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Oryza sativa
cluster # 2754 cluster # 2754       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2754#0 length = 2827 sequences # 2  

consensusID : consensus_2754#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2827
fasta sequence
                              [GGGCCGGCGACGAGCATGGCAGGTGACGGTGCCAAGTGCTCCGACGAGGTGAACGACGGCACCTACTTCATGGCCGGCGTGATGGCCGTGACCGGCCTCATGGCGACCGTCCTGGCGCTCTCCGGCATCTTCCATTGCGCGCTTCGACGCGTTGGGCAGCCAAGCATAATCTCGCACATCCT-----GGCCGGCGTGGTGGTCGGGCCGACGGTGCTCGGCCGCGCCGTGGACCTGCGTCCTCTGGGCATGCAGGACGCCGGCAGCGCGCTCAGCGACACCATCTACTTCGTCCGCATCATCTTCATGTTCTTCATCGGCCTGGAGATGGACCTCCGGTACCTCCGCCACCACCTGCGCCGCTCCCTCGCCATCGCCTGCGGCGGCTCGGGGCTCTGCCTCCTGCTCGCCGCCCTCGCGGGGCCCTTCTTCTACGGCCTCCTCCACCCCGGCCAGGGCCCCTTCAAGCCCGAGAAGCTCTACGCCTCCACCGCGCTCTTCATGCTCGTCCTCACCACCACCGCCTCCCCGGTCCTCATCCGCATCGTCACCGAGCTCAAGCTCACCGGCTCCGAGGCCGGCCAGCTCGCCATCGGCGCCGCCTTCGCCAACGACATGGCTAGCCTCTCCGTCTTCAGCATCATGGTCGTCGGCACCACCGCCTACGGCCCCGACGGCCAGCCCACCCCATCCTTCCCGGACATGTCCATCGTCATGTCCATGGCCTTCACGGCGTGCCTGGCGGTGCTCGCGGCCGCCAGGGCCCGCCAGGCTGCTCAACAGGCTCAAGCGCGGGCCGCCGCTACGTCAGCAAGTACGAGCTCTGCGCCATGCTCCTGCTCATCATCGCCCTCTCGCTGCTCGAGCAGGTGTTCGGCTACAGCGCCTCCATGACCGCCTTCCTCATCGGCCTCGCCATGCCGCGCGACGGGCCCACGGCGCGCACGCTCGTCGACCGCCTCACCTATCCCGTGCACCAGCTCGTCATGCCGCTCTGCTTCGGGGCCATCGGCGCAAGGCTCGACTTCGCCGCCGTCGGCAGCTTCACAGCCATGCAGTTCGCCGTCGCCGTCGCCTTCACGACGCTGCTCGGCGCAGTCGGGAAGGTGGGCGGCACGGTGCTCGCGGGCCGCATGCTGGGCATCTCGGCGAGGGAGTCGCTGGTGCTGGGCTTCCTGCTCAACGTCAAGGGCTACTGTGACATCCTCGCCATCAACTTCGGCAACCAGGCCGGCATCTGGGGCCAGACGGCGCAGGTGGTGCTGCTCCTCTCCTCCATCCTCAACACCTTCATGGCAGGCCCGGCTGCCGCGGCCATCGTCCGACAGCAGCGCGCCGCCTCCCGATACCGGTCGCGCTGCCTTCAGGACCTCAAGGTCGACCACGAGCTCCGCGTGCTGGTCTGCGTCCACGGCGCCGGGGGCGTCCACACCATGCTGACGCTCGCGGAGCTTTCCAAGGGCACCGCGCCGCTGGCCGTCTACCTCCTCCACCTGGTGGAGCTTATGGCCGCGCGCAAGTACGCCATCACCCATCTGTACCATGACGCCGACGCCGACGACGACGAGTGGGGTTATGCCCGCGAGATCGAGCAGGTGGCCGCGGCGGTGAACACCTTCACCTACGACGCCGGCGTGCCGGTGCGGCAGATGACCGCCATCTCCAGCCTGGGGTCCATGGACGCAGACGTGCGCAACGGCGTGGAGGACTCGCGCGCGTCGCTGGTGATCGTGCCCTTCCACAAGGAGCAGCGGTACGACGGGCGCATGGTGTGCCGGCGAGAGGGGAGGCGGCAGCTGAACCAGCGGATCCTGCAGCGCTTGCCCTGCACTGTCGGGGTCCTGGTGGAACGGCGCCTCGGCGGGGGCGGCGACAAGGGCGCGGAAGACGTGGTGAAGAACCAGGTGGTGGCGGTGTTCCTGGGCGGGCCGGACGACAGGGAGGCGGTAGCGTACGCGACGCGGCTGGCGGCGCACCCGTGGGTGAGCGTGACGGTGGTGAGATTCCTTCCAGCGCGACAGGATGATATTACCATTGGCATTGATGAACAATTATTAGCCACCACCAAGAGCCATGGCGGTGAGGGCGCCATGGAGGTGGCGGTGGAGGACGAGGAGGCGATGGCGGATGAGGAGTTCATGGCGGACGTGTACGCGAGGCTGGTGTTGGCGGGACAGGTGGAGTACACGGAGAGGTACGTGAGCAACGGCGCGGAGATGGTGAATTCGTTGAGCGCCATGGTGGGGACGTACTCGCTGTTCGTGGTGGGGAAGGGCGGCGGCGGCTCGGCGGCGGCGGCCATGACGAGCGGCATGGGAGGGCTACTGGAGGACGAGTGTCCGGAGCTGGGCCCCGTCGGGGAGGTGCTGGCCTCCGACGACTTCACGGCCTGCGGCTCCGTGCTGGTGCTTCAGCAGCACAGCGCGCATGTGCATCGCAGGATGAGGAGGTGGAATCCCAACATTCACATCACCACCACACCCTCGTCGTCCGATCATCATAGCCACCCACCCTAGCTATATACTACTTCATCTCCGACGACAACATCATCCATGGCGCCATGCATAGAACAAATTAATTAAGAGGAGTACGTGTGGCACGCAATGGCTAGCTGGTTGGACTGGATCGACCTAGCTAGAACGGGGCCGGGTTGACATTGCACCGATCGATCGATCGATGATCTGCATCTAATTGCCATGGGAAATTCAGTTGGTTTTAGGGTAAAAATCATATGCACCCGTGTCACGCATATACGCCATGACCCCATGTGTGGGGATAGATGAGTGAGTATATGTACCGATCGAAATAAACAGACTCGATTTTGAGGTTGGAA]

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[+] EMBL AK100456             [GGGCCGGCAACGAGCATGGCAGGTGACGGTGCCAAGTGCTCCGACGAGGTGAACGACGGCACCTACTTCATGGCCGGCGTGATGGCCGTGACCGGCCTCATGGCGACCGTCCTGGCGCTCTCCGGCATCTTCCATTGCGCGCTTCGACGCGTTGGGCAGCCAAGCATAATCTCGCACATCCTGTGCAGGCCGGCGTGGTGGTCGGGCCGACGGTGCTCGGCCGCGCCGTGGACCTGCGTCCTCTGGGCATGCAGGACGCCGGCAGCGCGCTCAGCGACACCATCTACTTCGTCCGCATCATCTTCATGTTCTTCATCGGCCTGGAGATGGACCTCCGGTACCTCCGCCACCACCTGCGCCGCTCCCTCGCCATCGCCTGCGGCGGCTCGGGGCTCTGCCTCCTGCTCGCCGCCCTCGCGGGGCCCTTCTTCTACGGCCTCCTCCACCCCGGCCAGGGCCCCTTCAAGCCCGAGAAGCTCTACGCCTCCACCGCGCTCTTCATGCTCGTCCTCACCACCACCGCCTCCCCGGTCCTCATCCGCATCGTCACCGAGCTCAAGCTCACCGGCTCCGAGGCCGGCCAGCTCGCCATCGGCGCCGCCTTCGCCAACGACATGGCTAGCCTCTCCGTCTTCAGCATCATGGTCGTCGGCACCACCGCCTACGGCCCCGACGGCCAGCCCACCCCATCCTTCCCGGACATGTCCATCGTCATGTCCATGGCCTTCACGGCGTGCCTGGCGGTGCTCGCGGCCGCCAGGG CCGCCAGGCTGCTCAACAGGCTCAAGCGC GGCCGCCGCTACGTCAGCAAGTACGAGCTCTGCGCCATGCTCCTGCTCATCATCGCCCTCTCGCTGCTCGAGCAGGTGTTCGGCTACAGCGCCTCCATGACCGCCTTCCTCATCGGCCTCGCCATGCCGCGCGACGGGCCCACGGCGCGCACGCTCGTCGACCGCCTCACCTATCCCGTGCACCAGCTCGTCATGCCGCTCTGCTTCGGGGCCATCGGCGCAAGGCTCGACTTCGCCGCCGTCGGCAGCTTCACAGCCATGCAGTTCGCCGTCGCCGTCGCCTTCACGACGCTGCTCGGCGCAGTCGGGAAGGTGGGCGGCACGGTGCTCGCGGGCCGCATGCTGGGCATCTCGGCGAGGGAGTCGCTGGTGCTGGGCTTCCTGCTCAACGTCAAGGGCTACTGTGACATCCTCGCCATCAACTTCGGCAACCAGGCCGGCATCTGGGGCCAGACGGCGCAGGTGGTGCTGCTCCTCTCCTCCATCCTCAACACCTTCATGGCAGGCCCGGCTGCCGCGGCCATCGTCCGACAGCAGCGCGCCGCCTCCCGATACCGGTCGCGCTGCCTTCAGGACCTCAAGGTCGACCACGAGCTCCGCGTGCTGGTCTGCGTCCACGGCGCCGGGGGCGTCCACACCATGCTGACGCTCGCGGAGCTTTCCAAGGGCACCGCGCCGCTGGCCGTCTACCTCCTCCACCTGGTGGAGCTTATGGCCGCGCGCAAGTACGCCATCACCCATCTGTACCATGACGCCGACGCCGACGACGACGAGTGGGGTTATGCCCGCGAGATCGAGCAGGTGGCCGCGGCGGTGAACACCTTCACCTACGACGCCGGCGTGCCGGTGCGGCAGATGACCGCCATCTCCAGCCTGGGGTCCATGGACGCAGACGTGCGCAACGGCGTGGAGGACTCGCGCGCGTCGCTGGTGATCGTGCCCTTCCACAAGGAGCAGCGGTACGACGGGCGCATGGTGTGCCGGCGAGAGGGGAGGCGGCAGCTGAACCAGCGGATCCTGCAGCGCTTGCCCTGCACTGTCGGGGTCCTGGTGGAACGGCGCCTCGGCGGGGGCGGCGACAAGGGCGCGGAAGACGTGGTGAAGAACCAGGTGGTGGCGGTGTTCCTGGGCGGGCCGGACGACAGGGAGGCGGTAGCGTACGCGACGCGGCTGGCGGCGCACCCGTGGGTGAGCGTGACGGTGGTGAGATTCCTTCCAGCGCGACAGGATGATATTACCATTGGCATTGATGAACAATTATTAGCCACCACCAAGAGCCATGGCGGTGAGGGCGCCATGGAGGTGGCGGTGGAGGACGAGGAGGCGATGGCGGATGAGGAGTTCATGGCGGACGTGTACGCGAGGCTGGTGTTGGCGGGACAGGTGGAGTACACGGAGAGGTACGTGAGCAACGGCGCGGAGATGGTGAATTCGTTGAGCGCCATGGTGGGGACGTACTCGCTGTTCGTGGTGGGGAAGGGCGGCGGCGGCTCGGCGGCGGCGGCCATGACGAGCGGCATGGGAGGGCTACTGGAGGACGAGTGTCCGGAGCTGGGCCCCGTCGGGGAGGTGCTGGCCTCCGACGACTTCACGGCCTGCGGCTCCGTGCTGGTGCTTCAGCAGCACAGCGCGCATGTGCATCGCAGGATGAGGAGGTGGAATCCCAACATTCACATCACCACCACACCCTCGTCGTCCGATCATCATAGCCACCCACCCTAGCTATATACTACTTCATCTCCGACGGCAACATCATCCATGGCGCCATGCATAGAACAAATTAATTAAGAGGAGTACGTGTGGCACGCAATGGCTAGCTGGTTGGACTGGATCGACCTAGCTAGAACGGGGCCGGGTTGACATTGCACCGATCGATCGATCGATGATCTGCATCTAATTGCCATGGGAAATTCAGTTGG                                                                                                                        ]


>consensus_2754#0 GGGCCGGCGACGAGCATGGCAGGTGACGGTGCCAAGTGCTCCGACGAGGTGAACGACGGC ACCTACTTCATGGCCGGCGTGATGGCCGTGACCGGCCTCATGGCGACCGTCCTGGCGCTC TCCGGCATCTTCCATTGCGCGCTTCGACGCGTTGGGCAGCCAAGCATAATCTCGCACATC CTGGCCGGCGTGGTGGTCGGGCCGACGGTGCTCGGCCGCGCCGTGGACCTGCGTCCTCTG GGCATGCAGGACGCCGGCAGCGCGCTCAGCGACACCATCTACTTCGTCCGCATCATCTTC ATGTTCTTCATCGGCCTGGAGATGGACCTCCGGTACCTCCGCCACCACCTGCGCCGCTCC CTCGCCATCGCCTGCGGCGGCTCGGGGCTCTGCCTCCTGCTCGCCGCCCTCGCGGGGCCC TTCTTCTACGGCCTCCTCCACCCCGGCCAGGGCCCCTTCAAGCCCGAGAAGCTCTACGCC TCCACCGCGCTCTTCATGCTCGTCCTCACCACCACCGCCTCCCCGGTCCTCATCCGCATC GTCACCGAGCTCAAGCTCACCGGCTCCGAGGCCGGCCAGCTCGCCATCGGCGCCGCCTTC GCCAACGACATGGCTAGCCTCTCCGTCTTCAGCATCATGGTCGTCGGCACCACCGCCTAC