cluster # 550

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Oryza sativa
cluster # 550 cluster # 550 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_550#0 length = 2374 sequences # 2
consensusID : consensus_550#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2374
fasta sequence
                              [GCTCTCCCTCCTCCCCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCTTCGCCTCCTTCCTATGCTGCCTTCCGCGCGGAGCTCAGCTGCTCGTGGAGGCAGAGCCGTGCCCGTCTCATCCCCTGCCCGTGCAAGCAGCTAGGTAGGACGATTTGAGCGTGGTGTTAGGCCGAACCGCTGAAGGAAGATTGCTCCACTGTTGACTGCATTAGGATTCAATCCTTGCTGCTAAATGTATTGCTTATATTCAGCAATATAATGTTCAGCAGCAAGAACTGGATCTTAATATAGTCGATAGTGGAAGAACGGTAACATATGTGGTTTGCAGCAGGTGAGCAGGATGGGTGTGGATGATTGAATATCTCTGTTCAGTGTTTTCATCATCTGACTGAACACTGAATCAGCTTGCTGACGTTAGAGGTTTCAGTTTACCTAATTTATGGTCTGTACCCATGAAAAGTGGGAAAAGGCTGAAGAATTCGATTTCTTTCTTTCTTTCAATGTTGAGCACAGCTACACAGGCATCCAACCCAACATCATGTTGTTCAACATGATATTTGTCTGCCTATGCAAGAAGACCAGGGCTTTGGAAGCCTAAAAAGTCTTCGACCAGATAGGATCTTAGGGTATGAAACCCGACGCGTTCTCGTGTGCTGCATATTGTTTATCTTGTAAGATAGATGAAGTAACCTGACCTATAATCAGTTAAATGCCCTATAATCTTGAATTATTGATTTATTTATGGCTTCAGCTTTCAGTAACAGGGCTTTTATTACTGTAACCATATAATCCAACATAGCAGATGAGTTGACAGGCAGGTTCTTGTCTTCACACTGTTGAAATAATAAAATTTGTTTCCTTGGTTTCTTCCTTTGTGAAATTATCGAAGGGAATTATCAACTTAAATTATACTGTATTCAGAAGGTATAGCTGAGATGCCAATGAAATATAGCAATGAATAAATTAAATGTTTTTTTCTTGTAATGTCAGTTTGTGGCTTATTTACATTGCATTTTTTCTTGGTTTTAAACATTTCAGTTGGCATTTGTATCTATAATTCGATGCTTCTAATAGTCATTAGCACGCCTACCTGTAGTACTTTCTGGAAGACAAAGCTTGAAACTGAGCTTGACTAGTATACTTCTGCTGCTTGCTTTCATATGGAAATTTATTTGGAACCCATAATCATGTAATATTTTACATGCACCTTAAGCACACTAACCTGTTCAATTCATTTTTTCCCCTTTTCTAGATGCTTCGCATACATCTTGCAAATGGGTTGTTACAGGCTCTCTGGAATCAGCATTCACCATTCAGGAACATCTTGCAAATGGGTTGTTACAGGCTCTCTGGAATCAGCATTCACCGTTCAGGAACCAATAACGTTTTGTACTGCCAAGTGCCAACTATTATTTCCTTTGTTGTTATTGCTTAAAAAAGATGGTTATACGAGTCACAGGCCATATTTTATACTGGCAAAGTCTTTTTTTCGTATTTTTCTCCTTGGATGAGAATATCGCCTTTCCTTGCTGAACCCGTTACCTGGTTGCAACACCGGAACATTGCATTCGACTCAGCTAATGGTACACATCAGTTTTTGACGGGATGTCTGTATGATTGGAGTACCTCCACGGGTCTTTCAGTCCACCATTGATCTTGATCCATAGAGATGTGAAGACCCAGAACATCCTTACTGCAAATTGTGAGGCAAAAATATCTGATTTCAGGCTGAGCAGCCAGCGCTTTCTGCAGTGAAACCAAAACACACACCACCACTGATCCTACTGCCACTCTTGGATACTTGGACTCTATGCATTTCCTCACCCCTAAGTAATAATAATTCATTTGGGGTAACCAGCAAATAGATAAGAAATTGGTGATTGTTTACCATGAGCAGGTACTACAAAACCTCTCCTCTCGACATCGCAGTGAAAAGAGCGATGGCTTTGGGGTTGCTCCCTTAGTGCTTATCAGCTATCACAGCTCAACCAACGATCATCAGCATTGTGAAATTTGGTGCAGAACAGCCTTTCTGAAGGACATTGCTGACAGCAGCAGAATAACTGAGCAAGAGGAAATTATGATATAAACTCTGTATGAAGGTGTCCGATCTGGCTTTGCATTGCACAAAGCAACGCATTGTGGAAGGTTTTATGGGAGAGCTTGTACCTGGAAGACCTCGTCCTGTTACTACGAGGTGCAGCTCCAATGGTACGTTTGCTGACGCTAAGTTGGGGCACTCGAGTCAGAGAAAATTAATTAGAGAAACATCAGCAAGGGAACACAGCTGATTTTCCTACGGTGCTAATTTTTCATTTGATATAGGAGTATGAAACATTGGTGAATTGTTTAAACTTTAGTAAAGACCTACAACCTATT]

[+] EMBL AK101146             [GCTCTCCCTCCTCCCCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCTTCGCCTCCTTCCTATGCTGCCTTCCGCGCGGAGCTCAGCTGCTCGTGGAGGCAGAGCCGTGCCCGTCTCATCCCCTGCCCGTGCAAGCAGCTAGGTAGGACGATTTGAGCGTGGTGTTAGGCCGAACCGCTGAAGGAAGATTGCTCCACTGTTGACTGCATTAGGATTCAATCCTTGCTGCTAAATGTATTGCTTATATTCAGCAATATAATGTTCAGCAGCAAGAACTGGATCTTAATATAGTCGATAGTGGAAGAACGGTAACATATGTGGTTTGCAGCAGGTGAGCAGGATGGGTGTGGATGATTGAATATCTCTGTTCAGTGTTTTCATCATCTGACTGAACACTGAATCAGCTTGCTGACGTTAGAGGTTTCAGTTTACCTAATTTATGGTCTGTACCCATGAAAAGTGGGAAAAGGCTGAAGAATTCGATTTCTTTCTTTCTTTCAATGTTGAGCACAGCTACACAGGCATCCAACCCAACATCATGTTGTTCAACATGATATTTGTCTGCCTATGCAAGAAGACCAGGGCTTTGGAAGCCTAAAAAGTCTTCGACCAGATAGGATCTTAGGGTATGAAACCCGACGCGTTCTCGTGTGCTGCATATTGTTTATCTTGTAAGATAGATGAAGTAACCTGACCTATAATCAGTTAAATGCCCTATAATCTTGAATTATTGATTTATTTATGGCTTCAGCTTTCAGTAACAGGGCTTTTATTACTGTAACCATATAATCCAACATAGCAGATGAGTTGACAGGCAGGTTCTTGTCTTCACACTGTTGAAATAATAAAATTTGTTTCCTTGGTTTCTTCCTTTGTGAAATTATCGAAGGGAATTATCAACTTAAATTATACTGTATTCAGAAGGTATAGCTGAGATGCCAATGAAATATAGCAATGAATAAATTAAATGTTTTTTTCTTGTAATGTCAGTTTGTGGCTTATTTACATTGCATTTTTTCTTGGTTTTAAACATTTCAGTTGGCATTTGTATCTATAATTCGATGCTTCTAATAGTCATTAGCACGCCTACCTGTAGTACTTTCTGGAAGACAAAGCTTGAAACTGAGCTTGACTAGTATACTTCTGCTGCTTGCTTTCATATGGAAATTTATTTGGAACCCATAATCATGTAATATTTTACATGCACCTTAAGCACACTAACCTGTTCAATTCATTTTTTCCCCTTTTCTAGATGCTTCGCATACATCTTGCAAATGGGTTGTTACAGGCTCTCTGGAATCAGCATTCACCATTCAGGAACATCTTGCAAATGGGTTGTTACAGGCTCTCTGGAATCAGCATTCACCGTTCAGGAACCAATAACGTTTTGTACTGCCAAGTGCCAACTATTATTTCCTTTGTTGTTATTGCTTAAAAAAGATGGTTATACGAGTCACAGGCCATATTTTATACTGGCAAAGTCTTTTTTTCGTATTTTTCTCCTTGGATGAGAATATCGCCTTTCCTTGCTGAACCCGTTACCTGGTTGCAACACCGGAACATTGCATTCGACTCAGCTAATGGTACACATCAGTTTTTGACGGGATGTCTGTATGATTGGAGTACCTCCACGGGTCTTTCAGTCCACCATTGATCTTGATCCATAGAGATGTGAAGACCCAGAACATCCTTACTGCAAATTGTGAGGCAAAAATATCTGATTTCAGGCTGAGCAGCCAGCGCTTTCTGCAGTGAAACCAAAACACACACCACCACTGATCCTACTGCCACTCTTGGATACTTGGACTCTATGCATTTCCTCACCCCTAAGTAATAATAATTCATTTGGGGTAACCAGCAAATAGATAAGAAATTGGTGATTGTTTACCATGAGCAGGTACTACAAAACCTCTCCTCTCGACATCGCAGTGAAAAGAGCGATGGCTTTGGGGTTGCTCCCTTAGTGCTTATCAGCTATCACAGCTCAACCAACGATCATCAGCATTGTGAAATTTGGTGCAGAACAGCCTTTCTGAAGGACATTGCTGACAGCAGCAGAATAACTGAGCAAGAGGAAATTATGATATAAACTCTGTATGAAGGTGTCCGATCTGGCTTTGCATTGCACAAAGCAACGCATTGTGGAAGGTTTTATGGGAGAGCTTGTACCTGGAAGACCTCGTCCTGTTACTACGAGGTGCAGCTCCAATGGTACGTTTGCTGACGCTAAGTTGGGGCACTCGAGTCAGAGAAAATTAATTAGAGAAACATCAGCAAGGGAACACAGCTGATTTTCCTACGGTGCTAATTTTTCATTTGATATAGGAGTATGAAACATTGGTGAATTGTTTAAACTTTAGTAAAGACCTACAACCTATT]
[+] EMBL CF306060             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gGAATTATTGATTCATTTATGGCTTCAGCTTTCAGTAACAGGGCTTTTATTACTGTAACCATATAATCCAACATAGCAGATGAGTTGACAGGCAGGTTCTTGTCTTCACACTGTTGAAATAATAAAATTTGTTTCCTTGTTTTTTTCCTTTGTGAAATTATCGAAGGGAATTATCAACTTATTTTATACTGTATTCAGAAGGTATAGCTGAGATGCCAATGAAATATAGCAATGAATAAATTAAATGTTTTTTTCTTGTAATGTCAGTTTGTGGCTTATTTACATTGCATTTTTTCTTGGTTTTAAACATTTCAGTTGGCATTTGTATCTATAATTCGATGCTTCTAATAGTCATTAGCACGCCTACCTGTAGTACTTTCTGGAAGACAAAGCTTGAAACTGAGCTTGACTAGTATACTTCTGCTGCTTGCTTTCATATGGAAATTTATTTGGAACCCATAATCATGTAATATTTTACATGCACCTTAAGCACACTAACCTGTTCAATTCATTTTTTCCCCTTTTCTAGATGCTTCGCATACATCTTGCAAATGGGTTGTTACAGGCTCTCTGGAATCAGCATTCACCATTCAGGAACATCTTGCAAATGGGTTGTTACAGGCTCTCTGGAATCAGCTTTCACCGTTCAGGAACCAATAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]




>consensus_550#0
GCTCTCCCTCCTCCCCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCTTCGCCTCCTTCCTATGC
TGCCTTCCGCGCGGAGCTCAGCTGCTCGTGGAGGCAGAGCCGTGCCCGTCTCATCCCCTG
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AGATTGCTCCACTGTTGACTGCATTAGGATTCAATCCTTGCTGCTAAATGTATTGCTTAT
ATTCAGCAATATAATGTTCAGCAGCAAGAACTGGATCTTAATATAGTCGATAGTGGAAGA
ACGGTAACATATGTGGTTTGCAGCAGGTGAGCAGGATGGGTGTGGATGATTGAATATCTC
