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Oryza sativa
cluster # 3046 cluster # 3046       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3046#0 length = 1488 sequences # 2  

consensusID : consensus_3046#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1488
fasta sequence
                              [CCCCACGAGAACTCCGATGATTTGCGCCTCCCCCACCGGCGGCGGTGCGGTGATGGATCCTTCGCCGGAGTTCCGCGACTGGGCCAACCTGCCGGAGCTGCCGCTCTCGGAGGTGCTACGGGGCCTCCTCCCCTGCCTCCGCTCCGTCTACGCCTTCGCCGCCGCGTGCCAGCCCTGGCGCCGCCTGCTCCGGGACTCCGCCGCCGACCTCGTCCGCCCCCGCATCCCGCCGCTCCTCCTCCTCTGCCCCACCTATCGCGTCGTCCCTTTCTCCCAGCTCGTCGTCGCGGCGCTCCTCTCCTCCTACCCCGTCCCGGGCGACGCCACCCTCCTCTCCTCCTCCCGCGGCCACCTCGTCCTCCTCCGCCGCCGCGACCCCTTCCACGGCCTCCACCTCGTCGACGCGCTCACCGGCGCCACGCGCCACGCGCTGCCGCTCCCTTCCCCGCACTTCGCCTATCACTACGCCGCCCTCGCGCCATCCCGCCGCCTCCTCCTCTTCCATTCCAAGCACGCCTTCTTCTCCCTCCCCGTGGGCGACGCGGGCCACAACCCTCGCCTCGATTGGACCAAGCACAGCCTCCCCCGTGCCGCCTCCTTCGTTCGATCCATCCTCGAATTCCGCGGGCGCGTCCTCGGCTTGACCGATCGCGCGCAGCTGCTGGAGTTCCACCTCGATGCCAACCCTCCGAACAAATCCGCCCAAATGTTGCACGCCGCCGGCCTCCCTGAGGTCAGCACGTTCGACCGGTGGCACTTCGGCCCGCATCTGGTCGCCGCCGGTGATCGATTGCTCCTGGTGCTCTTCATGATGGGGCCGAAATTGGGCCATATGTTTGAGACATTGGTGAGTGTGAAGAAGGTTGGCGTCTATGCACTTGACATGGTGAAGATGAGGTGGGAAGAGGTGGACAACATTGGGGCTTACAGCTTGTTTGTGGACTGCGCCGGGAGGAGTACAGCTGCTTGTGTAGACGTGGAGAACTGTGGCGTGGAGGCGAACCGAATTTACATTGCTGCTCCTGGGTGCCGTGACTGGTATGCATGGCGGCCTGGGCGTGAGGTGCCTCTCGGTGGTCAAGGGCTTGGACCATTGTCCATTCAAGCAATGAACCACTTGCCATGGCCTTCACAGATATGGATTTATCCACGTCTTCTCTTTTGATGATGCATGGTAACTAGTGAGACAAGTGAAGAAACCTTATCTATGATCAGTTGTTTTGCTGTAAATCTATTACTGTGGATATTTTACTTCCGTAGCATGTTGTGCCAACATAATGAGTGTTTTTCTAGCAATTCCCTTTCAGCCAACACATGTCATAGTAAGTCACATTTTTGTATCATATGGAAACACCAAGTACAGATTGTAATTGTCGTCATGACTTCCGGTGGTACCACCTGGTAGGCCGGTACATGCTGATCACCAACGTTTTGTATGAGTTTGTAGGCTTCTCTTTTAGGCTTGCATAACATGCACTGTCTCATATT]

