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Oryza sativa
cluster # 3392 cluster # 3392       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3392#0 length = 2606 sequences # 2  

consensusID : consensus_3392#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2606
fasta sequence
                              [ACAAGCACAAGCCATTGAGCACTTGATAGGTAGTTTTTCTCGAGAAATTGTTCCCATCTAGGCTATCTATAGCAGCTCAAAATTAAGAGGAAATTATGTTTTATGGATAGTACGCCGCCCACAGGTCGAAAAAGAAAGCGTGCGTCCGGAAAGCAAGCTATTCTTACAACAGGTGTGAGTTCACACTCTACTGGGGGCACAATACGTGAAAGGCAGCAACGTTGGAGATCCATAATAAAAGCAAAGAAAGGAAATTGTTCATCTGAGTTAAAAAAAAACACAGTCTCTAAACAGCAAGTTCCAGTTGCCATTGCAGATGAGATTTCCTACTACGGACCTCCTGCCCACGTGTGTCGATATTGTGGTGCCCAGTTTTGGTATCAGGAGCGTGTGAAGAGGTCTTATTCAAGTGACCAGGGTCATATTCGCTTTCATCTGTGTTGTAGGGGTGGGCAAAAACCAGAAGATAGACCTGATATAGTAAGTAGAGTTTTCAAATTGAAGGTGAACGAACTTGTTTCTGTGTTGAAGAAGGGTACTTATTTTGGGAAGGCACGGGCAGTTCTATACACCATTGAGTTCCAGAAGCGTGGTCTACCTCACGTCCATATTTTGGTTTGGCTTCAAGCTTCCGATGGAGTACAGTCTGCTATCACAAATTAATTCCACCAGGCATAATTGGCGTATAAAGGTCAGAGTTGCTAGGTCATGGCATCTATCTGGAACTTCCAAAAGAAGAGATTTTACTGCTTTGGAACTTATCTTGGTCGATGAAGAGGGGGTAGGCATTACAGCTTGTGTGGGAGAAAATGAAATACAGAAGTTTTCAACGTCTATAGTGGAGGGACATGCCTACTTCTTACGGAATTTCCGTGTTAGTAGACAGACAAAAAAGCTCAATGCTGTGCCTAGCACATATGCCATCTTTTTTTACACCATGGACTATTGTTGAAGAGATCCCTACAGAGATATCTGGCAGTCTTCCACTCTACATTTTTAATTTCGTGGACTTTGAGGATTTGGATGAAAGGGCAAGGCATCCAAATGGTTTAGTAGATGTTATTGGACAACTCACGGTTGTGCACCCTCTAGTACAAAGCAACGGTTTGAATGGGCCATCTGTTAGGCGGAATGTGGAATTACGAGACCTTAGCGATCGGCTCTTGGAGATCACTTTATGGGCTGAGCATGCAACTTCTTTTGAAGATGAGTTCCTTATTGAAACTATTGGTAAAGATGAACCAGTCATAATTGTTTTTGCTGGCCTTAATATGAAACTATTCTCAGGTGCTCCAAGTTGCCGGAGCAGTGCTGCCACAAAATGGTACATTAACATTGATATTCCGGAGATTAATGCCTTTCGTACAAGCCTGCAAGGAAGAGGTTGCGAGGTTCTTCTCGTACCTAGTGATGGTGCTGCACTAGGAGCGGCTAACGAGGCAGATGCTAATAGGAAGTCTATATCCGAGCTTTTATCCTTGAATCCTCATGACAACAACGATGTACGCTTCACTTGTGACGCACGTATAAAGGAAATTGATGTCTCAAGTGGTTGGTGGTATAAGGCTTGCAGTATTTGTAGAAAGGGTGTGAAGCCAACTCTTCAAGGATTTGAATGTGTTAACTGTGACAACACAGAGCCAATAATCACACCCAGCTATAAGTTAAATGTTGTGATTGAGGACAACACTGACCGTGCAAAAATATTCATGTTTGGTGGTATGGCGGAGCAAGTTGTGCGACGAACAGCTGCCGATCTAGTTGAAGAAAGCTCAGCCAATCAGCTCTTACTGCCGTCACCCCTCCGTGCTCTCATTGGCCGTAGGTTTGTTTTCCAAATAGTTATAAGTGAGCAGACCTTTCGGACTGGACAATTGTGCTTTCAAGTAAGGAAAGTGTTTAATCCACCCCCAATCGATGGGCAAAACAATGGTGTTCATGCCACTCTTGGAAATAGTCTTAGCCATGCAACCTTAGCTAGAACGTCAGGTGCTCAAAAGAAATGTGATCCTACCCCTTTAATGGAGGCATCGGGGAGTAGCTCCAACAAAGCATCCACCTTGCAGACATATGGTGTAACTGAACTCCCAACAGATCCTAAAGGAAGCGCCACTCCACCACCTCCTTTTGCTCATGGGGCTATCACAAAAACATCACCACAGAAGGGGAATGAGATTTCTGAAGAACATGGAACTCCGGTTGGGAAACGATCTAGGTCTACTCGCAAGGAACTATTCTCCACGAAAAAAGTGAAGGCAAGTGATGATTGAGCTCACAGTTTGCTGATATGCACCCGTCAATAACCTACTACAACATCTTCGGCACAGCATCCAGTTATTGTCTACTCATATTGCCGAGTATTGCTCCTTATGTACATATTGGAATAAATGTCCTTCTATATTGTTGTAATATACTTAAGAGCTTGTTTGCAGTCTATATTAGGGTATATTTGTATGTTGTTTGGTAATGCAGTATGGACTAGGGAGTTCGCCTACTAGACCTTCAAGTATGTGTAGATTAATAAAATGTGCCATAGTGGTCTACCGGCGCCCTTGGTACAATCAGAAGTGAACTGGTTTATGTTTAGTGTCATGTAATAAAAAATA]

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[+] EMBL CA767347             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      caaggggGTGGAATTACGAGACCTTAGNGNGCGGCTCTTGGAGATCACTTTATGGGCTGAGCATGCAACTTCTTTTGAAGATGAGTTCCTTATTGAAACTATTGGNAAAGATGAACCAGTCATAATTGTTTTTGCTGGCCTTAATATGAAACTATTCTCAGGTGCTCCAAGTTGCCGGAGCAGGGCTGCCACAAAATGGNACATTAACATTGATATTCCGGAGATTAATGCCTTTCGTACAAGCCTGCAAGGAAGAGGTTGCGAGGTTCTTCTCGTACCTAGTGATGGTGCTGCACTAGGAGCGGCTAACGAGGCAGATGCTAATAGGAAGTCTATATCCGAGCTTTTATCCTTGAATCCTCATGACAACAACGATGTACGCTTCACTTGTGACGCACGTATAAAGGAAATTGATGTCTCAAGNGGTTGGNGGTATAAGGCTTGCAGTATTTGTAGAAAGGGTGTGAAGCCAACTCTTCAAGGATTTGAATGNGGTAACTGNGACAACACAGAGCCAATAATCACACCCAGCTATAAGTTAAATGGTGNGATTGAGGACAACACTGACCGGGCAAAAATATTCATGgt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]


>consensus_3392#0 ACAAGCACAAGCCATTGAGCACTTGATAGGTAGTTTTTCTCGAGAAATTGTTCCCATCTA GGCTATCTATAGCAGCTCAAAATTAAGAGGAAATTATGTTTTATGGATAGTACGCCGCCC ACAGGTCGAAAAAGAAAGCGTGCGTCCGGAAAGCAAGCTATTCTTACAACAGGTGTGAGT TCACACTCTACTGGGGGCACAATACGTGAAAGGCAGCAACGTTGGAGATCCATAATAAAA GCAAAGAAAGGAAATTGTTCATCTGAGTTAAAAAAAAACACAGTCTCTAAACAGCAAGTT CCAGTTGCCATTGCAGATGAGATTTCCTACTACGGACCTCCTGCCCACGTGTGTCGATAT TGTGGTGCCCAGTTTTGGTATCAGGAGCGTGTGAAGAGGTCTTATTCAAGTGACCAGGGT CATATTCGCTTTCATCTGTGTTGTAGGGGTGGGCAAAAACCAGAAGATAGACCTGATATA GTAAGTAGAGTTTTCAAATTGAAGGTGAACGAACTTGTTTCTGTGTTGAAGAAGGGTACT