cluster # 4210

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 4210 cluster # 4210 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4210#0 length = 625 sequences # 3

consensusID : consensus_4210#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 625
fasta sequence

                              [GACAAGGGGTATGAACCCTATATTGTGAGATCGAGCAACTGAAGAGAGCTCTTGGGAGAGCTAGGAAGAAACACAATACTCTTGCAAAGAAGGCACGACTGTTAGAAATCGGCTGGGATAAAGCTTTAGATTTGTTGGCTTTTGTGAACCAGATATGTGATGGTATATGCTCCTCTGCTCTAGGAGGCCCTGATGCTGATGGCCTTAATAATCGTGAGGTTGGAGTATTATACGATGTGCATCGCCTTGGTGAATATGCTCAGTCTCACATGGACGAAGGCTTGGCTAATCTTAGCAGTGTTGCTAGCAGATGCATCTAAGGCTAAGGACCTGCTCATGGATTTCTTTTGGGGACTAAGCTAGCCGAAAACAATAGACCTTGTGACATATATTATCTCTAGTATGTTTTCATTAGGGATGTTGCAGCTGATTGTAATAGAAATAGCTCTGTATAGCTAAGTGTTGATGTATAGAAGAGCATGTATGCATGCTATATGGTAGTTATGTATTTGTGTACAGTATACATGCAGACATATGTAATCTATAATGGAACGGTAGTGTAAG-CAGTAAAACCTTATGATTTGTATGCACTGGCGCTTAGCTAAAAAAAAAAAAAACGAAAAAA]

[+] EMBL CA765603             [GACAAGGGGTATGAACCCTATATTGTGAGATCGAGCAACTGAAGAGAGCTCTTGGGAGAGCTAGGAAGAAACACAATACTCTTGCAAAGAAGGCACGACTGTTAGAAATCGGCTGGGATAAAGCTTTAGATTTGTTGGCTTTTGTGAACCAGATATGTGATGGTATATGCTCCTCTGCTCTAGGAGGCCCTGATGCTGATGGCCTTAATAATCGTGAGGTTGGAGTATTATACGATGTGCATCGCCTTGGTGAATATGCTCAGTCTCACATGGACGAAGGCTTGGCTAATCTTAGCAGTGTTGCTAGCAGATGCATCTAAGGCTAAGGACCTGCTCATGGATTTCTTTTGGGGACTAAGCTAGCCGAAAACAATAGACCTTGTGACATATATTATCTCTAGTATGTTTTCATTAGGGATGTTGCAGCTGATTGTAATAGAAATAGCTCTGTATAGCTAAGTGTTGATGTATAGAAGAGCATGTATGCATGCTATATGGTAGTTATGTATTTGTGTACAGTATACATGCAGACATATGTAATCTATAATGGAACGGTAGTGTAAG CAGTAAAACCTTA                                                ]
[+] EMBL CA765606             [GAC AGGGGTATGAACCCTATATTGTGAGATCGAGCAACTGAAGAGAGCTCTTGGGAGAGCTAGGAAGAAACACAATACTCTTGCAAAGAAGGCACGACTGTTAGAAATCGGCTGGGATAAAGCTTTAGATTTGTTGGCTTTTGTGAACCAGATATGTGATGGTATATGCTCCTCTGCTCTAGGAGGCCCTGATGCTGATGGCCTTAATAATCGTGAGGTTGGAGTATTATACGATGTGCATCGCCTTGGTGAATATGCTCAGTCTCACATGGACGAAGGCTTGGCTAATCTTAGCAGTGTTGCTAGCAGATGCATCTAAGGCTAAGGACCTGCTCATGGATTTCTTTTGGGGACTAAGCTAGCCGAAAACAATAGACCTTGTGACATATATTATCTCTAGTATGTTTTCATTAGGGATGTTGCAGCTGATTGTAATAGAAATAGCTCTGTATAGCTAAGTGTTGATGTATAGAAGAGCATGTATGCATGCTATATGGTAGTTATGTATTTGTGTACAGTATACATGCAGACATATGTAATCTATAATGGAACGGTAGTGTAAG CAGTAAAACCTTA                                                ]
[+] EMBL BI804046             [                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTTGGCTAATCTTAGCAGTGTTGCTAGCAGATGCATCTAAGGCTAAGGACCTGCTCATGGATTTCTTTTGGGGACTAAGCTAGCCGAAAACCATAGACCTTGTGACATATATTATCTCTAGTATGTTTTCATTAGGGATGTTGCAGCTGATTGTAATAGAAATAGCTCTGTATAGCTAAGTGTTGATGTATAGAAGAGCATGTATGCATGCTATATGGTAGTTATGTATTTGTGTACAGTATACATGCAGACATATGTAATCTATAATGGAACGGTAGTGTAAGCCAGTAAAACCTTATGATTTGTATGCACTGGCGCTTAGCTAAAAAAAAAAAAAACGAAAAAA]




>consensus_4210#0
GACAAGGGGTATGAACCCTATATTGTGAGATCGAGCAACTGAAGAGAGCTCTTGGGAGAG
CTAGGAAGAAACACAATACTCTTGCAAAGAAGGCACGACTGTTAGAAATCGGCTGGGATA
AAGCTTTAGATTTGTTGGCTTTTGTGAACCAGATATGTGATGGTATATGCTCCTCTGCTC
TAGGAGGCCCTGATGCTGATGGCCTTAATAATCGTGAGGTTGGAGTATTATACGATGTGC
ATCGCCTTGGTGAATATGCTCAGTCTCACATGGACGAAGGCTTGGCTAATCTTAGCAGTG
TTGCTAGCAGATGCATCTAAGGCTAAGGACCTGCTCATGGATTTCTTTTGGGGACTAAGC
TAGCCGAAAACAATAGACCTTGTGACATATATTATCTCTAGTATGTTTTCATTAGGGATG
TTGCAGCTGATTGTAATAGAAATAGCTCTGTATAGCTAAGTGTTGATGTATAGAAGAGCA
TGTATGCATGCTATATGGTAGTTATGTATTTGTGTACAGTATACATGCAGACATATGTAA
TCTATAATGGAACGGTAGTGTAAGCAGTAAAACCTTATGATTTGTATGCACTGGCGCTTA
GCTAAAAAAAAAAAAAACGAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case