cluster # 546

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Oryza sativa
cluster # 546 cluster # 546 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_546#0 length = 1755 sequences # 2
consensusID : consensus_546#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1755
fasta sequence
                              [CCGAGCAGCACGCGCGCCCCGCCGCCGCTTACTCCTTCCACTACGCCACCGACCCGCGCCGCCGCCGCTTCCCCCACGAGGCCACCGACCCTCGCCGCCGCAGCTATGCAGAAGGTGCGGCTCAAGTGGGTGAAGAACCGGGGCCTGGACCACATCATCGCCCGCACGACCTCCATCAGGGCGTCCTGCCTGCTGCTCGACCACCTCGCGCGCCTCCCGTCGTCGTCGCCCGTGCCGGCGCGCTCCCTCGCGCGCCTTCAGAAGCCGCTTGGCCTCACCGTGCCCGTGCTCCGCTTCCTCCGCCGCCACCCCACCCTCTTCGCGGAGACCCTGCACCCGCGCTTCCCGACCCTCCCGTCCTTCTCCCTCACGCCGGCCTCGGACATCCTCCTCGGCCGCCTCGCCCGCGCCTCCGCGCTCGACTCGCACCTCCGCCTCGCCCGCCTCCTCCTCCTCACCCGCTCCAAGTCGCTCCCGCTTGCCTCCGTCCTCCCGCTGCGCTTCGACCTCGGCCTGCCTTACAACTTCGCCGCCGCCTTCCCGGTCGCCCACCCCGACCTCTTCGCCGTCTCCAACAACCACATCTCCCTGTCCGCTACCGCCTCCGGCCTCCCCGAGGGCATCGCCATCTCCTCCCTCCAGCGCCGCCACGCCGAGGCCATCGAGGGAGCGACCTACCGCGCGCTGTCTCGGCCGCCGTCCTCGTCAATCGCCCCCCTCGCCTTCCCGATGCGGTTCCCGCGTGGGTATGGCGGGATGAAGAAGGTCAAGGCCTGGATGGACGAGTTCCACAGGCTTCCGTACATCTCCCCGTACGACGACGCGTCAGGGATCGATCCCGACAGCGACATCTACGAGAAGAGGAACATTGGATTGCTGCACGAGCTGCTCGGTCTGATGGTGCACAAGATGGTTCGGAGGAACGCGATTCGGCTGCTCCGGGAGGAATTGGGCCTGCCGCACAAGTTCACGAGATTGTTCACGCGGTACCCTGGGGTTTTCTACCTGTCGTTGAAGTGCAAGACGACGACGGTGGTGCTCCGGGAGGGGTACGAGAGGGGTAAGCTGGTGGAGCAGCATCCCCTTGCGGCAGTGAGAGACAAGGTGTTCTATGTGATGCGTACTGGCGTGCTGTTCCGGGGGAAAGGCTTGTCCAAGCTTGTTTTGGATGAGGATGGTGATGAGGAGGTTGTGATGGATGGAGATGAAGAGTTTCACGGAGAAGGGATGGATGAAGATGCTGACGTTGAGTGCTTTGGAATGGATATT-GTGGATAATGAAGACAATACTGATGATGAGGACAACGAACGGGATATGTATGATTGACA-TTGCATGATGATTCTCACTTGCTGAATTTCGTTGTTCTGAAATGTTAACGACTCCTGGATGTCAGCAATATGGTTCAAGTTGTTGCCTCCA-AAGGAGAGGTTTCAACTCATGAATATTCATAAGAGAGTCTTATCTGGCTCATGAAGGAGATGTTTCAGAAGGCTATCACTGTGAGTAGCTAGCTCCATCGAAATTTTGATGTACTTGTATATTAGTTGCTTGAGATGTAGAAAGCTATTCAGGATGTTTAGTTTCTCTGGTCAGTCTGTGGTTGATGGTGCAAAACATATACTTATAGCCCTCTCTAAATAGCATGAGAATTATCATAAGTTTGACA-AATTGGCAGATAATTGGGTGATTGCTTTTATGTATCCAGCTATTCAATTTTATGCCCAGTGCCTTACTGAGTTAAATTTAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK122016             [CCGAGCAGCACGCGCGCCCCGCCGCCGCTTACTCCTTCCACTACGCCACCGACCCGCGCCGCCGCCGCTTCCCCCACGAGGCCACCGACCCTCGCCGCCGCAGCTATGCAGAAGGTGCGGCTCAAGTGGGTGAAGAACCGGGGCCTGGACCACATCATCGCCCGCACGACCTCCATCAGGGCGTCCTGCCTGCTGCTCGACCACCTCGCGCGCCTCCCGTCGTCGTCGCCCGTGCCGGCGCGCTCCCTCGCGCGCCTTCAGAAGCCGCTTGGCCTCACCGTGCCCGTGCTCCGCTTCCTCCGCCGCCACCCCACCCTCTTCGCGGAGACCCTGCACCCGCGCTTCCCGACCCTCCCGTCCTTCTCCCTCACGCCGGCCTCGGACATCCTCCTCGGCCGCCTCGCCCGCGCCTCCGCGCTCGACTCGCACCTCCGCCTCGCCCGCCTCCTCCTCCTCACCCGCTCCAAGTCGCTCCCGCTTGCCTCCGTCCTCCCGCTGCGCTTCGACCTCGGCCTGCCTTACAACTTCGCCGCCGCCTTCCCGGTCGCCCACCCCGACCTCTTCGCCGTCTCCAACAACCACATCTCCCTGTCCGCTACCGCCTCCGGCCTCCCCGAGGGCATCGCCATCTCCTCCCTCCAGCGCCGCCACGCCGAGGCCATCGAGGGAGCGACCTACCGCGCGCTGTCTCGGCCGCCGTCCTCGTCAATCGCCCCCCTCGCCTTCCCGATGCGGTTCCCGCGTGGGTATGGCGGGATGAAGAAGGTCAAGGCCTGGATGGACGAGTTCCACAGGCTTCCGTACATCTCCCCGTACGACGACGCGTCAGGGATCGATCCCGACAGCGACATCTACGAGAAGAGGAACATTGGATTGCTGCACGAGCTGCTCGGTCTGATGGTGCACAAGATGGTTCGGAGGAACGCGATTCGGCTGCTCCGGGAGGAATTGGGCCTGCCGCACAAGTTCACGAGATTGTTCACGCGGTACCCTGGGGTTTTCTACCTGTCGTTGAAGTGCAAGACGACGACGGTGGTGCTCCGGGAGGGGTACGAGAGGGGTAAGCTGGTGGAGCAGCATCCCCTTGCGGCAGTGAGAGACAAGGTGTTCTATGTGATGCGTACTGGCGTGCTGTTCCGGGGGAAAGGCTTGTCCAAGCTTGTTTTGGATGAGGATGGTGATGAGGAGGTTGTGATGGATGGAGATGAAGAGTTTCACGGAGAAGGGATGGATGAAGATGCTGACGTTGAGTGCTTTGGAATGGATATT GTGGATAATGAAGACAATACTGATGATGAGGACAACGAACGGGATATGTATGATTGACA TTGCATGATGATTCTCACTTGCTGAATTTCGTTGTTCTGAAATGTTAACGACTCCTGGATGTCAGCAATATGGTTCAAGTTGTTGCCTCCA AAGGAGAGGTTTCAACTCATGAATATTCATAAGAGAGTCTTATCTGGCTCATGAAGGAGATGTTTCAGAAGGCTATCACTGTGAGTAGCTAGCTCCATCGAAATTTTGATGTACTTGTATATTAGTTGCTTGAGATGTAGAAAGCTATTCAGGATGTTTAGTTTCTCTGGTCAGTCTGTGGTTGATGGTGCAAAACATATACTTATAGCCCTCTCTAAATAGCATGAGAATTATCATAAGTTTGACA AATTGGCAGATAATTGGGTGATTGCTTTTATGTAT                                                      ]
[+] EMBL BI811907             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ACGTTGAGTGCTTTGGAATGGATATTGGTGGATAATGAAGCCCATACTGATGATGAGGACAACGAACGGGATATGTATGATTGACACTTGCATGATGATTCTCACTTGCTGAATTTCGTTGTTCTGAAATGTTAACGACTCCTGGATGTCA CCATATGGTTCAAGTTGTTGCCTCCACAAGGAGAGGTTTCAACTCATGAATATTCATAAGAGAGTCTTATCTGGCTCATGAAGGAGAGGTTTCAGAAGGCTATCACTGTGAGTAGCTAGCTCCATCGAAATTTTGATGTACTTGTATATTAGTTGCTTGAGATGTAGAAAGCTATTCAGGATGTTTAGTTTCTCTGGTCAGTCTGTGGTTGATGGTGCAAAACATATACTTATAGCCCTCTCTAAATAGCATGAGAATTATCATAAGTTTGACACAATTGGCAGATAATTGGGTGATTGCTTTTATGTATCCAGCTATTCAATTTTATGCCCAGTGCCTTACTGAGTTAAATTTAAAAAAAAAA]




