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Oryza sativa
cluster # 1866 cluster # 1866       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1866#0 length = 2433 sequences # 2  

consensusID : consensus_1866#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2433
fasta sequence
                              [TTCCAAAGAAAGACATGTGGGTGCTTCAGTTGCATTGCCCTGGATTCCATCTTGCTGATGGTCGAAAATCATACAAGTGAAGTGTTTTTAGAGCTTGCTGTTTTACCTATTTGAAATTCTGAAAGGTTTTATCCCTTAGTTACTTATGTAATTCCTATCAATGGTAAATTTCTTACTCATGGTTTACAGGATTTTACATTGGACTGGTTGCAGACAGTGACTCAGTGAGCCAGTGATGCGAGGAGCATTCCTGAACCTTCTAGTTGCTCTTTTTGCCTTGGAACGTGACAATGTGTCAGAACCTGAAATATATAACTGAATTTCTTAGTTCATAGTACTATAAAAGAACTACACCTTGTGCTTTGTATGGCCAATTCATTATGACAGCATTTTAGGAGTATAGCTATGGCTTCTCCAGCATTCTTGGTTTCAGAGATAACTATACAGTGTCTCTTTTTCATTGACATGGGTCTTCATACATTTGTTTTTGGATACCAGAGACATGGGTCTTCATGATCAGATCCTCATATTTTTACTTAATATTTCAAAATGTTAGTGGAAGAACTGCTCATGTGCAAGAATTATTCTGAATATCTATATGGATGTAACTAGTTATTGTAAGATGTAAGTACTTACCTGAGGAATAGTGTTATTGGAGATAAATTGTTCATTATTACAGATCCTAGCTGCAATATAGATTTCGCACGGAAACACAGTGTGGTACAAAGATTTATTTTGTATGCTTCAGTACTTCCTAAATATCAAATGATTTTGGATTGCAGTGATTTCGAACTTGCTTGCCTCTGTTATTTGTTTCGTTGTTAACAACATGCTTGAAATTTGTTTTGTGGTTCTTATAATATTCCCAATATATTGAAATTTGTGCTACCCTGACATGCCCTTTTGTGGTAATTCATCAACTTTTTACAGAGAATTCTCATCTTTAAATAAGAGGATAATTTCTGTTTGTGAAACTTTTTGCATCCATAGATTATTAATTTCTGCTTGATATATATGAGAACAGCATCAGATAAAACAACAAAGTCGGTAGTATCTGCTGAATTTTGATATCTGAAGTAGATCAAATTTATCTACTGCTGTATTGCGTGCTTGCCTAGATTAGTTTAAAGCACCATTTGGTGCGTGCAGATCTCTATTCTCGCTAATCGCTATCTTTCATTGCTTTAGCAGAACATTTATTTTACTATAAATAGGCTGCTCTGGCAGTTTTGCATATATGCTAGAATTACCAAGACATTGCTGTGATCCAGTACTAGTTCTAACATACTACTTAATTAGAGCCTGATCCTTCTGCATCACTAGCCTTCATTGAGAAATCATCTTTTGTGCTATGCCAAACTATTGACCGTTAATGAGATTGTAGTTTCTTGTTTTCACATAGTAGATATTCTTTCTGAAAACTTGAAAATGTACCAATTATTTATAGGTATTTATTGAGTTGTTTGTGCAGGGTGAAAATAACATGAACTGCTTTATTGTGTGTATATGATTCTTTCCTTTAATCATGTGCTCGTGATTTGATGTGGTCGACACTGTTTGTAGAATGGCTCAAAAAGATGGCCTGAGCGATCTTAGAAATTTGTCTCCTCATGTTCTTGTGAGAGGCAGTTTTCCTTCTGTGCAGAACATGATTGCTTCATATTTCCAACACGCTGCTCTGTCTTTGCAGGCCATACTTAACATGTGTGACAATATTGGCGGTACCTTAATCGACATGAATGGACCTCTGCCTATGGCATACTAAATGATCATGGTGGCACTGCACATAATGAACTGCCACGGTTTGCCTTCAGCGGCGTCGTCTACTCATCTGTGTGCTTCTTGTGAGTTGTGAAGCATCCATCCTGACATTGCGCCATATTTCGCATTGTGGTTATTAGTAATATAGAAGAAAAAAGGGGTCGCAGCTCGTGCATACAGCATTCGGAGGAGCAAGGTTAAACCGTTCGATGGAATCATCATGGAAATTACCAGCTTTCTGTATCATCATGGAAATTACCAGCTTTCTGAATAAGCAGAACATGAAGTCTACAGTTGTACGGTGTACTTCATAAAGTCAGAAGCTGCGTATCGTTTGTTAGGTACAGTGCCATGTCGAGGCATTTACTAAGAAGTGGCCCAGGTCAACACTGATGAGAGCTTTCTTGAAAAGTGGAAACGCGATGGTTACTCCTTGGCCAAAGGACCGTTCTTCCATTTCCATCACAAGAACGGCGCCAACCATGGAGATTTAGCTCTCGAGTCATGTGGACTGCCGTCCATTTTACAATGGACGGCGAGCCCTTCGTCGATGCCTTCTGTGGTCTGAAATACTTCATGCCCTGTCAGGTTCCCCAAATTATCTGAATTTTGGCTGTGTACGATCCGTTTTGGATGTAGAGACCGGTTTAACCCATTTCTTTAAAAAAACTG]

[+] EMBL CF306811             [TTCCAAAGAAAGACATGTGGGTGCTTCAGTTGCATTGCCCTGGATTCCATCTTGCTGATGGTCGAAAATCATACAAGTGAAGTGTTTTTAGAGCTTGCTGTTTTACCTATTTGAAATTCTGAAAGGTTTTATCCCTTAGTTACTTATGTAATTCCTATCAATGGTAAATTTCTTACTCATGGTTTACAGGATTTTACATTGGACTGGTTGCAGACAGTGACTCAGTGAGCCAGTGATGCGAGGAGCATTCCTGAACCTTCTAGTTGCTCTTTTTGCCTTGGAACGTGACAATGTGTCAGAACCTGAAATATATAACTGAATTTCTTAGTTCATAGTACTATAAAAGAACTACACCTTGTGCTTTGTATGGCCAATTCATTATGACAGCATTTTAGGAGTATAGCTATGGCTTCTCCAGCATTCTTGGTTTCAGAGATAACTATACAGTGTCTCTTTTTCATTGACATGGGTCTTCATACATTTGTTTTTGGATACCAGAGACATGGGTCTTCATGATCAGATCCTCATATTTTTACTTAATATTTCAAAATGTTAGTGGAAGAACTGCTCATGTGCAAGAATTATTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AK064561             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AAAATGTTAGTGGAAGAACTGCTCATGTGCAAGAATTATTCTGAATATCTATATGGATGTAACTAGTTATTGTAAGATGTAAGTACTTACCTGAGGAATAGTGTTATTGGAGATAAATTGTTCATTATTACAGATCCTAGCTGCAATATAGATTTCGCACGGAAACACAGTGTGGTACAAAGATTTATTTTGTATGCTTCAGTACTTCCTAAATATCAAATGATTTTGGATTGCAGTGATTTCGAACTTGCTTGCCTCTGTTATTTGTTTCGTTGTTAACAACATGCTTGAAATTTGTTTTGTGGTTCTTATAATATTCCCAATATATTGAAATTTGTGCTACCCTGACATGCCCTTTTGTGGTAATTCATCAACTTTTTACAGAGAATTCTCATCTTTAAATAAGAGGATAATTTCTGTTTGTGAAACTTTTTGCATCCATAGATTATTAATTTCTGCTTGATATATATGAGAACAGCATCAGATAAAACAACAAAGTCGGTAGTATCTGCTGAATTTTGATATCTGAAGTAGATCAAATTTATCTACTGCTGTATTGCGTGCTTGCCTAGATTAGTTTAAAGCACCATTTGGTGCGTGCAGATCTCTATTCTCGCTAATCGCTATCTTTCATTGCTTTAGCAGAACATTTATTTTACTATAAATAGGCTGCTCTGGCAGTTTTGCATATATGCTAGAATTACCAAGACATTGCTGTGATCCAGTACTAGTTCTAACATACTACTTAATTAGAGCCTGATCCTTCTGCATCACTAGCCTTCATTGAGAAATCATCTTTTGTGCTATGCCAAACTATTGACCGTTAATGAGATTGTAGTTTCTTGTTTTCACATAGTAGATATTCTTTCTGAAAACTTGAAAATGTACCAATTATTTATAGGTATTTATTGAGTTGTTTGTGCAGGGTGAAAATAACATGAACTGCTTTATTGTGTGTATATGATTCTTTCCTTTAATCATGTGCTCGTGATTTGATGTGGTCGACACTGTTTGTAGAATGGCTCAAAAAGATGGCCTGAGCGATCTTAGAAATTTGTCTCCTCATGTTCTTGTGAGAGGCAGTTTTCCTTCTGTGCAGAACATGATTGCTTCATATTTCCAACACGCTGCTCTGTCTTTGCAGGCCATACTTAACATGTGTGACAATATTGGCGGTACCTTAATCGACATGAATGGACCTCTGCCTATGGCATACTAAATGATCATGGTGGCACTGCACATAATGAACTGCCACGGTTTGCCTTCAGCGGCGTCGTCTACTCATCTGTGTGCTTCTTGTGAGTTGTGAAGCATCCATCCTGACATTGCGCCATATTTCGCATTGTGGTTATTAGTAATATAGAAGAAAAAAGGGGTCGCAGCTCGTGCATACAGCATTCGGAGGAGCAAGGTTAAACCGTTCGATGGAATCATCATGGAAATTACCAGCTTTCTGTATCATCATGGAAATTACCAGCTTTCTGAATAAGCAGAACATGAAGTCTACAGTTGTACGGTGTACTTCATAAAGTCAGAAGCTGCGTATCGTTTGTTAGGTACAGTGCCATGTCGAGGCATTTACTAAGAAGTGGCCCAGGTCAACACTGATGAGAGCTTTCTTGAAAAGTGGAAACGCGATGGTTACTCCTTGGCCAAAGGACCGTTCTTCCATTTCCATCACAAGAACGGCGCCAACCATGGAGATTTAGCTCTCGAGTCATGTGGACTGCCGTCCATTTTACAATGGACGGCGAGCCCTTCGTCGATGCCTTCTGTGGTCTGAAATACTTCATGCCCTGTCAGGTTCCCCAAATTATCTGAATTTTGGCTGTGTACGATCCGTTTTGGATGTAGAGACCGGTTTAACCCATTTCTTTAAAAAAACTG]


>consensus_1866#0 TTCCAAAGAAAGACATGTGGGTGCTTCAGTTGCATTGCCCTGGATTCCATCTTGCTGATG GTCGAAAATCATACAAGTGAAGTGTTTTTAGAGCTTGCTGTTTTACCTATTTGAAATTCT GAAAGGTTTTATCCCTTAGTTACTTATGTAATTCCTATCAATGGTAAATTTCTTACTCAT GGTTTACAGGATTTTACATTGGACTGGTTGCAGACAGTGACTCAGTGAGCCAGTGATGCG AGGAGCATTCCTGAACCTTCTAGTTGCTCTTTTTGCCTTGGAACGTGACAATGTGTCAGA ACCTGAAATATATAACTGAATTTCTTAGTTCATAGTACTATAAAAGAACTACACCTTGTG CTTTGTATGGCCAATTCATTATGACAGCATTTTAGGAGTATAGCTATGGCTTCTCCAGCA TTCTTGGTTTCAGAGATAACTATACAGTGTCTCTTTTTCATTGACATGGGTCTTCATACA TTTGTTTTTGGATACCAGAGACATGGGTCTTCATGATCAGATCCTCATATTTTTACTTAA