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Oryza sativa
cluster # 5660 cluster # 5660       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5660#0 length = 403 sequences # 3  
consensusID : consensus_5660#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 403
fasta sequence 
                              [AGGACGAGAAAGACGGAGTAGTTGTTGTTTTGAATTTATAAAATATTTAGTAGTCTTTCAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCTTGTTTTCCCTTTACTTACCAAAGGGCAAATTCGGGGCCGTAAAATAAAATTCCCCTTATAGGAAGTCTTTTAAAAATTAATGGGCCGTCTTTTAAAAACTTCGGAATTGGAAAAACCCTGGCTTAACCAAATTAAATCCCTTTGAAAAAAATCCCCTTTTCCCCAGTTGGGTAAAAACCAAAAAGGCCCCCACCAATCCCCTTTCCAAAAATTTGCCAACCCTATACTTACGGAATTTAAAGGTTAACACCTATAA]

[+] EMBL CA765896             [AGGACGAGAAAGGGGGAGTAGTTGTTGTTTTGAATTTATAAAATATTTAGTAGTCTTTCAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CF333921             [            ACGGAGTAGTTGTTGTTTTGAATTTATAAAATATTTAGTAGTCTTTCAAAGCANAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCTTGTTTTCCCTTTACTTACCAAAGGGCAAATTCGGGGCCGTAAAATAAAATTCCCCTTATAGGAAGTCTTTTAAAAATTAATGGGCCGTCTTTTAAAAACTTCGGAATTGGAAAAACCCTGGCTTAACCAAATTAAATCCCTTTGAAAAAAATCCCCTTTTCCCCAGTTGGGTAAAAACCAAAAAGGCCCCCACCAATCCCCTTTCCAAAAATTTGCCAACCCTATACTTACGGAATTTAAAGGTTAACACCTATAA]
[+] EMBL CF336442             [            ACGGAGTAGTTGTTGTTTTGAATTTATAAAATATTTAGTAGTCTTTCAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]




>consensus_5660#0
AGGACGAGAAAGACGGAGTAGTTGTTGTTTTGAATTTATAAAATATTTAGTAGTCTTTCA
AAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCTTGTTTTCCCTTTACTTACCAAAGGGCAAATTCG
GGGCCGTAAAATAAAATTCCCCTTATAGGAAGTCTTTTAAAAATTAATGGGCCGTCTTTT
AAAAACTTCGGAATTGGAAAAACCCTGGCTTAACCAAATTAAATCCCTTTGAAAAAAATC
CCCTTTTCCCCAGTTGGGTAAAAACCAAAAAGGCCCCCACCAATCCCCTTTCCAAAAATT
TGCCAACCCTATACTTACGGAATTTAAAGGTTAACACCTATAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)