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Oryza sativa
cluster # 5137 cluster # 5137       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5137#0 length = 973 sequences # 3  
consensusID : consensus_5137#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 973
fasta sequence 
                              [GTCACCCCGCTCGCCGCCGGCTCGCCGCCTCCCACCACTGGATCGGCCAAATCCGACGCCAGCGCCGCCGCCTAGCCACTCCATGGACCGCTCTCGCCACAAGAACTCGCCTAGTTCCGAGCGCTTCCTCGGCTCCTTCCTCCCCTCCGCGGCCGCCGGCGACCAGCCCGGATCGGCGGCCTTCGAGCTCGACGAGGACGACCTGTTCGCCTCTGGGGCTGGATCCCCCGAGCGGCCGCAGCCGTCTCGCCGCCCTCTCATCCTCTCCGCAGTCCGCGCCGCAAACCCTAGCCCCCTCCCCCGCCTCCGCCGCCCGCCGGAGGGCATCCTCGATGCTCTCCCCGAGCGCCGCTCCCCTTTCTCACCGCCTCCATCGTCTTCGTCGAACTCGTCGACCACCGCCTCCCCAGCGGCGGCGGCGGCTGCTCCTCCACGCCTGATCCCCACCATCCCCCGCCCGGCGGCGGCTCTGGCACCACATATCCCGCAGTCTGCGCCGGTGAATGTGCCGGTAGCGCAGTTTAGGCGGTTATCGGTGGAGGCACTGATGGATAAAGCTGAGGATGACGACGACGACGACGAGGAGATGCTGCCGCCGCACGAGATGGTGGCGCGAGCGCGGGCGC-GGGATTCACCGATGACCACCTTCTCGGTGCTGGAGGGCGCCGGCCGCACGCTCAAGGGGAGGGACCTCCGCCAGGTACGCAATGCCGTGTGGCGGAAGACAGGATTCCTCGATTGATCCGTGCCTTCTGCATTCAGCTGTAGCTTAAGTTAGATTTGAGTGATTGGTTATGCACTATGCATGTTTGAATTTGTCTGTGTACAACATGGATGATCGGGTGTT-AATTTTGGTTGCACCTGTAAAATATGTCTGTCATATTATCAATCATTATTACTTGTAAACCCTTGATTGGAGCTGTCAATTGTTCAGCATTGAACTATTGGATAAGGTGAATTGTGACCTCAAAAA]

[+] EMBL AK108344             [GTCACCCCGCTCGCCGCCGGCTCGCCGCCTCCCACCACTGGATCGGCCAAATCCGACGCCAGCGCCGCCGCCTAGCCACTCCATGGACCGCTCTCGCCACAAGAACTCGCCTAGTTCCGAGCGCTTCCTCGGCTCCTTCCTCCCCTCCGCGGCCGCCGGCGACCAGCCCGGATCGGCGGCCTTCGAGCTCGACGAGGACGACCTGTTCGCCTCTGGGGCTGGATCCCCCGAGCGGCCGCAGCCGTCTCGCCGCCCTCTCATCCTCTCCGCAGTCCGCGCCGCAAACCCTAGCCCCCTCCCCCGCCTCCGCCGCCCGCCGGAGGGCATCCTCGATGCTCTCCCCGAGCGCCGCTCCCCTTTCTCACCGCCTCCATCGTCTTCGTCGAACTCGTCGACCACCGCCTCCCCAGCGGCGGCGGCGGCTGCTCCTCCACGCCTGATCCCCACCATCCCCCGCCCGGCGGCGGCTCTGGCACCACATATCCCGCAGTCTGCGCCGGTGAATGTGCCGGTAGCGCAGTTTAGGCGGTTATCGGTGGAGGCACTGATGGATAAAGCTGAGGATGACGACGACGACGACGAGGAGATGCTGCCGCCGCACGAGATGGTGGCGCGAGCGCGGGCGC GGGATTCACCGATGACCACCTTCTCGGTGCTGGAGGGCGCCGGCCGCACGCTCAAGGGGAGGGACCTCCGCCAGGTACGCAATGCCGTGTGGCGGAAGACAGGATTCCTCGATTGATCCGTGCCTTCTGCATTCAGCTGTAGCTTAAGTTAGATTTGAGTGATTGGTTATGCACTATGCATGTTTGAATTTGTCTGTGTACAACATGGATGATCGGGTGTT AATTTTGGTTGCACCTGTAAAATATGTCTGTCATATTATCAATCATTATTACTTGTAAACCCTTGATTGGAGCTGTCAATTGTTCAGCATTGAACTATTGGATAAGGTGAA               ]
