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Oryza sativa
cluster # 2768 cluster # 2768       Sequences # 2       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2768#0 length = 1928 sequences # 1  
consensus_2768#1 length = 1809 sequences # 1  

consensusID : consensus_2768#0
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Sequences nbr = 1
consensus length = 1928
fasta sequence
                              [CACACGACGCCCCAAACCCTCGTCGGCTCGTCCCCTTCCCTAGTTCCCTTCCGGCCCCGGCGGCGGCGAGCGGCGACCATGGACACCCGCGTGCCGCCCGTCCCCATGGGCCGCGCGATGGCGGCCGAGTTCCGGCGGCGCGGGGACGACCCGGACGACGTGCAGGGGACGGTGGCGCGCGTGCTCTCCTACATCCACTACGCCCTCCCCGACCCGCCCGTCTCCGCCGCCGCGCGCCTCTACGCGCTCGCCCCGCACGACGCCGTCGACCGCATCAGCGCCCTCCCCGACGCGCTCCTCCGCAGGGTCGTCTCCCGCCTCCCCGTCAAGGACGCCGCGCGCACCGCCGCGCTCTCCCGCCGCTGGCGCCCGCTCTGGCGCTCCACGCCGCTCGTCCTCGTCGACGCCCACCTCCTCTCCTCCTCCTCCGCCGCCCCCGGCGCTCCCGACGACTCCTCCAAGAAGGCGCGGGAGGCGGCACGCGGCGTCACCCACGCCGTGTCCCGCGTCATGGGCGCGCACCCGGGCCCGTTCCGGTGCGTCCACCTCACGTCCAGCTGCATGGAGGAGTTCCAGGGCATGCTCGCGAACTGGCTCCAGGTGCTCGCCATGAAGGGCATCCAGGAGCTCGTCCTCGTGAACCGCCCGTGGCCGCTCGACCTGGGCCTCCCCGCCACCTTCTTCGGCATGGCCACGCTCACCCGCCTCTACCTCGGCCTCTGGAAGTTCCCCGCCACGGCTGACCTCCCGCGCGGCGTCTCGTTCCCCAACCTCCGCGAGCTCGGCCTCTGCAGCGTCGTCATGGACACGCAGGACATGGATCTCGTCCTCGCCAGGAGCCCCGTCCTGGAGACGCTCTGCATCAAGGGGAACCTGTTCAGGATGCGCATCCGCCTCGCCAGCCGCAGCCTCCGGTGCGCGCAGATCATCGGCTCCTCCTACGAGGAGATCGCCGTGGTGGACACGCCGTGCCTTGAGCGCCTCATCGTCTCCGGCACATGGAGGCATGACGGCGCCTCCTCCGGCAGCGTCAAGATTGGGAATGCGCCGGCTCTGCGCGTGTTTGGATACTTGGACCCTGCAGCGAACGTTCTTGTGGTTGGCAAAACCGCCATCAAGTCCGCGACAAAGGTGAGCCCAAGCAATATGGTACCAAACGTCAAGATCCTTGCTCTGGAGGTGCGTTTCGGTGTCCGCAACGATGCCAAGATGATCCCCAATGTCCTCAGATGCTTTCCCAACATTGAGAGGCTCCACATCAAGTCTGGAAAAACTGATGAAACCACTGGCAAGCTCAACTTCAAGTTCTGGCAGGAGTCTGGTCCCATCGAGTGCATTCGGTCAAGCATCCAGATGATTGTTTTCCATGATTTTCATGGCACTCGGAGTGAGGTTAACTTTCTCAAGTTTTTCTTCGAGACTACGCGGGTGCTGAAGATAGTGGTCATTTTGTTTGACACTGGAAGTTTTTCTTCGATGGATGAGGTGCGTTCCAAGGTGGAGGTTCTGAGGGCTGCAAAACGGCCGACTGGTTGTTTAGTCCTGGTCACCCCAAGTACAGAACCTGAAGAGTGTAACATTTGGAGCTTCAAGAGAGGATCTGATTTTTCTCGTTTTGACCCTTTCACGGACTACTGAAAGAAAAAGATGCATTTCCATGTCATTTTGTGATCCAAGACAAATATCTTTGGAAGTGGTTAGTGCTCTGTTTGCAGCTTCATGGTATTCATGTTAGAGTTTCGGCTTCCCTTTTATTGAAGATTGGACAGCGGACTTGATTATACTGTCTTGAGAAGTGTTGAAATTAGTGCTTGAATAGTGTTATCTATCATGCAAATGTCAAATTATGTTTTCTGGATGACAACTAAGAACTACTGTGTCTGCTATGCGTTTCATTTGTTGTTGGACGATGATGATGTTATGTTGCA]

