cluster # 4024

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 4024 cluster # 4024 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4024#0 length = 1215 sequences # 3
consensusID : consensus_4024#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1215
fasta sequence
                              [GGTCTCTAAAGGACTCCTTTTTGGATGAAGGGTTCATTCTAGACAAGAAAATCGGTCTTGGCCAACCGAAGAGGATTGAAAACGCCAAGATTTTGGTTGCAAATACTGCTATGGACACCGACAAAGTTAAGATATATGGAGCACGTGTACGGGTTGATTCAATGGCTAAGGTTGCTGAAATTGAAGCTGCTGAAAAGCAAAAAATGAGAGAAAAAGTGCAAAAAATCATAGGTCATGGAATCAACTGTTTCGTTAACAGGCAGTTGATCTACAACTTCCCTGAGGAACTCTTTGCAGATGCTGGCATACTGGCAATCGAGCATGCTGATTTTGAGGGCATTGAGCGGCTTGCTCTTGTCACTGGTGGTGACATCGCCTCCACTTTTGATAACCCGGAGTCTGTCAAACTTGGTCATTGCAAGGTCATTGAAGAGATTATGATTGGGGAGGACAGGCTGATTCATTTCTCTGGGGTTGAAATGGGGCAAGCCTGTACTATTGTCCTCAGAGGAGCAAGTGAGCATGTGCTTGATGAAGCAGAGAGGTCCCTGCACGATGCCTTATGTGTGCTTTCACAAACAGTGAACGACACCCGTGTGTTATATGGTGGTGGATGGCCTGAGATGGTTATGGCCAAAGAAGTAGATGGACTGGCGAGAAAGACACCTGGGAAGAAGTCCCATGCTATCGAAGCCTTCTCGCGCGCTCTTCAGTCCATTCCAACCATCATCGCTGACAATGCTGGTCTGGATAGCGCTGATCTGATCTCTCAGCTCAGAGCAGAGCATCACAAAGAGCAGAGCACTGCTGGAATTGATGTCATTTCTGGCGGCGTTGGAGACATGGAAAAGCTGGGGATATCAGAGTCGTTTAAGGCGAAGCAAGCTGTTCTTATGTCTG-CTA-CCGAGG--CAGCGGAGATGATT-CTCAGGGT-CGATGAG-ATCGTCACTTGTGCTCCACGGAGAAGGGAGGACAGGATGTGATGTGTCTGATATTTGTGTTCTAATCTGAGGGTGTTTGTTTTTTTGAAGTGTTTTGTATCAGGTCGTCTTGTAGACACATATGGGACGGCCGGGTCTGTATTATCATGAAAGCTTTGTCCTAACAGCGGAACACTTTGAATGGGATTCTTATTTGCAGCTTTACTCATGTGCGCTTGGCTCAAAATATGTTGGGTTTCGGTCTTGAGTATACATTCTATTGTACCAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK059663             [GGTCTCTAAAGGACTCCTTTTTGGATGAAGGGTTCATTCTAGACAAGAAAATCGGTCTTGGCCAACCGAAGAGGATTGAAAACGCCAAGATTTTGGTTGCAAATACTGCTATGGACACCGACAAAGTTAAGATATATGGAGCACGTGTACGGGTTGATTCAATGGCTAAGGTTGCTGAAATTGAAGCTGCTGAAAAGCAAAAAATGAGAGAAAAAGTGCAAAAAATCATAGGTCATGGAATCAACTGTTTCGTTAACAGGCAGTTGATCTACAACTTCCCTGAGGAACTCTTTGCAGATGCTGGCATACTGGCAATCGAGCATGCTGATTTTGAGGGCATTGAGCGGCTTGCTCTTGTCACTGGTGGTGACATCGCCTCCACTTTTGATAACCCGGAGTCTGTCAAACTTGGTCATTGCAAGGTCATTGAAGAGATTATGATTGGGGAGGACAGGCTGATTCATTTCTCTGGGGTTGAAATGGGGCAAGCCTGTACTATTGTCCTCAGAGGAGCAAGTGAGCATGTGCTTGATGAAGCAGAGAGGTCCCTGCACGATGCCTTATGTGTGCTTTCACAAACAGTGAACGACACCCGTGTGTTATATGGTGGTGGATGGCCTGAGATGGTTATGGCCAAAGAAGTAGATGGACTGGCGAGAAAGACACCTGGGAAGAAGTCCCATGCTATCGAAGCCTTCTCGCGCGCTCTTCAGTCCATTCCAACCATCATCGCTGACAATGCTGGTCTGGATAGCGCTGATCTGATCTCTCAGCTCAGAGCAGAGCATCACAAAGAGCAGAGCACTGCTGGAATTGATGTCATTTCTGGCGGCGTTGGAGACATGGAAAAGCTGGGGATATCAGAGTCGTTTAAGGCGAAGCAAGCTGTTCTTATGTCTG CTA CCGAGG  CAGCGGAGATGATT CTCAGGGT CGATGAG ATCGTCACTTGTGCTCCACGGAGAAGGGAGGACAGGATGTGATGTGTCTGATATTTGTGTTCTAATCTGAGGGTGTTTGTTTTTTTGAAGTGTTTTGTATCAGGTCGTCTTGTAGACACATATGGGACGGCCGGGTCTGTATTATCATGAAAGCTTTGTCCTAACAGCGGAACACTTTGAATGGGATTCTTATTTGCAGCTTTACTCATGTGCGCTTGGCTCAAAATATGTTGG                                           ]
