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Oryza sativa
cluster # 2904 cluster # 2904       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2904#0 length = 1668 sequences # 2  

consensusID : consensus_2904#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1668
fasta sequence
                              [GAACATGTTACACGATACGAACAAGTTACAAGAACAAGAAAGTCGTGCAACTCTGCTACACTTTTTACATACGGCAACAAACCAAATCATCGCGCGGCGGCTCGGCTCGCGGTACGACCGTACGAAGCATACAACTCTCTGCTATACTCACCTCCCGGTGATGGGAGTGGATGTCATGGAGCAGAAACTGAGCTGCCCTCCGGTGAACAGCACGCCGACGTGCGGCAGCTCGATCTCCTGCCGCTTGCCGTCGGGAGGCCAAACAAACGCAGGCTTCTCGAACGGTGGCTCCGGCGCAGGGGCTCCGCCGACCAGCACCTGCACGGCCGTCCTCATGGACGGCCTCTCCCTCGGGCTGGGGTGGCAGCACGCCAGCGCCAGCCTCGCCGCGCGCTCCACCTGAGCCTCGTCGTACGCGCCACCGAGCACCGCGTCGGCCGCCTCCAGGACCGTCCCGTCGCCGTAGTGCCTCCACATCCAGTCCACGATGTACATCGGCTGGCGGCGGCCGTCGTGGTCATGCTCCTGCTGGCGGTTGTGGTACGTTACGGAGCTGCTCGGGCTCCTCCCGGTGAGCACCTCCATGACGAACACCCCGAACGCGTACACGTCCGTGTCGAGGCTGGCGCGTCCGGTGAAGAAGCACTCGTACGCCATGTAGCCGCGGGTGCCCGCCACGGCCTGCGTCGAGTGGTGCGTCACCTCGTCGAGGTGGATGACACGGGCGAGGCCGAAGTCGCCGAGGCGCGCGCTGTACTCCTCGTCGAGCATGGCGTTGCTCGCCTTGACGTCCCTGTGGAGGATCCGGCTGCTGCTCCCGTGGTGCAGGTACTCCAGCGCGGACGCCACGCCGCAGATTATCTTGTACCGTCGCTCCCAGGTCAGCTCAGCCGGTCTAGCACCGCCATACAGGAGCTTGTCCAGGCTACCCATGGGGAAGTACTCGTAGACGAGGAGCAGCTCGCCTCCCTCGTGGCACCACCCGATCAGCTTCACGAGGTTGCGGTGCGAGAGCTTGCTGATCGTGTTCACCTCCGCGACGAACTCCTGCTCTCCTCGGTTGGAACTGGATTTGTTGTTCGCTGCCACCCGCTTGACGGCCACCTCCATGTTCATGCTGCTCAGGTAGCCGTGGTACACGGTGCCGAAGCCACCTCTGCCGAGCTTGCGCGAGGAGCTGAAGTTGGCAGTCGCACGCCTGAGCTCCTTGAGCTTAAATTTGACAGGGCCATGGGCGTCGATCATCTTCTCGAGGTTGCGGTAGGCGAGCCTTCTCTTCCGCGTCGACCTTCTCCACACCAAGAACACAAGAAACGAAGACATAGCAAATAGTATGAAGGCAACGAGAGGCAGAAGCACCTTTCTCCCATGCCTTCTTCCGGTCGTGATATCGTCGTCGATTGTGGCAAAGTTCCAAGACTTTATTTGGTTCAGCTCGGTGAAATCACCTGTTGAACCTGCAAATCCCACATATACGTCGTCGAATAGAAATTGTGATAGATCGACGGACCAAGCTTTGGAACCATAGTGCGCCCCAGTCGTGTCGAACTGGATTAAAATTGCCACCAGTACTTGCTCTGTACTATTGTAAGTGATCCTGACCTGTACATCAGCACCACTCGAGAGGATTAATGAAACATTGCTTAGAGGGTACGGATCCAAAGATCC]