[+] EMBL C73177               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CGCAGTCTGCGCCGGTNAATGTNCCGGTAGCGCAGTTTAGGCGGTTATCGGTGGAGGCACTGATGGATAAAGCTGAGGATGACGACGACGACGACGAGGAGATGCTGCCGCCGCACGANATGGTGGCGCGA CGCGGGCGCGGGGATTCACCGATGACCACCTTCTCGGTGCTGGAGGGCGCCGGCCGCACGCTCAAGGGGAGGGACCTCCGCCAGGTACGCAATGCCGTGTGGCGGAAGACAGGATTCCTCGATTGATCCGTGCCTTCTGCATTCAGCTGTAGCTTAAGTTAGATTTGAGTGATTGGTTATGCACTATGCATGTTTGANTTTGTCTGTGTACAACATGGATGATCGGGTGTTAAATTTTGGTTGCACCTGTAAAATATGTCTGTCATATTATCAATCATTATTACTTGTAAACCCTTGATT GNGCTGTCA                                                ]
[+] EMBL AU172644             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGGCACTGATGGATAAAGCTGAGGATGACGACGACGACGACGAGGAGATGCTGCCGCCGCACGAGATGGTGGCGCGAGCGCGGGCGC GGGATTCACCGATGACCACCTTCTCGGTGCTGGAGGGCGCCGGCCGCACGCTCAAGGGGAGGGACCTCCGCCAGGTACGCAATGCCGTGTGGCGGAAGACAGGATTCCTCGATTGATCCGTGCCTTCTGCATTCAGCTGTAGCTTAAGTTAGATTTGAGTGATTGGTTATGCACTATGCATGTTTGAATTTGTCTGTGTACAACATGGATGATCGGGTGTT AATTTTGGTTGCACCTGTAAAATATGTCTGTCATATTATCAATCATTATTACTTGTAAACCCTTGATTGGAGCTGTCAATTGTTCAGCATTGAACTATTGGATAAGGTGAATTGTGACCTCAAAAA]




>consensus_5137#0
GTCACCCCGCTCGCCGCCGGCTCGCCGCCTCCCACCACTGGATCGGCCAAATCCGACGCC
AGCGCCGCCGCCTAGCCACTCCATGGACCGCTCTCGCCACAAGAACTCGCCTAGTTCCGA
GCGCTTCCTCGGCTCCTTCCTCCCCTCCGCGGCCGCCGGCGACCAGCCCGGATCGGCGGC
CTTCGAGCTCGACGAGGACGACCTGTTCGCCTCTGGGGCTGGATCCCCCGAGCGGCCGCA
GCCGTCTCGCCGCCCTCTCATCCTCTCCGCAGTCCGCGCCGCAAACCCTAGCCCCCTCCC
CCGCCTCCGCCGCCCGCCGGAGGGCATCCTCGATGCTCTCCCCGAGCGCCGCTCCCCTTT
CTCACCGCCTCCATCGTCTTCGTCGAACTCGTCGACCACCGCCTCCCCAGCGGCGGCGGC
GGCTGCTCCTCCACGCCTGATCCCCACCATCCCCCGCCCGGCGGCGGCTCTGGCACCACA
TATCCCGCAGTCTGCGCCGGTGAATGTGCCGGTAGCGCAGTTTAGGCGGTTATCGGTGGA
GGCACTGATGGATAAAGCTGAGGATGACGACGACGACGACGAGGAGATGCTGCCGCCGCA
CGAGATGGTGGCGCGAGCGCGGGCGCGGGATTCACCGATGACCACCTTCTCGGTGCTGGA
GGGCGCCGGCCGCACGCTCAAGGGGAGGGACCTCCGCCAGGTACGCAATGCCGTGTGGCG
GAAGACAGGATTCCTCGATTGATCCGTGCCTTCTGCATTCAGCTGTAGCTTAAGTTAGAT
TTGAGTGATTGGTTATGCACTATGCATGTTTGAATTTGTCTGTGTACAACATGGATGATC
GGGTGTTAATTTTGGTTGCACCTGTAAAATATGTCTGTCATATTATCAATCATTATTACT
TGTAAACCCTTGATTGGAGCTGTCAATTGTTCAGCATTGAACTATTGGATAAGGTGAATT
GTGACCTCAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)