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Oryza sativa
cluster # 3613 cluster # 3613       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3613#0 length = 2653 sequences # 2  

consensusID : consensus_3613#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2653
fasta sequence
                              [CCACCGGTGAGGTCACGGCCGCCGCCTCCGCACCTCGCGGACTGCTCGCCGGCGCGGCCGGTGCCCGGCGGCTCTCGGTTCCTGCCGCGACCTCACCGCTCAGCCCGGATGTCCTCCTCTACGGATAAGGAGCTGCACGACGCACAGTGAATGATGTCCTACAGTCAGCTGATGGCACTTTCTCCTGCGGCTTCCTCACCATCTACAGCAATGCTTTTGCCTTCTCAATATGGTATACCAACTCAAAAAACAAGACTGTTGTCTGGACCGCGAACCGCGGACGCCCTGTGCATGCTAGGCGCTCTGTTGTTACCCTGCAGAAGGACGGTGCCATGGTTCTCAAGGACTACGATGGCACTGTGGTGTGGCAATCAGACAGCAACTCAATTGATGTCCAGTATGCTCAACTTCTGGACACTGGGAATCTTGTCATGAAGAACTCGAGTGGTAAGGTTGTATGGCAAAGTTTTGATTCACCCACAGATACTCTGCTACCAACTCAAAAAATCACTGCAGCTACAAAGTTGGTCTCTACTACTGGTTTATATGTTCCTGGTCACTACACATTTCATTTCACGGATTCATCAATACTGTCACTTATGTATGATGATGCTGATGTTCATGAAATATATTGGCCAGATCCTGACCGTGGAGAGTATGGAAATAAGAGGAACCGTTATATCAATACTAGGATGGGGTTTCTTGATGATAATGGGGATTTTGTTTCAAGTGATTTCGCTGATCAGCAACCATTTTCTGCTTCTGATAAAGGTTCAGGGATCAAGAGAAGGCTTACTCTAGACCATGACGGTAATCTCCGTCTCTACAGCTTGAGTAATGGGGAATGGTTGGTTTCCTGGGTCGCAATATCTCAACCATGCAATATTCATGGTTTGTGTGGTCCAAATGGAATCTGTCATTACTCGCCTACGCCTACATGTTCTTGTCCACCAGGCTATGAAATGAATAGTCATGGTAATTGGAGCCAAGGTTGTAAGGCTATAGTAGACATCTCCTGTAGTGTTGCAAAAGTTCAGTTTAAGTTTGTGCATCTTCCTGATACTGACTTCTGGGGATCTGATCAACAGCTTGTTAACCATGTATCTTGGCAGGCTTGTATGAACATATGCAGGAGTGATTGTAACTGTAAAGGTTTTCAGTACCTAAAAGGGGAAGGGACATGCTTTCCAAAATCATTCCTTTTCAATGGAAGGGCATACCCATCACACTTTGTGTCACCACGCAATATGTATCTTAAGATCCCTATAAGCATGAATATTTCAGGTATGCCAGTATCCCAATCCAATGTGCTTGATTCAAGAAAACATAGCCTTAATTGTGATCAGATGGATGAAAAAACTAGGGAACTATTTCCCGATGTGCACAAGACAAGTCAGGGAGAAACAAGATGGTTTTACTTGTATGGGTTTGCGGGTGCGATTTTTATTCTTGAAGTTTTCTTTATTGGATTTGCATGGTTCTTTGTTTCAAGATGGGATCTGGATGCATTAGAAATACAAGCAGTCGAGCAAGGTTACAAGGTGATGGCAAGTAATTTCAGAAGATATAATTATAAAGAGTTGGCTAAGGCAACTAGAAAGTTTAAATGTGAGCTTGGAAGAGGAGGCTCAGGTATTGTCTACAAGGGAACCTTGGATGATGGTCGAGTAGTTGCTGTTAAGATGCTGGAAAATGTAAGGCAATGTGAGGAAGAATTTCAAGCTGAGTTGCGCATAATTGGGAAAATTAACCATATGAATCTGGTAAGGATATGGGGATTTTGCTCAGAGAACTCACACAGGATGCTGGTTACCGAGTATATCGAGAATGGGTCATTAGCTAACATACTGTTTAATGAAAACATTTTGCTAGAGTGGAGACAGCGATTTAATATTGCTGTAGGTGTTGCCAAGGGGCTAGCCTATCTCCACCATGAGTGTCTAGAGTGGGTCATCCATTGTGACGTGAAGCCAGAGAATATCCTGTTGGACGGAAATTTTGAGCCTAAGATCGCGGACTTTGGGTTGGCGAAGCTCCTAAACAGAGGCGGGTCCAATCAAAACGTGTCTCGAGTGCGAGGGACCATAGGTTACATTGCTCCAGAGTGGATCAGCAGCCTGCAAATTACTGCAAAAGTTGATGTGTATAGCTATGGAGTTGTGCTGCTTGAGCTGGTGTCAGGAAAGCGAGTTCTGGATTTGGCTACAAGTGCTAATGAGGAGGTGCATGTAGTGCTCAGGAGGCTTGTAAAGATGTTTGCCAATAACTTGAGTGGAAATGAACCATCTTGGATTGCGGAGTTTGTGGATTGCAGGCTAAGTGGCCAGTTCAACTACACGCAAGTAAGAACAATGATCACACTGGCTGTCGCGTGCTTGGATGAAGAACGAAGCAAAAGGCCAACAATGGAATCTATAGTGCAGCTGCTCCTTTTGGTTGATGAATCTTGTAGCAGTAATGTTCTATGTCCTGAGATGCCAACAAGGTGGACAACTGGACACGCCAAGGCAAATGCAAGTTTTTGTATTCATAGTTTGTAGTTCTATCTCATTGTATGGAAATTCGGAAACTCTTGTACTTCAAACTCTAGGCATTCATTTATTCAGATGTGCTGCATATTCCTTCACAAATTATAATAAAGTATGCTATTCAA]

[+] EMBL AK101473             [CCACCGGTGAGGTCACGGCCGCCGCCTCCGCACCTCGCGGACTGCTCGCCGGCGCGGCCGGTGCCCGGCGGCTCTCGGTTCCTGCCGCGACCTCACCGCTCAGCCCGGATGTCCTCCTCTACGGATAAGGAGCTGCACGACGCACAGTGAATGATGTCCTACAGTCAGCTGATGGCACTTTCTCCTGCGGCTTCCTCACCATCTACAGCAATGCTTTTGCCTTCTCAATATGGTATACCAACTCAAAAAACAAGACTGTTGTCTGGACCGCGAACCGCGGACGCCCTGTGCATGCTAGGCGCTCTGTTGTTACCCTGCAGAAGGACGGTGCCATGGTTCTCAAGGACTACGATGGCACTGTGGTGTGGCAATCAGACAGCAACTCAATTGATGTCCAGTATGCTCAACTTCTGGACACTGGGAATCTTGTCATGAAGAACTCGAGTGGTAAGGTTGTATGGCAAAGTTTTGATTCACCCACAGATACTCTGCTACCAACTCAAAAAATCACTGCAGCTACAAAGTTGGTCTCTACTACTGGTTTATATGTTCCTGGTCACTACACATTTCATTTCACGGATTCATCAATACTGTCACTTATGTATGATGATGCTGATGTTCATGAAATATATTGGCCAGATCCTGACCGTGGAGAGTATGGAAATAAGAGGAACCGTTATATCAATACTAGGATGGGGTTTCTTGATGATAATGGGGATTTTGTTTCAAGTGATTTCGCTGATCAGCAACCATTTTCTGCTTCTGATAAAGGTTCAGGGATCAAGAGAAGGCTTACTCTAGACCATGACGGTAATCTCCGTCTCTACAGCTTGAGTAATGGGGAATGGTTGGTTTCCTGGGTCGCAATATCTCAACCATGCAATATTCATGGTTTGTGTGGTCCAAATGGAATCTGTCATTACTCGCCTACGCCTACATGTTCTTGTCCACCAGGCTATGAAATGAATAGTCATGGTAATTGGAGCCAAGGTTGTAAGGCTATAGTAGACATCTCCTGTAGTGTTGCAAAAGTTCAGTTTAAGTTTGTGCATCTTCCTGATACTGACTTCTGGGGATCTGATCAACAGCTTGTTAACCATGTATCTTGGCAGGCTTGTATGAACATATGCAGGAGTGATTGTAACTGTAAAGGTTTTCAGTACCTAAAAGGGGAAGGGACATGCTTTCCAAAATCATTCCTTTTCAATGGAAGGGCATACCCATCACACTTTGTGTCACCACGCAATATGTATCTTAAGATCCCTATAAGCATGAATATTTCAGGTATGCCAGTATCCCAATCCAATGTGCTTGATTCAAGAAAACATAGCCTTAATTGTGATCAGATGGATGAAAAAACTAGGGAACTATTTCCCGATGTGCACAAGACAAGTCAGGGAGAAACAAGATGGTTTTACTTGTATGGGTTTGCGGGTGCGATTTTTATTCTTGAAGTTTTCTTTATTGGATTTGCATGGTTCTTTGTTTCAAGATGGGATCTGGATGCATTAGAAATACAAGCAGTCGAGCAAGGTTACAAGGTGATGGCAAGTAATTTCAGAAGATATAATTATAAAGAGTTGGCTAAGGCAACTAGAAAGTTTAAATGTGAGCTTGGAAGAGGAGGCTCAGGTATTGTCTACAAGGGAACCTTGGATGATGGTCGAGTAGTTGCTGTTAAGATGCTGGAAAATGTAAGGCAATGTGAGGAAGAATTTCAAGCTGAGTTGCGCATAATTGGGAAAATTAACCATATGAATCTGGTAAGGATATGGGGATTTTGCTCAGAGAACTCACACAGGATGCTGGTTACCGAGTATATCGAGAATGGGTCATTAGCTAACATACTGTTTAATGAAAACATTTTGCTAGAGTGGAGACAGCGATTTAATATTGCTGTAGGTGTTGCCAAGGGGCTAGCCTATCTCCACCATGAGTGTCTAGAGTGGGTCATCCATTGTGACGTGAAGCCAGAGAATATCCTGTTGGACGGAAATTTTGAGCCTAAGATCGCGGACTTTGGGTTGGCGAAGCTCCTAAACAGAGGCGGGTCCAATCAAAACGTGTCTCGAGTGCGAGGGACCATAGGTTACATTGCTCCAGAGTGGATCAGCAGCCTGCAAATTACTGCAAAAGTTGATGTGTATAGCTATGGAGTTGTGCTGCTTGAGCTGGTGTCAGGAAAGCGAGTTCTGGATTTGGCTACAAGTGCTAATGAGGAGGTGCATGTAGTGCTCAGGAGGCTTGTAAAGATGTTTGCCAATAACTTGAGTGGAAATGAACCATCTTGGATTGCGGAGTTTGTGGATTGCAGGCTAAGTGGCCAGTTCAACTACACGCAAGTAAGAACAATGATCACACTGGCTGTCGCGTGCTTGGATGAAGAACGAAGCAAAAGGCCAACAATGGAATCTATAGTGCAGCTGCTCCTTTTGGTTGATGAATCTTGTAGCAGTAATGTTCTATGTCCTGAGATGCCAACAAGGTGGACAACTGGACACGCCAAGGCAAATGCAAGTTTTTGTATTCATAGTTTGTAGTTCTATCTCATTGTATGGAAATTCGGAAACTCTTGTACTTCAAACTCTAGGCATTCATTTATTCAGATGTGCTGCATATTCCTTCACAAATTATAATAAAGTATG        ]
