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Oryza sativa
cluster # 5652 cluster # 5652       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5652#0 length = 1165 sequences # 3  
consensusID : consensus_5652#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1165
fasta sequence 
                              [AACAATACGACAATTTTGATTGGATGGGTGAGACAGAGCTAATAATCAATAAAATCTGGAAGTCTCTTCACAACAAGAGGTACTTTGTTGTAGTTGAAGATATATGGGATTTACGGTCATGGAAATTTATCTGGTTGGCTCTAAACAGAAATAGCAAAGACAGTGCAATTCTGACGACAAGCAACAATTTTCGTATAGCTGAACATGTTGGTGATGGTTCTGTTTACACATTAGCGCCTCTTTCAAAAACCGACTCCGGAAAATTATTCTATGGAAGATTATTTCCATCTGAAGGCAAATGTCCCCCTGAATTGACAGAAATATCAAAAACAATTCTGAGAAAATGTGGCGGAATACCATTAGCAATCATTGCTACTATTGATTTGCTCGCAAGTAAAAGCTATACAGTGAAAGATTGGCAAGCTGTGAACGAACACTTTGGTTACGAACTTCAGCAAGGTCGATATGATGTGAGAAGGATAGTAACTCCCTCTTATAATGATCTACCTCTCCATCTAAAATTTTGCTTGTTGTATTTAGGTATGTTCCAGAGGGGTTACGAGATTAGTGGAGATCGCTTAATATGGGGGTGGATAGCTCAAGGTTTCATCCCGAACAACATGGGAAGAACTTTACAGGAAGTAGGAGAGAGCTGGCTCAATGAACTCATAGACAGAAATTTGGTCGAATCAGTGGAAGTTGATGCGAGTGGTAAGCCTTTATCATTCCGTGTGTACGGCTTGATTCATGACTTGATCGTCTCGTTGTTAACTGAAGAGAATGTCGCTACCATTTTATATGGTCAGCAAGGAGGATCTTTGAAAGATACAGTTTATCAGCTATCCATCCGCGGGAACACCATGCCGGAAGTGCGCACGAGTTTATCCCCTGTCTGGTCACTTGTTGTCTCTGGTGATGCCAGTTTGATGCCATCCCTCTCAGAGTTTAAGAATCTGCGTATTATGGATCTAGGTGGGTGTGAATCTTTGNCAAAATGAACATCTCAATGGTGTTGGAAGATTAGTTCTTTTGGTATGTCTGGTACTGAGAGGTGCTTGTATTACTGACATCCCAAAAGATATTGGAGGTTTAACATTTTTGGAAACTCTGGACCTAAGGGGAACAAGTATAAAAGAATTGCCAGAAAGTATTGTCCAGTTAATAA]

[+] EMBL CB630337             [AACAATACGACAATTTTGATTGGATGGGTGAGACAGAGCTAATAATCAATAAAATCTGGAAGTCTCTTCACAACAAGAGGTACTTTGTTGTAGTTGAAGATATATGGGATTTACGGTCATGGAAATTTATCTGGTTGGCTCTAAACAGAAATAGCAAAGACAGTGCAATTCTGACGACAAGCAACAATTTTCGTATAGCTGAACATGTTGGTGATGGTTCTGTTTACACATTAGCGCCTCTTTCAAAAACCGACTCCGGAAAATTATTCTATGGAAGATTATTTCCATCTGAAGGCAAATGTCCCCCTGAATTGACAGAAATATCAAAAACAATTCTGAGAAAATGTGGCGGAATACCATTAGCAATCATTGCTACTATTGATTTGCTCGCAAGTAAAAGCTATACAGTGAAAGATTGGCAAGCTGTGAACGAACACTTTGGTTACGAACTTCAGCAAGGTCGATATGATGTGAGAAGGATAGTAACTCCCTCTTATAATGATCTACCTCTCCATCTAAAATTTTGCTTGTTGTATTTAGGTATGTTCCAGAGGGGTTACGAGATTAGTGGAGATCGCTTAATATGGGGGTGGATAGCTCAAGGTTTCATCCCGAACAACATGGGAAGAACTTTACAGGAAGTAGGAGAGAGCTGGCTCAATGAACTCATAGACAGAAATTTGGTCGAATCAGTGGAAGTTGATGCGAGTGGTAAGCCTTTATCATTCCGTGTGTACGGCTTGATTCATGACTTGATCGTCTCGTTGTTAACTGAAGAGAATGTCGCTACCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CB634332             [                                                                                                                                                                                                                     