[+] EMBL AK106410             [CACACGACGCCCCAAACCCTCGTCGGCTCGTCCCCTTCCCTAGTTCCCTTCCGGCCCCGGCGGCGGCGAGCGGCGACCATGGACACCCGCGTGCCGCCCGTCCCCATGGGCCGCGCGATGGCGGCCGAGTTCCGGCGGCGCGGGGACGACCCGGACGACGTGCAGGGGACGGTGGCGCGCGTGCTCTCCTACATCCACTACGCCCTCCCCGACCCGCCCGTCTCCGCCGCCGCGCGCCTCTACGCGCTCGCCCCGCACGACGCCGTCGACCGCATCAGCGCCCTCCCCGACGCGCTCCTCCGCAGGGTCGTCTCCCGCCTCCCCGTCAAGGACGCCGCGCGCACCGCCGCGCTCTCCCGCCGCTGGCGCCCGCTCTGGCGCTCCACGCCGCTCGTCCTCGTCGACGCCCACCTCCTCTCCTCCTCCTCCGCCGCCCCCGGCGCTCCCGACGACTCCTCCAAGAAGGCGCGGGAGGCGGCACGCGGCGTCACCCACGCCGTGTCCCGCGTCATGGGCGCGCACCCGGGCCCGTTCCGGTGCGTCCACCTCACGTCCAGCTGCATGGAGGAGTTCCAGGGCATGCTCGCGAACTGGCTCCAGGTGCTCGCCATGAAGGGCATCCAGGAGCTCGTCCTCGTGAACCGCCCGTGGCCGCTCGACCTGGGCCTCCCCGCCACCTTCTTCGGCATGGCCACGCTCACCCGCCTCTACCTCGGCCTCTGGAAGTTCCCCGCCACGGCTGACCTCCCGCGCGGCGTCTCGTTCCCCAACCTCCGCGAGCTCGGCCTCTGCAGCGTCGTCATGGACACGCAGGACATGGATCTCGTCCTCGCCAGGAGCCCCGTCCTGGAGACGCTCTGCATCAAGGGGAACCTGTTCAGGATGCGCATCCGCCTCGCCAGCCGCAGCCTCCGGTGCGCGCAGATCATCGGCTCCTCCTACGAGGAGATCGCCGTGGTGGACACGCCGTGCCTTGAGCGCCTCATCGTCTCCGGCACATGGAGGCATGACGGCGCCTCCTCCGGCAGCGTCAAGATTGGGAATGCGCCGGCTCTGCGCGTGTTTGGATACTTGGACCCTGCAGCGAACGTTCTTGTGGTTGGCAAAACCGCCATCAAGTCCGCGACAAAGGTGAGCCCAAGCAATATGGTACCAAACGTCAAGATCCTTGCTCTGGAGGTGCGTTTCGGTGTCCGCAACGATGCCAAGATGATCCCCAATGTCCTCAGATGCTTTCCCAACATTGAGAGGCTCCACATCAAGTCTGGAAAAACTGATGAAACCACTGGCAAGCTCAACTTCAAGTTCTGGCAGGAGTCTGGTCCCATCGAGTGCATTCGGTCAAGCATCCAGATGATTGTTTTCCATGATTTTCATGGCACTCGGAGTGAGGTTAACTTTCTCAAGTTTTTCTTCGAGACTACGCGGGTGCTGAAGATAGTGGTCATTTTGTTTGACACTGGAAGTTTTTCTTCGATGGATGAGGTGCGTTCCAAGGTGGAGGTTCTGAGGGCTGCAAAACGGCCGACTGGTTGTTTAGTCCTGGTCACCCCAAGTACAGAACCTGAAGAGTGTAACATTTGGAGCTTCAAGAGAGGATCTGATTTTTCTCGTTTTGACCCTTTCACGGACTACTGAAAGAAAAAGATGCATTTCCATGTCATTTTGTGATCCAAGACAAATATCTTTGGAAGTGGTTAGTGCTCTGTTTGCAGCTTCATGGTATTCATGTTAGAGTTTCGGCTTCCCTTTTATTGAAGATTGGACAGCGGACTTGATTATACTGTCTTGAGAAGTGTTGAAATTAGTGCTTGAATAGTGTTATCTATCATGCAAATGTCAAATTATGTTTTCTGGATGACAACTAAGAACTACTGTGTCTGCTATGCGTTTCATTTGTTGTTGGACGATGATGATGTTATGTTGCA]