TATTTTGGGAAGGCACGGGCAGTTCTATACACCATTGAGTTCCAGAAGCGTGGTCTACCT CACGTCCATATTTTGGTTTGGCTTCAAGCTTCCGATGGAGTACAGTCTGCTATCACAAAT TAATTCCACCAGGCATAATTGGCGTATAAAGGTCAGAGTTGCTAGGTCATGGCATCTATC TGGAACTTCCAAAAGAAGAGATTTTACTGCTTTGGAACTTATCTTGGTCGATGAAGAGGG GGTAGGCATTACAGCTTGTGTGGGAGAAAATGAAATACAGAAGTTTTCAACGTCTATAGT GGAGGGACATGCCTACTTCTTACGGAATTTCCGTGTTAGTAGACAGACAAAAAAGCTCAA TGCTGTGCCTAGCACATATGCCATCTTTTTTTACACCATGGACTATTGTTGAAGAGATCC CTACAGAGATATCTGGCAGTCTTCCACTCTACATTTTTAATTTCGTGGACTTTGAGGATT TGGATGAAAGGGCAAGGCATCCAAATGGTTTAGTAGATGTTATTGGACAACTCACGGTTG TGCACCCTCTAGTACAAAGCAACGGTTTGAATGGGCCATCTGTTAGGCGGAATGTGGAAT TACGAGACCTTAGCGATCGGCTCTTGGAGATCACTTTATGGGCTGAGCATGCAACTTCTT TTGAAGATGAGTTCCTTATTGAAACTATTGGTAAAGATGAACCAGTCATAATTGTTTTTG CTGGCCTTAATATGAAACTATTCTCAGGTGCTCCAAGTTGCCGGAGCAGTGCTGCCACAA AATGGTACATTAACATTGATATTCCGGAGATTAATGCCTTTCGTACAAGCCTGCAAGGAA GAGGTTGCGAGGTTCTTCTCGTACCTAGTGATGGTGCTGCACTAGGAGCGGCTAACGAGG CAGATGCTAATAGGAAGTCTATATCCGAGCTTTTATCCTTGAATCCTCATGACAACAACG ATGTACGCTTCACTTGTGACGCACGTATAAAGGAAATTGATGTCTCAAGTGGTTGGTGGT ATAAGGCTTGCAGTATTTGTAGAAAGGGTGTGAAGCCAACTCTTCAAGGATTTGAATGTG TTAACTGTGACAACACAGAGCCAATAATCACACCCAGCTATAAGTTAAATGTTGTGATTG AGGACAACACTGACCGTGCAAAAATATTCATGTTTGGTGGTATGGCGGAGCAAGTTGTGC GACGAACAGCTGCCGATCTAGTTGAAGAAAGCTCAGCCAATCAGCTCTTACTGCCGTCAC CCCTCCGTGCTCTCATTGGCCGTAGGTTTGTTTTCCAAATAGTTATAAGTGAGCAGACCT TTCGGACTGGACAATTGTGCTTTCAAGTAAGGAAAGTGTTTAATCCACCCCCAATCGATG GGCAAAACAATGGTGTTCATGCCACTCTTGGAAATAGTCTTAGCCATGCAACCTTAGCTA GAACGTCAGGTGCTCAAAAGAAATGTGATCCTACCCCTTTAATGGAGGCATCGGGGAGTA GCTCCAACAAAGCATCCACCTTGCAGACATATGGTGTAACTGAACTCCCAACAGATCCTA AAGGAAGCGCCACTCCACCACCTCCTTTTGCTCATGGGGCTATCACAAAAACATCACCAC AGAAGGGGAATGAGATTTCTGAAGAACATGGAACTCCGGTTGGGAAACGATCTAGGTCTA CTCGCAAGGAACTATTCTCCACGAAAAAAGTGAAGGCAAGTGATGATTGAGCTCACAGTT TGCTGATATGCACCCGTCAATAACCTACTACAACATCTTCGGCACAGCATCCAGTTATTG TCTACTCATATTGCCGAGTATTGCTCCTTATGTACATATTGGAATAAATGTCCTTCTATA TTGTTGTAATATACTTAAGAGCTTGTTTGCAGTCTATATTAGGGTATATTTGTATGTTGT TTGGTAATGCAGTATGGACTAGGGAGTTCGCCTACTAGACCTTCAAGTATGTGTAGATTA ATAAAATGTGCCATAGTGGTCTACCGGCGCCCTTGGTACAATCAGAAGTGAACTGGTTTA TGTTTAGTGTCATGTAATAAAAAATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)