[+] EMBL D42659               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TATGTNTG CTA CNGAGG  CAGC GAGATGATA NTNAGGGT CGATGAG ATCGTCACTTGTG TCCACGGAGAAGGGAGGACAGGATGTGATGTGTCTGATATTTGTGTTCTAATCTGAGGGTGTTTG TTTTTTGAAGTGTTTTGTATCAGGTCGTCTTGTAGACACATATGGGACNGCCGGGTCTGTATTATCATGAAAGCT                                                                                                                          ]
[+] EMBL AU095659             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttaatgncCTGCCTACCCGAGGGCCAGCGGAGATGATTCCTCAGGGTCCGATGAGAACCGTCACTTGTGCTCCACGGAGAAGGGAGGACAGGATGTGATGTGTCTGATATTTGTGTTCTAANCTGAGGGTGTTTGTTTTTTTGAAGTGTTTTGTATCAGGTCGTCTTGTAGACACATATGGGACGGCCGGGTCTGTATTATCATGAAAGCTTTGTCCTAACAGCGGAACACTTTGAATGGGATTCTTATTTGCAGCTTTACTCATGTGCGCTTGGCTCAAAATATGTTGGGTTTCGGTCTTGAGTATACATTCTATTGTACCAAAAAAAAAAA]




>consensus_4024#0
GGTCTCTAAAGGACTCCTTTTTGGATGAAGGGTTCATTCTAGACAAGAAAATCGGTCTTG
GCCAACCGAAGAGGATTGAAAACGCCAAGATTTTGGTTGCAAATACTGCTATGGACACCG
ACAAAGTTAAGATATATGGAGCACGTGTACGGGTTGATTCAATGGCTAAGGTTGCTGAAA
TTGAAGCTGCTGAAAAGCAAAAAATGAGAGAAAAAGTGCAAAAAATCATAGGTCATGGAA
TCAACTGTTTCGTTAACAGGCAGTTGATCTACAACTTCCCTGAGGAACTCTTTGCAGATG
CTGGCATACTGGCAATCGAGCATGCTGATTTTGAGGGCATTGAGCGGCTTGCTCTTGTCA
CTGGTGGTGACATCGCCTCCACTTTTGATAACCCGGAGTCTGTCAAACTTGGTCATTGCA
AGGTCATTGAAGAGATTATGATTGGGGAGGACAGGCTGATTCATTTCTCTGGGGTTGAAA
TGGGGCAAGCCTGTACTATTGTCCTCAGAGGAGCAAGTGAGCATGTGCTTGATGAAGCAG
AGAGGTCCCTGCACGATGCCTTATGTGTGCTTTCACAAACAGTGAACGACACCCGTGTGT
TATATGGTGGTGGATGGCCTGAGATGGTTATGGCCAAAGAAGTAGATGGACTGGCGAGAA
AGACACCTGGGAAGAAGTCCCATGCTATCGAAGCCTTCTCGCGCGCTCTTCAGTCCATTC
CAACCATCATCGCTGACAATGCTGGTCTGGATAGCGCTGATCTGATCTCTCAGCTCAGAG
CAGAGCATCACAAAGAGCAGAGCACTGCTGGAATTGATGTCATTTCTGGCGGCGTTGGAG
ACATGGAAAAGCTGGGGATATCAGAGTCGTTTAAGGCGAAGCAAGCTGTTCTTATGTCTG
CTACCGAGGCAGCGGAGATGATTCTCAGGGTCGATGAGATCGTCACTTGTGCTCCACGGA
GAAGGGAGGACAGGATGTGATGTGTCTGATATTTGTGTTCTAATCTGAGGGTGTTTGTTT
TTTTGAAGTGTTTTGTATCAGGTCGTCTTGTAGACACATATGGGACGGCCGGGTCTGTAT
TATCATGAAAGCTTTGTCCTAACAGCGGAACACTTTGAATGGGATTCTTATTTGCAGCTT
TACTCATGTGCGCTTGGCTCAAAATATGTTGGGTTTCGGTCTTGAGTATACATTCTATTG
TACCAAAAAAAAAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case