[+] EMBL AK060614             [CCCCACGAGAACTCCGATGATTTGCGCCTCCCCCACCGGCGGCGGTGCGGTGATGGATCCTTCGCCGGAGTTCCGCGACTGGGCCAACCTGCCGGAGCTGCCGCTCTCGGAGGTGCTACGGGGCCTCCTCCCCTGCCTCCGCTCCGTCTACGCCTTCGCCGCCGCGTGCCAGCCCTGGCGCCGCCTGCTCCGGGACTCCGCCGCCGACCTCGTCCGCCCCCGCATCCCGCCGCTCCTCCTCCTCTGCCCCACCTATCGCGTCGTCCCTTTCTCCCAGCTCGTCGTCGCGGCGCTCCTCTCCTCCTACCCCGTCCCGGGCGACGCCACCCTCCTCTCCTCCTCCCGCGGCCACCTCGTCCTCCTCCGCCGCCGCGACCCCTTCCACGGCCTCCACCTCGTCGACGCGCTCACCGGCGCCACGCGCCACGCGCTGCCGCTCCCTTCCCCGCACTTCGCCTATCACTACGCCGCCCTCGCGCCATCCCGCCGCCTCCTCCTCTTCCATTCCAAGCACGCCTTCTTCTCCCTCCCCGTGGGCGACGCGGGCCACAACCCTCGCCTCGATTGGACCAAGCACAGCCTCCCCCGTGCCGCCTCCTTCGTTCGATCCATCCTCGAATTCCGCGGGCGCGTCCTCGGCTTGACCGATCGCGCGCAGCTGCTGGAGTTCCACCTCGATGCCAACCCTCCGAACAAATCCGCCCAAATGTTGCACGCCGCCGGCCTCCCTGAGGTCAGCACGTTCGACCGGTGGCACTTCGGCCCGCATCTGGTCGCCGCCGGTGATCGATTGCTCCTGGTGCTCTTCATGATGGGGCCGAAATTGGGCCATATGTTTGAGACATTGGTGAGTGTGAAGAAGGTTGGCGTCTATGCACTTGACATGGTGAAGATGAGGTGGGAAGAGGTGGACAACATTGGGGCTTACAGCTTGTTTGTGGACTGCGCCGGGAGGAGTACAGCTGCTTGTGTAGACGTGGAGAACTGTGGCGTGGAGGCGAACCGAATTTACATTGCTGCTCCTGGGTGCCGTGACTGGTATGCATGGCGGCCTGGGCGTGAGGTGCCTCTCGGTGGTCAAGGGCTTGGACCATTGTCCATTCAAGCAATGAACCACTTGCCATGGCCTTCACAGATATGGATTTATCCACGTCTTCTCTTTTGATGATGCATGGTAACTAGTGAGACAAGTGAAGAAACCTTATCTATGATCAGTTGTTTTGCTGTAAATCTATTACTGTGGATATTTTACTTCCGTAGCATGTTGTGCCAACATAATGAGTGTTTTTCTAGCAATTCCCTTTCAGCCAACACATGTCATAGTAAGTCACATTTTTGTATCATATGGAAACACCAAGTACAGATTGTAATTGTCGTCATGACTTCCGGTGGTACCACCTGGTAGGCCGGTACATGCTGATCACCAACGTTTTGTATGAGTTTGTAGGCTTCTCTTTTAGGCTTG                       ]
[+] EMBL CA765137             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTGTTTGTGGACTGCGCCGGGAGGAGTACAGCTGCTTGTGTAGACGTGGAGAACTGTGGCGTGGAGGCGAACCGAATTTACATTGCTGCTCCTGGGTGCCGTGACTGGTATGCATGGCGGCCTGGGCGTGAGGTGCCTCTCGGTGGTCAAGGGCTTGGACCATTGTCCATTCAAGCAATGAACCACTTGCCATGGCCTTCACAGATATGGATTTATCCACGTCTTCTCTTTTGATGATGCATGGTAACTAGTGAGACAAGTGAAGAAACCTTATCTATGATCAGTTGTTTTGCTGTAAATCTATTACTGTGGATATTTTACTTCCGTAGCATGTTGTGCCAACATAATGAGTGTTTTTCTAGCAATTCCCTTTCAGCCAACACTTGTCATAGTAAGTCACA TTTTGTATCATATGGAAACACCAAGTACGGATTGTAATTGTCGTCATGACTTCCGGCGGTACCACCTGGTAGGCCGGTACATGCTGATCACCAATGTTTTGTATGAGTTTGTAGGCTTCTCTTTTAGGCTTGCATAACATGCACTGTCTCATATT]