GGCCCCGACGGCCAGCCCACCCCATCCTTCCCGGACATGTCCATCGTCATGTCCATGGCC TTCACGGCGTGCCTGGCGGTGCTCGCGGCCGCCAGGGCCCGCCAGGCTGCTCAACAGGCT CAAGCGCGGGCCGCCGCTACGTCAGCAAGTACGAGCTCTGCGCCATGCTCCTGCTCATCA TCGCCCTCTCGCTGCTCGAGCAGGTGTTCGGCTACAGCGCCTCCATGACCGCCTTCCTCA TCGGCCTCGCCATGCCGCGCGACGGGCCCACGGCGCGCACGCTCGTCGACCGCCTCACCT ATCCCGTGCACCAGCTCGTCATGCCGCTCTGCTTCGGGGCCATCGGCGCAAGGCTCGACT TCGCCGCCGTCGGCAGCTTCACAGCCATGCAGTTCGCCGTCGCCGTCGCCTTCACGACGC TGCTCGGCGCAGTCGGGAAGGTGGGCGGCACGGTGCTCGCGGGCCGCATGCTGGGCATCT CGGCGAGGGAGTCGCTGGTGCTGGGCTTCCTGCTCAACGTCAAGGGCTACTGTGACATCC TCGCCATCAACTTCGGCAACCAGGCCGGCATCTGGGGCCAGACGGCGCAGGTGGTGCTGC TCCTCTCCTCCATCCTCAACACCTTCATGGCAGGCCCGGCTGCCGCGGCCATCGTCCGAC AGCAGCGCGCCGCCTCCCGATACCGGTCGCGCTGCCTTCAGGACCTCAAGGTCGACCACG AGCTCCGCGTGCTGGTCTGCGTCCACGGCGCCGGGGGCGTCCACACCATGCTGACGCTCG CGGAGCTTTCCAAGGGCACCGCGCCGCTGGCCGTCTACCTCCTCCACCTGGTGGAGCTTA TGGCCGCGCGCAAGTACGCCATCACCCATCTGTACCATGACGCCGACGCCGACGACGACG AGTGGGGTTATGCCCGCGAGATCGAGCAGGTGGCCGCGGCGGTGAACACCTTCACCTACG ACGCCGGCGTGCCGGTGCGGCAGATGACCGCCATCTCCAGCCTGGGGTCCATGGACGCAG ACGTGCGCAACGGCGTGGAGGACTCGCGCGCGTCGCTGGTGATCGTGCCCTTCCACAAGG AGCAGCGGTACGACGGGCGCATGGTGTGCCGGCGAGAGGGGAGGCGGCAGCTGAACCAGC GGATCCTGCAGCGCTTGCCCTGCACTGTCGGGGTCCTGGTGGAACGGCGCCTCGGCGGGG GCGGCGACAAGGGCGCGGAAGACGTGGTGAAGAACCAGGTGGTGGCGGTGTTCCTGGGCG GGCCGGACGACAGGGAGGCGGTAGCGTACGCGACGCGGCTGGCGGCGCACCCGTGGGTGA GCGTGACGGTGGTGAGATTCCTTCCAGCGCGACAGGATGATATTACCATTGGCATTGATG AACAATTATTAGCCACCACCAAGAGCCATGGCGGTGAGGGCGCCATGGAGGTGGCGGTGG AGGACGAGGAGGCGATGGCGGATGAGGAGTTCATGGCGGACGTGTACGCGAGGCTGGTGT TGGCGGGACAGGTGGAGTACACGGAGAGGTACGTGAGCAACGGCGCGGAGATGGTGAATT CGTTGAGCGCCATGGTGGGGACGTACTCGCTGTTCGTGGTGGGGAAGGGCGGCGGCGGCT CGGCGGCGGCGGCCATGACGAGCGGCATGGGAGGGCTACTGGAGGACGAGTGTCCGGAGC TGGGCCCCGTCGGGGAGGTGCTGGCCTCCGACGACTTCACGGCCTGCGGCTCCGTGCTGG TGCTTCAGCAGCACAGCGCGCATGTGCATCGCAGGATGAGGAGGTGGAATCCCAACATTC ACATCACCACCACACCCTCGTCGTCCGATCATCATAGCCACCCACCCTAGCTATATACTA CTTCATCTCCGACGACAACATCATCCATGGCGCCATGCATAGAACAAATTAATTAAGAGG AGTACGTGTGGCACGCAATGGCTAGCTGGTTGGACTGGATCGACCTAGCTAGAACGGGGC CGGGTTGACATTGCACCGATCGATCGATCGATGATCTGCATCTAATTGCCATGGGAAATT CAGTTGGTTTTAGGGTAAAAATCATATGCACCCGTGTCACGCATATACGCCATGACCCCA TGTGTGGGGATAGATGAGTGAGTATATGTACCGATCGAAATAAACAGACTCGATTTTGAG GTTGGAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)