Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 4723 cluster # 4723       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4723#0 length = 1524 sequences # 3  

consensusID : consensus_4723#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1524
fasta sequence
                              [ACCAATCCTACTACTTCTCGTCCCGGGGTTTCTACAATTGAAGAAAAAAGTACAGGGCGTATCGATCAAATTATTGGACCCGTGCTGGATGTCACTTTTCCCCCGGGCAAGTTACCTTATATTTATAATGCTTTGGTAGTCAAGAGTCGAGACACTGACGGTAAGCAAATTAATGTAACTTGTGAGGTACAACAATTATTAGGAAATAATCGAGTTAGAGCTGTAGCTATGAGTGCTACAGATGGGTTGATGAGAGGAATGGAAGTGATTGACACGGTAGCTCCTCTCAGTGTTCCTGTCGGTGGAGCTACTCTTGGACGAATTTTCAACGTTCTTGGGGAGCCTGTTGACAATTTGGGTCCTGTAGATACTAGTGCAACATTCCCTATTCATAGATCCGCGCCCGCCTTTATCGAGTTAGATACGAAATTATCCATCTTTGAAACTGGTATTAAGGTGGTCGATCTTTTAGCTCCTTATCGGCGTGGAGGAAAAATCGGACTATTTGGGGGAGCTGGAGTAGGTAAAACAGTACTCATCATGGAATTAATCAACAATATTGCTAAAGCTCACGGCGGCGTATCCGTATTTGGCGGAGTAGGGGAACGGACTCGTGAAGGAAATGATCTTTATATGGAAATGAAGGAATCTGGAGTAATTAATGAAAAAAATCTTGAGGAATCAAAGGTAGCTCTAGTCTATGGCCAAATGAATGAACCGCCAGGAGCTCGTATGAGAGTTGGTTTGACTGCCCTAACTATGGCAGAATATTTCCGAGATGTTAATAAGCAAGACGTGCTTCTATTCATCGATAATATCTTTCGTTTTGTTCAAGCAGGATCGGAGGTATCTGCCTTATTAGGGAGAATGCCCTCTGCAGTGGGTTATCAACCTACTCTTAGTACAGAAATGGGTTCTTTGCAAGAAAGAATTACTTCTACTAAAAAGGGATCTATAACTTCGATCCAAGCGGTTTATGTACCTGCGGACGATTTGACCGACCCTGCTCCTGCTACAACATTTGCACATTTGGATGCTACTACCGTACTTTCCAGAGGATTAGCTTCCAAAGGGATTTATCCTGCAGTAGATCCTTTAGATTCAACCTCAACTATGTTACAACCTCGGATCGTTGGCAACGAACATTATGAAACTGCGCAAAGAGTTAAGCAAACTTTACAACGTTACAAAGAACTTCAGGACATTATCGCAATTCTTGGGTTGGATGAATTATCGGAGGAGGATCGTTTAACTGTAGCAAGAGCACGAAAAATTGAGCGCTTCTTATCACAACCGTTTTTTGTGGCAGAAGTTTTTACCGGTTCTCCGGGAAAGTATGTTGGTCTTGCAGAAACTATTAGGGGATTTCAACTAATCCTTTCCGGAGAATTAGACGGCCTACCCGAACAGGCTTTTTATTTGGTGGGTAACATCGATGAAGCTAGCACGAAAGCTATAAACTTAGAAGAGGAGAACAAATTGAAGAAATGAAATTAAATCTTTATGTACTGACTCCTAAGCGAA]

[+] EMBL AB037543             [ACCAATCCTACTACTTCTCGTCCCGGGGTTTCTACAATTGAAGAAAAAAGTACAGGGCGTATCGATCAAATTATTGGACCCGTGCTGGATGTCACTTTTCCCCCGGGCAAGTTACCTTATATTTATAATGCTTTGGTAGTCAAGAGTCGAGACACTGACGGTAAGCAAATTAATGTAACTTGTGAGGTACAACAATTATTAGGAAATAATCGAGTTAGAGCTGTAGCTATGAGTGCTACAGATGGGTTGATGAGAGGAATGGAAGTGATTGACACGGTAGCTCCTCTCAGTGTTCCTGTCGGTGGAGCTACTCTTGGACGAATTTTCAACGTTCTTGGGGAGCCTGTTGACAATTTGGGTCCTGTAGATACTAGTGCAACATTCCCTATTCATAGATCCGCGCCCGCCTTTATCGAGTTAGATACGAAATTATCCATCTTTGAAACTGGTATTAAGGTGGTCGATCTTTTAGCTCCTTATCGGCGTGGAGGAAAAATCGGACTATTTGGGGGAGCTGGAGTAGGTAAAACAGTACTCATCATGGAATTAATCAACAATATTGCTAAAGCTCACGGCGGCGTATCCGTATTTGGCGGAGTAGGGGAACGGACTCGTGAAGGAAATGATCTTTATATGGAAATGAAGGAATCTGGAGTAATTAATGAAAAAAATCTTGAGGAATCAAAGGTAGCTCTAGTCTATGGCCAAATGAATGAACCGCCAGGAGCTCGTATGAGAGTTGGTTTGACTGCCCTAACTATGGCAGAATATTTCCGAGATGTTAATAAGCAAGACGTGCTTCTATTCATCGATAATATCTTTCGTTTTGTTCAAGCAGGATCGGAGGTATCTGCCTTATTAGGGAGAATGCCCTCTGCAGTGGGTTATCAACCTACTCTTAGTACAGAAATGGGTTCTTTGCAAGAAAGAATTACTTCTACTAAAAAGGGATCTATAACTTCGATCCAAGCGGTTTATGTACCTGCGGACGATTTGACCGACCCTGCTCCTGCTACAACATTTGCACATTTGGATGCTACTACCGTACTTTCCAGAGGATTAGCTTCCAAAGGGATTTATCCTGCAGTAGATCCTTTAGATTCAACCTCAACTATGTTACAACCTCGGATCGTTGGCAACGAACATTATGAAACTGCGCAAAGAGTTAAGCAAACTTTACAACGTTACAAAGAACTTCAGGACATTATCGCAATTCTTGGGTTGGATGAATTATCGGAGGAGGATCGTTTAACTGTAGCAAGAGCACGAAAAATTGAGCGCTTCTTATCACAACCGTTTTTTGTGGCAGAAGTTTTTACCGGTTCTCCGGGAAAGTATGTTGGTCTTGCAGAAACTATTAGGGGATTTCAACTAATCCTTTCCGGAGAATTAGACGGCCTACCCGAACAGGCTTTTTATTTGGTGGGTAACATCGATGAAGCTAGCACGAAAGCTATAAACTTAGAAGAGGAGAACAAATTGAAGAAATGAAATTAAATCTTTATGTACTGACTCCTAAGCGAA]
[+] EMBL BI306697             [         ACTACTTCTCGTCCCGGGGTTTCTACAATTGAAGAAAAAAGTACAGGGCGTATCGATCAAATTATTGGACCCGTGCTGGATGTCACTTTTCCCCCGGGCAAGTTACCTTATATTTATAATGCTTTGGTAGTCAAGAGTCGAGACACTGACGGTAAGCAAATTAATGTAACTTGTGAGGTACAACAATTATTAGGAAATAATCGAGTTAGAGCTGTAGCTATGAGTGCTACAGATGGGTTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CB631977             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTATATGGAAATGAAGGAATCTGGAGTAATTAATGAAAAAAATCTTGAGGAATCAAAGGTAGCTCTAGTCTATGGCCAAATGAATGAACCGCCAGGAGCTCGTATGAGAGTTGGTTTGACTGCCCTAACTATGGCAGAATATTTCCGAGATGTTAATAAGCAAGACGTGCTTCTATTCATCGATAATATCTTTCGTTTTGTTCAAGCAGGATCGGAGGTATCTGCCTTATTAGGGAGAATGCCCTCTGCAGTGGGTTATCAACCTACTCTTAGTACAGAAATGGGTTCTTTGCAAGAAAGAATTACTTCTACTAAAAAGGGATCTATAACTTCGATCCAAGCGGTTTATGTACCTGCGGACGATTTGACCGACCCTGCTCCTGCTACAACATTTGCACATTTGGATGCTACTACCGTACTTTCCAGAGGATTAGCTTCCAAAGGGATTTATCCTGCAGTAGATCCTTTAGATTCAACCTCAACTATGTTACAACCTCGGATCGTTGGCAACGAACATTATGAAACTGCACAAAGAGTTAAGCAAACTTTACAACGTTACAAAGAACTTCAGGACATTATCGCAATTCTTGGGTTGGATGAATTATCGGAGGAGGATCGTTTAACTGTAGCAAGAGCACGAAAAATTGAGCGCTTCTTATCACAACCGTTTTTTGTGGCAGAAGTTTTTACCGGTTCTCCGGGAAAGTATGTTGGTCTTGCAGAAACTATTAGGGGATTTCAACTAATCCTTTCCGGAGAATTAGACGGCCTACCCGAACAGGCTTTTTATTTGGTGGGTAACATCGATGAAGCTAGCACGAA                                                                         ]


>consensus_4723#0 ACCAATCCTACTACTTCTCGTCCCGGGGTTTCTACAATTGAAGAAAAAAGTACAGGGCGT ATCGATCAAATTATTGGACCCGTGCTGGATGTCACTTTTCCCCCGGGCAAGTTACCTTAT ATTTATAATGCTTTGGTAGTCAAGAGTCGAGACACTGACGGTAAGCAAATTAATGTAACT TGTGAGGTACAACAATTATTAGGAAATAATCGAGTTAGAGCTGTAGCTATGAGTGCTACA GATGGGTTGATGAGAGGAATGGAAGTGATTGACACGGTAGCTCCTCTCAGTGTTCCTGTC GGTGGAGCTACTCTTGGACGAATTTTCAACGTTCTTGGGGAGCCTGTTGACAATTTGGGT CCTGTAGATACTAGTGCAACATTCCCTATTCATAGATCCGCGCCCGCCTTTATCGAGTTA GATACGAAATTATCCATCTTTGAAACTGGTATTAAGGTGGTCGATCTTTTAGCTCCTTAT CGGCGTGGAGGAAAAATCGGACTATTTGGGGGAGCTGGAGTAGGTAAAACAGTACTCATC ATGGAATTAATCAACAATATTGCTAAAGCTCACGGCGGCGTATCCGTATTTGGCGGAGTA GGGGAACGGACTCGTGAAGGAAATGATCTTTATATGGAAATGAAGGAATCTGGAGTAATT AATGAAAAAAATCTTGAGGAATCAAAGGTAGCTCTAGTCTATGGCCAAATGAATGAACCG CCAGGAGCTCGTATGAGAGTTGGTTTGACTGCCCTAACTATGGCAGAATATTTCCGAGAT GTTAATAAGCAAGACGTGCTTCTATTCATCGATAATATCTTTCGTTTTGTTCAAGCAGGA TCGGAGGTATCTGCCTTATTAGGGAGAATGCCCTCTGCAGTGGGTTATCAACCTACTCTT AGTACAGAAATGGGTTCTTTGCAAGAAAGAATTACTTCTACTAAAAAGGGATCTATAACT TCGATCCAAGCGGTTTATGTACCTGCGGACGATTTGACCGACCCTGCTCCTGCTACAACA TTTGCACATTTGGATGCTACTACCGTACTTTCCAGAGGATTAGCTTCCAAAGGGATTTAT CCTGCAGTAGATCCTTTAGATTCAACCTCAACTATGTTACAACCTCGGATCGTTGGCAAC GAACATTATGAAACTGCGCAAAGAGTTAAGCAAACTTTACAACGTTACAAAGAACTTCAG GACATTATCGCAATTCTTGGGTTGGATGAATTATCGGAGGAGGATCGTTTAACTGTAGCA AGAGCACGAAAAATTGAGCGCTTCTTATCACAACCGTTTTTTGTGGCAGAAGTTTTTACC GGTTCTCCGGGAAAGTATGTTGGTCTTGCAGAAACTATTAGGGGATTTCAACTAATCCTT TCCGGAGAATTAGACGGCCTACCCGAACAGGCTTTTTATTTGGTGGGTAACATCGATGAA GCTAGCACGAAAGCTATAAACTTAGAAGAGGAGAACAAATTGAAGAAATGAAATTAAATC TTTATGTACTGACTCCTAAGCGAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)