>consensus_2768#0 CACACGACGCCCCAAACCCTCGTCGGCTCGTCCCCTTCCCTAGTTCCCTTCCGGCCCCGG CGGCGGCGAGCGGCGACCATGGACACCCGCGTGCCGCCCGTCCCCATGGGCCGCGCGATG GCGGCCGAGTTCCGGCGGCGCGGGGACGACCCGGACGACGTGCAGGGGACGGTGGCGCGC GTGCTCTCCTACATCCACTACGCCCTCCCCGACCCGCCCGTCTCCGCCGCCGCGCGCCTC TACGCGCTCGCCCCGCACGACGCCGTCGACCGCATCAGCGCCCTCCCCGACGCGCTCCTC CGCAGGGTCGTCTCCCGCCTCCCCGTCAAGGACGCCGCGCGCACCGCCGCGCTCTCCCGC CGCTGGCGCCCGCTCTGGCGCTCCACGCCGCTCGTCCTCGTCGACGCCCACCTCCTCTCC TCCTCCTCCGCCGCCCCCGGCGCTCCCGACGACTCCTCCAAGAAGGCGCGGGAGGCGGCA CGCGGCGTCACCCACGCCGTGTCCCGCGTCATGGGCGCGCACCCGGGCCCGTTCCGGTGC GTCCACCTCACGTCCAGCTGCATGGAGGAGTTCCAGGGCATGCTCGCGAACTGGCTCCAG GTGCTCGCCATGAAGGGCATCCAGGAGCTCGTCCTCGTGAACCGCCCGTGGCCGCTCGAC CTGGGCCTCCCCGCCACCTTCTTCGGCATGGCCACGCTCACCCGCCTCTACCTCGGCCTC TGGAAGTTCCCCGCCACGGCTGACCTCCCGCGCGGCGTCTCGTTCCCCAACCTCCGCGAG CTCGGCCTCTGCAGCGTCGTCATGGACACGCAGGACATGGATCTCGTCCTCGCCAGGAGC CCCGTCCTGGAGACGCTCTGCATCAAGGGGAACCTGTTCAGGATGCGCATCCGCCTCGCC AGCCGCAGCCTCCGGTGCGCGCAGATCATCGGCTCCTCCTACGAGGAGATCGCCGTGGTG GACACGCCGTGCCTTGAGCGCCTCATCGTCTCCGGCACATGGAGGCATGACGGCGCCTCC TCCGGCAGCGTCAAGATTGGGAATGCGCCGGCTCTGCGCGTGTTTGGATACTTGGACCCT GCAGCGAACGTTCTTGTGGTTGGCAAAACCGCCATCAAGTCCGCGACAAAGGTGAGCCCA AGCAATATGGTACCAAACGTCAAGATCCTTGCTCTGGAGGTGCGTTTCGGTGTCCGCAAC GATGCCAAGATGATCCCCAATGTCCTCAGATGCTTTCCCAACATTGAGAGGCTCCACATC AAGTCTGGAAAAACTGATGAAACCACTGGCAAGCTCAACTTCAAGTTCTGGCAGGAGTCT GGTCCCATCGAGTGCATTCGGTCAAGCATCCAGATGATTGTTTTCCATGATTTTCATGGC ACTCGGAGTGAGGTTAACTTTCTCAAGTTTTTCTTCGAGACTACGCGGGTGCTGAAGATA GTGGTCATTTTGTTTGACACTGGAAGTTTTTCTTCGATGGATGAGGTGCGTTCCAAGGTG GAGGTTCTGAGGGCTGCAAAACGGCCGACTGGTTGTTTAGTCCTGGTCACCCCAAGTACA GAACCTGAAGAGTGTAACATTTGGAGCTTCAAGAGAGGATCTGATTTTTCTCGTTTTGAC CCTTTCACGGACTACTGAAAGAAAAAGATGCATTTCCATGTCATTTTGTGATCCAAGACA AATATCTTTGGAAGTGGTTAGTGCTCTGTTTGCAGCTTCATGGTATTCATGTTAGAGTTT CGGCTTCCCTTTTATTGAAGATTGGACAGCGGACTTGATTATACTGTCTTGAGAAGTGTT GAAATTAGTGCTTGAATAGTGTTATCTATCATGCAAATGTCAAATTATGTTTTCTGGATG ACAACTAAGAACTACTGTGTCTGCTATGCGTTTCATTTGTTGTTGGACGATGATGATGTT ATGTTGCA



