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Oryza sativa
cluster # 3768 cluster # 3768       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3768#0 length = 676 sequences # 2  

consensusID : consensus_3768#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 676
fasta sequence
                              [NCACCAGAAACCTGGGAGTGTGGATTCNCCAGNACAATGGTTTGGGGGCTGCATAATTAGGACCGCTTGATATTTGGAGGAGCGTATTTTTCAAGGGCATGCTGCATTTGATCACCATGGATGATGTGGTGGCCAGTGGTGGATGTGGAGGGGAATTCTTGGAGGACCATTCCAATGCCAGAAACTTTTGTTGACCCTTATTATGGTGTTGATGATGGATTCATTGATGTGTCTCAAGATTGCCTATGTTTTGTAAATACCGATCGCGATGATCTATACAAATTATCGGTATGGGTTCTTGAGGACTACAGCAGTGATCAGTGGACCTTGAAGCACACTGTCAGCCATCTACATCTATTTGGAACTGACAAACAGCATTTTGGATATGACGACAAAGTTGTCTCGATTCACCCAAAACGGAATATCATTTTCTTGGTTTCACTGAATGATGGAATATTCATTTCCTATGAAATGGATAGCAGGGAAGTGCATTATATATGTGAGCTTGGAGATATTTTGACACGGCATTATCTTCCCTATGTTCCCTTGTACTCGGAGTCACTGGCAAATGTACATTGATCATCTTAATTGCATAGCGTAATGCTCAGTTTGTTAACTTTAATTATGGCATTGAAGTTAAGTCATCAGTAACCTCACTTTATGGGGGGCCAAAAAA]

[+] EMBL AU093975             [NCACCAGAAACCTGGGAGTGTGGATTCNCCAGNACAATGGTTTGGGGGCTGCATAATTAGGACCGCTTGATATTTGGAGGAGCGTATTTTTCAAGGGCATGCTGCATTTGATCACCATGGATGATGTGGTGGCCAGTGGTGGATGTGGAGGGGAATTCTTGGAGGACCATTCCAATGCCAGAAACTTTTGTTGACCCTTATTATGGTGTTGATGATGGATTCATTGATGTGTCTCAAGATTGCCTATGTTTTGTAAATACCGATCGCGATGATCTATACAAATTATCGGTATGGGTTCTTGAGGACTACAGCAGTGATCAGTGGACCTTGAAGCACACTGTCAGCCATCTACATCTATTTGGAACTGACAAACAGCATTTTGGATATGACGACAAAGTTGTCTCGATTCACCCAAAACGGAATATCATTTTCTTGGTTTCACTGAATGATGGAATATTCATTTCCTATGAAATGGATAGCAGGGAAGTGCATTATATATGTGAGCTTGGAGATATTTTGACACGGCATTATCTTCCCTATGTTCCCTTGTACTCGGAGTCACTGGCAAATGTACATTGATCATCTTAATTGCATAGCGTAATGCTCAGTTTGTTAACTTTAATTATGGCATTGAAGTTAAGTCATCAGTAACCTCACTTTATGGGGGGCCAAAAAA]
[+] EMBL CB097090             [                 agggGGATT ACAGGAACAATGGTT  GGGGCTGCATAATTAGGA CGCTTGATATTTGGAGGAGCGTATTTTTCAAGGGCATGCTGCATTTGATCACCATGGATGATGTGGTGG CAGTGGTGGATGTGGAGGGGAATTCTTGGAGGACCATTCCAATGCCAGAAACTTTTGTTGATCCTTATTATGGTGTTGATGATGGATTCATTGATGTGTCTCAAGATTGCCTATGATTTGTAAATACCGATCGCGATGATCTATACAAATTATCGGTATGGGTTCTTGAGGACTACGGCAGTGATCAGTGGACCTTGAAGCACACTGTCAGCCATCTACATCTATTTGAAACTGACAAACAGCATTTTGGATATGACTACAAAGTTGTCTCGATTCACCCAAAACGGAATATCATTTTCTTGGTTTCACTGAATGACGGAATATTCATTTCCTATGAAATGGATAGCAGGGAAGTGCATTATATATGTGAGCTTGGAGATATTTTGACACGGCATTATCTTCCCTATGTTCCCTTGTACTCGGAGTCACTGGCAAATGTACATTGATCATCTTAATTGCATAGCGTAATGCTCAGTTTGTTAACTTTAATTATGGCATTGAAGTTAAGTCATCAGTAACCTCACTTTATGGGGGGCCAAtg  ]


>consensus_3768#0 NCACCAGAAACCTGGGAGTGTGGATTCNCCAGNACAATGGTTTGGGGGCTGCATAATTAG GACCGCTTGATATTTGGAGGAGCGTATTTTTCAAGGGCATGCTGCATTTGATCACCATGG ATGATGTGGTGGCCAGTGGTGGATGTGGAGGGGAATTCTTGGAGGACCATTCCAATGCCA GAAACTTTTGTTGACCCTTATTATGGTGTTGATGATGGATTCATTGATGTGTCTCAAGAT TGCCTATGTTTTGTAAATACCGATCGCGATGATCTATACAAATTATCGGTATGGGTTCTT GAGGACTACAGCAGTGATCAGTGGACCTTGAAGCACACTGTCAGCCATCTACATCTATTT GGAACTGACAAACAGCATTTTGGATATGACGACAAAGTTGTCTCGATTCACCCAAAACGG AATATCATTTTCTTGGTTTCACTGAATGATGGAATATTCATTTCCTATGAAATGGATAGC AGGGAAGTGCATTATATATGTGAGCTTGGAGATATTTTGACACGGCATTATCTTCCCTAT GTTCCCTTGTACTCGGAGTCACTGGCAAATGTACATTGATCATCTTAATTGCATAGCGTA ATGCTCAGTTTGTTAACTTTAATTATGGCATTGAAGTTAAGTCATCAGTAACCTCACTTT ATGGGGGGCCAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)