cluster # 5312

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Oryza sativa
cluster # 5312 cluster # 5312 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_5312#0 length = 1190 sequences # 3
consensusID : consensus_5312#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1190
fasta sequence
                              [TTGAGCAGCCTCCTGCTACATATGGTGCTGATGCAGAGTATGATAAGTTTATGTCAGAGATGAAGTGATGTGAGCCAAGATGAAGCAATTCTTCCAACAGTGGAAAAAGGCTTAAGGTTTCTTGGAGCTAGTGCCAGAATGATTTATTTCTTGTTGGAAGTTTGGGACTCACATCTTTAACCTTGCTGTGCTGTTATGACCATTGCAGAGGTTTCATGATTATGAAGGACGTTAATGACAGGGCACAGAGGAAACCAGATTATCTGCTCTATCTCCATCTTCGAGAACCATTTTAAGAACCATTTACTGATGCTTTTCTTATCTTAAAATTCTTGTCATTACTTGGCATTTTTCCTGTGATGTCACTTTAATTGTCTGTTGGCTGTGATATAATCTTTATTCTCACAAAAAAAATTTATGTTTTTCTTCACTCTTCAATTTGGTAAGTGCTGGCAGTCCTCTTCATGTGGATACCGGAAAATTTGCGGCCCCATGGTGATTGGTATAACGTGTGAAACATATGCACTATGCTTGTTTCTGTTGAATCTCTTTTAAGTTTTTACATCTTACGCTTTGCCTAAGTTGTTTGGCAGTTTGCTCGTGACAGAGGCAGCCAGAGTTAGTGCTTGCTTCTCAGGTATTGTTGAGATGATATGAATCGTCCACTGTGGAACGTACTAACTTTTGTTTTAATTTGGATTGCTCTCTATATTTTCCACTGACAATCAGTAATATGAGTTTCT-TTAATTAATTTGACTTCTTTT-CACATTNTCTACTGACAAAGAGTAACAAGT-TT-CCCCT-TTTGATAGTAAAATATATGCATTTTGGTATGGAAGCATAATCTGCCATGCTGGAAAGTCATCGGTGCAGAGGTTCTGGATATGTTTTTTTTGCCGCTAATGACTCTCTTAACATGTAAATGAATTTCTTTTCCAACTGAACTAGGACATGGCGACGCACAGATCAAGTCATTAGTCTGGAGGCTATGTTCAAGATGCGTACTGCAACAATTATTTATGTGAGCTATTCTGAAGGTTTTAGGTAGCTGAGACTGATTGTAGGTTCTAGGTGTTCCGGGAGTAAAGAAAAGTAGGAGACATAATAAGCTAGTGAAATTTCCTTATATTCTCATTCAGTTGTTTTTAACTTGCATTAGTTAACTGTCCATTGCCATGCAGATAAAAAAAAAA]

[+] EMBL CA998220             [TTGAGCAGCCTCCTGCTACATATGGTGCTGATGCAGAGTATGATAAGTTTATGTCAGAGATGAAGTGATGTGAGCCAAGATGAAGCAATTCTTCCAACAGTGGAAAAAGGCTTAAGGTTTCTTGGAGCTAGTGCCAGAATGATTTATTTCTTGTTGGAAGTTTGGGACTCACATCTTTAACCTTGCTGTGCTGTTATGACCATTGCAGAGGTTTCATGATTATGAAGGACGTTAATGACAGGGCACAGAGGAAACCAGATTATCTGCTCTATCTCCATCTTCGAGAACCATTTTAAGAACCATTTACTGATGCTTTTCTTATCTTAAAATTCTTGTCATTACTTGGCATTTTTCCTGTGATGTCACTTTAATTGTCTGTTGGCTGTGATATAATCTTTATTCTCACAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CF306475             [                                                                                                    ttttggcAGGCTTAAGGTTTCTTGGAGCTAGTGCCAGAATGATTTATTTCTTGTTGGAAGTTTGGGACTCACATCTTTAACCTTGCTGTGCTGTTATGACCATTGCAGAGGTTTCATGATTATGAAGGACGTTAATGACAGGGCACAGAGGAAACCAGATTATCTGCTCTATCTCCATCTTCGAGAACCATTTTAAGAACCATTTACTGATGCTTTTCTTATCTTAAAATTCTTGTCATTACTTGGCATTTTTCCTGTGATGTCACTTTAATTGTCTGTTGGCTGTGATATAATCTTTATTCTCACTGTTACTGTTTATGTTTTTCTTCACTCTTCAATTTGGTAAGTGCTGGCAGTCCTCTTCATGTGGATACCGGAAAATTTGCGGCCCCATGGTGATTGGTATAACGTGTGAAACATATGCACTATGCTTGTTTCTGTTGAATCTCTTTTAAGTTTTTACATCTTACGCTTTGCCTAAGTTGTTTGGCAGTTTGCTCGTGACAGAGGCAGCCAGAGTTAGTGCTTGCTTCTCAGGTATTGTTGAGATGATATGAATCGTCCACTGTGGAACGTACTAACTTTTGTTTTAATTTGGATTGCTCTCTATATTTTCCACTGACAATCAGTAATATGAGTTTCT TTAATTAATTTGACTTCTTTT CACATTNTCTACTGACAAAGAGTAACAAGT TT CCCCT TTTGATAGTAAAATATATGCATTTTGGTATGGAAGCATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BM420940             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTGAGATGATANGAATCGTCCCCTGTGGAACGTACTAACTTTTGTTTTAATTTGGATTGCTCTCTATATTTTCCACTGACAATCAGTAATATGAGTTTCTGTTAANTAATTTGACTTCTTTTGCACATTTTCTACTGACNAAGAGTAACAAGTGTTGCCCCTGTTTGATAGTAAAATATATGCA TTTGGTATGGAAGCATGATCTGCCATGCTGGAAAGTCATCGGTGCAGAGGTTCTGGATATGTTTTTTTTGCCGCTAATGACTCTCTTAACATGTAAATGAATTTCTTTTCCAACTGAACTAGGACATGGCGACGCACAGATCAAGTCATTAGTCTGGAGGCTATGTTCAAGATGCGTACTGCAACAATTATTTATGTGAGCTATTCTGAAGGTTTTAGGTAGCTGAGACTGATTGTAGGTTCTAGGTGTTCCGGGAGTAAAGAAAAGTAGGAGACATAATAAGCTAGTGAAATTTCCTTATATTCTCATTCAGTTGTTTTTAACTTGCATTAGTTAACTGTCCATTGCCATGCAGATAAAAAAAAAA]




>consensus_5312#0
TTGAGCAGCCTCCTGCTACATATGGTGCTGATGCAGAGTATGATAAGTTTATGTCAGAGA
TGAAGTGATGTGAGCCAAGATGAAGCAATTCTTCCAACAGTGGAAAAAGGCTTAAGGTTT
CTTGGAGCTAGTGCCAGAATGATTTATTTCTTGTTGGAAGTTTGGGACTCACATCTTTAA
CCTTGCTGTGCTGTTATGACCATTGCAGAGGTTTCATGATTATGAAGGACGTTAATGACA
GGGCACAGAGGAAACCAGATTATCTGCTCTATCTCCATCTTCGAGAACCATTTTAAGAAC
CATTTACTGATGCTTTTCTTATCTTAAAATTCTTGTCATTACTTGGCATTTTTCCTGTGA
TGTCACTTTAATTGTCTGTTGGCTGTGATATAATCTTTATTCTCACAAAAAAAATTTATG
TTTTTCTTCACTCTTCAATTTGGTAAGTGCTGGCAGTCCTCTTCATGTGGATACCGGAAA
ATTTGCGGCCCCATGGTGATTGGTATAACGTGTGAAACATATGCACTATGCTTGTTTCTG
TTGAATCTCTTTTAAGTTTTTACATCTTACGCTTTGCCTAAGTTGTTTGGCAGTTTGCTC
GTGACAGAGGCAGCCAGAGTTAGTGCTTGCTTCTCAGGTATTGTTGAGATGATATGAATC
GTCCACTGTGGAACGTACTAACTTTTGTTTTAATTTGGATTGCTCTCTATATTTTCCACT
GACAATCAGTAATATGAGTTTCTTTAATTAATTTGACTTCTTTTCACATTNTCTACTGAC
AAAGAGTAACAAGTTTCCCCTTTTGATAGTAAAATATATGCATTTTGGTATGGAAGCATA
ATCTGCCATGCTGGAAAGTCATCGGTGCAGAGGTTCTGGATATGTTTTTTTTGCCGCTAA
TGACTCTCTTAACATGTAAATGAATTTCTTTTCCAACTGAACTAGGACATGGCGACGCAC
AGATCAAGTCATTAGTCTGGAGGCTATGTTCAAGATGCGTACTGCAACAATTATTTATGT
GAGCTATTCTGAAGGTTTTAGGTAGCTGAGACTGATTGTAGGTTCTAGGTGTTCCGGGAG
TAAAGAAAAGTAGGAGACATAATAAGCTAGTGAAATTTCCTTATATTCTCATTCAGTTGT
TTTTAACTTGCATTAGTTAACTGTCCATTGCCATGCAGATAAAAAAAAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case