consensusID : consensus_2768#1
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fasta sequence
                              [AACCCTCTTCCCTTCCGGCGTCGGCTCGGTGGGCGGCGGACATGGACACGAGGGTGCTACCCATCCCCATGGACGAGGCCACCATGGCCGAGTTCCGGCAGCGCGGCCAGGTCCCCGAGGACGTCGAGAGCTCCATCGGCACCGTCCTCTCCTACATCCACTTTGCCATCCCCGACGCGCCGGTCTCCTCCCACGCCCGCCTCTCCGCGCTCCCGCCCGACGACGACGACGACGGTGTCGACCGCCTCAGCCTCCTCCCCGACGCGCTCCTCCGCCGGATCGTCTCCCGCCTCCCCGTCAAGGACGCCGCGCGCACCGCCGCGCTCTCCTCCCGCTGGCGCGACGCCTGGCGCTCCACCCCGCTCGTCCTCGTCGACGCCGACCTCCTCCCCGCCGGCGTGTCCGACGCCGACACCGACGCCGCGCGCGAGGAGGCCCGCGCAGTCACCTTCGCCGTGTCCCGCGTCATCGCCGCGCACCCCGGCCCGTTCCGCCGCCTCCACCTCACCTCCAGCTTCATGGACCAGTACCAGGGTCTGCTCGCGAGCTGGCTCCAGGTGCTCGCCGTCAAGGGTATCCAGGAGCTCATCCTCGTCAACCGCCCGTTCCCGGCCGACCTCACCCTCCCCGCCACCTTCTTCGGCATGGCCACCCTCACCCGCCTCTACCTCGGCCTCTGGAAGTTCCCCGACACGGCCGCGCTCCCGCGCGCCGCCTGCTTCCCCAACCTCCGCGACCTCGGCTTCTCCCTCATCGGCATCACCAACCACGACATGGACTTCGTCCTCGCCAGGAGCCCCGTTCTGGAGACGCTCTGCCTCCAGGCCAACACGCTTCAGCGCGTCCGCGTCGCCAGCCGCAGCCTCCGGTGCCTGATGATGATGGGGTTCGACCAGGATGTCAACGTGGTCAACGCGCCCCGCCTCGAGCGCCTCATCATGCTCTACTCCTGTGGCTCCTCCATGCTGGTAAAGATTGGCCGTGCTCCCTCGCTGCGTGCAATTGGATACCTTGATCTGGAAACCCATGTGCTGGAGATCGGCGACACTATTATCAAGGCTGGAACAAGGGCTAGTCCAAGCACCATGGTTCCAAGTGTGAAGATCCTTGGCATAATTGTGTGTTTCGGAGTCCGCAATGAAGCCAAGATGCTGCCCAGTTTCCTCAGATGCTTTCCTAATGTTGAGACTCTGCACGTCGAATCCCGGAAAACTGATGAGCTCACTGGCAAGCTGAACCTCAAGTTCTGGCAGGATGCAGGCGCCATCGAATGCATCCAGTCTCACATTACCGTGATGATTTTTCGTCGTTTCCGAGCAACGCGGGGTGAGATTAACTTCCTCAAATTTGTCCTTGAGAGTGCGCGGATGCTGAAGAAGCTGATAATTGTGTCTCCCAAAGGAACATTTGCATCGACAGATGAGGCAAATTTCAGACTGAAGCCTCTGTTCGCCACAAAATGGGCTAGTAAATGTTGTTCACTAGTGGTCCTTGAGAGTGATGCTAGTGCAGGAGAAAGCAATTGGAACTTTGAGAGAGGATGTGATTTTTCACTTATGGACCCTTTTGCGATCATCATCCGATCTTCTCGGCTTGACATCTCTGGAAGTTGTTAGTGTTCTGTGGCAGTTTCTAAATGAGAGGGATTGTTTTGCTTCCTTGACTTCTGCTGTTTTTTGTTCCAATTTTGAGATTTATCAGTGCTCTCAATCCTGTAGCAACTCCAACAGTATTGTCTTTCCAGCAGAAGACAAATGTTATCTCAGATGAATGTTGTATTGACCTGGCATTGATCATGTGACATCACAC]

