These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_17043#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 40 consensus length = 714 fasta sequence [TGGACTGAAGGAGTAGAAAACCTCTCAACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG-CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA-CCACTTCGATGGTGAT-CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC-GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG-TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT-GGCCGATTCTGTTGTTGCT-AAGATGGACG-AAAT-G-GGAGTTC-TTGCTAAGAT-GGACGAAAT-G-GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG-AAT-AT-GTTG-TTTTGCTTC-AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT-G-TTATCTTCAAT-AAATTATTGACCATATG--GGACGATCTAT-AGTGGAT-CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTGTCCATTGTGTCATCCGATGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTACGACATGATTAATATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACTGTCATGCCGTTAGTAGCGTATC] [+] EMBL CF338155 [TGGACTGAAGGAGTAGAAAACCTCTCAACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAACATGGAAGGACAACCCTAGAACAACA ] [+] EMBL CF335721 [ GGAGTAGAAAACCTCTCAACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGT ] [+] EMBL CF333960 [ GAGTAGAAAACCTCTCAACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT ATNGTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGCTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATGNNGGACGATCTAT AGTGGATCCCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTG ] [+] EMBL CF338130 [ CTCTCAACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAATNG GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAATNG GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAGAAAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTA ] [+] EMBL CF336436 [ TCAACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT A ] [+] EMBL CF312254 [ TCAACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTAaaaaa ] [-] EMBL CF312255 [ CAACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTAaaaaaa ] [+] EMBL CF317657 [ ACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTT ] [+] EMBL CF337805 [ ACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCT ] [+] EMBL CF317973 [ ACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTGTTTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT GNGGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT GNGGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTAT ] [+] EMBL CF298883 [ ACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAATNG GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AATNAT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTATAAGTGGATCCCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCT ] [+] EMBL CF307562 [ ACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAATNG GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAATNG GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCAT AG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTA ] [+] EMBL CF316131 [ ACACAAAACTAAGAAATATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTCTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTGTCCATTGTGTCAaaaacaaaa ] [+] EMBL CF336550 [ ACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATA ] [+] EMBL CF334416 [ CAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAGG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCT ] [+] EMBL OSS15850A [ GAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG GAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGNCAAGTTATGTTAAT G TATCTTC AT AAATTATTG CCCTATG GGGCGGTCTNT AGTGG T CCA CTGTT ] [+] EMBL OSR2711A [ GAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG GAT AT GTTG ] [+] EMBL CF301510 [ GAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAAT ] [+] EMBL OSR2712A [ GAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGG ] [+] EMBL AU095453 [ AACATAGCTAGNTAACCAGGGAAGGTAGCATCAGNCAGCGGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTN CCACTTCGATGNTGATCCATGTGCATGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGA TACGCCACCGCAGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGAGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCNCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTNCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATATTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTTTCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCTAGTTATGTTAAT GTTTATCTCCAAT AAATTGTTGACCATATG GAGCGATCTAT AGTCGAT CCATCTGTTGGTCCCAACTATTTGTATGTCGTGCATGTGTTCGCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTATCCAATGTATCATCTGTTGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTGCAACATGATTATTATTAAAAAAAAAAAAA ] [+] EMBL OSR1368A [ AACATAGCTAGGTAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAGCGGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCATGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTACGCCACCGCAGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGAGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTTCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTG ] [+] EMBL AU164763 [ CATAGCTAGGTAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAGCGGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCATGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTACGCCACCGCAGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGAGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATATTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTTTCATAAG