cluster # 2274

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Oryza sativa
cluster # 2274 cluster # 2274 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_2274#0 length = 957 sequences # 2

consensusID : consensus_2274#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 957
fasta sequence

                              [TTGTATAGTTTTATCTATGTTCTAGACACCTACTTGAAGCCGCTCTAACAGCATGGTCTTGAACTTTTTTTAAACCTCTCATTTAGTTTTCATTTTTGGCTATAAAATTGCACATTTCCTTTTGTTGTATAGATTGCCATTCTTGACAGTGTGAACATGGGTGGTGGCAGAGGTGTTTCCATGCATACAACATTTTGCATTGCCACTGTCAAAAAAATTCGCATTTCACAGGACTGCTATTGCATGATTTATCTTGGATTAGAAAATACTTTCTGGGTTATCTCTCGATGTGTTTTGTAATAATTGTTCATCGAGCAAGACTGCACTCAGTTCAGTTTGTTATGTTACTGATGTTACATAACGCCTTGCAAATCTAAACTTGGGATGGAGAGTTTTGGCATGTTTCAAATTATACTACCAAGTTGGACAATGTTTATTGTCCTTCGAACTCTAATTTTGAAGCTTAATCTATATCCTTAGAAGTGCCAATGTCAGCTAGACTATATTTGTGGTTTGGACGCATTTTTCAGTACTACATAGCTTATTGAGTTTAATAACATTTGCACAGTTCTCTTCTTCACCTCTGTGGTTACCTGGAACATTGTTCTTAAACGTTGTGTTGTTCCTGGCAGTGTTTGGGCCAACATTCTGTAGGCACCATATATTAATTTTACTACTTGAGCTTAGTTTGGGACTCCAATATTCTAGGCATTTTTATGTTGATGTAATGGCGTGGAATTTGTCGGTGTTCCATGTATATTTAATTTAGTTGCTTAAAAGTCGGTGGTTTCGATCCGTCCACATCAAGCCTCCACACATGTTCATTACTAATTCATCTGCCTTTAAAAGCAAATTGGTAATTAGGGAGTAATTTCTGAATGTTCTAGGCTCAAAAGTGGTTCTGGTAATCTTGAATATTTGCTCTGGATGACATTCCCTCTATTTTTGCTTCTGACT]