[+] EMBL AK100900             [AACCCTCTTCCCTTCCGGCGTCGGCTCGGTGGGCGGCGGACATGGACACGAGGGTGCTACCCATCCCCATGGACGAGGCCACCATGGCCGAGTTCCGGCAGCGCGGCCAGGTCCCCGAGGACGTCGAGAGCTCCATCGGCACCGTCCTCTCCTACATCCACTTTGCCATCCCCGACGCGCCGGTCTCCTCCCACGCCCGCCTCTCCGCGCTCCCGCCCGACGACGACGACGACGGTGTCGACCGCCTCAGCCTCCTCCCCGACGCGCTCCTCCGCCGGATCGTCTCCCGCCTCCCCGTCAAGGACGCCGCGCGCACCGCCGCGCTCTCCTCCCGCTGGCGCGACGCCTGGCGCTCCACCCCGCTCGTCCTCGTCGACGCCGACCTCCTCCCCGCCGGCGTGTCCGACGCCGACACCGACGCCGCGCGCGAGGAGGCCCGCGCAGTCACCTTCGCCGTGTCCCGCGTCATCGCCGCGCACCCCGGCCCGTTCCGCCGCCTCCACCTCACCTCCAGCTTCATGGACCAGTACCAGGGTCTGCTCGCGAGCTGGCTCCAGGTGCTCGCCGTCAAGGGTATCCAGGAGCTCATCCTCGTCAACCGCCCGTTCCCGGCCGACCTCACCCTCCCCGCCACCTTCTTCGGCATGGCCACCCTCACCCGCCTCTACCTCGGCCTCTGGAAGTTCCCCGACACGGCCGCGCTCCCGCGCGCCGCCTGCTTCCCCAACCTCCGCGACCTCGGCTTCTCCCTCATCGGCATCACCAACCACGACATGGACTTCGTCCTCGCCAGGAGCCCCGTTCTGGAGACGCTCTGCCTCCAGGCCAACACGCTTCAGCGCGTCCGCGTCGCCAGCCGCAGCCTCCGGTGCCTGATGATGATGGGGTTCGACCAGGATGTCAACGTGGTCAACGCGCCCCGCCTCGAGCGCCTCATCATGCTCTACTCCTGTGGCTCCTCCATGCTGGTAAAGATTGGCCGTGCTCCCTCGCTGCGTGCAATTGGATACCTTGATCTGGAAACCCATGTGCTGGAGATCGGCGACACTATTATCAAGGCTGGAACAAGGGCTAGTCCAAGCACCATGGTTCCAAGTGTGAAGATCCTTGGCATAATTGTGTGTTTCGGAGTCCGCAATGAAGCCAAGATGCTGCCCAGTTTCCTCAGATGCTTTCCTAATGTTGAGACTCTGCACGTCGAATCCCGGAAAACTGATGAGCTCACTGGCAAGCTGAACCTCAAGTTCTGGCAGGATGCAGGCGCCATCGAATGCATCCAGTCTCACATTACCGTGATGATTTTTCGTCGTTTCCGAGCAACGCGGGGTGAGATTAACTTCCTCAAATTTGTCCTTGAGAGTGCGCGGATGCTGAAGAAGCTGATAATTGTGTCTCCCAAAGGAACATTTGCATCGACAGATGAGGCAAATTTCAGACTGAAGCCTCTGTTCGCCACAAAATGGGCTAGTAAATGTTGTTCACTAGTGGTCCTTGAGAGTGATGCTAGTGCAGGAGAAAGCAATTGGAACTTTGAGAGAGGATGTGATTTTTCACTTATGGACCCTTTTGCGATCATCATCCGATCTTCTCGGCTTGACATCTCTGGAAGTTGTTAGTGTTCTGTGGCAGTTTCTAAATGAGAGGGATTGTTTTGCTTCCTTGACTTCTGCTGTTTTTTGTTCCAATTTTGAGATTTATCAGTGCTCTCAATCCTGTAGCAACTCCAACAGTATTGTCTTTCCAGCAGAAGACAAATGTTATCTCAGATGAATGTTGTATTGACCTGGCATTGATCATGTGACATCACAC]


>consensus_2768#1 AACCCTCTTCCCTTCCGGCGTCGGCTCGGTGGGCGGCGGACATGGACACGAGGGTGCTAC CCATCCCCATGGACGAGGCCACCATGGCCGAGTTCCGGCAGCGCGGCCAGGTCCCCGAGG ACGTCGAGAGCTCCATCGGCACCGTCCTCTCCTACATCCACTTTGCCATCCCCGACGCGC CGGTCTCCTCCCACGCCCGCCTCTCCGCGCTCCCGCCCGACGACGACGACGACGGTGTCG ACCGCCTCAGCCTCCTCCCCGACGCGCTCCTCCGCCGGATCGTCTCCCGCCTCCCCGTCA AGGACGCCGCGCGCACCGCCGCGCTCTCCTCCCGCTGGCGCGACGCCTGGCGCTCCACCC CGCTCGTCCTCGTCGACGCCGACCTCCTCCCCGCCGGCGTGTCCGACGCCGACACCGACG CCGCGCGCGAGGAGGCCCGCGCAGTCACCTTCGCCGTGTCCCGCGTCATCGCCGCGCACC CCGGCCCGTTCCGCCGCCTCCACCTCACCTCCAGCTTCATGGACCAGTACCAGGGTCTGC TCGCGAGCTGGCTCCAGGTGCTCGCCGTCAAGGGTATCCAGGAGCTCATCCTCGTCAACC GCCCGTTCCCGGCCGACCTCACCCTCCCCGCCACCTTCTTCGGCATGGCCACCCTCACCC GCCTCTACCTCGGCCTCTGGAAGTTCCCCGACACGGCCGCGCTCCCGCGCGCCGCCTGCT TCCCCAACCTCCGCGACCTCGGCTTCTCCCTCATCGGCATCACCAACCACGACATGGACT TCGTCCTCGCCAGGAGCCCCGTTCTGGAGACGCTCTGCCTCCAGGCCAACACGCTTCAGC GCGTCCGCGTCGCCAGCCGCAGCCTCCGGTGCCTGATGATGATGGGGTTCGACCAGGATG TCAACGTGGTCAACGCGCCCCGCCTCGAGCGCCTCATCATGCTCTACTCCTGTGGCTCCT CCATGCTGGTAAAGATTGGCCGTGCTCCCTCGCTGCGTGCAATTGGATACCTTGATCTGG AAACCCATGTGCTGGAGATCGGCGACACTATTATCAAGGCTGGAACAAGGGCTAGTCCAA GCACCATGGTTCCAAGTGTGAAGATCCTTGGCATAATTGTGTGTTTCGGAGTCCGCAATG AAGCCAAGATGCTGCCCAGTTTCCTCAGATGCTTTCCTAATGTTGAGACTCTGCACGTCG AATCCCGGAAAACTGATGAGCTCACTGGCAAGCTGAACCTCAAGTTCTGGCAGGATGCAG GCGCCATCGAATGCATCCAGTCTCACATTACCGTGATGATTTTTCGTCGTTTCCGAGCAA CGCGGGGTGAGATTAACTTCCTCAAATTTGTCCTTGAGAGTGCGCGGATGCTGAAGAAGC TGATAATTGTGTCTCCCAAAGGAACATTTGCATCGACAGATGAGGCAAATTTCAGACTGA AGCCTCTGTTCGCCACAAAATGGGCTAGTAAATGTTGTTCACTAGTGGTCCTTGAGAGTG ATGCTAGTGCAGGAGAAAGCAATTGGAACTTTGAGAGAGGATGTGATTTTTCACTTATGG ACCCTTTTGCGATCATCATCCGATCTTCTCGGCTTGACATCTCTGGAAGTTGTTAGTGTT CTGTGGCAGTTTCTAAATGAGAGGGATTGTTTTGCTTCCTTGACTTCTGCTGTTTTTTGT TCCAATTTTGAGATTTATCAGTGCTCTCAATCCTGTAGCAACTCCAACAGTATTGTCTTT CCAGCAGAAGACAAATGTTATCTCAGATGAATGTTGTATTGACCTGGCATTGATCATGTG ACATCACAC