ATGGTTCTGTTTACACATTAGCGCCTCTTTCAAAAACCGACTCCGGAAAATTATTCTATGGAAGATTATTTCCATCTGAAGGCAAATGTCCCCCTGAATTGACAGAAATATCAAAAACAATTCTGAGAAAATGTGGCGGAATACCATTAGCAATCATTGCTACTATTGATTTGCTCGCAAGTAAAAGCTATACAGTGAAAGATTGGCAAGCTGTGAACGAACACTTTGGTTACGAACTTCAGCAAGGTCGATATGATGTGAGAAGGATAGTAACTCCCTCTTATAATGATCTACCTCTCCATCTAAAATTTTGCTTGTTGTATTTAGGTATGTTCCAGAGGGGTTACGAGATTAGTGGAGATCGCTTAATATGGGGGTGGATAGCTCAAGGTTTCATCCCGAACAACATGGGAAGAACTTTACAGGAAGTAGGAGAGAGCTGGCTCAATGAACTCATAGACAGAAATTTGGTCGAATCAGTGGAAGTTGATGCGAGTGGTAAGCCTTTATCATTCCGTGTGTACGGCTTGATTCATGACTTGATCGTCTCGTTGTTAACTGAAGAGAATGTCGCTACCATTTTATATGGTCAGCAAGGAGGATCTTTGAAAGATACAGTTTATCAGCTATCCATCCGCGGGAACACCATGCCGGAAGTGCGCACGAGTTTATCCCCTGTCTGGTCACTTGTTGTCTCTGGTGATGCCAGTTTGATGCCATCCCTCTCAGAGTTTAAGAATCTGCGTATTATGGATCTAGGTGGGTGTGAATCTTTGNCAA                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CB627100             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGTGAAACTTTGGAAAGCTGTGAACGAACACTTTGGTTACGAACTTCAGCAAGGTCGATATGATGTGAGAAGGATAGTAACTCCCTCTTATAATGATCTACCTCTCCATCTAAAATTTTGCTTGTTGTATTTAGGTATGTTCCAGAGGGGTTACGAGATTAGTGGAGATCGCTTAATATGGGGGTGGATAGCTCAAGGTTTCATCCCGAACAACATGGGAAGAACTTTACAGGAAGTAGGAGAGAGCTGGCTCAATGAACTCATAGACAGAAATTTGGTCGAATCAGTGGAAGTTGATGCGAGTGGTAAGCCTTTATCATTCCGTGTGTACGGCTTGATTCATGACTTGATCGTCTCGTTGTTAACTGAAGAGAATGTCGCTACCATTTTATATGGTCAGCAAGGAGGATCTTTGAAAGATACAGTTTATCAGCTATCCATCCGCGGGAACACCATGCCGGAAGTGCGCACGAGTTTATCCCCTGTCTGGTCACTTGTTGTCTCTGGTGATGCCAGTTTGATGCCATCCCTCTCAGAGTTTAAGAATCTGCGTATTATGGATCTAGGTGGGTGTGAATCTTTG CAAAATGAACATCTCAATGGTGTTGGAAGATTAGTTCTTTTGGTATGTCTGGTACTGAGAGGTGCTTGTATTACTGACATCCCAAAAGATATTGGAGGTTTAACATTTTTGGAAACTCTGGACCTAAGGGGAACAAGTATAAAAGAATTGCCAGAAAGTATTGTCCAGTTAATAA]




>consensus_5652#0
AACAATACGACAATTTTGATTGGATGGGTGAGACAGAGCTAATAATCAATAAAATCTGGA
AGTCTCTTCACAACAAGAGGTACTTTGTTGTAGTTGAAGATATATGGGATTTACGGTCAT
GGAAATTTATCTGGTTGGCTCTAAACAGAAATAGCAAAGACAGTGCAATTCTGACGACAA
GCAACAATTTTCGTATAGCTGAACATGTTGGTGATGGTTCTGTTTACACATTAGCGCCTC
TTTCAAAAACCGACTCCGGAAAATTATTCTATGGAAGATTATTTCCATCTGAAGGCAAAT
GTCCCCCTGAATTGACAGAAATATCAAAAACAATTCTGAGAAAATGTGGCGGAATACCAT
TAGCAATCATTGCTACTATTGATTTGCTCGCAAGTAAAAGCTATACAGTGAAAGATTGGC
AAGCTGTGAACGAACACTTTGGTTACGAACTTCAGCAAGGTCGATATGATGTGAGAAGGA
TAGTAACTCCCTCTTATAATGATCTACCTCTCCATCTAAAATTTTGCTTGTTGTATTTAG
GTATGTTCCAGAGGGGTTACGAGATTAGTGGAGATCGCTTAATATGGGGGTGGATAGCTC
AAGGTTTCATCCCGAACAACATGGGAAGAACTTTACAGGAAGTAGGAGAGAGCTGGCTCA
ATGAACTCATAGACAGAAATTTGGTCGAATCAGTGGAAGTTGATGCGAGTGGTAAGCCTT
TATCATTCCGTGTGTACGGCTTGATTCATGACTTGATCGTCTCGTTGTTAACTGAAGAGA
ATGTCGCTACCATTTTATATGGTCAGCAAGGAGGATCTTTGAAAGATACAGTTTATCAGC
TATCCATCCGCGGGAACACCATGCCGGAAGTGCGCACGAGTTTATCCCCTGTCTGGTCAC
TTGTTGTCTCTGGTGATGCCAGTTTGATGCCATCCCTCTCAGAGTTTAAGAATCTGCGTA
TTATGGATCTAGGTGGGTGTGAATCTTTGNCAAAATGAACATCTCAATGGTGTTGGAAGA
TTAGTTCTTTTGGTATGTCTGGTACTGAGAGGTGCTTGTATTACTGACATCCCAAAAGAT
ATTGGAGGTTTAACATTTTTGGAAACTCTGGACCTAAGGGGAACAAGTATAAAAGAATTG
CCAGAAAGTATTGTCCAGTTAATAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)