cluster # 2065

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Oryza sativa
cluster # 2065 cluster # 2065 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_2065#0 length = 919 sequences # 2

consensusID : consensus_2065#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 919
fasta sequence

                              [TCATTGTGAAGACGTGAGGGCAAGTTATTTAATGTATATACAATGGTAACTTTTAACAACATAGTTTTACGATAGTACTAGACAAGTTAAACTTTTAAGAAAAAAAATCAGAAGTGCACATCCAATAGACAAAATAGTGTGTATGGATCGATTTAAGATGCCACATTTATTTTTAACTTCACACCATTTAACACAAATCTAAAGATAGTTTATATCCATATTTATAGTTAAAAATTAGTCTTTCTTAAAAATGGAGTGAGTACATATCAGGTGTACTGTCCAAAAGACATATGCAAAAAGAATTTACACTCGAATATGCAATTATGCATGATTTTTTTATTGTGCAAGGTCGTTTGCAGTAGGGCTAACCATTGTACAATTTTAGGCATGAGGGATAAAAGGAATAGGCTGAAAAAAACTGAGTTAAGCTCAAATTGCATTTAGAAGAGCTTTTAATAATGATAGTTTCGATCTGACATGTCAACAATCTATATGTAGACTGGGGGTAGCAAGTATCAACAAGTTGTCTCGAATGAGATCGGACATAGCTAACACTAATATGAAATATTTATTAGTTTTTACATGTAAAAGTACCGGATGTTTTTTTATTGCCCCCCCCCCCAACCCCCCAAACACACACAACACACACACCTTTATACTTGTCCTTCATTGCCCCGTCACAAGTAGAACGTGACTTGGCTGACATGGCTCTTAATAGCTAGTACCAATGATATTCTCTTTCTAATGATGGTAATAAGTGATTTAGTAGCAATATATTATGATAGGAGTTTCTAGCATGATTTATCTAGCATTTATGGTTTTAGTCCTATTTCATTGGTTCGCCATGCTTGAATTAAGTAGGTGTGACTTGAGTGATGCCATACTTTGACGAAAACCCTCAACTTGCAGATAGCTAGAT]

[+] EMBL CB637743             [TCATTGTGAAGACGTGAGGGCAAGTTATTTAATGTATATACAATGGTAACTTTTAACAACATAGTTTTACGATAGTACTAGACAAGTTAAACTTTTAAGAAAAAAAATCAGAAGTGCACATCCAATAGACAAAATAGTGTGTATGGATCGATTTAAGATGCCACATTTATTTTTAACTTCACACCATTTAACACAAATCTAAAGATAGTTTATATCCATATTTATAGTTAAAAATTAGTCTTTCTTAAAAATGGAGTGAGTACATATCAGGTGTACTGTCCAAAAGACATATGCAAAAAGAATTTACACTCGAATATGCAATTATGCATGATTTTTTTATTGTGCAAGGTCGTTTGCAGTAGGGCTAACCATTGTACAATTTTAGGCATGAGGGATAAAAGGAATAGGCTGAAAAAAACTGAGTTAAGCTCAAATTGCATTTAGAAGAGCTTTTAATAATGATAGTTTCGATCTGACATGTCAACAATCTATATGTAGACTGGGGGTAGCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CB640077             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGTTAAGCTCAAATTGCATTTAGAAGAGCTTTTAATAATGATAGTTTTGATCTGACATGTCAACAATCTATATGTAGACTTGGGGTAGCAAGTATCAACAAGTTGTCTCGAATGAGATCGGACATAGCTAACACTAATATGAAATATTTATTAGTTTTTACATGTAAAAGTACCGGATGTTTTTTTATTGCCCCCCCCCCCAACCCCCCAAACACACACAACACACACACCTTTATACTTGTCCTTCATTGCCCCGTCACAAGTAGAACGTGACTTGGCTGACATGGCTCTTAATAGCTAGTACCAATGATATTCTCTTTCTAATGATGGTAATAAGTGATTTAGTAGCAATATATTATGATAGGAGTTTCTAGCATGATTTATCTAGCATTTATGGTTTTAGTCCTATTTCATTGGTTCGCCATGCTTGAATTAAGTAGGTGTGACTTGAGTGATGCCATACTTTGACGAAAACCCTCAACTTGCAGATAGCTAGAT]




>consensus_2065#0
TCATTGTGAAGACGTGAGGGCAAGTTATTTAATGTATATACAATGGTAACTTTTAACAAC
ATAGTTTTACGATAGTACTAGACAAGTTAAACTTTTAAGAAAAAAAATCAGAAGTGCACA
TCCAATAGACAAAATAGTGTGTATGGATCGATTTAAGATGCCACATTTATTTTTAACTTC
ACACCATTTAACACAAATCTAAAGATAGTTTATATCCATATTTATAGTTAAAAATTAGTC
TTTCTTAAAAATGGAGTGAGTACATATCAGGTGTACTGTCCAAAAGACATATGCAAAAAG
AATTTACACTCGAATATGCAATTATGCATGATTTTTTTATTGTGCAAGGTCGTTTGCAGT
AGGGCTAACCATTGTACAATTTTAGGCATGAGGGATAAAAGGAATAGGCTGAAAAAAACT
GAGTTAAGCTCAAATTGCATTTAGAAGAGCTTTTAATAATGATAGTTTCGATCTGACATG
TCAACAATCTATATGTAGACTGGGGGTAGCAAGTATCAACAAGTTGTCTCGAATGAGATC
GGACATAGCTAACACTAATATGAAATATTTATTAGTTTTTACATGTAAAAGTACCGGATG
TTTTTTTATTGCCCCCCCCCCCAACCCCCCAAACACACACAACACACACACCTTTATACT
TGTCCTTCATTGCCCCGTCACAAGTAGAACGTGACTTGGCTGACATGGCTCTTAATAGCT
AGTACCAATGATATTCTCTTTCTAATGATGGTAATAAGTGATTTAGTAGCAATATATTAT
GATAGGAGTTTCTAGCATGATTTATCTAGCATTTATGGTTTTAGTCCTATTTCATTGGTT
CGCCATGCTTGAATTAAGTAGGTGTGACTTGAGTGATGCCATACTTTGACGAAAACCCTC
AACTTGCAGATAGCTAGAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case