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Oryza sativa
cluster # 4770 cluster # 4770       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4770#0 length = 4592 sequences # 3  

consensusID : consensus_4770#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 4592
fasta sequence
                              [GCAGATTGACATATATTGGAGCAAGCGGCAAGTGGTGCTCCGGATATGATTTTTCTGGACATCATATCTGCAGCAAGCGTTTGGCGAGGAAGTGCTTTGTCTTTTTAAAATGTGTCACGGGTTAACGTAGGATGCTATTACTCGCACTAGCTAATTATTTTGTTTATCTGAAAACGAACGCCACCGTTGAAATACGAGTAGATGCAGTACATCTCCAAAAAAAATAAAAAATCTTGAGGTCAGGGTTAGTGACATCTTGCAACAGGTGTTATGAATATTTTTAAGTGCAGAATATGCTACCGTGGTGGTCTTGAGCACTAGCAAGAGGTAAAGCTATATGCCACAGCATTGCCATGTAAGTGCTTTCATCATATATTTTCCAGTTCTGTGAAAAGCTAGCTTGTGTATGTAGTGTGGACATGCTTAGAAACAAATGCCCAAGCCAGTAACTTCATTAACTTTGGATATACTAATATACTTTGAAATGCATACCGAGGTAGAAAGTATAGGTGGACTTTAAATAGCTTAGCGGCGGCCAATTCGGTGCTAGGCTTCTCCTGGTTCCGTGTGTTGGAGCTGTCGACGTGTGGGTGGTGGTATACTTTTTTTTCTTTTCCTGGTTACGATCTTACGGGGTTGTAATCTTGTAATTTTTCTTCTGCTCTATCAATAGAACTTCGCACCATCTTGTGCGAGTTGTTCAAAAAAAAACTTTAAATAGCTGGTATTTGTTGTGTTGTCTTTGTAGAAGACTTGTCCAAACTTGGCCATTAGCACATCGTCTTGTAATTGACAGGTGGAGAGGATGACTCATTATGCACATCTCTATCTTGCATTTCTCATGTGTCGGTTTACAACCAAAATGCTTTGCTCTTGCAGTATCCAACCTTATTTTTTTTTCTAATGGGGGCAACAGAGGGTGGTTTGGAAAATGCTTTGGTCACAGCTGAACTTGAGATCTTGAAAGAAGAGAAACTTCAGCTGCTATCTGGCAGTCGGTACTGAGCACCATGCATCGCCATCTGCTTTGCTTTCAGCATCTTCTTACTCACCCAACTTAAGGATGTAACAAACCCACCATGGATGCCTGTGGAGCAATTCTCTCCCTTCTTTTTACCTGCCAAAGCTTCCTTCCATGATGCCTCCTTTTTCCTTCATTTTTCCTCTTTCCATTTAGCCTCTCTTGGTGGCATCATGCTCACCAAAGGAATGGACTTGGCATCCATTTGGTGCTAATCTCTAAGCTGCTGGCTGTATTGCATAAGTATTCTTTAAGGATCATAGATAGTATTTGTGGGTGTCCTGACTATAATGGAGGAGGTACCATCCCCACTTTCCTACTGGTTGTGTATAACCCCTGAAACCAATGAGCTTTGCTTGTGGCTTTCCTCGTCTGTACTCCAGCTTTATTCCCATTCTCTTATCGTGCACCTGTTCCTCTCTTCATGTTTCTCGGTGGCATCTAACAATGCTGATGGATATATCTGCAGGCGTCTTGATGCATCCTATGCTTCTTCCTTAAGATAAGAAGAGCAATGGTGTTTATTACATTACCATATTAGCATGACGAAGGTGGCTCATTAGTATATCAATATATGAATCTCTGAATTTGTTTATGACCCATTTCTTTGAGCTGCGTATACGTATACTTAATACATGTTATTTTGAAATATCTACTTAATACATGTAAAGAAAATGGAAGGAAAAGTAGAAGAGATCCATAAAGTGGATATCTATCATAAGGTTGCAGAGTTGGATTAAGCGTGTACGGACATTAGTGGGCCTTGCGGCATGACTTTGTTAGTACTTCTGCATACCTGTGGTAGTACCATAATGCAGCATTAGATTCATCTTAAACATATATATTTATTTCTTTGTCCATGCTTACCTGCAAAGTCTACAAGGCCATTAGTCCTTGTGATTGAGCAAAGCATCCCCTTCGCGGCAGTCTTATAATGGGCTTCTAGCCTTGTGCCTTATATATTCTTGCCATTCAACTAGGCTTCATTACTTTTAGGACCCATGAAGCCATGTACCTGCATTCAACTAACTGCCATCAAATGTGTTAGGTTTCTCTTCTTAGCGTCTAAACTAGGCTGAAGCAAACTGATCTGATCCTTCTTTCCCTGACGCAAGATGCTGGTTCGATTAGGTTGTATCTTGTGCTAAGGGGGCAAGTACATGAAAGATGCAGTCAACACGATAAGTTGCAAAATAATTGTCTAGCTGGCTCCTTATGGAGCTTTCTAATGGGTGGACAGCACTAACAAAAATAAAATCATCCTTTCTGCAATGGACGAAATGTGATTATGGTGCTAACATTTGACCAACTAGAAGCTACGGTATCGGATCATCCAAACTTTCTTTCATCCTATTTCAAACTAGCTGCGGTATTGGAGTTCATCGGTGTGCGGGATTTCAGCGGTATGTAGGAGCTGTTGTACTCAAAGTCGTCGATGCGCTTGAGAAGAGAGTCGAGGTAGTCCAAAGTGTAATTCTTTGTATGCCTGGTGAAAATAAAAACAGAAAACATTTGTTTCAAAAGATAAGAAAAGAATTGAAAAACATAATTTATATTTAAAAAAGAGCATGTGACTGTCATCAAGAAGTGGGGTGGAGAGGACTGAAGAGGTTGGCCTTGCTGCAGCCCGTGCCTCGCAAAATCCAAACAAATTAAACTCCTGCCTACAATGGCGACCCGTTCATGCAATCCTTTTTCTCTCTTTTTTCCTCTCCAGAGTCCAGTCCAGGCTAGAACCAGCAGCAGTGTGGCCAGCAGCGTCCCTATTGCTGCATGTTTTTGCATCAGCCGGTGACTGATGAGTGAGTAAGGTTGCTGGGCTGGCCGGCCTCGGTATCCTGGCTCCCATTAGGGTGGGCATCAAAAGACAGTGCCAACGCTGCCGTGGACTAGATGGGCCAAAGCAGCAAGCACAGGGCCGACCCTTTGGAAGGGCAAGCCAGCCAGGGGGGCACACGTTAGTTGACAATAATATCAGTCCATCACAATTTTAGGTATCTGACTCGTCTCTTTCCCTCTCACTTCACACAGATGGGGAGTAATGGTGTGGGAGCTGCCGCTGCCGCTGCACTGCGTGGTAGAAACAAATCTGGGGTCAGAGCTGGCCTAGCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACCCAATGCATGATGGGGGAAGGAACCTTGTGATATGGAGATGCAGCATAGCATAGGGAAGGGCCGATGCACATGCCAATGCCACTGCCGATCAGGTACAGATGCTCTCTCTACAGATCCCTCTAGCTTGGTTGGTTAATGCTGTTAGGCATGGAGGTTTGTTGCTTGCTTTACTTTGCTCAATGGCTATAGTAAAAGTGGTGATCAAGATAAGACAGCAATGCTGCCTGGAACAGTGAAAATCTGAATTATTATCAGGGTTTATGGAGCAAAGAAGTAAAGCAATCAAGGCATGCATGCCTCGCAGGATAAATATATACACATCTCTGTCGGAACCTTTTCAGGGTCATGTCTATAATGCCACTTTGCTAAGCCACGGGTTTGCATTTAGCTTAGTTGAGGCAACATGAGCTTGGGACCCGCAGAGAGTGTAGCTGTGAATCTCTGATTCATCAGCTTTGTTGCAGTGTGCAGTCACTCACTTATGATGTTTTCACCCACACATACAGAGAGATACACTCCTATTTCTTAAAGATTGCACACATACAAGAGGAGTCAGTCTCAGTCACTGCGTCCTGCTGCGTGAAGAGGGAATAGGAAGCAAATATTGGAGAGACAAGTGCAGCTGTTGAGACCAGAGAAGGGAGGAGTGGTGGCCTTTGCACTGCTCACATGAGAAGGATCAGAAGAGTGTAATAATATAAAGGCAGTGCATGTGATGGCGATTGGTGTGGTTTGGTGCTCCTCCAGGAAACACTCATCAGTCTCCCGTAGCATCACTTACTATAATAATTAAAGTCCAAAACACATTAGCTAGCTGCACGTTAGCATGTTTATCCAACCAAGAAGGTGAGGACTGAGCAGGATATGAAAGAAAGAAAAGAAGAAAAGGATGGAAAAAAAGAAAACGGAGACAAGAATTGCTAATGGAGGCAACAGGACTACAGAAGAGTAGGTGGGCTAAACAATGGGGAGGAGGAGCAGCATCAGAGCATGGCATGGAGAAGTGTGAGCTTGGGGCCAAAGGAAAGGAGCTCTCCTCTGACGACGCCCATATGCTTTGGTTCTAGCACAGCATTAAGTAGCGAGAAAGACGGTGTTGGTGATGGCCATGATTCATGAGAAGTTGCGAAAGTCTCTCATTAGTGCCTGGAAATGAAGGTTGTTTATGCACTTTACCTGCCTTGTGCCCAAATCCCTTAATCAAGCTGTTGGAATCTTTTGTTAAAATTAAAGGGTTCCTGTACTGCTGTTAAAGTGTCATGTATGCAGTTCAAGTAGATGCATCATGCCACCTGCATATGTTGGCAGTTGTTGGAGTATATTACTGACATTATCTCTGCTGTTTTCCCATTATTATACCTGAATGTATTCGGTACTTCAATTGACATTTTTGTGTAAAATTCTCATGGCAGATGCAATAATGCTTGCTTGTTT]

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[+] EMBL CB673693             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTTTTTACCTGCCAAAGCTTCCTTCCATGATGCCTCCTTTTTCCTTCATTTTTCCTCTTTCCATTTAGCCTCTCTTGGTGGCATCATGCTCACCAAAGGAATGGACTTGGCATCCATTTGGTGCTAATCTCTAAGCTGCTGGCTGTATTGCATAAGTATTCTTTAAGGATCCTAGATAGTATTTGTGGGTGTCCTGACTATAATGGAGGAGGTACCATCCCCACTTTCCTACTGGTTGTGTATAACCCCTGAAACCAATGAGCTTTGCTTGTGGCTTTCCTCGTCTGTACTCCAGCTTTATTCCCATTCTCTTATCGTGCACCTGTTCCTCTCTTCATGTTTCTCGGTGGCATCTAACAATGCTGATGGATATATCTGCAGGCGTCTTGATGCATCCTATGCTTCTTCCTTAAGATAAGAAGAGCAATGGTGTTTATTACATTACCATATTAGCATGACGAAGGTTGCTCATTAGTATATCAATATATGAATCTCTGAATTTGTTTATGACCCATTTCTTTGAGCTGCGTATACGTATACTTAATACATGTTATTTTGAAATATCTACTTAATACATGTAAAGAAAATGGAAGGAAAAGTAGAAGAGATCCATAAAGTGGATATCTATCATAAGGTTGCAGAGTTGGATTAAGCGTGTACGGACATTAGTGGGCCTTGCGGCATGACTTTGTTAGTACTTCTGCATACCTGTGGTAGTACCATAATGCAGCATTAGATTCATCTTAAACATATATATTTATTTCTTTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CA766404             