[-] EMBL CB626909             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TAACATACTGTTTAATGAAAACATTTTGCTAGAGTGGAGACAGCGATTTAATATTGCTGTAGGTGTTGCCAAGGGGCTAGCCTATCTCCACCATGAGTGTCTAGAGTGGGTCATCCATTGTGACGTGAAGCCAGAGAATATCCTGTTGGACGGAAATTTTGAGCCTAAGATCGCGGACTTTGGGTTGGCGAAGCTCCTAAACAGAGGCGGGTCCAATCAAAACGTGTCTCGAGTGCGAGGGACCATAGGTTACATTGCTCCAGAGTGGATCAGCAGCCTGCAAATTACTGCAAAAGTTGATGTGTATAGCTATGGAGTTGTGCTGCTTGAGCTGGTGTCAGGAAAGCGAGTTCTGGATTTGGCTACAAATGCTAATGAGGAGGTGCATGTAGTGCTCAGGAGGCTTGTAAATATGTTTGTCAATAACTTGAGTGGAAATGAACCATCTTGGATTGCGGAGTTTGTGGATTGCAGGCTAAGTGGCCAGTTCAACTACACGCAAGTAAGAACAATGATCACACTGGCTGTCGCGTGCTTGGATGAAGAACGAAGCAAAAGGCCAACAATGGAATCTATAGTGCAGCTGCTCCTTTTGGTTGATGAATCTTGTAGCAGTAATGTTCTATGTCCTGAGATGTCAACAAGGTGGACAACTGGACACGCCAAGGCAAATGCAAGTTTTTGTATTCATAGTTTGTAGTTCTATCTCATTGTATGGAAATTCGGAAACTCTTGTACTTCAAACTCTAGGCATTCATTTATTCAGATGTGCTGCATATTGCTTCACAAATTATAATAAAGTATGCTATTCAA]


>consensus_3613#0 CCACCGGTGAGGTCACGGCCGCCGCCTCCGCACCTCGCGGACTGCTCGCCGGCGCGGCCG GTGCCCGGCGGCTCTCGGTTCCTGCCGCGACCTCACCGCTCAGCCCGGATGTCCTCCTCT ACGGATAAGGAGCTGCACGACGCACAGTGAATGATGTCCTACAGTCAGCTGATGGCACTT TCTCCTGCGGCTTCCTCACCATCTACAGCAATGCTTTTGCCTTCTCAATATGGTATACCA ACTCAAAAAACAAGACTGTTGTCTGGACCGCGAACCGCGGACGCCCTGTGCATGCTAGGC GCTCTGTTGTTACCCTGCAGAAGGACGGTGCCATGGTTCTCAAGGACTACGATGGCACTG TGGTGTGGCAATCAGACAGCAACTCAATTGATGTCCAGTATGCTCAACTTCTGGACACTG GGAATCTTGTCATGAAGAACTCGAGTGGTAAGGTTGTATGGCAAAGTTTTGATTCACCCA CAGATACTCTGCTACCAACTCAAAAAATCACTGCAGCTACAAAGTTGGTCTCTACTACTG GTTTATATGTTCCTGGTCACTACACATTTCATTTCACGGATTCATCAATACTGTCACTTA TGTATGATGATGCTGATGTTCATGAAATATATTGGCCAGATCCTGACCGTGGAGAGTATG GAAATAAGAGGAACCGTTATATCAATACTAGGATGGGGTTTCTTGATGATAATGGGGATT TTGTTTCAAGTGATTTCGCTGATCAGCAACCATTTTCTGCTTCTGATAAAGGTTCAGGGA TCAAGAGAAGGCTTACTCTAGACCATGACGGTAATCTCCGTCTCTACAGCTTGAGTAATG