Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 2551 cluster # 2551       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2551#0 length = 842 sequences # 2  

consensusID : consensus_2551#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 842
fasta sequence
                              [CGACTGATAATAGGTGGTCTTGGGTAGAAGTTAAACATCTATCCAAATGTCTAGTCCAGGCCCTTGATGCTGGTCTTGAACATGCCCTCTTGGGCTCTGAAATGACTCTGGACAGGTACGCTGCTGCTGAGGGTTTCTATAAGCTAGCAATGGCCTACGCGCCTGTGCCAGATCTTCATATAATGTGGTTACTGCATCTATGTGATGCACATCAGGAGATGCAATCATGGGCTGAAGCTGCACAATGTGCAGTTGCTGTAGCTGGTGTTATCATGCAGGCACTTGTTGGAAGGAATGATGCGGTGTGGAGTAAGGAGCATGTTGCTTCCCTATGTAAGATTTGCCCTATTGTGAACACTGATGTTAGCTCAGAAGCATCTGCAGCAGAAGTTGAGGGATATGGTGCATCCAAGCTTACTGTGGATTCAGCTGTCAAGTATCTTCAGCTGGCAAACAAACTTTTTGCACAAGCCGAACTCTATCACTTTTGTGCTAGTATTCAGGAACTCATCATTCCTGTGTATAAAAGCAGAAGGGCATATGGGCATCTGGCTAAGTGTCATACATCACTCAAGGATATCTATGAGTCAATTCTTGAACAGGAGGCTAGTCCTATACCATTCATTGATGCTACCTACTACCGGGTAGGGTTTTATGGGGAACCGGTTTGGCAAACTCAACAAAAAAGGAGTATGTGTCCAGAGAANCCAAGAAGATGTTCCGNCTTGGTGACATAATGGAGAAGCTTAAGTCCATAACCTAATGNAGGCTAAAATNGGATGGCAATCAAAACCTTTAAAACATCCATTNCCGGATTCCGAGAANANGTCAAACCCTGAATG]

[+] EMBL AU068630             [CGACTGATAATAGGTGGTCTTGGGTAGAAGTTAAACATCTATCCAAATGTCTAGTCCAGGCCCTTGATGCTGGTCTTGAACATGCCCTCTTGGGCTCTGAAATGACTCTGGACAGGTACGCTGCTGCTGAGGGTTTCTATAAGCTAGCAATGGCCTACGCGCCTGTGCCAGATCTTCATATAATGTGGTTACTGCATCTATGTGATGCACATCAGGAGATGCAATCATGGGCTGAAGCTGCACAATGTGCAGTTGCTGTAGCTGGTGTTATCATGCAGGCACTTGTTGGAAGGAATGATGCGGTGTGGAGTAAGGAGCATGTTGCTTCCCTATGTAAGATTTGCCCTATTGTGAACACTGATGTTAGCTCAGAAGCATCTGCAGCAGAAGTTGAGGGATATGGTGCATCCAAGCTTACTGTGGATTCAGCTGTCAAGTATCTTCAGCTGGCAAACAAACTTTTTGCACAAGCCGAACTCTATCACTTTTGTGCTAGTATTCAGGAACTCATCATTCCTGTGTATAAAAGCAGAAGGGCATATGGGCATCTGGCTAAGTGTCATACATCACTCAAGGATATCTATGAGTCAATTCTTGAACAGGAGGCTAGTCCTATACCATTCATTGATGCTACCTACTACCGGGTAGGGTTTTATGGGGAACCGGTTTGGCAAACTCAACAAAAAAGGAGTATGTGTCCAGAGAANCCAAGAAGATGTTCCGNCTTGGTGACATAATGGAGAAGCTTAAGTCCATAACCTAATGNAGGCTAAAATNGGATGGCAATCAAAACCTTTAAAACATCCATTNCCGGATTCCGAGAANANGTCAAACCCTGAATG]
[+] EMBL AU062737             [                                                                              AACATGCCCTCTTGGGCTCTGAAATGACTCTGGACAGGTACGCTGCTGCTGAGGGTTTCTATAAGCTAGCAATGGCCTACGCGCCTGTGCCAGATCTTCATATAATGTGGTTACTGCATCTATGTGATGCACATCAGGAGATGCAATCATGGGCTGAAGCTGCACAATGTGCAGTTGCTGTAGCTGGTGTTATCATGCAGGCACTTGTTGGAAGGAATGATGCGGTGTGGAGTAAGGAGCATGTTGCTTCCCNATGTAAGNTTTNCCCTATTGTNGACACTGATTGTAGCTCAGAAGCATCTtc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]


>consensus_2551#0 CGACTGATAATAGGTGGTCTTGGGTAGAAGTTAAACATCTATCCAAATGTCTAGTCCAGG CCCTTGATGCTGGTCTTGAACATGCCCTCTTGGGCTCTGAAATGACTCTGGACAGGTACG CTGCTGCTGAGGGTTTCTATAAGCTAGCAATGGCCTACGCGCCTGTGCCAGATCTTCATA TAATGTGGTTACTGCATCTATGTGATGCACATCAGGAGATGCAATCATGGGCTGAAGCTG CACAATGTGCAGTTGCTGTAGCTGGTGTTATCATGCAGGCACTTGTTGGAAGGAATGATG CGGTGTGGAGTAAGGAGCATGTTGCTTCCCTATGTAAGATTTGCCCTATTGTGAACACTG ATGTTAGCTCAGAAGCATCTGCAGCAGAAGTTGAGGGATATGGTGCATCCAAGCTTACTG TGGATTCAGCTGTCAAGTATCTTCAGCTGGCAAACAAACTTTTTGCACAAGCCGAACTCT ATCACTTTTGTGCTAGTATTCAGGAACTCATCATTCCTGTGTATAAAAGCAGAAGGGCAT ATGGGCATCTGGCTAAGTGTCATACATCACTCAAGGATATCTATGAGTCAATTCTTGAAC AGGAGGCTAGTCCTATACCATTCATTGATGCTACCTACTACCGGGTAGGGTTTTATGGGG AACCGGTTTGGCAAACTCAACAAAAAAGGAGTATGTGTCCAGAGAANCCAAGAAGATGTT CCGNCTTGGTGACATAATGGAGAAGCTTAAGTCCATAACCTAATGNAGGCTAAAATNGGA TGGCAATCAAAACCTTTAAAACATCCATTNCCGGATTCCGAGAANANGTCAAACCCTGAA TG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)