAACAGACCATAATTTTCCGCTGCAGCGTTGTACAGGAGTCTTTG GAACACCCAGATTCTTTGCTGGTTTGGATCCCATACTCGGGGGGCTGCAGGACGGACAAG AGCAGCAGCTTTCTCCTCTTCAGTGTTCCTCCAAGCTGCAGGAGCTTCATACGGATGACT TCGCAGGTGTCCACGTGAAGCCCATCTGCAGACTCCTCTCTTCCTCCCTCACCAAGCTAG TCCTTGGATGGAACGACGAGGTGGAGCGTTTCACGAAGGAGCAAGAGGAGGCACTTCAGC TTCTCATCTCCCTCCAGGACCTCCATTTTTGGGGATGCACTAATCTGCAGTGCCTCCCTG CGGGGCTACATAGACTTACCAGCCTCAAGAGATTAGAGATCATCGGCTGTCCATCCATCC GGTCGCTGCCCAAGGGTGGCCTCCCCAGTTCACTGCAAGAACTAGATGTCAGAGCTAGCT GGAACGAGAAGTTCAAACAGCGGTGCAGGAAGCTAAAGGGAACCATCCCAGAAATCATAC TAGACTAATAAAGGTGTTCTTTTGTGAGTTCCAGTAGGCTTCTTAATACTTCGGTTGTAT TATATTTTGGTCATCACTCCTGAAGAACCAGTGGTGTTCAGCTAGTTGCACTGACATACA TTATGGATCAAAATATCATCACGGCATAATAATGGTGGAACATGTTACCATTTCTTAGTG AAATTTAATGGCGTACCGGACCGTCACAAGAAAACCCAATCAAATCATATCAGTGCATCA TGGAGTCCCTTCAGACTCTGATTCAGAACTACGATTATTGGATTGCTAGATAGTGCGGCA GCGGCACAGCTTTGGAAACCAACAGTGTGGCAAACTGGCAGTTACATGCTTGAAGGTTTT AGTTCCCATACTCTCAGTGTTCTCAAATGGGAACAAACTGTACAATGGCAAGACAAGTGA ACGACACGATGGTCAAAAGAAGAGAAGAAAAACTAGTGTGCCTAGCACACTCTTGAAGCG CAATTGAACCTCTGTAACTCCGGATGCACAGTATTTAACGTGCTGCCCAACTTCATACTT GCAATCTCGCTTAACTAGTGACAGAATGGTAACATTGCAGTCTTCTTCTACTGACAGAGG CATGAAAATGGTACTTTCTGGTGGATGCAACTTTATCTGTTCAAAATGCTAATGTGTCAA TGGTAGACGTAATTTTTGGACCACAGGTTGTAAAATCAGTCCTGAATCTCCTAGGACCTT GATGTCTTGGTTGCAGCCTCTGCAAGCTACAAATCTCTTCCCTTGTGCTATCCTCAATGA CTTGCTCTTCATTTTGTTCATCCATTTATGCAGTGAACCAAAGCGCCTTAGATTAGACTG TTTGCACTCTATTACCGGGAATTGTTGCAGCGAACTTCCAAACAGGTTGTCACTTATGAG GAATTAGTAGTGTTTGGCTAGTCATGGCATAACAACTGTGGAAAACAATGAGTGTTCAGT GTTTTGCTACTTGGATTAAGAACACTCACAAGAATAGCCATTACATCATATTAGTTCATT GTGGAGTCCCTTCAGATCTCAGGTTAATATTATATGGAACGCGTTAATATGAGAGGTAAA TCTTCTATTGACACCAACTACATGAAATCGGTACTGTCCAAGGGATGCAGCTTAATCTGT TCAAGGCGCTAATGTGCCAATGCCAGATGTAATTTTTGAACCACATGTTGCATAATATGT AGGAACAAAAGGCTTAGTTCAATGAACATAAATGACTGGAATTATTGCAATGAACGTCCA AACAGTCTAGCTCCTTCCCTTTATATGAAGAAGACATAATATGGATAAGTGCTCAATTGC ACTGTCTCTTCTCAGCGGATAAATGGCAATTGGGCAATTGATCTCCACCCGGTGATCTCC ACCCAAGCTCAACTTGAATTAGATATGCTTATGACGACTTTACAATCCCAGCAGATACAT CCTGAAAGACCAGATAACAGAAGCTGTACACTGAGCCCGGTTGGATTTACGACAACAGCA TACTATGAGCTAATAACATATCATGGCATCCTATGGCGCCCGGCACACTTCATCTGGATT AAAGCAATACCAAACACCTGCAAAATCTTCCTTTGGCTAGCCTTTCGGGGAAGGCTAAAC ACAAATGATAACAGGGTGAAGAAATGCTGGGCATCTGATCCACATTGTGCGGTTTGCCCG GCTATAGAAACAGCTAATCACATCATTCTACGCTGCAAGTTAGCCACTGAAATCTGGAAC AAACTCAACCTCCTTGATCAGGCAATTCAGAGTGCTGACATTCTACAGTTCACCGAGCAT GTCCTGGGAATTCTACCGACTCAACTTAAACTGGGATGGCCAATATGCTTCGCTGCCTGT TCACACAGCTTATGAAAAGCACGCAATCATAGAACCTTCAGAGAAGAAGAACTCTCCGTA ACTAATGTGACGCATCAAATCAAGGACTGCCTACACTTATGGAAAAACCGAGTTAAACCA CAATGTCAGCCGCCAATATGTAGTTGGGCAGCTCTACTAGCATAGATGTTGTTTTTCTGT TTGTTTGTGGTTCTCTCTAATCCCTTTCTTCCTTCTTTTCTACCTCTTCTTTTTCTTGCC TTTCTGCTTGAATGTATTTTTGTTATATCTTTTTTGACCACCATTAATACAATGGTTATA AGGTAGAGCCTCTCTACCTTTTCAGTCAAAAAAAAATTGGATAAATGCAAGCAGTTTTCA TCAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)