AAT ATGGTTGTTTTTGCTTC AAGTAATGGCCTAGGTATGGTAATGG TTANCTCCAATAAAATGGTTGAC ] [+] EMBL AU164512 [ ATAGCTAGGTACCCAGGNAAGGTAGCATCAG CAGC GGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCATGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTACGCCACCGCAGCACAGTGCGGGCTGCTGCATATCCTCTCGAGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATATTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTTTCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCTAGTTATGTTAAT GTTTATCTCCAAT AAATTGTTGACCATATG GAGCGATCTAT AGTCGAT CCATCTGTTGGTCCCAACTATTTGTATGTCGTGCATGTGTTCGCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTATCCAATGTATCATCTGTTGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTGCAACATGATTATTATTAAAAAAAAAAAAAAAA ] [+] EMBL OSR0186A [ ATAGCTAGGTAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAGCGGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCATGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTACGCCACCGCAGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGAGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGCCAAGCCTAAAACAACATATTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGC ] [+] EMBL AU095434 [ TAGCTAGGTAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAGCGGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCATGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTACGCCACCCCAGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGAGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATATTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTTTCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCTAGTTATGTTAAT GTTTATCTCCAAT AAATTGTTGACCATATG GAGCGATCTAT AGTCGAT CCATCTGTTGGTCCCAACTATTTGTATGTCGTGCATGTGTTCGCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTATCCAATGTATCATCTGTTGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTGCAACATGATTATTATTAAAAAAAA ] [+] EMBL OSR0820A [ AGCTAGGTAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAGCGGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCATGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTACGCCACCCCAGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGAGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGCCG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTA ] [+] EMBL OSR2186A [ CAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGA ] [+] EMBL OSR13821A [ AAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGAT ] [+] EMBL AU031740 [ AAGATACCCAGGGAAGGTACCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTNCCTGGTCATCTTGANCNTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTNCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCAaaaaa ] [+] EMBL CA754586 [ AGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCCACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCANAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCCAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTgaaaaaaa ] [+] EMBL AU162393 [ CCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTACCCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTNACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTGTCCATTGTGTCATCCGATGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTACGACATGATTAATATTAt ] [+] EMBL AU101637 [ CCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G NGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACANGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG GTTTGCTTCAAAGTTATGGCCAAGT ] [+] EMBL OSR1015A [ CCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGTCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGNCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AA ] [+] EMBL OSR0363A [ AGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTCTTTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACANCATGCTTNCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATA ] [+] EMBL OSR3195A [ GTAGCATCAG CAGCGGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCATGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTACGCCACCGCAGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGAGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCTGGGCCGATTCTGTTGTTGCTAAAGATGGACGAAAAT G GGAGTTC TTGCTAAGATGGGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAA ] [-] EMBL CF334417 [ TGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAGG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTGTCCATTGTGTCATCCGATGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTACGACATGATTAATATTATTTGTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAACACTGTCATGCCGTTAGTAGCGTATC] [-] EMBL CF336846 [ TGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTAACAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTGTCCATTGTGTCATCCGATGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTACGACATGATTAATATTAAAAAAA ] [-] EMBL CF337115 [ TGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACCGTCCATTGTGTCATCCGATGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTACGACATGATTAAAA AAAAAAAAA ] [+] EMBL AU198119 [ GGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTGTCCATTGTGTCATCCGATGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTACGACATGATTAATATTAAAAA ] [+] EMBL AU184406 [ TGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTGTCCATTGTGTCATCCGATGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTACGACATGATTAATATTAAAAAAAAAA ] consensusID : consensus_17043#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 634 fasta sequence [CAAGGGGTCCGGCCAAGAATACCCAGGNAAGGTAGCCATCAGCACCAGGAGGCCAATGGAAGGGAAAGAGGACTACCACTTTCGATGGTGATCATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGCGGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTGTTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCTGGCCGATTCTGTTGTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTGTCCATTGTGTCATCCGATGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTACGACATGATTAATATTAT] [+] EMBL AU101638 [CAAGGGGTCCGGCCAAGAATACCCAGGNAAGGTAGCCATCAGCACCAGGAGGCCAATGGAAGGGAAAGAGGACTACCACTTTCGATGGTGATCATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGCGGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTGTTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCTGGCCGATTCTGTTGTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTGTCCATTGTGTCATCCGATGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTACGACATGATTAATATTAT] consensusID : consensus_17043#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 600 fasta sequence [AACATGATCACCAACGAACGCAGAATCATCGACAGGACGAAATGTATTCAAATAGGACTACCACTTCCATGCTGATCATGTGCCTGCTCATCTTGAGCCTCACTGTAGACTCCGCCACCGCACCACAGAGCGGCTGCTGCATATCCTCTCCGTTCACAGGATGTTGTTTTGGCTGCATTGCTGGTGGTGGCTCCTACTCACTCTGCAACAACACTTGCTGTTTACCCATGTCATTCTGCGCCGATTCTGGTGTTGCTAACATGGACGAAATGCTACGTCTTGCTAACATGGACGACATGCGAGTTCTTGCTAACATGGAACTACAAGTCTACAACGACATGCTTGCATTGCTACCACTCTTAATGCCTATCATAAGAATATGCTTGTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGGTATGGTAAAGCTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGCACGATCTATAGTGCATCCCTCTGTCGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCCCACAAGCATATTTAATTTCTCTGGCTGCTTTTACCAANCGCATAGCACGGTCTATTGTGCCGCGANCACTGACTCATGCCGTGAAAACTT] [+] EMBL CA756310 [AACATGATCACCAACGAACGCAGAATCATCGACAGGACGAAATGTATTCAAATAGGACTACCACTTCCATGCTGATCATGTGCCTGCTCATCTTGAGCCTCACTGTAGACTCCGCCACCGCACCACAGAGCGGCTGCTGCATATCCTCTCCGTTCACAGGATGTTGTTTTGGCTGCATTGCTGGTGGTGGCTCCTACTCACTCTGCAACAACACTTGCTGTTTACCCATGTCATTCTGCGCCGATTCTGGTGTTGCTAACATGGACGAAATGCTACGTCTTGCTAACATGGACGACATGCGAGTTCTTGCTAACATGGAACTACAAGTCTACAACGACATGCTTGCATTGCTACCACTCTTAATGCCTATCATAAGAATATGCTTGTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGGTATGGTAAAGCTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGCACGATCTATAGTGCATCCCTCTGTCGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCCCACAAGCATATTTAATTTCTCTGGCTGCTTTTACCAANCGCATAGCACGGTCTATTGTGCCGCGANCACTGACTCATGCCGTGAAAACTT] consensusID : consensus_17043#3 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 577 fasta sequence [AAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAGCAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTACCACTTCGATGGTGATCATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGNCCACCGCGGCACAGTGCGGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTGTTCTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCTGGCCGATTCTGTTGTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAACTCT-ATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTGTCCATTGTGTCAAAAACAAAAA] [-] EMBL CF316132 [AAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAGCAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTACCACTTCGATGGTGATCATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGNCCACCGCGGCACAGTGCGGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTGTTCTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCTGGCCGATTCTGTTGTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAACTCT ATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTGTCCATTGTGTCAAAAACAAAAA] [+] EMBL AU162441 [ GATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATCCTCAATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAACTCTNATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAaa ] consensusID : consensus_17043#4 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 372 fasta sequence [AAGATGGACNAAATGGGGAGTTCTTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTTCTTGCTAAGATGNAAGGACAAGCCTAAAACAACATATTTGCANTGCTACCAGTNTTAATGCCTTNTCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCTAGTTATGTTAATGTTTATCTCCAATAAATTGTTGNCCATATGGAGCGATCTATAGTCGATCCATCTGTTGGTCCCAACTATTTGTATGTCGTGCATGTGTTCGCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTATCCAATGTATCATCTGTTGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTGCAACATGATTATTATTAAAAA] [+] EMBL AU031220 [AAGATGGACNAAATGGGGAGTTCTTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTTCTTGCTAAGATGNAAGGACAAGCCTAAAACAACATATTTGCANTGCTACCAGTNTTAATGCCTTNTCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCTAGTTATGTTAATGTTTATCTCCAATAAATTGTTGNCCATATGGAGCGATCTATAGTCGATCCATCTGTTGGTCCCAACTATTTGTATGTCGTGCATGTGTTCGCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTATCCAATGTATCATCTGTTGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTGCAACATGATTATTATTAAAAA] consensusID : consensus_17043#5 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 343 fasta sequence [TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCTGGCCGATTCTGTTGTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL AU101747 [TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACNCTTGTTGTTTCCCATGTATTCTGGCCGATTCTGTTGTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA ] [+] EMBL OSS11973A [TTTTNGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGTCTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCTGGCCGATTCTGTTGTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGNTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAAAA ] [+] EMBL OSS11947A [TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCTGGCCGATTCTGTTGTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAAAA ] [+] EMBL AU101745 [ TCTGGCCGATTCTGTTGTTNCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGNCGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACNACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATNTGTTGGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA ] [-] EMBL CF335722 [ AATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATTTTCAATAAATTATTGCCCATATGGGACGATTTATAGTGGATCCATCTGTTGGTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] consensusID : consensus_17043#6 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 185 fasta sequence [TTGCTTCAAGTTACGGCCAAGGTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGTCGATCGAGAGTGGATCCATCGGTTGGTCCCAAATGTATGTAGGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTGGTTGCTTTAAAGCAGGCCAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAA] [-] EMBL CF333961 [TTGCTTCAAGTTACGGCCAAGGTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGTCGATCGAGAGTGGATCCATCGGTTGGTCCCAAATGTATGTAGGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTGGTTGCTTTAAAGCAGGCCAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAA] consensusID : consensus_17043#7 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 173 fasta sequence [GTCGAGACGCGTGGGGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAACTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAANAAAAAANAAAAAAAAAAAAAAAAAANAAAAAAAAAAA] [+] EMBL AU095508 [GTCGAGACGCGTGGGGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAACTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAANAAAAAANAAAAAAAAAAAAAAAAAANAAAAAAAAAAA] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_17043#4 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#6 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#1 ------------------------------CAAGGGGTCCGGCCAAGAATACCCAGGNAA 30 consensus_17043#0 TGGACTGAAGGAGTAGAAAACCTCTCAACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAG 60 consensus_17043#3 -------------------------------------------------AAGATAACCAG 11 consensus_17043#2 ----------------------------------------------AACATGATCACCAA 14 consensus_17043#5 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#7 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#4 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#6 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#1 GGTAGCCATCAGCACCAGGAGGCCAATGGAAGGGAAAGAGGACTACCACTTTCGATGGTG 90 consensus_17043#0 GGAAGGTAGCATCAGCAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTACCACTTCGATGGTG 120 consensus_17043#3 GGAAGGTAGCATCAGCAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTACCACTTCGATGGTG 71 consensus_17043#2 CGAACGCAGAATCATCGACAGGACGAAATGTATTCAAATAGGACTACCACTTCCATGCTG 74 consensus_17043#5 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#7 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#4 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#6 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#1 ATCATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCC-ACCGCGGCACAGTGCGG 149 consensus_17043#0 ATCATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCC-ACCGCGGCACAGTGCGG 179 consensus_17043#3 ATCATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGNCCACCGCGGCACAGTGCGG 131 consensus_17043#2 ATCATGTGCCTGCTCATCTTGAGCCTCACTGTAGACTCCGCC-ACCGCACCACAGAGCGG 133 consensus_17043#5 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#7 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#4 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#6 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#1 CTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTGTTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTC 209 consensus_17043#0 CTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTGTTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTC 239 consensus_17043#3 CTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTGTTCTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTC 191 consensus_17043#2 CTGCTGCATATCCTCTCCGTTCACAGGATGTTGTTTTGGCTGCATTGCTGGTGGTGGCTC 193 consensus_17043#5 ---------------------------------TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTC 27 consensus_17043#7 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#4 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#6 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#1 CGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCC---ATGTATTCTGGCCGATTCTGTTGT 266 consensus_17043#0 CGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCC---ATGTATTCTGGCCGATTCTGTTGT 296 consensus_17043#3 CGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCC---ATGTATTCTGGCCGATTCTGTTGT 248 consensus_17043#2 CTACTCACTCTGCAACAACACTTGCTGTTTACCCATGTCATTCTGCGCCGATTCTGGTGT 253 consensus_17043#5 CGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCC---ATGTATTCTGGCCGATTCTGTTGT 