cluster # 5082

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Oryza sativa
cluster # 5082 cluster # 5082 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_5082#0 length = 1436 sequences # 3
consensusID : consensus_5082#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1436
fasta sequence
                              [AGTTGCAACCGACGATCCATCCATGCACCGCCGTTGCAATTTGCGTTTCACCCTCCTCACCAAAATCGATTTGCTCCCCCCCTCCCCCTCAGATCCCAAATCACTAGTACTACTACCTCACTACCACCACTCCGGCGACTCCGCCGCCGCCATGCACCCCTCCTCCTCCTCCTCCCACCCGCCCGATCACCCCAACCCCAAGTCCCCGCCACCACCCGCGCCCGCCATGGGCTACCCAGCCAACCACCCACCCCCACCCCCCTCCTCCAACGCCGCCTACTTCGCCTCCGCCGCCCCACCCCCCGCCGCCACCAACGGCACCGCCGCCTTCGCCGTCGCCTACCCTTACCCTGCGCCGCCGCCCCACTCCCACTCCCACCCGCCCCCTCCTCCTCCGCACGCCTACCACCACCACCACTACCCACCACCTCCTCCTCCTCACCACCACCCCTACCCGCCTCACCCGCCTCCGCCCACCTGCCTCCGCCGCCTCCTCGGCCTCGTCGTCGCCGCCTTCCTCCTCCTCGGCGCCGCCACCTTCATCGTCTGGCTCCTCCTCCGCCCCCGCGTCCCGGCCTTCTCCCTCGCCTCCCTCACCCTCTCCCGCGTCGCCTACTCCGCCGCCAACTCCTCCCTCTCCGCCTCCTTCGACGCCTCCCTCCTCGCCGACAACCCAAACTCCAAGCTCACCGTCACCTACTTCTCCCCGCTCGCCTCCGTCTCCCTCGCCCCGTCCTCCCCCATCGCCGTCGCCACGCTCCCGCCCTTCGCGCAGCCGCCGCGGAACACCACCACGCTCGCCTTCCGCCTCGAGGTGGATGGCGCATACGTGGGTCCCGACGACGCCGCGCCGCTCAAGGGCGGGGGTGTTGGTACCATGGAGGTCCAGGTCAGGCTCGCCGCCGTCGCCGTCTTCGATCGCGGTGGCTGGCGCACGCGCCGGAGGGTCATGAGGGTCATGTGCGACGGCGTGCCCGTCGCCTTCCGCGGGAAGAACGGGATGGAGGCGGCGTTCACTGGCCCCGCTCGCCGGTGCGATGTAGTGTTGTGAAGGATCACTGCATTGTGGTCATTGACTACCTCAGATGCTGATCTATGGGAGCATCTTCCGAAGGTACGGCAAGTTAACTGGCGCTATAAGAAGTTGATCTGCCGCTGATTGATGAGTGATAGCTGCTGGGTTACTATAGTTTACCCGGCCACCATAGAATCCTTAACATGGAAAAGTCTGGATTGATTTATCCTTAATGGGTGGGTATATGA-CTTA-TGTTG-GAGATAATTGGCTAGAGTGATTATACCCTGGTGGTTGTTTTGCACACTGAGAGGAATTTAAACATGTATGGAACCA-CAGGGAACATTCATACTTTAAGCTACTATTGCTTGAAAGCAAGATATGTTCTCTAGTTCTATATGTGTGCCTGATTTCAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK071072             [AGTTGCAACCGACGATCCATCCATGCACCGCCGTTGCAATTTGCGTTTCACCCTCCTCACCAAAATCGATTTGCTCCCCCCCTCCCCCTCAGATCCCAAATCACTAGTACTACTACCTCACTACCACCACTCCGGCGACTCCGCCGCCGCCATGCACCCCTCCTCCTCCTCCTCCCACCCGCCCGATCACCCCAACCCCAAGTCCCCGCCACCACCCGCGCCCGCCATGGGCTACCCAGCCAACCACCCACCCCCACCCCCCTCCTCCAACGCCGCCTACTTCGCCTCCGCCGCCCCACCCCCCGCCGCCACCAACGGCACCGCCGCCTTCGCCGTCGCCTACCCTTACCCTGCGCCGCCGCCCCACTCCCACTCCCACCCGCCCCCTCCTCCTCCGCACGCCTACCACCACCACCACTACCCACCACCTCCTCCTCCTCACCACCACCCCTACCCGCCTCACCCGCCTCCGCCCACCTGCCTCCGCCGCCTCCTCGGCCTCGTCGTCGCCGCCTTCCTCCTCCTCGGCGCCGCCACCTTCATCGTCTGGCTCCTCCTCCGCCCCCGCGTCCCGGCCTTCTCCCTCGCCTCCCTCACCCTCTCCCGCGTCGCCTACTCCGCCGCCAACTCCTCCCTCTCCGCCTCCTTCGACGCCTCCCTCCTCGCCGACAACCCAAACTCCAAGCTCACCGTCACCTACTTCTCCCCGCTCGCCTCCGTCTCCCTCGCCCCGTCCTCCCCCATCGCCGTCGCCACGCTCCCGCCCTTCGCGCAGCCGCCGCGGAACACCACCACGCTCGCCTTCCGCCTCGAGGTGGATGGCGCATACGTGGGTCCCGACGACGCCGCGCCGCTCAAGGGCGGGGGTGTTGGTACCATGGAGGTCCAGGTCAGGCTCGCCGCCGTCGCCGTCTTCGATCGCGGTGGCTGGCGCACGCGCCGGAGGGTCATGAGGGTCATGTGCGACGGCGTGCCCGTCGCCTTCCGCGGGAAGAACGGGATGGAGGCGGCGTTCACTGGCCCCGCTCGCCGGTGCGATGTAGTGTTGTGAAGGATCACTGCATTGTGGTCATTGACTACCTCAGATGCTGATCTATGGGAGCATCTTCCGAAGGTACGGCAAGTTAACTGGCGCTATAAGAAGTTGATCTGCCGCTGATTGATGAGTGATAGCTGCTGGGTTACTATAGTTTACCCGGCCACCATAGAATCCTTAACATGGAAAAGTCTGGATTGATTTATCCTTAATGGGTGGGTATATGA