>consensus_3046#0 CCCCACGAGAACTCCGATGATTTGCGCCTCCCCCACCGGCGGCGGTGCGGTGATGGATCC TTCGCCGGAGTTCCGCGACTGGGCCAACCTGCCGGAGCTGCCGCTCTCGGAGGTGCTACG GGGCCTCCTCCCCTGCCTCCGCTCCGTCTACGCCTTCGCCGCCGCGTGCCAGCCCTGGCG CCGCCTGCTCCGGGACTCCGCCGCCGACCTCGTCCGCCCCCGCATCCCGCCGCTCCTCCT CCTCTGCCCCACCTATCGCGTCGTCCCTTTCTCCCAGCTCGTCGTCGCGGCGCTCCTCTC CTCCTACCCCGTCCCGGGCGACGCCACCCTCCTCTCCTCCTCCCGCGGCCACCTCGTCCT CCTCCGCCGCCGCGACCCCTTCCACGGCCTCCACCTCGTCGACGCGCTCACCGGCGCCAC GCGCCACGCGCTGCCGCTCCCTTCCCCGCACTTCGCCTATCACTACGCCGCCCTCGCGCC ATCCCGCCGCCTCCTCCTCTTCCATTCCAAGCACGCCTTCTTCTCCCTCCCCGTGGGCGA CGCGGGCCACAACCCTCGCCTCGATTGGACCAAGCACAGCCTCCCCCGTGCCGCCTCCTT CGTTCGATCCATCCTCGAATTCCGCGGGCGCGTCCTCGGCTTGACCGATCGCGCGCAGCT GCTGGAGTTCCACCTCGATGCCAACCCTCCGAACAAATCCGCCCAAATGTTGCACGCCGC CGGCCTCCCTGAGGTCAGCACGTTCGACCGGTGGCACTTCGGCCCGCATCTGGTCGCCGC CGGTGATCGATTGCTCCTGGTGCTCTTCATGATGGGGCCGAAATTGGGCCATATGTTTGA GACATTGGTGAGTGTGAAGAAGGTTGGCGTCTATGCACTTGACATGGTGAAGATGAGGTG GGAAGAGGTGGACAACATTGGGGCTTACAGCTTGTTTGTGGACTGCGCCGGGAGGAGTAC AGCTGCTTGTGTAGACGTGGAGAACTGTGGCGTGGAGGCGAACCGAATTTACATTGCTGC TCCTGGGTGCCGTGACTGGTATGCATGGCGGCCTGGGCGTGAGGTGCCTCTCGGTGGTCA AGGGCTTGGACCATTGTCCATTCAAGCAATGAACCACTTGCCATGGCCTTCACAGATATG GATTTATCCACGTCTTCTCTTTTGATGATGCATGGTAACTAGTGAGACAAGTGAAGAAAC CTTATCTATGATCAGTTGTTTTGCTGTAAATCTATTACTGTGGATATTTTACTTCCGTAG CATGTTGTGCCAACATAATGAGTGTTTTTCTAGCAATTCCCTTTCAGCCAACACATGTCA TAGTAAGTCACATTTTTGTATCATATGGAAACACCAAGTACAGATTGTAATTGTCGTCAT GACTTCCGGTGGTACCACCTGGTAGGCCGGTACATGCTGATCACCAACGTTTTGTATGAG TTTGTAGGCTTCTCTTTTAGGCTTGCATAACATGCACTGTCTCATATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)