>consensus_546#0
CCGAGCAGCACGCGCGCCCCGCCGCCGCTTACTCCTTCCACTACGCCACCGACCCGCGCC
GCCGCCGCTTCCCCCACGAGGCCACCGACCCTCGCCGCCGCAGCTATGCAGAAGGTGCGG
CTCAAGTGGGTGAAGAACCGGGGCCTGGACCACATCATCGCCCGCACGACCTCCATCAGG
GCGTCCTGCCTGCTGCTCGACCACCTCGCGCGCCTCCCGTCGTCGTCGCCCGTGCCGGCG
CGCTCCCTCGCGCGCCTTCAGAAGCCGCTTGGCCTCACCGTGCCCGTGCTCCGCTTCCTC
CGCCGCCACCCCACCCTCTTCGCGGAGACCCTGCACCCGCGCTTCCCGACCCTCCCGTCC
TTCTCCCTCACGCCGGCCTCGGACATCCTCCTCGGCCGCCTCGCCCGCGCCTCCGCGCTC
GACTCGCACCTCCGCCTCGCCCGCCTCCTCCTCCTCACCCGCTCCAAGTCGCTCCCGCTT
GCCTCCGTCCTCCCGCTGCGCTTCGACCTCGGCCTGCCTTACAACTTCGCCGCCGCCTTC
CCGGTCGCCCACCCCGACCTCTTCGCCGTCTCCAACAACCACATCTCCCTGTCCGCTACC
GCCTCCGGCCTCCCCGAGGGCATCGCCATCTCCTCCCTCCAGCGCCGCCACGCCGAGGCC
ATCGAGGGAGCGACCTACCGCGCGCTGTCTCGGCCGCCGTCCTCGTCAATCGCCCCCCTC
GCCTTCCCGATGCGGTTCCCGCGTGGGTATGGCGGGATGAAGAAGGTCAAGGCCTGGATG
GACGAGTTCCACAGGCTTCCGTACATCTCCCCGTACGACGACGCGTCAGGGATCGATCCC
GACAGCGACATCTACGAGAAGAGGAACATTGGATTGCTGCACGAGCTGCTCGGTCTGATG
GTGCACAAGATGGTTCGGAGGAACGCGATTCGGCTGCTCCGGGAGGAATTGGGCCTGCCG
CACAAGTTCACGAGATTGTTCACGCGGTACCCTGGGGTTTTCTACCTGTCGTTGAAGTGC
AAGACGACGACGGTGGTGCTCCGGGAGGGGTACGAGAGGGGTAAGCTGGTGGAGCAGCAT
CCCCTTGCGGCAGTGAGAGACAAGGTGTTCTATGTGATGCGTACTGGCGTGCTGTTCCGG
GGGAAAGGCTTGTCCAAGCTTGTTTTGGATGAGGATGGTGATGAGGAGGTTGTGATGGAT
GGAGATGAAGAGTTTCACGGAGAAGGGATGGATGAAGATGCTGACGTTGAGTGCTTTGGA
ATGGATATTGTGGATAATGAAGACAATACTGATGATGAGGACAACGAACGGGATATGTAT
GATTGACATTGCATGATGATTCTCACTTGCTGAATTTCGTTGTTCTGAAATGTTAACGAC
TCCTGGATGTCAGCAATATGGTTCAAGTTGTTGCCTCCAAAGGAGAGGTTTCAACTCATG
AATATTCATAAGAGAGTCTTATCTGGCTCATGAAGGAGATGTTTCAGAAGGCTATCACTG
TGAGTAGCTAGCTCCATCGAAATTTTGATGTACTTGTATATTAGTTGCTTGAGATGTAGA
AAGCTATTCAGGATGTTTAGTTTCTCTGGTCAGTCTGTGGTTGATGGTGCAAAACATATA
CTTATAGCCCTCTCTAAATAGCATGAGAATTATCATAAGTTTGACAAATTGGCAGATAAT
TGGGTGATTGCTTTTATGTATCCAGCTATTCAATTTTATGCCCAGTGCCTTACTGAGTTA
AATTTAAAAAAAAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case