84 consensus_17043#7 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#4 ----AAGATGGACNAAATGGGGAGTTCTTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTTCTTGC 56 consensus_17043#6 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#1 TGCTAAGATGGACGAAATGGGAG--TTCTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTT-CTTGC 323 consensus_17043#0 TGCTAAGATGGACGAAATGGGAG--TTCTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTT-CTTGC 353 consensus_17043#3 TGCTAAGATGGACGAAATGGGAG--TTCTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTT-CTTGC 305 consensus_17043#2 TGCTAACATGGACGAAATGCTAC--GTCTTGCTAACATGGACGACATGCGAGTT-CTTGC 310 consensus_17043#5 TGCTAAGATGGACGAAATGGGAG--TTCTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTT-CTTGC 141 consensus_17043#7 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#4 TAAGATGNAAGGACAAGCCTAAAACAACATATTTGCANTGCTACCAGTNTTAATGCCTTN 116 consensus_17043#6 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#1 TAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCT-A 382 consensus_17043#0 TAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCT-A 412 consensus_17043#3 TAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCT-A 364 consensus_17043#2 TAACATGGAACTACAAGTCTACAACGACATGCTTGCATTGCTACCACTCTTAATGCCT-A 369 consensus_17043#5 TAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCT-A 200 consensus_17043#7 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#4 TCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCTAGTTATGTTAATGTTTATCTCCA 176 consensus_17043#6 ------------------TTGCTTCAAGTTACGGCCAAGGTATGTTAATGTT-ATCTTCA 41 consensus_17043#1 TCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTT-ATCTTCA 441 consensus_17043#0 TCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTT-ATCTTCA 471 consensus_17043#3 TCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTT-ATCTTCA 423 consensus_17043#2 TCATAAGAATATGCTTGTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGGTATGGTAAAGCT-ATCTTCA 428 consensus_17043#5 TCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTT-ATCTTCA 259 consensus_17043#7 GTCGAGACGCGTGGGGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTT-ATCTTCA 59 ************* **** ** **** *** * * **** ** consensus_17043#4 ATAAATTGTTGNCCATATGGAGCGATCTATAGTCGATCCATCTGTTGGTCCCAACTATTT 236 consensus_17043#6 ATAAATTATTGACCATATGGGTCGATCGAGAGTGGATCCATCGGTTGGTCCCAAATGTAT 101 consensus_17043#1 ATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAACTCTAT 501 consensus_17043#0 ATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAACTCTAT 531 consensus_17043#3 ATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAACTCTAT 483 consensus_17043#2 ATAAATTATTGACCATATGGCACGATCTATAGTGCATCCCTCTGTCGGTCTCAACTCTAT 488 consensus_17043#5 ATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAAAAAAAA 319 consensus_17043#7 ATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAACTCTAA 119 ******* *** ******** ***** * *** **** ** ** **** *** consensus_17043#4 GTATGTCGTGCATGTGTTCGCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAG 296 consensus_17043#6 GTAGGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTGGTTGCTTTAAAGCAG 161 consensus_17043#1 GTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAG 561 consensus_17043#0 GTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAG 591 consensus_17043#3 GTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAG 543 consensus_17043#2 GTATGTCGTGCATGTGTGCTCCCACAAGCATATTTAATTTCTCTGGCTGCTTTTACCAAN 548 consensus_17043#5 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA------------------------------------ 343 consensus_17043#7 AAAAAAAAAAAAAAAANA-----AAAAANAAAAAAAAAAAAAAAAAANAAAAAAAAAAA- 173 * * * consensus_17043#4 GCCATAGCACTATCCAATGTATCATCTGT-TGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTGCAAC 355 consensus_17043#6 GCCAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAA------------------------------------ 185 consensus_17043#1 GCCATAGCACTGTCCATTGTGTCATCCGA-TGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTACGAC 620 consensus_17043#0 GCCATAGCACTGTCCATTGTGTCATCCGA-TGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTACGAC 650 consensus_17043#3 GCCATAGCACTGTCCATTGTGTCAAAAAC-AAAAA------------------------- 577 consensus_17043#2 CGCATAGCACGGTCTATTGTGCCGCGANCACTGACTCATGCCGTGAAAACTT-------- 600 consensus_17043#5 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#7 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#4 ATGATTATTATTAAAAA------------------------------------------- 372 consensus_17043#6 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#1 ATGATTAATATTAT---------------------------------------------- 634 consensus_17043#0 ATGATTAATATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACTGTCATGCCGTTAGTAGCG 710 consensus_17043#3 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#2 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#5 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#7 ------------------------------------------------------------ consensus_17043#4 ---- consensus_17043#6 ---- consensus_17043#1 ---- consensus_17043#0 TATC 714 consensus_17043#3 ---- consensus_17043#2 ---- consensus_17043#5 ---- consensus_17043#7 ---- |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||