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_2768#0      CACACGACGCCCCAAACCCTCGTCGGCTCGTCCCCTTCCCTAGTTCCCTTCCGGCCCCGG 60
consensus_2768#1      ------------------------------------AACCCTCTTCCCTTCCGGCGTCGG 24
                                                            **   ************  ***

consensus_2768#0      CGGCGGCGAGCGGCGACCATGGACACCCGCGTGCCGCCCGTCCCCATGGGCCGCGCGATG 120
consensus_2768#1      CT-CGGTGGGCGGCGGACATGGACACGAGGGTGCTACCCATCCCCATGGACGAGGCCACC 83
                      *  *** * ******  *********  * ****  *** ********* *   ** *  

consensus_2768#0      GCGGCCGAGTTCCGGCGGCGCGGGGACGACCCGGACGACGTGCAGGGGACGGTGGCGCGC 180
consensus_2768#1      ATGGCCGAGTTCCGGCAGCGCGGCCAGGTCCCCGAGGACGTCGAGAGCTCCATCGGCACC 143
                        ************** ******  * * *** ** *****  ** *  *  * *    *

consensus_2768#0      GTGCTCTCCTACATCCACTACGCCCTCCCCGACCCGCCCGTCTCCGCCGCCGCGCGCCTC 240
consensus_2768#1      GTCCTCTCCTACATCCACTTTGCCATCCCCGACGCGCCGGTCTCCTCCCACGCCCGCCTC 203
                      ** ****************  *** ******** **** ****** **  *** ******

consensus_2768#0      TACGCGCTC--GCCCCGC-------ACGACGCCGTCGACCGCATCAGCGCCCTCCCCGAC 291
consensus_2768#1      TCCGCGCTCCCGCCCGACGACGACGACGACGGTGTCGACCGCCTCAGCCTCCTCCCCGAC 263
                      * *******  ****  *       ******  ********* *****  **********

consensus_2768#0      GCGCTCCTCCGCAGGGTCGTCTCCCGCCTCCCCGTCAAGGACGCCGCGCGCACCGCCGCG 351
consensus_2768#1      GCGCTCCTCCGCCGGATCGTCTCCCGCCTCCCCGTCAAGGACGCCGCGCGCACCGCCGCG 323
                      ************ ** ********************************************

consensus_2768#0      CTCTCCCGCCGCTGGCGCCCGCTCTGGCGCTCCACGCCGCTCGTCCTCGTCGACGCCCAC 411
consensus_2768#1      CTCTCCTCCCGCTGGCGCGACGCCTGGCGCTCCACCCCGCTCGTCCTCGTCGACGCCGAC 383
                      ******  **********     ************ ********************* **

consensus_2768#0      CTCCTCTCCTCCTCCTCCGCCGCCCCCGGCGCTCCCGACGACTCCTCCAAGAAGGCGCGG 471
consensus_2768#1      CTCCTCCCCG---------------CCGGCGTGTCCGACGCCGACACCGACGCCGCGCGC 428
                      ****** **                ******   ****** *  * ** *    ***** 

