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Oryza sativa
cluster # 4169 cluster # 4169       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4169#0 length = 5078 sequences # 3  

consensusID : consensus_4169#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 5078
fasta sequence
                              [TGAAAAGGAAGAAAACTAATCCTCCCCCAAACTTTCTCTGTTCTCTCCTCTGTTCTTCCTATCCCCTTCTGTTCTTCCCAAAATCCCCATCTATTTCTGAAATCATCGCTGCGAATATTACAGTGGTATCAGATTCAGGTCGTTCGTGGTCGATTTAGGCTCATATTCTCTCGATCCGGCTGGTAAAATTCCTATGCTCAGGTAGGCGGCTACCCTTGGGTGCGGCTGCTGTAAATCCGGTTCTGGTTCGGCTGGATTTGGAGGAGTCTTTCACCACGGCGCCGATCAAACTCTCCGCTCCCTTGCGCCAATCTCTCGACGCCATGGAGGCTAAGCTTCTCGAGAAGCTGGACTCCCTCACGCTGTGTATGGAGGCTTTGGACGACAAGTTAACCAAGCAGAGCGGCCGAATTGATCAAGTCGCTACCAAGGTGGATCTCGCCATGGATGCTGTGGCCGCTTTGCAGAAGGAGCAAGTGCAGGCGGCGCAGCTGCACAAGCAAGCCATGGCTTCAGAACCGGTGAGTATTTTGGGTTCCCCGTCTTCTCTATCAGTGGCAAGTCTGGGCACAACAACACCACCACCACCACCACCTCCTCCTCCTCCACCGCTGGTTTTTTCTAAGTCAATATCTCGTTGGGGGAATGGTGAATCTAGTGCGGGTTGTGATGGGGGGTTGCGCGCTAAGAGTTGTCTTCCGAAGATGGATTTTCCACGTTTTGATGGGGCTGATGTGAGAGTCTGGATTGATATGTGTGAGACATTTTGAGATGTACCAGATTCCTCCTGTATTTCAAGTTTCAGCAGCTGTTCTTCACATGTCGGGGAATGCTGCCCAGTGGTATCAATCGTTTAAGCTCGTGGAGGAAGTTGCTAATTGGTCTCAGTTTCGACATGCTGTTGTTTGTGAGTTTGAGAGCACCTCGCAACGTGAGAAGATTCAGGCTCTGCAAACTTTAAGACAGGCAGGTTCTGTGGCTGAATATAAGCATCAATTTGATTCTCTTGTCTATCAGATCCGTGTATTTGATCCATCAGTGGGAGGTTTGATGCTGGTGTATCGTTTTTATGTTGGGGCTTAAGGAGGACATTCGTGCAGCAGTGATGGTTCAGTTGCCTACCACAGTTCAGCAAGCTGCTGCTGTGGCATTGATGCAAGAGAGTGTTCTACTTGAATTGAGTACTAAGCAATCTAAGCGATTGATGTATAAACCATTGCCTACCAAAGGGGAGTTGCCTCAGGGTGGTACTGATACTCCTGCTATTAAGCCTGAACGAGCAGAACTATGGAAGGCTCGACAGTTAAGGGATTATCGAAGAGCCAATGGTCTTTGTTTCAAATGTGGGGATAAATATTCTCCTGAGCACCAGTGTGCGCTGGGTGGTCAGATTAAAGCTATGCAAGTTACTGAAGTGATTCCGGATGATCTTTTGAATGCAGTGACTGCTGAAGAAGACTCTGACCAGGATGAGAATTGTCATATTTCACTCAATTCCCTGTCTGGTGCTAGTCATGTGAACACTATCAGACTCCGAGCTTTGGTCCAGAATAAGGTGTTGCTCTTACTGGTCGACTCTGGCAGTTCTCATAGTTTCTTGGACTATAACTTTGCTCAACTCTTGGGATTGCAGTTGCAGCCCATTGCTCCCTCCCTGGTTAAAGTAGCTAATGGTGATTGTATACACTGTCAGTTTATGGTTCCTCAGTTTACTTGGTGGTTTCAAGGGCGTACTTTCACTTATGATATGAGAGTTGTTCCTTTGGGTGGACATGATGCTATTTTGGGGATGGACTGGTTGGCACAGTGGGGTGATATGTCTTGCAATTGGGCCAACAAAACTTTGAAGTTTATGTATCAGGGTACTTGGGTTGAACTTCAGGGAGTCCCTGATTCTCCTCCCCAAACTGAGTTGAGTGCTATGTCTTTGTCTCAGGTTCTTAAGTGTCAAAAAGGGTGTGATATATGGGCAGCTGCACTGCTGGAAACAGCTGACTTCCCTTCTGCTGATTCAGTTCCACCTGCTGTTTCTCAGTTAGTGCATGAGTTTGCTGATGTTTTTCAAGATCCACACAGTTTACCACCTCACAGAGTTTATGATCACGCTATTACTCTTTTCCCTGGTTCAGCTCCTGTGAATAGCAAACCTTATCGGTATTCTCCTTTGCAAAAAGATGAGATTGAAAGTCAGGTCAAGGACATGATTGATTCTGGGTTGATCACTCCCAGTATGAGCCCTTTTGCTTCTCCTGTTTTATTGGTTAAAAAGAAGGATGGCACGTGGCGTTTTTGTGTGGATTATCGCAAACTCAACTCTATTACTGTGAAAAGTAAGTTTCCTATGCCTATTGTTGATGAATTGCTTGATGAGCTTGCTGGTACTCGTTTCTTCTCTAAACTTGACTTGAAAGCTGGCTATCATCAAATATGGATGGTGGAGGATGATGAATATAAAACTGCTTTTAAAACACACCATGGTCAATTTCAATTCCATGTGATGCCGTTTGGGTTGACCAATGCCCCTTCTACTTTTCAATGTGTGATGAATTCAGTGTTTGCACCCTTAATCAGGAAGTATGTTTTGGTGTTTATGGATGATATTCTAGTGTACAGTCCTGATTTACCGTCTCATCTCACACACTTGAAACAAGTTTTTGAACTGCTGAGACAACACAAGTTATATGCCAAAAGGTCCAAGTGTTCTTTTGCCTGTTCTCAATTGGAGTATTTGGGACACATAATTTCAGATCAAGGAGTCAGTACTGATCCTACTAAGACTGCAGCTATGTTGGCTTGGCCAGTCCCTGCCAATGTGACAGAACTCAGAGGGTTTTTGGGGCTTACAGGGTATTATAGAAAGTTTGTTAAAAATTATAGTATCCTGGCAAAACCTTTAACTGTCTTACTACAGAAGAAAGCGTTCCAGTGGTCTGATGATGCTCAGCAGGCTTTTCAGAAGCTGAAACTTGCTATGAGTTCAACTCCTGTACTGGCTTTGCCCGATTTCTCCCAACCTTTTATTTTGGAAACTGATGCTTGTGCGTTTGGAGTGGGAGCTGTCCTCAGTCAGCATAATCATCCTATTGCATATTATAGCAAGACATTGGGAGTGGCTAATCAGAAGCTTTCTATATATGAAAAAGAGTTCCTGGTGATTATGATGGCTGTGGATAAGTGGCGTTGTTATTTGTAACGATGCCCTTTTATCATTCGCACTGATCACAAAAGTCTTTGTCATCTCAATATCAGGTTCTGGGGACTGATTTACAGCAAAAGGCAATGACTAAATTGATGGGGTTACAATATACTTTCCAGTATAAGAAAGGAGTGGAGAACGTGGTAGCTGATGCTTTGTCTCGAGTGCCTCCTCAGTCTCACTTATCTGCTCTGTCAGTGGCTAGCCCCATTTGGTTGCAGGAAGTGTTAAACTCGTATGCTGTGGATACTCAGGCTCAGAAGTTATTGGTAGAATTGGCAGTCCATTCTCCTAATGATCAGGGTTATTCTTTGACTGATGGTCTCATTCGTCATCATGGTCGCATTTGGATAGGAGCTAATCTGGGTTTGCAGACTAAGTTAATCACTGCTTTTCATTCCTCTCCAATTGGTGGTCACTCGGGCACTATGGCCACTTATCACCGGCTCAAAAAGTTGTTCTCTTGGGTTGGTCTGAAAACTGCAGTATTCAACTTTGTTAAACAGTGTCAAATCTGCCAACAAGCTAAACATGAGCATTGTCGATTGCCTGGGTTGTTAGTTCCTTTACCAGTACCGAAAGAAGCTTGGATCGACATCTCGATGGATTTTATTGAAGGTTTGCCCAAATCTGATGGTTACACTGTTATACTTGTTGTGGTGGATCGTTTCACTAAATTTGCTAGTTTCATTCCTTTGAGACACCCTTATACTGCTTCACAAGTAGCGGTCACAGTGGATAAATTTGTGTTTAAGACCCATGGCTTACCACAGTCAATTGTGTCGGATCATGACAAAGTGTTCACTAGTCGTTTTTGGGGTGATTTGTTTAAAGTATGGAACACTCAATTGAACATGAGTACGGCATATCATCCTCAAACCGACGGGCAAACCGAAAGAGTGAATCAGTGTCTCGAGATGTATTTGAGGTGCATGATTCAAGCTACTCCCACCAAATGGAACAGTTGGCTGCATTTGGCTGAGTACTGGTATAATACATCTTTTCATACATCTTTGGGTTGTTCCCCTCACAAAGCTTTGTTTGGAGTGGAACCTCATATCAGTCAAGTGCCGGTGCTGCTGTCCTCAGTTCATCATTCTGTGGTGGACTTAATTTCTGAACGCAATCAGTTGTCTGTCTTTTTACAGCAACAGTTACAACGAGCACAATTGCGTATGAAGCATAAGGCTGATAAAGGGCGATCTGAGCGTTCCTTTTCTGTTGGTGATCATGTCTTTCTTCGCTTGCAACCTTATGCTCAGTCTTCGGTGGTGAATCGCCCATATCCCAAACTGGCATTCAAGTTCTTTGGACCATTTCAAATCTTGGAGAAAGTTGGGTCGGCAGCTTATCGTCTGGCTTTACCTGAAGGCAGTGCGGTCCATCCTGTGTTTCATGTGTCTCAACTCAAAGCTCATGTGCCAGATCACACTCCAGTGTTTACTTCTCTACCCACACCGGTTGTACTGGATGCTGCCGATGTGTGGCCTGAACTGATTCTGGACAGGCGTCTGGTAAAAAAGGGGAATGCAGCTCATGTTCAGGTGCTTATCAAGTGGTCATCTCTGTCTGCTGATGATGCCACCTGGGAGGATTATGATGTGTTGAAGACACGATTCCCTTCTGCGCCAGCTTGGGGACAAGCTGCATCTTTGGCGGGCGGTACTGTCACAGCTGATGGTATTCAGTGCGACGCGCCACAGTAGTCGTGATGGACAGCTACAGTAGCGTTCCAGGAATAGAGTGAAATGGGCCTGCGCGCTCACATGAGTTATGTTGGGTTGTTGGGCCTGCGAGCTCATG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GATGGGGTTACAATATACTTTCCAGTATAAGAAAGGAGTGGAGAACGTGGTAGCTGATGCTTTGTCTCGAGTGCCTCCTCAGTCTCACTTATCTGCTCTGTCAGTGGCTAGCCCCATTTGGTTGCAGGAAGTGTTAAACTCGTATGCTGTGGATACTCAGGCTCAGAAGTTATTGGTAGAATTGGCAGTCCATTCTCCTAATGATCAGGGTTATTCTTTGACTGATGGTCTCATTCGTCATCATGGTCGCATTTGGATAGGAGCTAATCTGGGTTTGCAGACTAAGTTAATCACTGCTTTTCATTCCTCTCCAATTGGTGGTCACTCGGGCACTATGGCCACTTATCACCGGCTCAAAAAGTTGTTCTCTTGGGTTGGTCTGAAAACTGCAGTATTCAACTTTGTTAAACAGTGTCAAATCTGCCAACAAGCTAAACATGAGCATTGTCGATTGCCTGGGTTGTTAGTTCCTTTACCAGTACCGAAAGAAGCTTGGATCGACATCTCGATGGATTTTATTGAAGGTTTGCCCAAATCTGATGGTTACACTGTTATACTTGTTGTGGTGGATCGTTTCACTAAATTCGCTAGTTTCATTCCTTTGAGACACCCTTATACTGCTTCACAAGTAGCGGTCACAGTGGATAAATTTGTGTTTAAGACCCATGGCTTACCACAGTCAATTGTGTCGGATCATGACAAAGTGTTCACTAGTCGTTTTTGGGGTGATTTGTTTAAAGTATGGAACACTCAATTGAACATGAGTACGGCATATCATCCTCAAACCGACGGGCAAACCGAAAGAGTGAATCAGTGTCTCGAGATGTATTTGAGGTGCATGATTCAAGCTACTCCCACCAAATGGAACAGTTGGCTGCATTTGGCTGAGTACTGGTATAATACATCTTTTCATACATCTTTGGGTTGTTCCCCTCACAAAGCTTTGTTTGGAGTGGAACCTCATATCAGTCAAGTGCCGGTGCTGCTGTCCTCAGTTCATCATTCTGTGGTGGACTTAATTTCTGAACGCAATCAGTTGTCTGTCTTTTTACAGCAACAGTTACAACGAGCACAATTGCGTATGAAGCATAAGGCTGATAAAGGGCGATCTGAGCGTTCCTTTTCTGTTGGTGATCATGTCTTTCTTCGCTTGCAACCTTATGCTCAGTCTTCGGTGGTGAATCGCCCATATCCCAAACTGGCATTCAAGTTCTTTGGACCATTTCAAATCTTGGAGAAAGTTGGGTCGGCAGCTTATCGTCTGGCTTTACCTGAAGGCAGTGCGGTCCATCCTGTGTTTCATGTGTCTCAACTCAAAGCTCATGTGCCAGATCACACTCCAGTGTTTACTTCTCTACCCACACCGGTTGTACTGGATGCTGCCGATGTGTGGCCTGAACTGATTCTGGACAGGCGTCTGGTAAAAAAGGGGAATGCAGCTCATGTTCAGGTGCTTATCAAGTGGTCATCTCTGTCTGCTGATGATGCCACCTGGGAGGATTATGATGTGTTGAAGACACGATTCCCTTCTGCGCCAGCTTGGGGACAAGCTGCATCTTTGGCGGGCGGTACTGTCACAGCTGATGGTATTCAGTGCGACGCGCCACAGTAGTCGTGATGGACAGCT 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>consensus_4169#0 TGAAAAGGAAGAAAACTAATCCTCCCCCAAACTTTCTCTGTTCTCTCCTCTGTTCTTCCT ATCCCCTTCTGTTCTTCCCAAAATCCCCATCTATTTCTGAAATCATCGCTGCGAATATTA CAGTGGTATCAGATTCAGGTCGTTCGTGGTCGATTTAGGCTCATATTCTCTCGATCCGGC TGGTAAAATTCCTATGCTCAGGTAGGCGGCTACCCTTGGGTGCGGCTGCTGTAAATCCGG TTCTGGTTCGGCTGGATTTGGAGGAGTCTTTCACCACGGCGCCGATCAAACTCTCCGCTC CCTTGCGCCAATCTCTCGACGCCATGGAGGCTAAGCTTCTCGAGAAGCTGGACTCCCTCA CGCTGTGTATGGAGGCTTTGGACGACAAGTTAACCAAGCAGAGCGGCCGAATTGATCAAG TCGCTACCAAGGTGGATCTCGCCATGGATGCTGTGGCCGCTTTGCAGAAGGAGCAAGTGC AGGCGGCGCAGCTGCACAAGCAAGCCATGGCTTCAGAACCGGTGAGTATTTTGGGTTCCC CGTCTTCTCTATCAGTGGCAAGTCTGGGCACAACAACACCACCACCACCACCACCTCCTC CTCCTCCACCGCTGGTTTTTTCTAAGTCAATATCTCGTTGGGGGAATGGTGAATCTAGTG CGGGTTGTGATGGGGGGTTGCGCGCTAAGAGTTGTCTTCCGAAGATGGATTTTCCACGTT TTGATGGGGCTGATGTGAGAGTCTGGATTGATATGTGTGAGACATTTTGAGATGTACCAG ATTCCTCCTGTATTTCAAGTTTCAGCAGCTGTTCTTCACATGTCGGGGAATGCTGCCCAG TGGTATCAATCGTTTAAGCTCGTGGAGGAAGTTGCTAATTGGTCTCAGTTTCGACATGCT GTTGTTTGTGAGTTTGAGAGCACCTCGCAACGTGAGAAGATTCAGGCTCTGCAAACTTTA AGACAGGCAGGTTCTGTGGCTGAATATAAGCATCAATTTGATTCTCTTGTCTATCAGATC