[+] EMBL CB651294             [TTGTATAGTTTTATCTATGTTCTAGACACCTACTTGAAGCCGCTCTAACAGCATGGTCTTGAACTTTTTTTAAACCTCTCATTTAGTTTTCATTTTTGGCTATAAAATTGCACATTTCCTTTTGTTGTATAGATTGCCATTCTTGACAGTGTGAACATGGGTGGTGGCAGAGGTGTTTCCATGCATACAACATTTTGCATTGCCACTGTCAAAAAAATTCGCATTTCACAGGACTGCTATTGCATGATTTATCTTGGATTAGAAAATACTTTCTGGGTTATCTCTCGATGTGTTTTGTAATAATTGTTCATCGAGCAAGACTGCACTCAGTTCAGTTTGTTATGTTACTGATGTTACATAACGCCTTGCAAATCTAAACTTGGGATGGAGAGTTTTGGCATGTTTCAAATTATACTACCAAGTTGGACAATGTTTATTGTCCTTCGAACTCTAATTTTGAAGCTTAATCTATATCCTTAGAAGTGCCAATGTCAGCTAGACTATATTTGTGGTTTGGACGCATTTTTCAGTACTACATAGCTTATTGAGTTTAATAACATTTGCACAGTTCTCTTCTTCACCTCTGTGGTTACCTGGAACATTGTTCTTAAACGTTGTGTTGTTCCTGGCAGTGTTTGGGCCAACATTCTGTAGGCACCATATATTAATTTTACTACTTGAGCTTAGTTTGGGACTCCAATATTCTAGGCATTTTTATGTTGATGTAATGGC                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CB684453             [                                                                                                                                                                                       CATACAACATTTTGCATTGCCACTGTCAAAAAAATTCGCATTTCACAGGACTGCTATTGCATGATTTATCTTGGATTAGAAAATACTTTCTGGGTTATCTCTCGATGTGTTTTGTAATAATTGTTCATCGAGCAAGACTGCACTCAGTTCAGTTTGTTATGTTACTGATGTTACATAACACCTTGCAAATCTAAACTTGGGATGGAGAGTTTTGGCATGTTTCAAATTATACTACCAAGTTGGACAATGTTTATTGTCCTTCGAACTCTAATTTTGAAGCTTAATCTATATCCTTAGAAGTGCCAATGTCAGCTAGACTATATTTGTGGTTTGGACGCATTTTTCAGTACTACATAGCTTATTGAGTTTAATAACATTTGCACAGTTCTCTTCTTCACCTCTGTGGTTACCTGGAACATTGTTCTTAAACGTTGTGTTGTTCCTGGCAGTGTTTGGGCCAACATTCTGTAGGCACCATATATTAATTTTACTACTTGAGCTTAGTTTGGGACTCCAATATTCTAGGCATTTTTATGTTGATGTAATGGCGTGGAATTTGTCGGTGTTCCATGTATATTTAATTTAGTTGCTTAAAAGTCGGTGGTTTCGATCCGTCCACATCAAGCCTCCACACATGTTCATTACTAATTCATCTGCCTTTAAAAGCAAATTGGTAATTAGGGAGTAATTTCTGAATGTTCTAGGCTCAAAAGTGGTTCTGGTAATCTTGAATATTTGCTCTGGATGACATTCCCTCTATTTTTGCTTCTGACT]




>consensus_2274#0
TTGTATAGTTTTATCTATGTTCTAGACACCTACTTGAAGCCGCTCTAACAGCATGGTCTT
GAACTTTTTTTAAACCTCTCATTTAGTTTTCATTTTTGGCTATAAAATTGCACATTTCCT
TTTGTTGTATAGATTGCCATTCTTGACAGTGTGAACATGGGTGGTGGCAGAGGTGTTTCC
ATGCATACAACATTTTGCATTGCCACTGTCAAAAAAATTCGCATTTCACAGGACTGCTAT
TGCATGATTTATCTTGGATTAGAAAATACTTTCTGGGTTATCTCTCGATGTGTTTTGTAA
TAATTGTTCATCGAGCAAGACTGCACTCAGTTCAGTTTGTTATGTTACTGATGTTACATA
ACGCCTTGCAAATCTAAACTTGGGATGGAGAGTTTTGGCATGTTTCAAATTATACTACCA
AGTTGGACAATGTTTATTGTCCTTCGAACTCTAATTTTGAAGCTTAATCTATATCCTTAG
AAGTGCCAATGTCAGCTAGACTATATTTGTGGTTTGGACGCATTTTTCAGTACTACATAG
CTTATTGAGTTTAATAACATTTGCACAGTTCTCTTCTTCACCTCTGTGGTTACCTGGAAC
ATTGTTCTTAAACGTTGTGTTGTTCCTGGCAGTGTTTGGGCCAACATTCTGTAGGCACCA
TATATTAATTTTACTACTTGAGCTTAGTTTGGGACTCCAATATTCTAGGCATTTTTATGT
TGATGTAATGGCGTGGAATTTGTCGGTGTTCCATGTATATTTAATTTAGTTGCTTAAAAG
TCGGTGGTTTCGATCCGTCCACATCAAGCCTCCACACATGTTCATTACTAATTCATCTGC
CTTTAAAAGCAAATTGGTAATTAGGGAGTAATTTCTGAATGTTCTAGGCTCAAAAGTGGT
TCTGGTAATCTTGAATATTTGCTCTGGATGACATTCCCTCTATTTTTGCTTCTGACT

clustalw multiple alignements is not computed in this case