cluster # 270

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Oryza sativa
cluster # 270 cluster # 270 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_270#0 length = 1348 sequences # 2
consensusID : consensus_270#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1348
fasta sequence
                              [AACTCCTAGCTGAAAAATTTGCACACTGAACTTCCCTGTGTTCTAAGGAAAAAAAAAATCTAGACATAACCTTGCTGATCTGTATTATGGACCGGCCATTGGAGTGCATAATGCATAACTGCTGATCACTTTGTTGGCACAAAACTTACGCATAGACATAGGAGGTACTTATGTATAATTGTATCTTTAATCAGGACTTTGTTTTCAACCATTTTGTTGATATAACAGTTATACTGTAGTAATGATGAGTACAGTCTCCAATGTAAACTCAGGGCAAATCAGATTTATCCCTTTTTGGTGCTTGGTATCTTTTTGTATTTTTCATGAGCGATGGCATTTTTGAACCCAAAATAGAGGGAAAGAGAAGGATCTCTGTGGGGGCATGCTATGTACTACAGTTCTTTGAGACCATGTAGGTGTGGATGCTTGTTTTGACCTTTTCCTTAACATATAGAAAGAATAAACATTAAATAAATGATGACATGGAAATGAAATTCATAAAGGAGTACATAAGCTAGTACTCCTGAAAATATCACTTCATATTCCCCCATGATTCAGTAACATGAATATCATACCATCAGCAGCAGTGAAATTTTTATGCGTAGACGGTTTGTTTCTTAAGGTATATATTTTTTATGTTTACAATTGTCTGTCGAGTTTACTGGTCAATTGAGCAACAAC-GGTACTTTTAACTGTTAATATCACTTGGTTTGCTATGTATCCTTGTTGTTCTGGCTTTGTTGCTTTACAGCCATTCTGCTTACGCTATTGGCATCTGTTATTTAGAAAACCATTTTCTAACAGTTTTTAGATTTCCTTTCGAGTCTCCAACTGTTTTTAACCTCCAAGTTGCCACATAATGCATAAATATACCGAGTAAGTTTGCCCCCCTCTGAAATATGGATGTTAGATACTCAGACAGGTTCAGTATGTGTTGGGTGTTGTTTTCTGAGTTTGTGGTTGTCATAAGATGCAGCGAAATTACTGCGCTGTATCTTGGACCAATGCAATCAGCGAAGTCCTTATCGTGCCAAAAGGATGTGCATGGATTTTCCATCATTTGCAAACTTGAGGATGGCCTGCCCTGATGCCCTCAGATGCTGAT-GAAGTGTGTGGTTCATGAAAACGTGAGAAGCTAAGTAGTGGAGTAACGGGAGTGAGTACCAGTGTGGCCACTATGAAGAAAGTTAATTACTGAGAAATTAAGACTTGAGCATGTTATTTTCAAGCAACTTGTACAGCATTATATTGCACTACCATCAAATGCTTCTCCTGCCTATACAATACTCTGCAAGCTCTTGTATTGTACACTGTTTTATCTTGTTTAAAGTATGCTTGTTTTTGCTTA]

