These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_4787#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 1743 fasta sequence [GCCAAAGGAAAGGAGAAAGCGCGGCCATGGCGGAAGACGCGCCGCCGTCGTCGCTTCCGCTGCTGCTGCCGCGGAAGTCGTTGTCCTCGTCCTCCGCGCAGCGCAAGCAGCAGTACGCGCGGTGCGTGTCGCACGCTGGGGACGAGCTCCACAGCTTCCGCTCCTGCCTCGCGTGGATGTGCGTCGACCACTCCACCCGCGCCCGCGGCGCCGCGTCGTGGGCGGCCTTCCTCCTCCTCGCCGTCGCCGCCCCGTCCGCGGCCACCCTCGCGCTCCCCTCCCCGGTCGGCGGCGGGGGGTCGCCGTTCGACGGGCAGGTCCAGGTGTCGCTCACCCTGGCCGCCGCGCTCGCCTACCTCACCCTCACGGCGCTCCTCCAGGGCCGCGGCCTCCGCCGCCTGCTCTACCTCGACCGCCTCCGCGACGACTCCGAGGAGGTCCGGTCCGGCTACATCGAGGAGCTCGCGGGCTCCTTCCGCGTCCTCGCCTGCTTCCTCCTCCCCTGCACGCTCGCCGAGGCCGCCTACAAGGCGTACTGGTACCTCGCCGCGCCGCCGTTCCGCTCCCCGTGGTGGTCCGCCGCCGCGTGCGCCGTCGAGGTCGCCTCCTGGGCCTACCGCACCGCCGTCTTCTTCATGGTCTGCGTCCTCTTCCGGACCATCTGCTACCTGCAGATCCTCCGGATGAAGGGCTTCGCGCGCGAGTTCTGCAGGTTCGCCGACGTCGCCGCCGTGCTCGAGAGCCACCGCCGCATCAGGAAGCAGCTCCACAGGATCAGCCACCGCTACCGCCGCTTCATACTCTGCTGCCTCGTCCTCGTCACCACCAGCCAGTTCGCCGCCCTGCTTGCCACCACCAGGCCGCACGCGCAGATCAACCTCGCCACCGCCGGCGAGCTCGCGCTCTGCTCGCTGAGCCTCGTGGCCGGGCTGCTGGTGTGCCTCCAGAGCGCGGCGAAGATCACGCACAAGACGCAGGCGATCACGAGCGTGGCGGCGGGGTGGCACGCCGACGCCACCATCAACGCCTTCGACAACGACCAGGAGGACCCCAACCCGGACCTCCCCCGCATCGTCGGCTACCTGGTGCCCGTGAACGCCTACTGGATGGCCTCCGGCGAGTCCTCGTCGGACTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCAGCGACGACGACGACTCCGGCCACCCCAAGTCCAAGTACATCCCTTTCCAGAACAACCACTGCTTCCAGCAGAGGCAGGCACTTGTGACGTACCTGGAGAACAACCGGGCCGGCATCACGGTGTACGGCTTCGTCGTCGACCGGACGTGGCTGCACGCGCTGTTCATGATCGAGTTCTCCCTCGTCATGTGGCTGCTGGGGAAGACGGTCGGCATATCCTGAGGCCTGAAGGAGCTTTTGCCTCCTGTTGAAGCTTTCAGCTCTCTCTCTGCTCTGCAGCCGTGCCGAGATTTCTGATGATCAAAGATCTCTGCATCGTCTCATATTGCTTCCTGGATTGTACAATACAAAATCGAGTGCAGAAATTGCAGATAATAGCTCAGTTTCTGTGCCATGTCCGGCACAAAAACGAAGCAACA-GTTCTGAAGTTTTTAGCTGTATGTTTTTCTTTAAAAATTTTTATGGTTCTTTGTTTGAGGCAGATTCTGATGGAGCATTAGTTGTATGAAAAATAATGGGATGGGATAGTTGTCCAGCTTGATTTGATGAGATTATGAGAGAACAGTAATCGTTGTATACTGTAAAAAAA] [+] EMBL AK101019 [GCCAAAGGAAAGGAGAAAGCGCGGCCATGGCGGAAGACGCGCCGCCGTCGTCGCTTCCGCTGCTGCTGCCGCGGAAGTCGTTGTCCTCGTCCTCCGCGCAGCGCAAGCAGCAGTACGCGCGGTGCGTGTCGCACGCTGGGGACGAGCTCCACAGCTTCCGCTCCTGCCTCGCGTGGATGTGCGTCGACCACTCCACCCGCGCCCGCGGCGCCGCGTCGTGGGCGGCCTTCCTCCTCCTCGCCGTCGCCGCCCCGTCCGCGGCCACCCTCGCGCTCCCCTCCCCGGTCGGCGGCGGGGGGTCGCCGTTCGACGGGCAGGTCCAGGTGTCGCTCACCCTGGCCGCCGCGCTCGCCTACCTCACCCTCACGGCGCTCCTCCAGGGCCGCGGCCTCCGCCGCCTGCTCTACCTCGACCGCCTCCGCGACGACTCCGAGGAGGTCCGGTCCGGCTACATCGAGGAGCTCGCGGGCTCCTTCCGCGTCCTCGCCTGCTTCCTCCTCCCCTGCACGCTCGCCGAGGCCGCCTACAAGGCGTACTGGTACCTCGCCGCGCCGCCGTTCCGCTCCCCGTGGTGGTCCGCCGCCGCGTGCGCCGTCGAGGTCGCCTCCTGGGCCTACCGCACCGCCGTCTTCTTCATGGTCTGCGTCCTCTTCCGGACCATCTGCTACCTGCAGATCCTCCGGATGAAGGGCTTCGCGCGCGAGTTCTGCAGGTTCGCCGACGTCGCCGCCGTGCTCGAGAGCCACCGCCGCATCAGGAAGCAGCTCCACAGGATCAGCCACCGCTACCGCCGCTTCATACTCTGCTGCCTCGTCCTCGTCACCACCAGCCAGTTCGCCGCCCTGCTTGCCACCACCAGGCCGCACGCGCAGATCAACCTCGCCACCGCCGGCGAGCTCGCGCTCTGCTCGCTGAGCCTCGTGGCCGGGCTGCTGGTGTGCCTCCAGAGCGCGGCGAAGATCACGCACAAGACGCAGGCGATCACGAGCGTGGCGGCGGGGTGGCACGCCGACGCCACCATCAACGCCTTCGACAACGACCAGGAGGACCCCAACCCGGACCTCCCCCGCATCGTCGGCTACCTGGTGCCCGTGAACGCCTACTGGATGGCCTCCGGCGAGTCCTCGTCGGACTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCAGCGACGACGACGACTCCGGCCACCCCAAGTCCAAGTACATCCCTTTCCAGAACAACCACTGCTTCCAGCAGAGGCAGGCACTTGTGACGTACCTGGAGAACAACCGGGCCGGCATCACGGTGTACGGCTTCGTCGTCGACCGGACGTGGCTGCACGCGCTGTTCATGATCGAGTTCTCCCTCGTCATGTGGCTGCTGGGGAAGACGGTCGGCATATCCTGAGGCCTGAAGGAGCTTTTGCCTCCTGTTGAAGCTTTCAGCTCTCTCTCTGCTCTGCAGCCGTGCCGAGATTTCTGATGATCAAAGATCTCTGCATCGTCTCATATTGCTTCCTGGATTGTACAATACAAAATCGAGTGCAGAAATTGCAGATAATAGCTCAGTTTCTGTGCCATGTCCGGCACAAAAACGAAGCAACA GTTCTGAAGTTTTTAGCTGTATGTTTTTCTTTAAAAATTTTTATGGTTCTTTGTTTGAGGCAGATTCTGATGGAGCATTAGTTGTATGAAAAATAATGGGATGGGATAGTT ] [+] EMBL CB675360 [ AAGCGCGGCCATGGCGGAAGACGCGCCGCCGTCGTCGCTTCCGCTGCTGCTGCCGCGGAAGTCGTTGTCCTCGTCCTCCGCGCAGCGCAAGCAGCAGTACGCGCGGTGCGTGTCGCACGCTGGGGACGAGCTCCACAGCTTCCGCTCCTGCCTCGCGTGGATGTGCGTCGACCACTCCACCCGCGCCCGCGGCGCCGCGTCGTGGGCGGCCTTCCTCCTCCTCGCCGTCGCCGCCCCGTCCGCGGCCACCCTCGCGCTCCCCTCCCCGGTCGGCGGCGGGGGGTCGCCGTTCGACGGGCAGGTCCAGGTGTCGCTCACCCTGGCCGCCGCGCTCGCCTACCTCACCCTCACGGCGCTCCTCCAGGGCCGCGGCCTCCGCCGCCTGCTCTACCTCGACCGCCTCCGCGACGACTCCGAGGAGGTCCGGTCCGGCTACATCGAGGAGCTCGCGGGCTCCTTCCGCGTCCTCGCCTGCTTCCTCCTCCCCTGCACGCTCGCCGAGGCCGCCTACAAGGCGTACTGGTACCTCGCCGCGCCGCCGTTCCGCTCCCCGTGGTGGTCCGCCGCCGCGTGCGCCGTCGAGGTCGCCTCCTGGGCCTACCGCACCGCCGTCTTCTTCATGGTCTGCGTCCTCTTCCGGACCATCTGCTACCTGCAGATCCTCCGGATGAAGGGCTTCGCGCGCGAGTTCTGCAGGTTCGCCGACGTCGCCGCCGTGCTCGAGAGCCACCGCCGCATCAGGAAGCAGCTCCACAGGATCAGCCACCGCTACCGCCGCTTCATACTCTGCTNGCTCGTCCTCGTCACCACCAGCCAGTT ] [+] EMBL BI811902 [ GCCTCCTGTTGAAGCTTTCAGCTCTCTCTCTGCTCTGCA CCGTGCCGAGATTTCTGATGATC AAGATCTCTGCATCGTCTCATATTGCTTCCTGGATTGTACAATACCAAATCGAGTGCAGAAATTGCAGATAATAGTTCAGTTTCTGTGCCATGTCCGGCAC AAAACGAAGCCACACGTTCTGAAGTTTTTAGCTGTATGTTTTTCTTTAAAATTTTTTATGGTTCTTTGTTTGAGGCAGATTCTGATGGAGCATTAGTTGTATGAAAAATAATGGGATGGGATAGTTGTCCAGCTTGATTTGATGAGATTATGAGAGAACAGTAATCGTTGTATACTGTAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||