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Oryza sativa
cluster # 5227 cluster # 5227       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5227#0 length = 991 sequences # 3  
consensusID : consensus_5227#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 991
fasta sequence 
                              [TTATATGATACTTATGTTCTTTGCTAGTTTAATGCTACCAAAACTATTCAGACAGGACTACTTGTCCACAGATAGAAAAGAGTACATATCTTGCTTGCCCACAGTTAGAAAATGCTTCAGCAAGTTTTTTTTGTTCAGTCACGTGATGATCCTTTGCACTATCCTCCCTAATAGCCCATTGTACCTGGCCTCCCACCTCCCTCGTTCCCTGGTTGAATCCTTACCTTCTCTGTAATAAGGGAGGCATGGTTAGTTAACCATGAAGTACAACACCAAAGGCTGCAATCAAAACACGGGAATTCTAACAAAACTAATAAATCAGAAGCTAATATTTGCACAAAAAAACTTACCATTCTCAATGAAGAAAAATGCAGATATATCAATAGCCTAAACATATCTGATTATTGGTGCCATTCTAACAAAATTCGGTAGAGCAAATTAGAGAACCAACTCCTGGTTGAGCCAATTAAGATCAAATGTTGCAAGCAATAATGAAGGACGAATTGACATGAGTATGATTATTAGTTAGATAGTTAGCCATGTGTTACAAAAGTATGTATCAGGAATATTGTTACAACAGACAGAAATCCTAACCTAACTGTAAATTCATTTAGAGTTAATTGGCACGATGATACATATAGGGCAACATTGAAAAGCATTGCAAGTTTGCAACTTAAAGAGTATGAAATATACCTTTGAAGATATGACTAATAACATTTGTTTTCTATAGGAAATAAATTCAAAATATCAATCAGCACCAGCTGTCGATAAAACAGATCAAATTCTGAATATTTGTGGCAGTAATTATCAACAGTACAGAATTTTTTAAAGTTTCATGCCACACTATGAGAGCCTTCTGATTTTTTTTTGAATTTTTGTTATTCCATTTCTGCATGTCTTGCATTTTTATCACTGCTCTACTATACACTGGAAATGGCCTGTGCTAGTCTAGGGATTCAATTGTCTCATGGATGTACAATCTTGAGAAACA]

[+] EMBL CB673482             [TTATATGATACTTATGTTCTTTGCTAGTTTAATGCTACCAAAACTATTCAGACAGGACTACTTGTCCACAGATAGAAAAGAGTACATATCTTGCTTGCCCACAGTTAGAAAATGCTTCAGCAAGTTTTTTTTGTTCAGTCACGTGATGATCCTTTGCACTATCCTCCCTAATAGCCCATTGTACCTGGCCTCCCACCTCCCTCGTTCCCTGGTTGAATCCTTACCTTCTCTGTAATAAGGGAGGCATGGTTAGTTAACCATGAAGTACAACACCAAAGGCTGCAATCAAAACACGGGAATTCTAACAAAACTAATAAATCAGAAGCTAATATTTGCACAAAAAAACTTACCATTCTCAATGAAGAAAAATGCAGATATATCAATAGCCTAAACATATCTGATTATTGGTGCCATTCTAACAAAATTCGGGAGAGCAAATTAGAGAACCAACTCCTGGTTGAGCCAATTAAGATCAAATGTTGCAAGCAATAATGAAGGACGAATTGACATGAGTATGATTATTAGTTAGATAGTTAGCCATGTGTTACAAAAGTATGTATCAGGAATATTGTTACAACAGACAGAAATCCTAACCTAACTGTAAATTCATTTAGAGTTAATTGGCACGATGATACATATAGGGCAACATTGAAAAGCATTGCGAGTTTGCAACTTAAAGAGTATGAAATATACCTTTGAAGATATGACTAATAACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CB636603             