CGTGTATTTGATCCATCAGTGGGAGGTTTGATGCTGGTGTATCGTTTTTATGTTGGGGCT TAAGGAGGACATTCGTGCAGCAGTGATGGTTCAGTTGCCTACCACAGTTCAGCAAGCTGC TGCTGTGGCATTGATGCAAGAGAGTGTTCTACTTGAATTGAGTACTAAGCAATCTAAGCG ATTGATGTATAAACCATTGCCTACCAAAGGGGAGTTGCCTCAGGGTGGTACTGATACTCC TGCTATTAAGCCTGAACGAGCAGAACTATGGAAGGCTCGACAGTTAAGGGATTATCGAAG AGCCAATGGTCTTTGTTTCAAATGTGGGGATAAATATTCTCCTGAGCACCAGTGTGCGCT GGGTGGTCAGATTAAAGCTATGCAAGTTACTGAAGTGATTCCGGATGATCTTTTGAATGC AGTGACTGCTGAAGAAGACTCTGACCAGGATGAGAATTGTCATATTTCACTCAATTCCCT GTCTGGTGCTAGTCATGTGAACACTATCAGACTCCGAGCTTTGGTCCAGAATAAGGTGTT GCTCTTACTGGTCGACTCTGGCAGTTCTCATAGTTTCTTGGACTATAACTTTGCTCAACT CTTGGGATTGCAGTTGCAGCCCATTGCTCCCTCCCTGGTTAAAGTAGCTAATGGTGATTG TATACACTGTCAGTTTATGGTTCCTCAGTTTACTTGGTGGTTTCAAGGGCGTACTTTCAC TTATGATATGAGAGTTGTTCCTTTGGGTGGACATGATGCTATTTTGGGGATGGACTGGTT GGCACAGTGGGGTGATATGTCTTGCAATTGGGCCAACAAAACTTTGAAGTTTATGTATCA GGGTACTTGGGTTGAACTTCAGGGAGTCCCTGATTCTCCTCCCCAAACTGAGTTGAGTGC TATGTCTTTGTCTCAGGTTCTTAAGTGTCAAAAAGGGTGTGATATATGGGCAGCTGCACT GCTGGAAACAGCTGACTTCCCTTCTGCTGATTCAGTTCCACCTGCTGTTTCTCAGTTAGT GCATGAGTTTGCTGATGTTTTTCAAGATCCACACAGTTTACCACCTCACAGAGTTTATGA TCACGCTATTACTCTTTTCCCTGGTTCAGCTCCTGTGAATAGCAAACCTTATCGGTATTC TCCTTTGCAAAAAGATGAGATTGAAAGTCAGGTCAAGGACATGATTGATTCTGGGTTGAT CACTCCCAGTATGAGCCCTTTTGCTTCTCCTGTTTTATTGGTTAAAAAGAAGGATGGCAC GTGGCGTTTTTGTGTGGATTATCGCAAACTCAACTCTATTACTGTGAAAAGTAAGTTTCC TATGCCTATTGTTGATGAATTGCTTGATGAGCTTGCTGGTACTCGTTTCTTCTCTAAACT TGACTTGAAAGCTGGCTATCATCAAATATGGATGGTGGAGGATGATGAATATAAAACTGC TTTTAAAACACACCATGGTCAATTTCAATTCCATGTGATGCCGTTTGGGTTGACCAATGC CCCTTCTACTTTTCAATGTGTGATGAATTCAGTGTTTGCACCCTTAATCAGGAAGTATGT TTTGGTGTTTATGGATGATATTCTAGTGTACAGTCCTGATTTACCGTCTCATCTCACACA CTTGAAACAAGTTTTTGAACTGCTGAGACAACACAAGTTATATGCCAAAAGGTCCAAGTG TTCTTTTGCCTGTTCTCAATTGGAGTATTTGGGACACATAATTTCAGATCAAGGAGTCAG TACTGATCCTACTAAGACTGCAGCTATGTTGGCTTGGCCAGTCCCTGCCAATGTGACAGA ACTCAGAGGGTTTTTGGGGCTTACAGGGTATTATAGAAAGTTTGTTAAAAATTATAGTAT 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clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)