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  nCTCAGTCACTGCGTCCTGCAGCGTGAAGAGGGAATAGGAAGCAAATATTGGAGAGACAAGTGCAGCTGTTGAGACCAGAGAAGGGAGGAGTGGTGGCCTTTGCACTGCTCACATGAGAAGGATCAGAAGAGTGTAATAATATAAAGGCAGTGCATGTGATGGCGATTGGTGTGGTTTGNTNCTCCTCCAGGAAACACTCATCAGTCTCCCGTAGCATNANNNACTATAATAATTAACCCCCAAAACACATTAGCTAGCTGCACGTTAGCATGTTTATCCAACCAAGAAGGTGANAACAGANCAGGATATGAAAGAAAGAAAAGAAGAAAAGGATGGAAAAAAAGNAAACGGAGACAAGAATTGCTAATGGAGGCAACAGGACTACAGAAGAGTAGGTGGGCTAAACAATGGGGAGGAGGAGCAGCATCAGAGCATGGCATGGAGAAGTGTGAGCTTGGGGCCAAAGGAAAGGAGCTCTCCTCTGACGACGCCCATATGCTTTGGTTCTAGCACAGCATTAAGTAGCGAGAAAGACGGTGTTGGNGATGGCCATGATTCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]


>consensus_4770#0 GCAGATTGACATATATTGGAGCAAGCGGCAAGTGGTGCTCCGGATATGATTTTTCTGGAC ATCATATCTGCAGCAAGCGTTTGGCGAGGAAGTGCTTTGTCTTTTTAAAATGTGTCACGG GTTAACGTAGGATGCTATTACTCGCACTAGCTAATTATTTTGTTTATCTGAAAACGAACG CCACCGTTGAAATACGAGTAGATGCAGTACATCTCCAAAAAAAATAAAAAATCTTGAGGT CAGGGTTAGTGACATCTTGCAACAGGTGTTATGAATATTTTTAAGTGCAGAATATGCTAC CGTGGTGGTCTTGAGCACTAGCAAGAGGTAAAGCTATATGCCACAGCATTGCCATGTAAG TGCTTTCATCATATATTTTCCAGTTCTGTGAAAAGCTAGCTTGTGTATGTAGTGTGGACA TGCTTAGAAACAAATGCCCAAGCCAGTAACTTCATTAACTTTGGATATACTAATATACTT TGAAATGCATACCGAGGTAGAAAGTATAGGTGGACTTTAAATAGCTTAGCGGCGGCCAAT TCGGTGCTAGGCTTCTCCTGGTTCCGTGTGTTGGAGCTGTCGACGTGTGGGTGGTGGTAT ACTTTTTTTTCTTTTCCTGGTTACGATCTTACGGGGTTGTAATCTTGTAATTTTTCTTCT GCTCTATCAATAGAACTTCGCACCATCTTGTGCGAGTTGTTCAAAAAAAAACTTTAAATA GCTGGTATTTGTTGTGTTGTCTTTGTAGAAGACTTGTCCAAACTTGGCCATTAGCACATC GTCTTGTAATTGACAGGTGGAGAGGATGACTCATTATGCACATCTCTATCTTGCATTTCT CATGTGTCGGTTTACAACCAAAATGCTTTGCTCTTGCAGTATCCAACCTTATTTTTTTTT CTAATGGGGGCAACAGAGGGTGGTTTGGAAAATGCTTTGGTCACAGCTGAACTTGAGATC