GGGAATGGTTGGTTTCCTGGGTCGCAATATCTCAACCATGCAATATTCATGGTTTGTGTG GTCCAAATGGAATCTGTCATTACTCGCCTACGCCTACATGTTCTTGTCCACCAGGCTATG AAATGAATAGTCATGGTAATTGGAGCCAAGGTTGTAAGGCTATAGTAGACATCTCCTGTA GTGTTGCAAAAGTTCAGTTTAAGTTTGTGCATCTTCCTGATACTGACTTCTGGGGATCTG ATCAACAGCTTGTTAACCATGTATCTTGGCAGGCTTGTATGAACATATGCAGGAGTGATT GTAACTGTAAAGGTTTTCAGTACCTAAAAGGGGAAGGGACATGCTTTCCAAAATCATTCC TTTTCAATGGAAGGGCATACCCATCACACTTTGTGTCACCACGCAATATGTATCTTAAGA TCCCTATAAGCATGAATATTTCAGGTATGCCAGTATCCCAATCCAATGTGCTTGATTCAA GAAAACATAGCCTTAATTGTGATCAGATGGATGAAAAAACTAGGGAACTATTTCCCGATG TGCACAAGACAAGTCAGGGAGAAACAAGATGGTTTTACTTGTATGGGTTTGCGGGTGCGA TTTTTATTCTTGAAGTTTTCTTTATTGGATTTGCATGGTTCTTTGTTTCAAGATGGGATC TGGATGCATTAGAAATACAAGCAGTCGAGCAAGGTTACAAGGTGATGGCAAGTAATTTCA GAAGATATAATTATAAAGAGTTGGCTAAGGCAACTAGAAAGTTTAAATGTGAGCTTGGAA GAGGAGGCTCAGGTATTGTCTACAAGGGAACCTTGGATGATGGTCGAGTAGTTGCTGTTA AGATGCTGGAAAATGTAAGGCAATGTGAGGAAGAATTTCAAGCTGAGTTGCGCATAATTG GGAAAATTAACCATATGAATCTGGTAAGGATATGGGGATTTTGCTCAGAGAACTCACACA GGATGCTGGTTACCGAGTATATCGAGAATGGGTCATTAGCTAACATACTGTTTAATGAAA ACATTTTGCTAGAGTGGAGACAGCGATTTAATATTGCTGTAGGTGTTGCCAAGGGGCTAG CCTATCTCCACCATGAGTGTCTAGAGTGGGTCATCCATTGTGACGTGAAGCCAGAGAATA TCCTGTTGGACGGAAATTTTGAGCCTAAGATCGCGGACTTTGGGTTGGCGAAGCTCCTAA ACAGAGGCGGGTCCAATCAAAACGTGTCTCGAGTGCGAGGGACCATAGGTTACATTGCTC CAGAGTGGATCAGCAGCCTGCAAATTACTGCAAAAGTTGATGTGTATAGCTATGGAGTTG TGCTGCTTGAGCTGGTGTCAGGAAAGCGAGTTCTGGATTTGGCTACAAGTGCTAATGAGG AGGTGCATGTAGTGCTCAGGAGGCTTGTAAAGATGTTTGCCAATAACTTGAGTGGAAATG AACCATCTTGGATTGCGGAGTTTGTGGATTGCAGGCTAAGTGGCCAGTTCAACTACACGC AAGTAAGAACAATGATCACACTGGCTGTCGCGTGCTTGGATGAAGAACGAAGCAAAAGGC CAACAATGGAATCTATAGTGCAGCTGCTCCTTTTGGTTGATGAATCTTGTAGCAGTAATG TTCTATGTCCTGAGATGCCAACAAGGTGGACAACTGGACACGCCAAGGCAAATGCAAGTT TTTGTATTCATAGTTTGTAGTTCTATCTCATTGTATGGAAATTCGGAAACTCTTGTACTT CAAACTCTAGGCATTCATTTATTCAGATGTGCTGCATATTCCTTCACAAATTATAATAAA GTATGCTATTCAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)