cluster # 3530

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Oryza sativa
cluster # 3530 cluster # 3530 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3530#0 length = 774 sequences # 2

consensusID : consensus_3530#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 774
fasta sequence

                              [AGTTTTTTTTTTAGATAACGGTAGCACGCTATATCCAGCTTCTGTAGTATGTACCCAAGGGTGTACAGGGTTGAATTATTACATAGTTATGCGAGAATACGCTTGATACTAAAAGAAAGGGCACATTTTATATGATATAATGGATATTGCTAAGACTTATTAGTTTTCCTCTTGAAATTATGCGGTATCTGAAACAAAGTCTTGGATTATAGTGCGTACTGCTACCGGAATCCTCATCGAGTGTGTATTATCGTCTAGCCATGTCAAGCTCCCAAATGTATATCCACCTTGTACTCTCTGCCTTGCTGTAAATGTGACTTTAAATGTTGCACTTTGACTACCACCTTTAGCGAAAGTGATCACCTGAGGCTCCACAACAACATTCACCCCAGCTGGTGCTTCAACCACCACCTTGTAATTTGCTTCTGACCCTCCAACGTTGGTGACAGTGCGCCAGACTATAACTGAGTCCTTGAGGTCTGGCACAGCGATGGATGGGAGGTTGAGTTGGTAGAGCTTCCCCATGTAGGACTTGCAGTCTTCCTGGGGGTCGAGGGAGCAGTTAAAGAACTTTGTATAGTCTTTTGGGTCGATGTCATACACTAGGCCAGGGTCGATTGCCTTGTTTGGCTCTATGTGGCCGCCGCCGAAGTCGAAAGGGTCGGCCACTTTTCTTGCTGATCCCTCAGCTTGAATTGGCATACCAAAACGGTCCGTCACTGATGCTGTAATGACAATGGCAGACTTGATCATGGCAGGTGACCAGTCTGGGTG]

[+] EMBL CB618623             [AGTTTTTTTTTTAGATAACGGTAGCACGCTATATCCAGCTTCTGTAGTATGTACCCAAGGGTGTACAGGGTTGAATTATTACATAGTTATGCGAGAATACGCTTGATACTAAAAGAAAGGGCACATTTTATATGATATAATGGATATTGCTAAGACTTATTAGTTTTCCTCTTGAAATTATGCGGTATCTGAAACAAAGTCTTGGATTATAGTGCGTACTGCTACCGGAATCCTCATCGAGTGTGTATTATCGTCTAGCCATGTCAAGCTCCCAAATGTATATCCACCTTGTACTCTCTGCCTTGCTGTAAATGTGACTTTAAATGTTGCACTTTGACTACCACCTTTAGCGAAAGTGATCACCTGAGGCTCCACAACAACATTCACCCCAGCTGGTGCTTCAACCACCACCTTGTAATTTGCTTCTGACCCTCCAACGTTGGTGACAGTGCGCCAGACTATAACTGAGTCCTTGAGGTCTGGCACAGCGATGGATGGGAGGTTGAGTTGGTAGAGCTTCCCCATGTAGGACTTGCAGTCTTCCTGGGGGTCGAGGGAGCAGTTAAAGAACTTTGTATAGTCTTTTGGGTCGATGTCATACACTAGGCCAGGGTCGATTGCCTTGTTTGGCTCTATGTGGCCGCCGCCGAAGTCGAAAGGGTCGGCCACTTTTCTTGCTGATCCCTCAGCTTGAATTGGCATACCAAAACGGTCCGTCACTGATGCTGTAATGACAATGGCAGACTTGATCATGGCAGGTGACCAGTCTGGGTG]
[+] EMBL CB618522             [                     TAGCACGCTATATCCAGCTTCTGTATTATGTACCCAAGGGTGTACAGGGTTGAATTATTACATAGTTATGCGAGAATACGCTTGATACTAAAAGAAAGGGCACATTTTATATGATATAATGGATATTGCTAAGACTTATTAGTTTTCCTCTTGAAATTATGCGGTATCTGAAACAAAGTCTTGGATTATAGTGCGTACTGCTACCGGAATCCTCATCGAGTGTGTATTATCGTCTAGCCATGTCAAGCTCCCAAATGTATATCCACCTTGTACTCTCTGCCTTGCTGTAAATGTGACTTTAAATGTTGCACTTTGACTACCACCTTTAGCGAAAGTGATCACCTGAGGCTCCACAACAACATTCACCCCAGCTGGTGCTTCAACCACCACCTTGTAATTTGCTTCTGACCCTCCAACGTTGGTGACAGTGCGCCAGACTATAACTGAGTCCTTGAGGTCTGGCACAGCGATGGATGGGAGGTTGAGTTGGTAGAGCTTCCCCATGTAGGACTTGCAGTCTTCCTGGGGGTCGAGGGAGCAGTTAAAGAACTTTGTATAGTCTTTTGGGTCGATGTCATACACTAGGCCAGGGTCGATTGCCTTGTTTGGCTCTATGTGGCCGCCGCCGAAGTCGAAAGGGTCGGCCACTTTTCTTGCTGATCCCTCAGCTTGAATTGGCATACCAAAACGGTCC                                                           ]




>consensus_3530#0
AGTTTTTTTTTTAGATAACGGTAGCACGCTATATCCAGCTTCTGTAGTATGTACCCAAGG
GTGTACAGGGTTGAATTATTACATAGTTATGCGAGAATACGCTTGATACTAAAAGAAAGG
GCACATTTTATATGATATAATGGATATTGCTAAGACTTATTAGTTTTCCTCTTGAAATTA
TGCGGTATCTGAAACAAAGTCTTGGATTATAGTGCGTACTGCTACCGGAATCCTCATCGA
GTGTGTATTATCGTCTAGCCATGTCAAGCTCCCAAATGTATATCCACCTTGTACTCTCTG
CCTTGCTGTAAATGTGACTTTAAATGTTGCACTTTGACTACCACCTTTAGCGAAAGTGAT
CACCTGAGGCTCCACAACAACATTCACCCCAGCTGGTGCTTCAACCACCACCTTGTAATT
TGCTTCTGACCCTCCAACGTTGGTGACAGTGCGCCAGACTATAACTGAGTCCTTGAGGTC
TGGCACAGCGATGGATGGGAGGTTGAGTTGGTAGAGCTTCCCCATGTAGGACTTGCAGTC
TTCCTGGGGGTCGAGGGAGCAGTTAAAGAACTTTGTATAGTCTTTTGGGTCGATGTCATA
CACTAGGCCAGGGTCGATTGCCTTGTTTGGCTCTATGTGGCCGCCGCCGAAGTCGAAAGG
GTCGGCCACTTTTCTTGCTGATCCCTCAGCTTGAATTGGCATACCAAAACGGTCCGTCAC
TGATGCTGTAATGACAATGGCAGACTTGATCATGGCAGGTGACCAGTCTGGGTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case