CTTA TGTTG GAGATAATTGGCTAGAGTGATTATACCCTGGTGGTTGTTTTGCACACTGAGAGGAATTTAAACATGTATGGAACCA CAGGGAACATTCATACTTTAAGCTACTATTGCTTGAAAGCAAGATATGT                                       ]
[+] EMBL BI802920             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CGCACGCGCCGGAGGGTCATGAGGGTCATGTGCGACGGCGTGCCCGTCGCCTTCCGCGGGAAGAACGGGATGGA GCGGCGTTCACTGGCCCCGCTCGCCGGTGCGATGTAGTGTTGTGAAGGATCACTGCATTGTGGTCGTTGACTACCTCAGATGCTGATCTATGGGAGCATCTTCCGAAGGTACGGGAAGTTGACTGGCGCTATAAGAAGTTGATCTGCCGCTGATTGATGAGTGATAGCTGCTGGGTTACTATAGTTTACCCGGTCACCATAGAATCCTTAACATGGAAAAGTCTGGATTGATTTATCCTTAATGGGTGGGTATATGA CTTACCCTTG GAGATAATTGGCTAGAGTGATTATACCCTGGTGGTTGTTTTGCACACTGAGAGGAATTTAAACATGTATGGAACCACCAGGGAACATTCATACTTTAAGCTACTATTGCTTGAAAGCAAGATATGTTCTCTAGTTCTATATGTGTGCCTGATTTCAAAAAAAAAA]
[+] EMBL BI798007             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TATCCTTAATGGGTGGGTATATGACCTTA TGTTGCGAGATAATTGGCTAGAGTGATTATACCCTGGTGGTTGTTTTGCACACTGAGAGGAATTTAAACATGTATGGAACCA CAGGGAACATTCATACTTTAAGCTACTATTGCTTGAAAGC AGATATGTTC                                     ]




>consensus_5082#0
AGTTGCAACCGACGATCCATCCATGCACCGCCGTTGCAATTTGCGTTTCACCCTCCTCAC
CAAAATCGATTTGCTCCCCCCCTCCCCCTCAGATCCCAAATCACTAGTACTACTACCTCA
CTACCACCACTCCGGCGACTCCGCCGCCGCCATGCACCCCTCCTCCTCCTCCTCCCACCC
GCCCGATCACCCCAACCCCAAGTCCCCGCCACCACCCGCGCCCGCCATGGGCTACCCAGC
CAACCACCCACCCCCACCCCCCTCCTCCAACGCCGCCTACTTCGCCTCCGCCGCCCCACC
CCCCGCCGCCACCAACGGCACCGCCGCCTTCGCCGTCGCCTACCCTTACCCTGCGCCGCC
GCCCCACTCCCACTCCCACCCGCCCCCTCCTCCTCCGCACGCCTACCACCACCACCACTA
CCCACCACCTCCTCCTCCTCACCACCACCCCTACCCGCCTCACCCGCCTCCGCCCACCTG
CCTCCGCCGCCTCCTCGGCCTCGTCGTCGCCGCCTTCCTCCTCCTCGGCGCCGCCACCTT
CATCGTCTGGCTCCTCCTCCGCCCCCGCGTCCCGGCCTTCTCCCTCGCCTCCCTCACCCT
CTCCCGCGTCGCCTACTCCGCCGCCAACTCCTCCCTCTCCGCCTCCTTCGACGCCTCCCT
CCTCGCCGACAACCCAAACTCCAAGCTCACCGTCACCTACTTCTCCCCGCTCGCCTCCGT
CTCCCTCGCCCCGTCCTCCCCCATCGCCGTCGCCACGCTCCCGCCCTTCGCGCAGCCGCC
GCGGAACACCACCACGCTCGCCTTCCGCCTCGAGGTGGATGGCGCATACGTGGGTCCCGA
CGACGCCGCGCCGCTCAAGGGCGGGGGTGTTGGTACCATGGAGGTCCAGGTCAGGCTCGC
CGCCGTCGCCGTCTTCGATCGCGGTGGCTGGCGCACGCGCCGGAGGGTCATGAGGGTCAT
GTGCGACGGCGTGCCCGTCGCCTTCCGCGGGAAGAACGGGATGGAGGCGGCGTTCACTGG
CCCCGCTCGCCGGTGCGATGTAGTGTTGTGAAGGATCACTGCATTGTGGTCATTGACTAC
CTCAGATGCTGATCTATGGGAGCATCTTCCGAAGGTACGGCAAGTTAACTGGCGCTATAA
GAAGTTGATCTGCCGCTGATTGATGAGTGATAGCTGCTGGGTTACTATAGTTTACCCGGC
CACCATAGAATCCTTAACATGGAAAAGTCTGGATTGATTTATCCTTAATGGGTGGGTATA
TGACTTATGTTGGAGATAATTGGCTAGAGTGATTATACCCTGGTGGTTGTTTTGCACACT
GAGAGGAATTTAAACATGTATGGAACCACAGGGAACATTCATACTTTAAGCTACTATTGC
TTGAAAGCAAGATATGTTCTCTAGTTCTATATGTGTGCCTGATTTCAAAAAAAAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case