consensus_2768#0      GAGGCGGCACGCGGCGTCACCCACGCCGTGTCCCGCGTCATGGGCGCGCACCCGGGCCCG 531
consensus_2768#1      GAGGAGGCCCGCGCAGTCACCTTCGCCGTGTCCCGCGTCATCGCCGCGCACCCCGGCCCG 488
                      **** *** ****  ******  ****************** * ********* ******

consensus_2768#0      TTCCGGTGCGTCCACCTCACGTCCAGCTGCATGGAGGAGTTCCAGGGCATGCTCGCGAAC 591
consensus_2768#1      TTCCGCCGCCTCCACCTCACCTCCAGCTTCATGGACCAGTACCAGGGTCTGCTCGCGAGC 548
                      *****  ** ********** ******* ******  *** ******  ********* *

consensus_2768#0      TGGCTCCAGGTGCTCGCCATGAAGGGCATCCAGGAGCTCGTCCTCGTGAACCGCCCGTGG 651
consensus_2768#1      TGGCTCCAGGTGCTCGCCGTCAAGGGTATCCAGGAGCTCATCCTCGTCAACCGCCCGTTC 608
                      ****************** * ***** ************ ******* **********  

consensus_2768#0      CCGCTCGACCTGGGCCTCCCCGCCACCTTCTTCGGCATGGCCACGCTCACCCGCCTCTAC 711
consensus_2768#1      CCGGCCGACCTCACCCTCCCCGCCACCTTCTTCGGCATGGCCACCCTCACCCGCCTCTAC 668
                      ***  ******   ****************************** ***************

consensus_2768#0      CTCGGCCTCTGGAAGTTCCCCGCCACGGCTGACCTCCCGCGCGGCGTCTCGTTCCCCAAC 771
consensus_2768#1      CTCGGCCTCTGGAAGTTCCCCGACACGGCCGCGCTCCCGCGCGCCGCCTGCTTCCCCAAC 728
                      ********************** ****** *  ********** ** **  *********

consensus_2768#0      CTCCGCGAGCTCGGCCTCTGCAGCGTCGTCATGGACACGCAGGACATGGATCTCGTCCTC 831
consensus_2768#1      CTCCGCGACCTCGGCTTCTCCCTCATCGGCATCACCAACCACGACATGGACTTCGTCCTC 788
                      ******** ****** *** *  * *** ***   **  ** ********  ********

consensus_2768#0      GCCAGGAGCCCCGTCCTGGAGACGCTCTGCATCAAGGGGAACCTGTTCAGGATGCGCATC 891
consensus_2768#1      GCCAGGAGCCCCGTTCTGGAGACGCTCTGCCTCCAGGCCAACACGCTTCA---GCGCGTC 845
                      ************** *************** ** ***  ***  * *      **** **

consensus_2768#0      CGCCTCGCCAGCCGCAGCCTCCGGTGCGCGCAGATCATCGGCTCCTCCTACGAGGAGATC 951
consensus_2768#1      CGCGTCGCCAGCCGCAGCCTCCGGTGCCTGATGATGATGGGGTTCG---ACCAGGATGTC 902
                      *** ***********************  *  *** ** ** * *    ** ****  **

consensus_2768#0      GCCGTGGTGGACACGCCGTGCCTTGAGCGCCTCATCGTCTCCGGCACATGGAGGCATGAC 1011
consensus_2768#1      AACGTGGTCAACGCGCCCCGCCTCGAGCGCCTCATCATGCTCTACTCCTGTGG------- 955
                        ******  ** ****  **** ************ *   *  * * **  *       

consensus_2768#0      GGCGCCTCCTCCGGCAGCGTCAAGATTGGGAATGCGCCGGCTCTGCGCGTGTTTGGATAC 1071
consensus_2768#1      -----CTCCTCCATGCTGGTAAAGATTGGCCGTGCTCCCTCGCTGCGTGCAATTGGATAC 1010
                           *******      ** ********   *** **  * ***** *   ********

consensus_2768#0      TTGGACCCTGCAGCGAACGTTCTTGTGGTTGGCAAAACCGCCATCAAGTCCGCGACAAAG 1131
consensus_2768#1      CTTGATCTGGAAACCCATGTGCTGGAGATCGGCGACACTATTATCAAGGCTGGAACAAGG 1070
                       * ** *  * * *  * ** ** * * * *** * **    ****** * *  **** *

consensus_2768#0      GTGAGCCCAAGCAATATGGTACCAAACGTCAAGATCCTTGCTCTGGAGGTGCGTTTCGGT 1191
consensus_2768#1      GCTAGTCCAAGCACCATGGTTCCAAGTGTGAAGATCCTTGGCATAATTGTGTGTTTCGGA 1130
                      *  ** *******  ***** ****  ** **********   *    *** ******* 