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GATATATCAATAGCCTAAACATATCTGATTATTGGTGCCATTCTAACAAAATTCGGTAGAGCAAATTAGAGAACCAACTCCTGGTTGAGCCAATTAAGATCAAATGTTGCAAGCAATAATGAAGGACGAATTGACATGAGTATGATTATTAGTTAGATAGTTAGCCATGTGTTACAAAAGTATGTATCAGGAATATTGTTACAACAGACAGAAATCCTAACCTAACTGTAAATTCATTTAGAGTTAATTGGCACGATGATACATATAGGGCAACATTGAAAAGCATTGCAAGTTTGCAACTTAAAGAGTATGAAATATACCTTTGAAGATATGACTAATAACATTTGTTTTCTATAGGAAATAAATTCAAAATATCAATCAGCACCAGCTGTCGATAAAACAGATCAAATTCTGAATATTTGTGGCAGTAATTATCAACAGTACAGAATTTTTTAAAGTTTCATGCCACACTATGAGAGCCTTCTGATTTTTTTTTGAATTTTTGTTATTCCATTTCTGCATGTCTTGCATTTTTATCACTGCTCTACTATACACTGGAAATGGCCTGTGCTAGTCTAGGGATTCAATTGTCTCATGGATGTACAATCTTGAGAAACA]
[-] EMBL CB641379             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCAATAGCCTAAACATATCTGATTATTGGTGCCATTCTAACAAAATTCGGTAGAGCAAATTAGAGAACCAACTCCTGGTTGAGCCAATTAAGATCAAATGTTGCAAGCAATAATGAAGGACGAATTGACATGAGTATGATTATTAGTTAGATAGTTAGCCATGTGTTACAAAAGTATGTATCAGGAATATTGTTACAACAGACAGAAATCCTAACCTAACTGTAAATTCATTTAGAGTTAATTGGCACGATGATACATATAGGGCAACATTGAAAAGCATTGCAAGTTTGCAACTTAAAGAGTATGAAATATACCTTTGAAGATATGACTAATAACATTTGTTTTCTATAGGAAATAAATTCAAAATATCAATCAGCACCAGCTGTCGATAAAACAGATCAAATTCTGAATATTTGTGGCAGTAATTATCAACAGTACAGAATTTTTTAAAGTTTCATGCCACACTATGAGAGCCTTCTGATTTTTTTTTGAATTTTTGTTATTCCATTTCTGCATGTCTTGCATTTTTATCACTGCTCTACTATACACTGGAAATGGCCTGTGCTAGTCTAGGGATTCAATTGTCTCATGGATGTACAATCTTGAGAAACA]




>consensus_5227#0
TTATATGATACTTATGTTCTTTGCTAGTTTAATGCTACCAAAACTATTCAGACAGGACTA
CTTGTCCACAGATAGAAAAGAGTACATATCTTGCTTGCCCACAGTTAGAAAATGCTTCAG
CAAGTTTTTTTTGTTCAGTCACGTGATGATCCTTTGCACTATCCTCCCTAATAGCCCATT
GTACCTGGCCTCCCACCTCCCTCGTTCCCTGGTTGAATCCTTACCTTCTCTGTAATAAGG
GAGGCATGGTTAGTTAACCATGAAGTACAACACCAAAGGCTGCAATCAAAACACGGGAAT
TCTAACAAAACTAATAAATCAGAAGCTAATATTTGCACAAAAAAACTTACCATTCTCAAT
GAAGAAAAATGCAGATATATCAATAGCCTAAACATATCTGATTATTGGTGCCATTCTAAC
AAAATTCGGTAGAGCAAATTAGAGAACCAACTCCTGGTTGAGCCAATTAAGATCAAATGT
TGCAAGCAATAATGAAGGACGAATTGACATGAGTATGATTATTAGTTAGATAGTTAGCCA
TGTGTTACAAAAGTATGTATCAGGAATATTGTTACAACAGACAGAAATCCTAACCTAACT
GTAAATTCATTTAGAGTTAATTGGCACGATGATACATATAGGGCAACATTGAAAAGCATT
GCAAGTTTGCAACTTAAAGAGTATGAAATATACCTTTGAAGATATGACTAATAACATTTG
TTTTCTATAGGAAATAAATTCAAAATATCAATCAGCACCAGCTGTCGATAAAACAGATCA
AATTCTGAATATTTGTGGCAGTAATTATCAACAGTACAGAATTTTTTAAAGTTTCATGCC
ACACTATGAGAGCCTTCTGATTTTTTTTTGAATTTTTGTTATTCCATTTCTGCATGTCTT
GCATTTTTATCACTGCTCTACTATACACTGGAAATGGCCTGTGCTAGTCTAGGGATTCAA
TTGTCTCATGGATGTACAATCTTGAGAAACA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)