TTGAAAGAAGAGAAACTTCAGCTGCTATCTGGCAGTCGGTACTGAGCACCATGCATCGCC ATCTGCTTTGCTTTCAGCATCTTCTTACTCACCCAACTTAAGGATGTAACAAACCCACCA TGGATGCCTGTGGAGCAATTCTCTCCCTTCTTTTTACCTGCCAAAGCTTCCTTCCATGAT GCCTCCTTTTTCCTTCATTTTTCCTCTTTCCATTTAGCCTCTCTTGGTGGCATCATGCTC ACCAAAGGAATGGACTTGGCATCCATTTGGTGCTAATCTCTAAGCTGCTGGCTGTATTGC ATAAGTATTCTTTAAGGATCATAGATAGTATTTGTGGGTGTCCTGACTATAATGGAGGAG GTACCATCCCCACTTTCCTACTGGTTGTGTATAACCCCTGAAACCAATGAGCTTTGCTTG TGGCTTTCCTCGTCTGTACTCCAGCTTTATTCCCATTCTCTTATCGTGCACCTGTTCCTC TCTTCATGTTTCTCGGTGGCATCTAACAATGCTGATGGATATATCTGCAGGCGTCTTGAT GCATCCTATGCTTCTTCCTTAAGATAAGAAGAGCAATGGTGTTTATTACATTACCATATT AGCATGACGAAGGTGGCTCATTAGTATATCAATATATGAATCTCTGAATTTGTTTATGAC CCATTTCTTTGAGCTGCGTATACGTATACTTAATACATGTTATTTTGAAATATCTACTTA ATACATGTAAAGAAAATGGAAGGAAAAGTAGAAGAGATCCATAAAGTGGATATCTATCAT AAGGTTGCAGAGTTGGATTAAGCGTGTACGGACATTAGTGGGCCTTGCGGCATGACTTTG TTAGTACTTCTGCATACCTGTGGTAGTACCATAATGCAGCATTAGATTCATCTTAAACAT ATATATTTATTTCTTTGTCCATGCTTACCTGCAAAGTCTACAAGGCCATTAGTCCTTGTG ATTGAGCAAAGCATCCCCTTCGCGGCAGTCTTATAATGGGCTTCTAGCCTTGTGCCTTAT ATATTCTTGCCATTCAACTAGGCTTCATTACTTTTAGGACCCATGAAGCCATGTACCTGC ATTCAACTAACTGCCATCAAATGTGTTAGGTTTCTCTTCTTAGCGTCTAAACTAGGCTGA AGCAAACTGATCTGATCCTTCTTTCCCTGACGCAAGATGCTGGTTCGATTAGGTTGTATC TTGTGCTAAGGGGGCAAGTACATGAAAGATGCAGTCAACACGATAAGTTGCAAAATAATT GTCTAGCTGGCTCCTTATGGAGCTTTCTAATGGGTGGACAGCACTAACAAAAATAAAATC ATCCTTTCTGCAATGGACGAAATGTGATTATGGTGCTAACATTTGACCAACTAGAAGCTA CGGTATCGGATCATCCAAACTTTCTTTCATCCTATTTCAAACTAGCTGCGGTATTGGAGT TCATCGGTGTGCGGGATTTCAGCGGTATGTAGGAGCTGTTGTACTCAAAGTCGTCGATGC GCTTGAGAAGAGAGTCGAGGTAGTCCAAAGTGTAATTCTTTGTATGCCTGGTGAAAATAA AAACAGAAAACATTTGTTTCAAAAGATAAGAAAAGAATTGAAAAACATAATTTATATTTA AAAAAGAGCATGTGACTGTCATCAAGAAGTGGGGTGGAGAGGACTGAAGAGGTTGGCCTT GCTGCAGCCCGTGCCTCGCAAAATCCAAACAAATTAAACTCCTGCCTACAATGGCGACCC GTTCATGCAATCCTTTTTCTCTCTTTTTTCCTCTCCAGAGTCCAGTCCAGGCTAGAACCA GCAGCAGTGTGGCCAGCAGCGTCCCTATTGCTGCATGTTTTTGCATCAGCCGGTGACTGA