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Oryza sativa
cluster # 3650 cluster # 3650       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3650#0 length = 817 sequences # 2  

consensusID : consensus_3650#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 817
fasta sequence
                              [AAGAAAGTATATTGCTTTTTGATATATCACTCCAACATGCAACAATTTAATTTGTTTTTATCAATATGTAGAAGTTGAATTTTAATTTATATGTTTGTGAATTGATATATCTCATATTAATATATTATTTTAATTTTTTATAAATATTTAAGTAGCGAGCACCGAAAGAACATACCATCGAGAGCTTAAAATCCACACTTATGTTTGCGTCGAGTAAATAAAGGTCGATATTGATTGGTGACCTATCCTCTGCATTGCACGGAAACCTGGCCCATAGATGATCGGGGTAGGGATCGATTTCCCACGTTATAATTGATCATTTTTCACGGTTTTAATTTAGATATACTGTAGTTGAGCATGTGTATTTTGTTCTTACAGTTTTTCTACCACTACAAGAATCTATTTAATCTATGACAAAATTTTTTCGTCATGGATCACTGAAAATTCGTCACAGGAATTTGTTTGTGACGATTATACTTATCGTCATCTATTGAGCGTCACAGATTAAATTTGCCGATGTTTTTTCCGAAATCGTCACGGATCAGCACAATTATGACGTTTTTTAACCGTCATAAAACGCTTATGGGCTCATGTAGTCCAGGCCCAACATTTGTACGAAATTTAACGTCATAGATGGTTGCCACGTGGAAAGCC-ACATGGCAAGTGACGTGGTCGTTGACACGTGTGTGATGACATGTCACTGATGACATGGCAGCTGACGTCAGCAAATATTTTTATATGGCCCATTATTTTTTTTAACGGCTCATTATTTTTTTGACGGCCCATTANATTTTTTTAACTGGCCCATTTTGAACTA]

[+] EMBL CB628169             [AAGAAAGTATATTGCTTTTTGATATATCACTCCAACATGCAACAATTTAATTTGTTTTTATCAATATGTAGAAGTTGAATTTTAATTTATATGTTTGTGAATTGATATATCTCATATTAATATATTATTTTAATTTTTTATAAATATTTAAGTAGCGAGCACCGAAAGAACATACCATCGAGAGCTTAAAATCCACACTTATGTTTGCGTCGAGTAAATAAAGGTCGATATTGATTGGTGACCTATCCTCTGCATTGCACGGAAACCTGGCCCATAGATGATCGGGGTAGGGATCGATTTCCCACGTTATAATTGATCATTTTTCACGGTTTTAATTTAGATATACTGTAGTTGAGCATGTGTATTTTGTTCTTACAGTTTTTCTACCACTACAAGAATCTATTTAATCTATGACAAAATTTTTTCGTCATGGATCACTGAAAATTCGTCACAGGAATTTGTTTGTGACGATTATACTTATCGTCATCTATTGAGCGTCACAGATTAAATTTGCCGATGTTTTTTCCGAAATCGTCACGGATCAGCACAATTATGACGTTTTTTAACCGTCATAAAACGCTTATGGGCTCATGTAGTCCAGGCCCAACATTTGTACGAAATTTAACGTCATAGATGGTTGCCACGTGGAAAGCC ACATGGCAAGTGAC                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CB628168             [                                                                                                                                                  TTTAAGTAGCGAGCACCGAAAGAACATACCATCGAGAGCTTAAAATCCACACTTATGTTTGCGTCGAGTAAATAAAGGTCGATATTGATTGGTGACCTATCCTCTGCATTGCACGGAAACCTGGCCCATAGATGATCGGGGTAGGGATCGATTTCCCACGTTATAATTGATCATTTTTCACGGTTTTAATTTAGATATACTGTAGTTGAGCATGTGTATTTTGTTCTTACAGTTTTTCTACCACTACAAGAATCTATTTAATCTATGACAAAATTTTTTCGTCATGGATCACTGAAAATTCGTCACAGGAATTTGTTTGTGACGATTATACTTATCGTCATCTATTGAGCGTCACAGATTAAATTTGCCGATGTTTTTTCCGAAATCGTCACGGATCAGCACAATTATGACGTTTTTTAACCGTCATAAAACGCTTATGGGCTCATGTAGTCCAGGCCCAACATTTGTACGAAATTTAACGTCATAGATGGTTGCCACGTGG AAGCCAACATGGCAGGTGACGTGGTCGTTGACACGTGTGTGATGACATGTCACTGATGACATGGCAGCTGACGTCAGCAAATATTTTTATATGGCCCATTATTTTTTTTAACGGCTCATTATTTTTTTGACGGCCCATTANATTTTTTTAACTGGCCCATTTTGAACTA]


>consensus_3650#0 AAGAAAGTATATTGCTTTTTGATATATCACTCCAACATGCAACAATTTAATTTGTTTTTA TCAATATGTAGAAGTTGAATTTTAATTTATATGTTTGTGAATTGATATATCTCATATTAA TATATTATTTTAATTTTTTATAAATATTTAAGTAGCGAGCACCGAAAGAACATACCATCG AGAGCTTAAAATCCACACTTATGTTTGCGTCGAGTAAATAAAGGTCGATATTGATTGGTG ACCTATCCTCTGCATTGCACGGAAACCTGGCCCATAGATGATCGGGGTAGGGATCGATTT CCCACGTTATAATTGATCATTTTTCACGGTTTTAATTTAGATATACTGTAGTTGAGCATG TGTATTTTGTTCTTACAGTTTTTCTACCACTACAAGAATCTATTTAATCTATGACAAAAT TTTTTCGTCATGGATCACTGAAAATTCGTCACAGGAATTTGTTTGTGACGATTATACTTA TCGTCATCTATTGAGCGTCACAGATTAAATTTGCCGATGTTTTTTCCGAAATCGTCACGG ATCAGCACAATTATGACGTTTTTTAACCGTCATAAAACGCTTATGGGCTCATGTAGTCCA GGCCCAACATTTGTACGAAATTTAACGTCATAGATGGTTGCCACGTGGAAAGCCACATGG CAAGTGACGTGGTCGTTGACACGTGTGTGATGACATGTCACTGATGACATGGCAGCTGAC GTCAGCAAATATTTTTATATGGCCCATTATTTTTTTTAACGGCTCATTATTTTTTTGACG GCCCATTANATTTTTTTAACTGGCCCATTTTGAACTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)