consensus_2768#0      GTCCGCAACGATGCCAAGATGATCCCCAATGTCCTCAGATGCTTTCCCAACATTGAGAGG 1251
consensus_2768#1      GTCCGCAATGAAGCCAAGATGCTGCCCAGTTTCCTCAGATGCTTTCCTAATGTTGAGACT 1190
                      ******** ** ********* * **** * **************** **  ******  

consensus_2768#0      CTCCACATCAAGTCTGGAAAAACTGATGAAACCACTGGCAAGCTCAACTTCAAGTTCTGG 1311
consensus_2768#1      CTGCACGTCGAATCCCGGAAAACTGATGAGCTCACTGGCAAGCTGAACCTCAAGTTCTGG 1250
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consensus_2768#0      CAGGAGTCTGGTCCCATCGAGTGCATTCGGTCAAGCATCCAGATGATTGTTTTCCATGAT 1371
consensus_2768#1      CAGGATGCAGGCGCCATCGAATGCATCCAGTCTCACATTACCGTGATGATTTTTCGTCGT 1310
                      *****  * **  ******* ***** * ***   ***     ****  **** * *  *

consensus_2768#0      TTTCATGGCACTCGGAGTGAGGTTAACTTTCTCAAGTTTTTCTTCGAGACTACGCGGGTG 1431
consensus_2768#1      TTCCGAGCAACGCGGGGTGAGATTAACTTCCTCAAATTTGTCCTTGAGAGTGCGCGGATG 1370
                      ** *  *  ** *** ***** ******* ***** *** ** * **** * ***** **

consensus_2768#0      CTGAAGATAGTGGTCATTTTGTTTGACACTGGAAGTTTTTCTTCGATGGATGAGGTGCGT 1491
consensus_2768#1      CTGAAGAAGCTGATAATTGTGTCTCCCAAAGGAACATTTGCATCGACAGATGAGGCAAAT 1430
                      *******   ** * *** *** *  **  ****  *** * ****  *******    *

consensus_2768#0      TCCAAGGTGGAGGTTCTGAGGGCTGCAAAACGGCCGACTG---GTTGTTTAGTCCTGGTC 1548
consensus_2768#1      TTCAGACTGAAGCCTCTGTTCGCCACAAAATGGGCTAGTAAATGTTGTTCACTAGTGGTC 1490
                      * **   ** **  ****   **  ***** ** * * *    ****** * *  *****

consensus_2768#0      ACCCCAAGTACAGAACCTGAAGAGTGTAACATTTGGAGCTTCAAGAGAGGATCTGATTTT 1608
consensus_2768#1      CTTGAGAGTGATGCTAGTGCAGGAGAAAGCAATTGGAACTTTGAGAGAGGATGTGATTTT 1550
                            ***   *    ** **     * ** ***** ***  ********* *******

consensus_2768#0      TCTCGTTTTGACCCTTTCACGGACTACTGAAAGAAAAAGATGCATTTCCATGTCATTTTG 1668
consensus_2768#1      TCACTTATGGACCCTTTTGCGATC---------------------------ATCATCCGA 1583
                      ** * * * ********  **  *                            ****    

consensus_2768#0      TGATCCAAGACAAATATCTTTGGAAGTGGTTAGTGCTCTGTTTGCAGCTTCATGGTATTC 1728
consensus_2768#1      TCTTCTCGGCTTGACATCTCTGGAAGTTGTTAGTGTTCTGTG-GCAGTTTC------TAA 1636
                      *  **   *    * **** ******* ******* *****  **** ***      *  

consensus_2768#0      ATGTTAGAGTTTCGGCTTCCCTTTTATTGAAGATTGGACAGCGGACTTGATTATACTGTC 1788
consensus_2768#1      ATGAGAGGGATT--GTTTTGCTTCCTT----------------GACTTC----TGCTGTT 1674
                      ***  ** * **  * **  ***   *                *****     * **** 

consensus_2768#0      TTGAGAAGTGTTGAAATTAGTGCTTGAATAGTGTTATCTATCATGCAA-ATGTCAAATTA 1847
consensus_2768#1      TTTTGT----TCCAATTTTGAGATTTATCAGTGCTCTCAATCCTGTAGCAACTCCAACAG 1730
                      **  *     *  ** ** * * ** *  **** * ** *** ** *  *  ** **   

consensus_2768#0      TGTTTTCTGGATGACAACTAAGAACTACTGTGTCTGCTATGCGTTTCATTTGTTGTTGGA 1907
consensus_2768#1      TATTGTCTTTCCAGCAGAAGACAAATGTTATCTCAGATGAATGTTGTATTGACC---TGG 1787
                      * ** ***      **    * ** *  * * ** * *    ***  ***        * 

consensus_2768#0      CGATGATGATGTTATGTTGCA- 1928
consensus_2768#1      CATTGATCATGTGACATCACAC 1809
                      *  **** **** *  *  ** 




Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)