[-] EMBL AK108779             [GAACATGTTACACGATACGAACAAGTTACAAGAACAAGAAAGTCGTGCAACTCTGCTACACTTTTTACATACGGCAACAAACCAAATCATCGCGCGGCGGCTCGGCTCGCGGTACGACCGTACGAAGCATACAACTCTCTGCTATACTCACCTCCCGGTGATGGGAGTGGATGTCATGGAGCAGAAACTGAGCTGCCCTCCGGTGAACAGCACGCCGACGTGCGGCAGCTCGATCTCCTGCCGCTTGCCGTCGGGAGGCCAAACAAACGCAGGCTTCTCGAACGGTGGCTCCGGCGCAGGGGCTCCGCCGACCAGCACCTGCACGGCCGTCCTCATGGACGGCCTCTCCCTCGGGCTGGGGTGGCAGCACGCCAGCGCCAGCCTCGCCGCGCGCTCCACCTGAGCCTCGTCGTACGCGCCACCGAGCACCGCGTCGGCCGCCTCCAGGACCGTCCCGTCGCCGTAGTGCCTCCACATCCAGTCCACGATGTACATCGGCTGGCGGCGGCCGTCGTGGTCATGCTCCTGCTGGCGGTTGTGGTACGTTACGGAGCTGCTCGGGCTCCTCCCGGTGAGCACCTCCATGACGAACACCCCGAACGCGTACACGTCCGTGTCGAGGCTGGCGCGTCCGGTGAAGAAGCACTCGTACGCCATGTAGCCGCGGGTGCCCGCCACGGCCTGCGTCGAGTGGTGCGTCACCTCGTCGAGGTGGATGACACGGGCGAGGCCGAAGTCGCCGAGGCGCGCGCTGTACTCCTCGTCGAGCATGGCGTTGCTCGCCTTGACGTCCCTGTGGAGGATCCGGCTGCTGCTCCCGTGGTGCAGGTACTCCAGCGCGGACGCCACGCCGCAGATTATCTTGTACCGTCGCTCCCAGGTCAGCTCAGCCGGTCTAGCACCGCCATACAGGAGCTTGTCCAGGCTACCCATGGGGAAGTACTCGTAGACGAGGAGCAGCTCGCCTCCCTCGTGGCACCACCCGATCAGCTTCACGAGGTTGCGGTGCGAGAGCTTGCTGATCGTGTTCACCTCCGCGACGAACTCCTGCTCTCCTCGGTTGGAACTGGATTTGTTGTTCGCTGCCACCCGCTTGACGGCCACCTCCATGTTCATGCTGCTCAGGTAGCCGTGGTACACGGTGCCGAAGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AK105292             [                                                                                                                                                                                        AAACTGAGCTGCCCTCCGGTGAACAGCACGCCGACGTGCGGCAGCTCGATCTCCTGCCGCTTGCCGTCGGGAGGCCAAACAAACGCAGGCTTCTCGAACGGTGGCTCCGGCGCAGGGGCTCCGCCGACCAGCACCTGCACGGCCGTCCTCATGGACGGCCTCTCCCTCGGGCTGGGGTGGCAGCACGCCAGCGCCAGCCTCGCCGCGCGCTCCACCTGAGCCTCGTCGTACGCGCCACCGAGCACCGCGTCGGCCGCCTCCAGGACCGTCCCGTCGCCGTAGTGCCTCCACATCCAGTCCACGATGTACATCGGCTGGCGGCGGCCGTCGTGGTCATGCTCCTGCTGGCGGTTGTGGTACGTCACGGAGCTGCTCGGGCTCCTCCCGGTGAGCACCTCCATGACGAACACCCCGAACGCGTACACGTCCGTGTCGAGGCTGGCGCGTCCGGTGAAGAAGCACTCGTACGCCATGTAGCCGCGGGTGCCCGCCACGGCCTGCGTCGAGTGGTGCGTCACCTCGTCGAGGTGGATGACACGGGCGAGGCCGAAGTCGCCGAGGCGCGCGCTGTACTCCTCGTCGAGCATGACGTTGCTCGCCTTGACGTCCCTGTGGAGGATCCGGCTGCTGCTCCCGTGGTGCAGGTACTCCAGCGCGGACGCCACGCCGCAGATTATCTTGTACCGTCGCTCCCAGGTCAGCTCAGCCGGTCTAGCACCGCCATACAGGAGCTTGTCCAGGCTACCCATGGGGAAGTACTCGTAGACGAGGAGCAGCTCGCCTCCCTCGTGGCACCACCCGATCAGCTTCACGAGGTTGCGGTGCGAGAGCTTGCTGATCGTGTTCACCTCCGCGACGAACTCCTGCTCTCCTCGGTTGGAACTGGATTTGTTGTTCGCTGCCACCCGCTTGACGGCCACCTCCATGTTCATGCTGCTCAGGTAGCCGTGGTACACGGTGCCGAAGCCACCTCTGCCGAGCTTGCGCGAGGAGCTGAAGTTGGCAGTCGCACGCCTGAGCTCCTTGAGCTTAAATTTGACAGGGCCATGGGCGTCGATCATCTTCTCGAGGTTGCGGTAGGCGAGCCTTCTCTTCCGCGTCGACCTTCTCCACACCAAGAACACAAGAAACGAAGACATAGCAAATAGTATGAAGGCAACGAGAGGCAGAAGCACCTTTCTCCCATGCCTTCTTCCGGTCGTGATATCGTCGTCGATTGTGGCAAAGTTCCAAGACTTTATTTGGTTCAGCTCGGTGAAATCACCTGTTGAACCTGCAAATCCCACATATACGTCGTCGAATAGAAATTGTGATAGATCGACGGACCAAGCTTTGGAACCATAGTGCGCCCCAGTCGTGTCGAACTGGATTAAAATTGCCACCAGTACTTGCTCTGTACTATTGTAAGTGATCCTGACCTGTACATCAGCACCACTCGAGAGGATTAATGAAACATTGCTTAGAGGGTACGGATCCAAAGATCC]


>consensus_2904#0 GAACATGTTACACGATACGAACAAGTTACAAGAACAAGAAAGTCGTGCAACTCTGCTACA CTTTTTACATACGGCAACAAACCAAATCATCGCGCGGCGGCTCGGCTCGCGGTACGACCG TACGAAGCATACAACTCTCTGCTATACTCACCTCCCGGTGATGGGAGTGGATGTCATGGA GCAGAAACTGAGCTGCCCTCCGGTGAACAGCACGCCGACGTGCGGCAGCTCGATCTCCTG CCGCTTGCCGTCGGGAGGCCAAACAAACGCAGGCTTCTCGAACGGTGGCTCCGGCGCAGG GGCTCCGCCGACCAGCACCTGCACGGCCGTCCTCATGGACGGCCTCTCCCTCGGGCTGGG GTGGCAGCACGCCAGCGCCAGCCTCGCCGCGCGCTCCACCTGAGCCTCGTCGTACGCGCC ACCGAGCACCGCGTCGGCCGCCTCCAGGACCGTCCCGTCGCCGTAGTGCCTCCACATCCA GTCCACGATGTACATCGGCTGGCGGCGGCCGTCGTGGTCATGCTCCTGCTGGCGGTTGTG GTACGTTACGGAGCTGCTCGGGCTCCTCCCGGTGAGCACCTCCATGACGAACACCCCGAA CGCGTACACGTCCGTGTCGAGGCTGGCGCGTCCGGTGAAGAAGCACTCGTACGCCATGTA GCCGCGGGTGCCCGCCACGGCCTGCGTCGAGTGGTGCGTCACCTCGTCGAGGTGGATGAC ACGGGCGAGGCCGAAGTCGCCGAGGCGCGCGCTGTACTCCTCGTCGAGCATGGCGTTGCT CGCCTTGACGTCCCTGTGGAGGATCCGGCTGCTGCTCCCGTGGTGCAGGTACTCCAGCGC GGACGCCACGCCGCAGATTATCTTGTACCGTCGCTCCCAGGTCAGCTCAGCCGGTCTAGC ACCGCCATACAGGAGCTTGTCCAGGCTACCCATGGGGAAGTACTCGTAGACGAGGAGCAG CTCGCCTCCCTCGTGGCACCACCCGATCAGCTTCACGAGGTTGCGGTGCGAGAGCTTGCT GATCGTGTTCACCTCCGCGACGAACTCCTGCTCTCCTCGGTTGGAACTGGATTTGTTGTT CGCTGCCACCCGCTTGACGGCCACCTCCATGTTCATGCTGCTCAGGTAGCCGTGGTACAC GGTGCCGAAGCCACCTCTGCCGAGCTTGCGCGAGGAGCTGAAGTTGGCAGTCGCACGCCT GAGCTCCTTGAGCTTAAATTTGACAGGGCCATGGGCGTCGATCATCTTCTCGAGGTTGCG GTAGGCGAGCCTTCTCTTCCGCGTCGACCTTCTCCACACCAAGAACACAAGAAACGAAGA CATAGCAAATAGTATGAAGGCAACGAGAGGCAGAAGCACCTTTCTCCCATGCCTTCTTCC GGTCGTGATATCGTCGTCGATTGTGGCAAAGTTCCAAGACTTTATTTGGTTCAGCTCGGT GAAATCACCTGTTGAACCTGCAAATCCCACATATACGTCGTCGAATAGAAATTGTGATAG ATCGACGGACCAAGCTTTGGAACCATAGTGCGCCCCAGTCGTGTCGAACTGGATTAAAAT TGCCACCAGTACTTGCTCTGTACTATTGTAAGTGATCCTGACCTGTACATCAGCACCACT CGAGAGGATTAATGAAACATTGCTTAGAGGGTACGGATCCAAAGATCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)