TGTTCAGTGTTTTCATCATCTGACTGAACACTGAATCAGCTTGCTGACGTTAGAGGTTTC
AGTTTACCTAATTTATGGTCTGTACCCATGAAAAGTGGGAAAAGGCTGAAGAATTCGATT
TCTTTCTTTCTTTCAATGTTGAGCACAGCTACACAGGCATCCAACCCAACATCATGTTGT
TCAACATGATATTTGTCTGCCTATGCAAGAAGACCAGGGCTTTGGAAGCCTAAAAAGTCT
TCGACCAGATAGGATCTTAGGGTATGAAACCCGACGCGTTCTCGTGTGCTGCATATTGTT
TATCTTGTAAGATAGATGAAGTAACCTGACCTATAATCAGTTAAATGCCCTATAATCTTG
AATTATTGATTTATTTATGGCTTCAGCTTTCAGTAACAGGGCTTTTATTACTGTAACCAT
ATAATCCAACATAGCAGATGAGTTGACAGGCAGGTTCTTGTCTTCACACTGTTGAAATAA
TAAAATTTGTTTCCTTGGTTTCTTCCTTTGTGAAATTATCGAAGGGAATTATCAACTTAA
ATTATACTGTATTCAGAAGGTATAGCTGAGATGCCAATGAAATATAGCAATGAATAAATT
AAATGTTTTTTTCTTGTAATGTCAGTTTGTGGCTTATTTACATTGCATTTTTTCTTGGTT
TTAAACATTTCAGTTGGCATTTGTATCTATAATTCGATGCTTCTAATAGTCATTAGCACG
CCTACCTGTAGTACTTTCTGGAAGACAAAGCTTGAAACTGAGCTTGACTAGTATACTTCT
GCTGCTTGCTTTCATATGGAAATTTATTTGGAACCCATAATCATGTAATATTTTACATGC
ACCTTAAGCACACTAACCTGTTCAATTCATTTTTTCCCCTTTTCTAGATGCTTCGCATAC
ATCTTGCAAATGGGTTGTTACAGGCTCTCTGGAATCAGCATTCACCATTCAGGAACATCT
TGCAAATGGGTTGTTACAGGCTCTCTGGAATCAGCATTCACCGTTCAGGAACCAATAACG
TTTTGTACTGCCAAGTGCCAACTATTATTTCCTTTGTTGTTATTGCTTAAAAAAGATGGT
TATACGAGTCACAGGCCATATTTTATACTGGCAAAGTCTTTTTTTCGTATTTTTCTCCTT
GGATGAGAATATCGCCTTTCCTTGCTGAACCCGTTACCTGGTTGCAACACCGGAACATTG
CATTCGACTCAGCTAATGGTACACATCAGTTTTTGACGGGATGTCTGTATGATTGGAGTA
CCTCCACGGGTCTTTCAGTCCACCATTGATCTTGATCCATAGAGATGTGAAGACCCAGAA
CATCCTTACTGCAAATTGTGAGGCAAAAATATCTGATTTCAGGCTGAGCAGCCAGCGCTT
TCTGCAGTGAAACCAAAACACACACCACCACTGATCCTACTGCCACTCTTGGATACTTGG
ACTCTATGCATTTCCTCACCCCTAAGTAATAATAATTCATTTGGGGTAACCAGCAAATAG
ATAAGAAATTGGTGATTGTTTACCATGAGCAGGTACTACAAAACCTCTCCTCTCGACATC
GCAGTGAAAAGAGCGATGGCTTTGGGGTTGCTCCCTTAGTGCTTATCAGCTATCACAGCT
CAACCAACGATCATCAGCATTGTGAAATTTGGTGCAGAACAGCCTTTCTGAAGGACATTG
CTGACAGCAGCAGAATAACTGAGCAAGAGGAAATTATGATATAAACTCTGTATGAAGGTG
TCCGATCTGGCTTTGCATTGCACAAAGCAACGCATTGTGGAAGGTTTTATGGGAGAGCTT
GTACCTGGAAGACCTCGTCCTGTTACTACGAGGTGCAGCTCCAATGGTACGTTTGCTGAC
GCTAAGTTGGGGCACTCGAGTCAGAGAAAATTAATTAGAGAAACATCAGCAAGGGAACAC
AGCTGATTTTCCTACGGTGCTAATTTTTCATTTGATATAGGAGTATGAAACATTGGTGAA
TTGTTTAAACTTTAGTAAAGACCTACAACCTATT
clustalw multiple alignements is not computed in this case