cluster # 3789

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Oryza sativa
cluster # 3789 cluster # 3789 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3789#0 length = 620 sequences # 2

consensusID : consensus_3789#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 620
fasta sequence

                              [TGTAGCTGGTAATGAACTACGAACTTAATTGGTTCATTTGCACAAATGCTATGTTTAATCTATGGGAAGATGCAATGTAGTTTACGACTTGAAAAAGTCTGTGGCTGTATCTGCAACAGGGCTAACAGTAACTGCGTAACTTGTCTATCTGTTTTTTGTGTTATAGGCATTTAACATGATTTTTTTTCCGAAAGTAAAAAAATGAAAAATATTAAGAAGCAACATAGTATATCAAATTAATAGTGAATACATGGGCACCCAAGTTAAACAAGGAAGGAAGTGAGCCTAGCTCACTTGGATTTGAGCTGAATATATACATATGTGGTAGATGTTAAGACTTGTTTTTGTCCAGCTATGCTGCTGTCAGAAGCTGTTCTGCCGGTTCTGACTTCTGAGTTTTGATGGATGTGTTTTAAGAGAAATATGCATGGATTTGGTCCTCGTATAAGCGCACTTCACACACAAGTAATATTTTGTAGTACAGCAGGCTCAAACAAGTAATTATTGTCATGTAACACAACACTTGCTACCCACTTCCCCTCTTAAATTCAAGGTGAAAAAACTATTGTTGTTCTGAAAGTGGGGGTGAAACTCTAGTAACCTAGATGACGATCTGTGCA]

[+] EMBL CF304369             [TGTAGCTGGTAATGAACTACGAACTTAATTGGTTCATTTGCACAAATGCTATGTTTAATCTATGGGAAGATGCAATGTAGTTTACGACTTGAAAAAGTCTGTGGCTGTATCTGCAACAGGGCTAACAGTAACTGCGTAACTTGTCTATCTGTTTTTTGTGTTATAGGCATTTAACATGATTTTTTTTCCGAAAGTAAAAAAATGAAAAATATTAAGAAGCAACATAGTATATCAAATTAATAGTGAATACATGGGCACCCAAGTTAAACAAGGAAGGAAGTGAGCCTAGCTCACTTGGATTTGAGCTGAATATATACATATGTGGTAGATGTTAAGACTTGTTTTTGTCCAGCTATGCTGCTGTCAGAAGCTGTTCTGCCGGTTCTGACTTCTGAGTTTTGATGGATGTGTTTTAAGAGAAATATGCATGGATTTGGTCCTCGTATAAGCGCACTTCACACACAAGTAATATTTTGTAGTACAGCAGGCTCAAACAAGTAATTATTGTCATGTAACACAACACTTGCTACCCACTTCCCCTCTTAAATTCAAGGTGAAAAAACTATTGTTGTTCTGAAAGTGGGGGTGAAACTCTAGTAACCTAGATGACGATCTGTGCA]
[+] EMBL CF303917             [TGTAGCTGGTACTGAACTACGAACTTAATTGGTTCATTTGCACAAATGCTATGTTTAATCTATGGGAAGATGCAATGTAGTTTACGACTTGAAAAAGTCTGTGGCTGTATCTGCAACAGGGCTAACAGTAACTGCGTAACTTGTCTATCTGTTTTTTGTGTTATAGGCATTTAACATGATTTTTTTTCCGAAAGTAAAAAAATGAAAAATATTAAGAAGCAACATAGTATATCAAATTAATAGTGAATACATGGGCACCCAAGTTAAACAA GAAGGAAGTGAGCCTAGCTCACTTGGATTTGAGCTGAATATATACATATGTGGTAGATGTTAAGACTTGTTTTTGTCCAGCTATGCTGCTGTCAGAAGCTGTTCTGCCGGTTCTGACTTCTGAGTTTTGATGGATGTGTTTTAAGAGAAAT T CATGGATTTGGTCCTCGTATAAGCGCACTTCACACACAAGTAATATTTTGTAGTACAGCAGGCTCAAACAAGTAATTATTGTCATGTAACACAACACTTGCTACCCACTTCCCCTCTTAAATTCAAGGTGAAAAAACTATTGTTGTTCTGAAAGTGGGGGTGAAACTCTAGTAACCTAGATGACGATCTGTGCA]




>consensus_3789#0
TGTAGCTGGTAATGAACTACGAACTTAATTGGTTCATTTGCACAAATGCTATGTTTAATC
TATGGGAAGATGCAATGTAGTTTACGACTTGAAAAAGTCTGTGGCTGTATCTGCAACAGG
GCTAACAGTAACTGCGTAACTTGTCTATCTGTTTTTTGTGTTATAGGCATTTAACATGAT
TTTTTTTCCGAAAGTAAAAAAATGAAAAATATTAAGAAGCAACATAGTATATCAAATTAA
TAGTGAATACATGGGCACCCAAGTTAAACAAGGAAGGAAGTGAGCCTAGCTCACTTGGAT
TTGAGCTGAATATATACATATGTGGTAGATGTTAAGACTTGTTTTTGTCCAGCTATGCTG
CTGTCAGAAGCTGTTCTGCCGGTTCTGACTTCTGAGTTTTGATGGATGTGTTTTAAGAGA
AATATGCATGGATTTGGTCCTCGTATAAGCGCACTTCACACACAAGTAATATTTTGTAGT
ACAGCAGGCTCAAACAAGTAATTATTGTCATGTAACACAACACTTGCTACCCACTTCCCC
TCTTAAATTCAAGGTGAAAAAACTATTGTTGTTCTGAAAGTGGGGGTGAAACTCTAGTAA
CCTAGATGACGATCTGTGCA

clustalw multiple alignements is not computed in this case