[+] EMBL AK108784             [AACTCCTAGCTGAAAAATTTGCACACTGAACTTCCCTGTGTTCTAAGGAAAAAAAAAATCTAGACATAACCTTGCTGATCTGTATTATGGACCGGCCATTGGAGTGCATAATGCATAACTGCTGATCACTTTGTTGGCACAAAACTTACGCATAGACATAGGAGGTACTTATGTATAATTGTATCTTTAATCAGGACTTTGTTTTCAACCATTTTGTTGATATAACAGTTATACTGTAGTAATGATGAGTACAGTCTCCAATGTAAACTCAGGGCAAATCAGATTTATCCCTTTTTGGTGCTTGGTATCTTTTTGTATTTTTCATGAGCGATGGCATTTTTGAACCCAAAATAGAGGGAAAGAGAAGGATCTCTGTGGGGGCATGCTATGTACTACAGTTCTTTGAGACCATGTAGGTGTGGATGCTTGTTTTGACCTTTTCCTTAACATATAGAAAGAATAAACATTAAATAAATGATGACATGGAAATGAAATTCATAAAGGAGTACATAAGCTAGTACTCCTGAAAATATCACTTCATATTCCCCCATGATTCAGTAACATGAATATCATACCATCAGCAGCAGTGAAATTTTTATGCGTAGACGGTTTGTTTCTTAAGGTATATATTTTTTATGTTTACAATTGTCTGTCGAGTTTACTGGTCAATTGAGCAACAAC GGTACTTTTAACTGTTAATATCACTTGGTTTGCTATGTATCCTTGTTGTTCTGGCTTTGTTGCTTTACAGCCATTCTGCTTACGCTATTGGCATCTGTTATTTAGAAAACCATTTTCTAACAGTTTTTAGATTTCCTTTCGAGTCTCCAACTGTTTTTAACCTCCAAGTTGCCACATAATGCATAAATATACCGAGTAAGTTTGCCCCCCTCTGAAATATGGATGTTAGATACTCAGACAGGTTCAGTATGTGTTGGGTGTTGTTTTCTGAGTTTGTGGTTGTCATAAGATGCAGCGAAATTACTGCGCTGTATCTTGGACCAATGCAATCAGCGAAGTCCTTATCGTGCCAAAAGGATGTGCATGGATTTTCCATCATTTGCAAACTTGAGGATGGCCTGCCCTGATGCCCTCAGATGCTGAT GAAGTGTGTGGTTCATGAAAACGTGAGAAGCTAAGTAGTGGAGTAACGGGAGTGAGTACCAGTGTGGCCACTATGAAGAAAGTTAATTACTGAGAAATTAAGACTTGAGCATGTTATTTTCAAGCAACTTGTACAGCATTATATTGCACTACCATCAAATGCTTCTCCTGCCTATACAATACTCTGCAAGCTCTTGTATTGTACACTGTTTTATCTTGTTTAAAGTATGCTTGTTTTTGCTTA]
[-] EMBL CA760573             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CCCCATGATTCAGTAACATGAATATCATACCATCAGCAGCAGTGAAATTNTTATGCGTAGACGGTTTGTTTCNTAAGGTATATATTTTTTATGTTTACAATTGTCTGTCGAGTTTACTGGTCAATTGAGCAACAACGGGTACTTTTAACTGTTAATATCACTTGGTNTGCTATGTATCCTTGTTGTTCTGGCTTTGTTGCTTTACAGCCATTCTGCTTACGCTATTGGCATCTGTTATTTAGAAAACCATTTTCTAACAGTTTTTAGATTTCCTTTCGAGTCTCCAACTGTTTTTAACCTCCAAGTTGCCACATAATGCATAAATATACCGAGTAAGTTT CCCCCCTCTGAAATATGGATGTTAGATACTCAGACAGGTTCAGTATGTGTTGGGTGTTGTTTTCTGAGTTTGTGGTTGTCGTAAGATGCAGCGAAATTACTGCGCTGTATCTTGGACCAATGCAATCAGCGAAGTCCTTATCGTGCCAAAAGGATGTGCATGGATTTTCCGTCATTTGCAAACTTGAGGATGGCCTGCCCTGATGCCCTCAGATGCTGATGGAAGTGTGTGGTTCATGAAAACGTGAGAAGCTAAGTAGTGGAGTAACGGGAGTGAGTACCAGTGTGGCCCCTATGAAGAAAGTTAATTACTGAGAAATTAAGACTTGAGCATGTTATTTTCAAaaaaaaaaa                                                                                                               ]




>consensus_270#0
AACTCCTAGCTGAAAAATTTGCACACTGAACTTCCCTGTGTTCTAAGGAAAAAAAAAATC
TAGACATAACCTTGCTGATCTGTATTATGGACCGGCCATTGGAGTGCATAATGCATAACT
GCTGATCACTTTGTTGGCACAAAACTTACGCATAGACATAGGAGGTACTTATGTATAATT
GTATCTTTAATCAGGACTTTGTTTTCAACCATTTTGTTGATATAACAGTTATACTGTAGT
AATGATGAGTACAGTCTCCAATGTAAACTCAGGGCAAATCAGATTTATCCCTTTTTGGTG
CTTGGTATCTTTTTGTATTTTTCATGAGCGATGGCATTTTTGAACCCAAAATAGAGGGAA
AGAGAAGGATCTCTGTGGGGGCATGCTATGTACTACAGTTCTTTGAGACCATGTAGGTGT
GGATGCTTGTTTTGACCTTTTCCTTAACATATAGAAAGAATAAACATTAAATAAATGATG
ACATGGAAATGAAATTCATAAAGGAGTACATAAGCTAGTACTCCTGAAAATATCACTTCA
TATTCCCCCATGATTCAGTAACATGAATATCATACCATCAGCAGCAGTGAAATTTTTATG
CGTAGACGGTTTGTTTCTTAAGGTATATATTTTTTATGTTTACAATTGTCTGTCGAGTTT
ACTGGTCAATTGAGCAACAACGGTACTTTTAACTGTTAATATCACTTGGTTTGCTATGTA
TCCTTGTTGTTCTGGCTTTGTTGCTTTACAGCCATTCTGCTTACGCTATTGGCATCTGTT
ATTTAGAAAACCATTTTCTAACAGTTTTTAGATTTCCTTTCGAGTCTCCAACTGTTTTTA
ACCTCCAAGTTGCCACATAATGCATAAATATACCGAGTAAGTTTGCCCCCCTCTGAAATA
TGGATGTTAGATACTCAGACAGGTTCAGTATGTGTTGGGTGTTGTTTTCTGAGTTTGTGG
TTGTCATAAGATGCAGCGAAATTACTGCGCTGTATCTTGGACCAATGCAATCAGCGAAGT
CCTTATCGTGCCAAAAGGATGTGCATGGATTTTCCATCATTTGCAAACTTGAGGATGGCC
TGCCCTGATGCCCTCAGATGCTGATGAAGTGTGTGGTTCATGAAAACGTGAGAAGCTAAG
TAGTGGAGTAACGGGAGTGAGTACCAGTGTGGCCACTATGAAGAAAGTTAATTACTGAGA
AATTAAGACTTGAGCATGTTATTTTCAAGCAACTTGTACAGCATTATATTGCACTACCAT
CAAATGCTTCTCCTGCCTATACAATACTCTGCAAGCTCTTGTATTGTACACTGTTTTATC
TTGTTTAAAGTATGCTTGTTTTTGCTTA
clustalw multiple alignements is not computed in this case