TATTTCAAAATGTTAGTGGAAGAACTGCTCATGTGCAAGAATTATTCTGAATATCTATAT GGATGTAACTAGTTATTGTAAGATGTAAGTACTTACCTGAGGAATAGTGTTATTGGAGAT AAATTGTTCATTATTACAGATCCTAGCTGCAATATAGATTTCGCACGGAAACACAGTGTG GTACAAAGATTTATTTTGTATGCTTCAGTACTTCCTAAATATCAAATGATTTTGGATTGC AGTGATTTCGAACTTGCTTGCCTCTGTTATTTGTTTCGTTGTTAACAACATGCTTGAAAT TTGTTTTGTGGTTCTTATAATATTCCCAATATATTGAAATTTGTGCTACCCTGACATGCC CTTTTGTGGTAATTCATCAACTTTTTACAGAGAATTCTCATCTTTAAATAAGAGGATAAT TTCTGTTTGTGAAACTTTTTGCATCCATAGATTATTAATTTCTGCTTGATATATATGAGA ACAGCATCAGATAAAACAACAAAGTCGGTAGTATCTGCTGAATTTTGATATCTGAAGTAG ATCAAATTTATCTACTGCTGTATTGCGTGCTTGCCTAGATTAGTTTAAAGCACCATTTGG TGCGTGCAGATCTCTATTCTCGCTAATCGCTATCTTTCATTGCTTTAGCAGAACATTTAT TTTACTATAAATAGGCTGCTCTGGCAGTTTTGCATATATGCTAGAATTACCAAGACATTG CTGTGATCCAGTACTAGTTCTAACATACTACTTAATTAGAGCCTGATCCTTCTGCATCAC TAGCCTTCATTGAGAAATCATCTTTTGTGCTATGCCAAACTATTGACCGTTAATGAGATT GTAGTTTCTTGTTTTCACATAGTAGATATTCTTTCTGAAAACTTGAAAATGTACCAATTA TTTATAGGTATTTATTGAGTTGTTTGTGCAGGGTGAAAATAACATGAACTGCTTTATTGT GTGTATATGATTCTTTCCTTTAATCATGTGCTCGTGATTTGATGTGGTCGACACTGTTTG TAGAATGGCTCAAAAAGATGGCCTGAGCGATCTTAGAAATTTGTCTCCTCATGTTCTTGT GAGAGGCAGTTTTCCTTCTGTGCAGAACATGATTGCTTCATATTTCCAACACGCTGCTCT GTCTTTGCAGGCCATACTTAACATGTGTGACAATATTGGCGGTACCTTAATCGACATGAA TGGACCTCTGCCTATGGCATACTAAATGATCATGGTGGCACTGCACATAATGAACTGCCA CGGTTTGCCTTCAGCGGCGTCGTCTACTCATCTGTGTGCTTCTTGTGAGTTGTGAAGCAT CCATCCTGACATTGCGCCATATTTCGCATTGTGGTTATTAGTAATATAGAAGAAAAAAGG GGTCGCAGCTCGTGCATACAGCATTCGGAGGAGCAAGGTTAAACCGTTCGATGGAATCAT CATGGAAATTACCAGCTTTCTGTATCATCATGGAAATTACCAGCTTTCTGAATAAGCAGA ACATGAAGTCTACAGTTGTACGGTGTACTTCATAAAGTCAGAAGCTGCGTATCGTTTGTT AGGTACAGTGCCATGTCGAGGCATTTACTAAGAAGTGGCCCAGGTCAACACTGATGAGAG CTTTCTTGAAAAGTGGAAACGCGATGGTTACTCCTTGGCCAAAGGACCGTTCTTCCATTT CCATCACAAGAACGGCGCCAACCATGGAGATTTAGCTCTCGAGTCATGTGGACTGCCGTC CATTTTACAATGGACGGCGAGCCCTTCGTCGATGCCTTCTGTGGTCTGAAATACTTCATG CCCTGTCAGGTTCCCCAAATTATCTGAATTTTGGCTGTGTACGATCCGTTTTGGATGTAG AGACCGGTTTAACCCATTTCTTTAAAAAAACTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)