Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 3310 cluster # 3310       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3310#0 length = 709 sequences # 2  

consensusID : consensus_3310#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 709
fasta sequence
                              [CAGAGGACGAGACAAGGGGGTTGCACATGGTAATGCAGAGCTTATAGAATATGTCAGTAAGAAGATAACTGAACTAGAACCATTTAATTCTAGTTATCAAGTCCTGGTTTCTAATTGTAGTGCTTTGGAAGGAAGGTGGGATGGTGTGATCGATGCACGCACAAGCATGCGTAATTGGGGAATTGAGAAAGTGCCTGGAAGTAGCTCAATCCAGGTAGGCAGTGAGGTTCATGAGTTTTTGGCTAAAGATACGAGGCATAAGAGGAGGAAAGAGATATATGAAACAGTTGACGGTTTAATGGCCCTCATGAGACATACAGAGCAAGCACATTGGGTAAGATAATGTAGAACACTGCAGCATCAGAAGTGCTTAGTTGAGTGTTGCTCGTCCTACATGTGCAAAATAAATACTAGATTACCATTTGAACAGGATGGACTGGTAAGTTGTATAGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATCAGCAGTTGATGATTTGATTGAATGCATGAATCATAGAGGACACCCCCTTTGATTGCTTAAAGAAATTGCACACCGCTTAACTATTGAAGATCTTGCCTGCTTGTCTGTCTTGTGCAGCTCATGTGTAAAGGTTGAGAGTTGGGACCCTATGACCTTATGTCCTTGAGTCCTTGTGGCAGGACCTTTTTGTGGCTAGGTACTGGGG]

[+] EMBL CA766676             [CAGAGGACGAGACAAGGGGGTTGCACATGGTAATGCAGAGCTTATAGAATATGTCAGTAAGAAGATAACTGAACTAGAACCATTTAATTCTAGTTATCAAGTCCTGGTTTCTAATTGTAGTGCTTTGGAAGGAAGGTGGGATGGTGTGATCGATGCACGCACAAGCATGCGTAATTGGGGAATTGAGAAAGTGCCTGGAAGTAGCTCAATCCAGGTAGGCAGTGAGGTTCATGAGTTTTTGGCTAAAGATACGAGGCATAAGAGGAGGAAAGAGATATATGAAACAGTTGACGGTTTAATGGCCCTCATGAGACATACAGAGCAAGCACATTGGGTAAGATAATGTAGAACACTGCAGCATCAGAAGTGCTTAGTTGAGTGTTGCTCGTCCTACATGTGCAAAATAAATACTAGATTACCATTTGAACAGGATGGACTGGTAAGTTGTATAGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATCAGCAGTTGATGATTTGATTGAATGCATGAATCATAGAGGACACCCCCTTTGATTGCTTAAAGAAATTGCACACCGCTTAACTATTGAAGATCTTGCCTGCTTGTCTGTCTTGTGCAGCTCATGTGTAAAGGTTGAGAGTTGGGACCCTATGACCTTATGTCCTTGAGTCCTTGTGGCAGGACCTTTTTGTGGCTAGGTACTGGG ]
[+] EMBL CB097056             [                           TGGTAATGCAGAGCTTATAGAATATGTCAGTAAGAAGATAACTGAACTAGAACCATTTAATTCTAGTTATCAAGTCCTGGTTTCTAATTGTAGTGCTTTGGAAGGAAGGTGGGATGGTGTGATCGATGCACGCACAAGCATGCGTAATTGGGGAATTGAGAAAGTGCCTGGAAGTAGCTCAATCCAGGTAGGCAGTGAGGTTCATGAGTTTTTGGCTAAAGATACGAGGCATAAGAGGAGGAAAGAGATATATGAAACAGTTGACGGTTTAATGGCCCTCATGAGACATACAGAGCAAGCACATTGGGTAAGATAATGTAGAACACTGCAGCATCAGAAGTGCTTAGTTGAGTGTTGCTCGTCCTACATGTGCAAAATAAATACTAGATTACCATTTGAACAGGATGGACTGGTAAGTTGTATAGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATCAGCAGTTGATGATTTGATTGAATGCATGAATCATAGAGGACACCCCCTTTGATTGCTTAAAGAAATTGCACACCGCTTAACTATTGAAGATCTTGCCTGCTTGTCTGTCTTGTGCAGCTCATGTGTAAAGGTTGAGAGTTGGGACCCTATGACCTTATGTCCTTGAGTCCTTGTGGCAGGACCTTTTTGTGGCTAGGTACTGGGG]


>consensus_3310#0 CAGAGGACGAGACAAGGGGGTTGCACATGGTAATGCAGAGCTTATAGAATATGTCAGTAA GAAGATAACTGAACTAGAACCATTTAATTCTAGTTATCAAGTCCTGGTTTCTAATTGTAG TGCTTTGGAAGGAAGGTGGGATGGTGTGATCGATGCACGCACAAGCATGCGTAATTGGGG AATTGAGAAAGTGCCTGGAAGTAGCTCAATCCAGGTAGGCAGTGAGGTTCATGAGTTTTT GGCTAAAGATACGAGGCATAAGAGGAGGAAAGAGATATATGAAACAGTTGACGGTTTAAT GGCCCTCATGAGACATACAGAGCAAGCACATTGGGTAAGATAATGTAGAACACTGCAGCA TCAGAAGTGCTTAGTTGAGTGTTGCTCGTCCTACATGTGCAAAATAAATACTAGATTACC ATTTGAACAGGATGGACTGGTAAGTTGTATAGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATCAGCAGTTGATGATTTGATTGAATGCATGAATCATAG AGGACACCCCCTTTGATTGCTTAAAGAAATTGCACACCGCTTAACTATTGAAGATCTTGC CTGCTTGTCTGTCTTGTGCAGCTCATGTGTAAAGGTTGAGAGTTGGGACCCTATGACCTT ATGTCCTTGAGTCCTTGTGGCAGGACCTTTTTGTGGCTAGGTACTGGGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)