These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5229#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 2042 fasta sequence [TCCCCCACTGCCATGAGTTGAAGCCAGAGCCAGTGCCTTGACTGTGGGAGCTGTGATTCGGGCCGCCTCAACTGCTGCTGCTGCTGCCTTGGATCAACGCCGGGTGCCGCTGGAGCCGGAGGACCTGCTGTCGAACGCCTGCACGCTCGCCACCGTCGGCATCCTCTGCTTCCTTACCGCCTCCCAACTGCGACGCTGCGTTTCGCCGACTCGCCTTCTCATGGTCAGTAGAGTTCGATGAGATTAAGATGGAACACGTCTTCCGAACATGCTGGAAGGTGAGTGCGAAGGTGGTGTTCAAATCTCCCATGCAGCAAAACAAATTTGGTGCTCAATATATTCGGTTTATCCTAAAGGACGCAACGGATACAAGGATGGAAGCACTAGCGTATGACCAGCAAGCAGATCGTTTTAATGGAACCATACAGAGTGGCTTAGTCTATGATTTTACTAATGTGGGGTTCCAACCGACCGATGTGCCTACCTATGCCAACCTAACCATGCAAGCTAAGTTTTGTATGATTCTGACACCAAAGACAGCCCTACGCAAGCCTCGTTTTGTAGACTTCAGTGCTATTTTTACCGACGCGATAAGTGATGATATGTTCATAGATGTTGTTGGTGTGCTTATATACGTGGGAGAAATACATCATCACCAACTCTATGGACAAAGCTTACCTACTAGGGATATTGCCTTGGTTAATCGTCGATATAAGGTAATCTTTCTTCGAATTTGGGGTGAATATGCATCTCGACATACAGTGTGGTGGCAAGCACTTGCATCACAGTATTACTGCATGTCTGCTACATGTCTCAAGAAATTAGATATTCTAACCGGTAAGTAACAAATCATCCTAATAGGAATTACTATTTGACCATTTTTTTTGCGAGGTAATAGAACTGAACACTGTTAGACTAACTTGCTTATCGTGTAGAGACATTAACTACTACGGTGGACTCCGAATTGACCAAATCTACAGATTCACTCAGTGCACCTGAGTTGGGCGTGATTCGTCGTTTATTCGTTAGTTCTCGTGAGGATGCTCAACGGTTCACTCAAGCAGTCGTTTCCTTGAGAGCGGAATTTATTACTATTGCTTCCCTTTTAGACTGATTGGATCCTCAAGGAATCATCAGACGAGATGTGCCTTTGATACAACAAGAGGATACTATCGCCCGTTTTTAATAAGCTTAAGAGATTGCTTTTAGATTCATGATTTTCGTTATATGTTTAACATTTGTAGGGATGCTCTGGTCTATTAACGTTGTTTTTTGGGTCGTAGAAACATAAATTAAAATGTCCTATTATTTCGATTATGATGATTTGTTATGTCCGGATTTCGTCCGGTATGTTCGAACCAGATAAAAAAACACATGGTTTTCCGATGATGCATATGTTCCCCCTTGCAATGCACGTGTTATTTTCATACACATAAATTTAACCAGAACTATAATATTATGAAAAAATATTTTACGTGCTAATTAATTGCATCCGGTTTGTTCGGACCGATTCGACCAAAAAATTTAATCGTGATACATTCCCTTTATTTTTTTTAATGAGATATACTTACGTGCACGGTCCAACAATTTTGTTCTCTCAATTTTTTTCCTTCTAATTTTAATCGTACCCATGATATCGGATTTATTCAGTTTCCCGAAGATTGATGGACATAATAATCGAAGGAAGGAAGAAGCGTGAAACCGCCTCGACTCCTGCGTACCAAGGACACGTGATAAGGCCCATCAACTCATCCAGATTAAGGCCTATATAATATTAGTCAGTCAAGAATCACTTTCGACTTGATTAGGCCCATCAACTCATAAAGATTAAGCCCTATATAAGATAAGCTGGTGCCCTGTTTCCTTGCTAAGCGTTGCCGTGATATTCAGTTTGATCTGCTCATCGTATCGCCGCCGCACAACTCGCCGAATACCAAGGCTGGTAAACAAGCGCCGCCGCCGTCGCAAAATCCACCGAAACCAGACTACGCGACCACCACACGATGGATGCATCGCCATCAAATCCGCCCTCGTCGACTCCG] [+] EMBL CB634043 [TCCCCCACTGCCATGAGTTGAAGCCAGAGCCAGTGCCTTGACTGTGGGAGCTGTGATTCGGGCCGCCTCAACTGCTGCTGCTGCTGCCTTGGATCAACGCCGGGTGCCGCTGGAGCCGGAGGACCTGCTGTCGAACGCCTGCACGCTCGCCACCGTCGGCATCCTCTGCTTCCTTACCGCCTCCCAACTGCGACGCTGCGTTTCGCCGACTCGCCTTCTCATGGTCAGTAGAGTTCGATGAGATTAAGATGGAACACGTCTTCCGAACATGCTGGAAGGTGAGTGCGAAGGTGGTGTTCAAATCTCCCATGCAGCAAAACAAATTTGGTGCTCAATATATTCGGTTTATCCTAAAGGACGCAACGGATACAAGGATGGAAGCACTAGCGTATGACCAGCAAGCAGATCGTTTTAATGGAACCATACAGAGTGGCTTAGTCTATGATTTTACTAATGTGGGGTTCCAACCGACCGATGTGCCTACCTATGCCAACCTAACCATGCAAGCTAAGTTTTGTATGATTCTGACACCAAAGACAGCCCTACGCAAGCCTCGTTTTGTAGACTTCAGTGCTATTTTTACCGACGCGATAAGTGATGATATGTTCATAGATGTTGTTGGTGTGCTTATATACGTGGGAGAAATACATCATCACCAACTCTATGGACAAAGCTTACCTACTAGGGATATTGCCTTGGTTAATCGTCGATATAAGGTAATCTTTCTTCGAATTTGGGGTGAATATGCATCTCGACATACAGTGTGGTGGCAAGCACTTGCATCACAGTATTACTGCATGTCTGC ] [+] EMBL CB634584 [ TGCTATTTTTACCGACGCGATAAGTGATGATATGTTCATAGATGTTGTTGGTGTGCTTATATACGTGGGAGAAATACATCATCACCAACTCTATGGACAAAGCTTACCTACTAGGGATATTGCCTTGGTTAATCGTCGATATAAGGTAATCTTTCTTCGAATTTGGGGTGAATATGCATCTCGACATACAGTGTGGTGGCAAGCACTTGCATCACAGTATTACTGCATGTCTGCTACATGTCTCAAGAAATTAGATATTCTAACCGGTAAGTAACAAATCATCCTAATAGGAATTACTATTTGACCATTTTTTTTGCGAGGTAATAGAACTGAACACTGTTAGACTAACTTGCTTATCGTGTAGAGACATTAACTACTACGGTGGACTCCGAATTGACCAAATCTACAGATTCACTCAGTGCACCTGAGTTGGGCGTGATTCGTCGTTTATTCGTTAGTTCTCGTGAGGATGCTCAACGGTTCACTCAAGCAGTCGTTTCCTTGAGAGCGGAATTTATTACTATTGCTTCCCTTTTAGACTGATTGGATCCTCAAGGAATCATCAGACGAGATGTGCCTTTGATACAACAAGAGGATACTATCGCCCGTTTTTAATAAGCTTAAGAGATTGCTTTTAGATTCATGATTTTCGTTATATGTTTAACATTTGTAGGGATGCTCTGGTCTATTAACGTTGTTTTTTGGGTCGTAGAAACATAAATTAAAATGTCCTATTATTTCGATTATGATGATTTGTTATGTCCGGATTTCGTCCGGTATGTTCGAACCAGATAAAAAAACACATGGTTTTCCGATGATGCATATGTTCCCCCTTGCAATGCACGTGTTATTTTCATACACATAAATTTAACCAGAACTATAATATTATGAAAAAATATTTTACG ] [+] EMBL CB632685 [ GGATGCTCTGGTCTATTAACGTTGTTTTTTGGGTCGTAGAAACATAAATTAAAATGTCCTATTATTTCGATTATGATGATTTGTTATGTCCGGATTTCGTCCGGTATGTTCGAACCAGATAAAAAAACACATGGTTTTCCGATGATGCATATGTTCCCCCTTGCAATGCACGTGTTATTTTCATACACATAAATTAAACCAGAACTATAATATTATGAAAAAATATTTTACGTGCTAATTAATTGCATCCGGTTTGTTCGGACCGATTCGACCAAAAAATTTAATCGTGATACATTCCCTTTATTTTTTTTAATGAGATATACTTACGTGCACGGTCCAACAATTTTGTTCTCTCAATTTTTTTCCTTCTAATTTTAATCGTACCCATGATATCGGATTTATTCAGTTTCCCGAAGATTGATGGACATAATAATCGAAGGAAGGAAGAAGCGTGAAACCGCCTCGACTCCTGCGTACCAAGGACACGTGATAAGGCCCATCAACTCATCCAGATTAAGGCCTATATAATATTAGTCAGTCAAGAATCACTTTCGACTTGATTAGGCCCATCAACTCATAAAGATTAAGCCCTATATAAGATAAGCTGGTGCCCTGTTTCCTTGCTAAGCGTTGCCGTGATATTCAGTTTGATCTGCTCATCGTATCGCCGCCGCACAACTCGCCGAATACCAAGGCTGGTAAACAAGCGCCGCCGCCGTCGCAAAATCCACCGAAACCAGACTACGCGACCACCACACGATGGATGCATCGCCATCAAATCCGCCCTCGTCGACTCCG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||