cluster # 2253

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Oryza sativa
cluster # 2253 cluster # 2253 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_2253#0 length = 2827 sequences # 2
consensusID : consensus_2253#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2827
fasta sequence
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[+] EMBL AK102366             [TCTCATCCAAGCCACCACCCGTGAAAATCTTGGGAGATAAATCCATCTCCAACCTCCACCACCCCCGATTCTTCGCGATTAGTTGTTTCCTTCTTCTTCGCAGGATTCCCTCCTGCGAATTCTGCATCGCCATCATCCACTCCTGAAGGTCCAGTGACTTTACCTGCATTGTGTGATTGAGGCCTCACTTGTCGTCGCACACCGTCTTGTTTGCGGCAATGGAGGATCCACAGGGTGGTCAGGATTGTTCCAAGTTTGGGGCCTTTGTTGACAAGAATTCCGGTGCTTCATCGAGTAGTGCTGCTGACATTGAGCTTCAGAACATGTGTGGTACTTCTGTGGCAAGGACTGCTTCTTTGAGCACGGGAAGGGCTTCGCCTTCTCAATTCGCACCGACTGTTGGAAGATATCATCGTGCTGCCGGCTCCTGCCAAAGTGATGTTCTACCTGATGAGCAGTCTCTTGCATCAGCTTTTGACATGGTTCTGAGTTTCAGAAATCACCCTGTTGATTATCCTACCAATCCCTGCAATGTTGTGCCAAGTAATGGACTATATGTATCAGGCCCTATGAGGGCTACTTCAGTTCAGAGCTTTGATCCACTGCTTGTTCAGGATGAATCCATGCGTCCACAGTTTGGCGCTGGACATGGCAAGCTAAAGACTGATGAGTTCACTGTTGACCAACAAGAACAAGCACACATGCTCTCACATTACTTTGGGAATTGGCCACAGAACTATGGGATGAATAATATGGGTGGAGTTGCCAGTACTCCATACAAGCCATCAGCTTCACTCTACCAGCAACCATTTTATATGGATGAGCAATCTCAAATGTATGCACCTTATCAGCAGATTCCTTCAAACTTCTTGTTGCAGCATGATATGGATGTACAGAACCACTCTTCTATGCAACCACACTATGTTTATCCACAAATGCAACATGCTGCTGGGTCAAATGTTAGGAGCAATCAACAGGCTGCAGCTTGCACTTCTGCAAGGGGCAGATCAACATATGGACATCAACTGTTGCTGGATGGTGCTGTTTACCATAATGGAAATAACCAGATGAACAGTTTGTATATGGATGGTTTTCCTGGTATGTATACTGACAGTTCATTTGACTCCAGTGATTTTCACCGTCTGCTGGAAGCTGAAAAGTTTGCCCATCCGTATGAACTAAACTCTTCATCCAAAGGTTTCTTGCAACCTCAAATCCCAGATGATCTCAGCACGATGAAGATGCTGATGAATTCTGCTGGGGTAAATCGAGTAAGAGCTATCAAGTTCCCTCCTACAGTAAATGGCTATAGTGGTGTGGGTCGAAGAACCAATGGTTATGGCCATAACCATCTGGATGTTAAAAGTGATGAAACCTTGCACCTCAACGGGTTGAATTCCCAGTTTATGTCCTTAAAATCTGAGTATGATTTGGCGATGAAATCAACACAGCTGAATTATGGTTCAGTTGATGAAGTTGCTGGAAGGATTTATATGTTAGCGAAGGATCAAAACGGCTGCCGCTTTCTGCAAAAAGTATTCACTGAAGGCACCAAAGAGGACTTTGAAAAAATCTTAGCTGAAATTATTGATCATTTTGGAGAACTTATGATTGATCCATTCGGCAATTATTTGGTTCAGAAGTTGCTTGAAGAGTGCAGTGATGATCAGAGGACGCGTATAATTTGTGAAATTACCAGAGTGCCTGGAGAGCTTATTACAGTTGCTTGCAACATGCATGGGACTCGCACAGTTCAAAAGGTCATAGATACAATAAATACTCCGGAACAAATTTCGAAGGTTGTATCTGCATTGAGTCCTGGAGCAATGCGTTTGATGACAGATACTAATGGAAGTCATGTTGCACAACGGTGCTTGAAGAAATTGTTACCTGAGTATAAAGCGTTCCTTCTTGATGTTGCCGCATTGCGTTTTCTTAGATTAGCAAAAGATCAACATGGCTGTTGTATCATTCAAAAGTGTATTGAACATTCAAATGATGAGCAGAAGTACAACTTGTTGTGCAAGATCACATCCAGTGCCCTTAGCCTTTCAGAGGATCAGTATGGAAACTATGTCATTCAGTTTGTTGTCAACCTAGGAATTGAATGGGCCACAAGCAAAATAGTAAAAGAACTAAAGGGTCACTTTGGATATCTATCAATGCAGAAGTGTGGTAGCCATGTCGTCGAAAATTGTCTGAAGCAAGCATCGGAGCTCGACCGGGAAATGATTATCCATGAACTTATGGCTGATTCCAAGTTACCGCATATCATGGCAGATCCATTTGGGAATTTTGTGATTCAAACAGCACTTAAAGAGTGCAAGGGTGAACTACATAGCTCCTTTGTCGAAGCTATTAGGCCGCATGCTCCTGCGCTGCAGAACGATGTGTATGCGAAAAGGGTTTTATCGAAGACATATCTGAAGAACAAGCAATACCGACTTGGCATTTTTTAGCCTGTCATTTGGGTGATTGCAGGAAGGAAGGTGCAAGTTCAGGCAGCATGTATCAGAACAGGACTTTTAGTGTACAATGGTGTGATAAAGAAAAACAGTTCTTAGAGAAAATGATCTTTTTGTCTCAAGGTAGTCTTGGCGAAGGAAAGCTTTTGGTTGGACCATTTCAGTATATTTACGTTTGTAGAATTAATATAGCCAAAATAACTGTCAGTTGTGTTGTTGGATCGGTCATTAATCATGTAGTACGTCCTGTATCTGCAAAAACTGTAGTTTATCAGTAACATCTTGTAATCACTAGTCTGATCAGATGAGCTGTATCATCTGCAAGGGTTTATATTCCGGTTGTGTCCTTAGTAAAATTTTAG]
[+] EMBL CF306213             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCAGAGGACGCGTATAATTTGTGAAATTACCAGAGTGCCTGGAGAGCTTATTACAGTTGCTTGCAACATGCATGGGACTCGCACAGTTCAAAAGGTCATAGATACAATAAATACTCCGGAACAAATTTCGAAGGTTGTATCTGCATTGAGTCCTGGAGCAATGCGTTTGATGACAGATACTAATGGAAGTCATGTTGCACAACGGTGCTTGAAGAAATTGTTACCTGAGTATAAAGCGTTCCTTCTTGATGTTGCCGCATTGCGTTTTCTTAGATTAGCAAAAGATCAACATGGCTGTTGTATCATTCAAAAGTGTATCGAACATTCAAATGATGAGCAGAAGTACAACTTGTTGTGCAAGATCACATCCAGTGCCCTTGGCCTTTCAGAGGATCAGTATGGAAACTATGTCATTCAGTTTGTTGTCAACCTAGGAATTGAATGGGCCACAAGCAAAATAGTAAAAGAACTAAAGGGTAACTTTGGATATCTATCAATGCAGAAGTGTGGTAGCCATGTCGTCGAAAATTGTCTGAAGCAAGCATCGGAGCTCGACCGGGAAATGATTATCCACGAACTTATGGCTGATCCCAAGTTACCGCATATCATGGCAGATCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]




>consensus_2253#0
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TTAGGAGCAATCAACAGGCTGCAGCTTGCACTTCTGCAAGGGGCAGATCAACATATGGAC
ATCAACTGTTGCTGGATGGTGCTGTTTACCATAATGGAAATAACCAGATGAACAGTTTGT
ATATGGATGGTTTTCCTGGTATGTATACTGACAGTTCATTTGACTCCAGTGATTTTCACC
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ACTTTGAAAAAATCTTAGCTGAAATTATTGATCATTTTGGAGAACTTATGATTGATCCAT
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TAATTTGTGAAATTACCAGAGTGCCTGGAGAGCTTATTACAGTTGCTTGCAACATGCATG
GGACTCGCACAGTTCAAAAGGTCATAGATACAATAAATACTCCGGAACAAATTTCGAAGG
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CCGCATTGCGTTTTCTTAGATTAGCAAAAGATCAACATGGCTGTTGTATCATTCAAAAGT
GTATTGAACATTCAAATGATGAGCAGAAGTACAACTTGTTGTGCAAGATCACATCCAGTG
CCCTTAGCCTTTCAGAGGATCAGTATGGAAACTATGTCATTCAGTTTGTTGTCAACCTAG
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ATCCATTTGGGAATTTTGTGATTCAAACAGCACTTAAAGAGTGCAAGGGTGAACTACATA
GCTCCTTTGTCGAAGCTATTAGGCCGCATGCTCCTGCGCTGCAGAACGATGTGTATGCGA
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CTGTCATTTGGGTGATTGCAGGAAGGAAGGTGCAAGTTCAGGCAGCATGTATCAGAACAG
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GTCTCAAGGTAGTCTTGGCGAAGGAAAGCTTTTGGTTGGACCATTTCAGTATATTTACGT
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TCTGATCAGATGAGCTGTATCATCTGCAAGGGTTTATATTCCGGTTGTGTCCTTAGTAAA
ATTTTAG
clustalw multiple alignements is not computed in this case