TGAGTGAGTAAGGTTGCTGGGCTGGCCGGCCTCGGTATCCTGGCTCCCATTAGGGTGGGC ATCAAAAGACAGTGCCAACGCTGCCGTGGACTAGATGGGCCAAAGCAGCAAGCACAGGGC CGACCCTTTGGAAGGGCAAGCCAGCCAGGGGGGCACACGTTAGTTGACAATAATATCAGT CCATCACAATTTTAGGTATCTGACTCGTCTCTTTCCCTCTCACTTCACACAGATGGGGAG TAATGGTGTGGGAGCTGCCGCTGCCGCTGCACTGCGTGGTAGAAACAAATCTGGGGTCAG AGCTGGCCTAGCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACCCAATGCATGATGGGGGAAGGAA CCTTGTGATATGGAGATGCAGCATAGCATAGGGAAGGGCCGATGCACATGCCAATGCCAC TGCCGATCAGGTACAGATGCTCTCTCTACAGATCCCTCTAGCTTGGTTGGTTAATGCTGT TAGGCATGGAGGTTTGTTGCTTGCTTTACTTTGCTCAATGGCTATAGTAAAAGTGGTGAT CAAGATAAGACAGCAATGCTGCCTGGAACAGTGAAAATCTGAATTATTATCAGGGTTTAT GGAGCAAAGAAGTAAAGCAATCAAGGCATGCATGCCTCGCAGGATAAATATATACACATC TCTGTCGGAACCTTTTCAGGGTCATGTCTATAATGCCACTTTGCTAAGCCACGGGTTTGC ATTTAGCTTAGTTGAGGCAACATGAGCTTGGGACCCGCAGAGAGTGTAGCTGTGAATCTC TGATTCATCAGCTTTGTTGCAGTGTGCAGTCACTCACTTATGATGTTTTCACCCACACAT ACAGAGAGATACACTCCTATTTCTTAAAGATTGCACACATACAAGAGGAGTCAGTCTCAG TCACTGCGTCCTGCTGCGTGAAGAGGGAATAGGAAGCAAATATTGGAGAGACAAGTGCAG CTGTTGAGACCAGAGAAGGGAGGAGTGGTGGCCTTTGCACTGCTCACATGAGAAGGATCA GAAGAGTGTAATAATATAAAGGCAGTGCATGTGATGGCGATTGGTGTGGTTTGGTGCTCC TCCAGGAAACACTCATCAGTCTCCCGTAGCATCACTTACTATAATAATTAAAGTCCAAAA CACATTAGCTAGCTGCACGTTAGCATGTTTATCCAACCAAGAAGGTGAGGACTGAGCAGG ATATGAAAGAAAGAAAAGAAGAAAAGGATGGAAAAAAAGAAAACGGAGACAAGAATTGCT AATGGAGGCAACAGGACTACAGAAGAGTAGGTGGGCTAAACAATGGGGAGGAGGAGCAGC ATCAGAGCATGGCATGGAGAAGTGTGAGCTTGGGGCCAAAGGAAAGGAGCTCTCCTCTGA CGACGCCCATATGCTTTGGTTCTAGCACAGCATTAAGTAGCGAGAAAGACGGTGTTGGTG ATGGCCATGATTCATGAGAAGTTGCGAAAGTCTCTCATTAGTGCCTGGAAATGAAGGTTG TTTATGCACTTTACCTGCCTTGTGCCCAAATCCCTTAATCAAGCTGTTGGAATCTTTTGT TAAAATTAAAGGGTTCCTGTACTGCTGTTAAAGTGTCATGTATGCAGTTCAAGTAGATGC ATCATGCCACCTGCATATGTTGGCAGTTGTTGGAGTATATTACTGACATTATCTCTGCTG TTTTCCCATTATTATACCTGAATGTATTCGGTACTTCAATTGACATTTTTGTGTAAAATT CTCATGGCAGATGCAATAATGCTTGCTTGTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)