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Oryza sativa
cluster # 5732 cluster # 5732       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5732#0 length = 4702 sequences # 3  

consensusID : consensus_5732#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 4702
fasta sequence
                              [GATGGCTTCTTCCGACCTCATCCTCTACAACCTCGTCCCCGCCCAACCCCTAAACCCTAGCGCCATCCCCAACCCTAACCCCGACCTCTCCATCGCCGCCGCCGAGCCCCCCTCCTCCGACGGCGCCACCCCTCGCCGCGTCAGGCCCAGGAAGTCCCCCTCCTCCTCCGACCGCCACTCCAAGGTCGCCGGCCGCGGCCGCCGCGTCCGCATCCCGGCCATGGTGGCCGCCCGCGTCTTCCAGCTCACCCGCGAGCTCGGCCACCGCACCGACGGGGAGACCATCGAGTGGCTACTCCGCCAGGCCGAGCCCTCCATCATCGCCGCCACCGGGACGGGCGTCACCCCGGAGGAGGCGCCCCCCGCCGCCGTCGCCATCGGCTCTTCCTCGGTCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGCGGGCATGGGGGCGCGTTCGTCCATGTGCCTTACTACACCGCGCTCCTCATGCAGCCGCCTAACGCGGACGAGCCCCCCATGGCATCCGCTGCCTCCGCCTCGGGCACCACCGCCGCCGACGAGAACAATAATTAATTTAGAACTGCCGCTGTTAGGTTTAGGAGCTTGGAGCGTGTTAGGGTTAGGGTTCCCCGGCGTATTTAGGAGAGGTCTCCCCCTCCTCAATAATTTAACCTCATTGTCCTTGTGGCGGTTGCGGCGGCGGCATGGATTTAGGTTATTTAGATGCCTTATTCAGGCAAGCAAATGAGGGGGTGATTCAGATGGTTTCTTAGAGAGGAGGGCAGAAAAATGGAGAGCTCTCTGTAAGTGGTGGGTGAGGACTGGAGTGAGTGGTACTGATGCTCTGATGAAACAATGCCTGAGTTATTGTGAATGTTTAGATCTGCTGATTTATTCTCCGTGTGCGCTTTTTATGTGCTATAGTAGATGATTCCATTTGGTGTTTACCTTGACTAGGAAGTAGGAACATGGTTTGGTTGTGCCGCAGAAGGAACAGTCTTGGGTTGTATCATGAGAGGAGCTTGGAAGTTGGAAACATAACCAAATTGACTTGGCTGTTACTGTCAGCTGGTTATTTTTGAATCTAACCAGAATTCAGATGCAGATTAACAAAAAAGGTTTTATTTGGAAATTGCTTGGAAGGGTTTTAGTGCTCAGGACATGTGTTCTGCGGTTGCATCTTGTCGTATTCTGAAGACGACGGTTCTGGATTGCCAAATACATGCTTTTATTCCTACTATGCTTGTTTTGGACGTCAAATAAAATGCATGTGCTCTTCCACAAGTGGATACACATCTCATTTGGAGGATTAGGTTTCCTTTTGTTGTAACTGTTTGCTCTATTTCTTGTTTATTACTTTTGTTTATTCTTAAATCATGTAGAAGAACTATAGTTGTAGTGGTTAATGTTTTTTGTCTGTTTGGTTTCCCTTGTCATAAAAAATTATACCTTTTGTCTTTGAGTTGGGAAACGACTTTATATGATGCTTAATTTATTTCATTGCTTTCTGGACATATTTATATCAATAGCAATGTGTTGGTGCATTCAACTTGCTACTGAAGACCTACAGTTTGTTGACCTCAATGCTTGGCATGGCTGCAAAGATTCAGGTATGGTGCTTTTGCTATGCTATAGTATTTTCTCTAAAAATTAGCTTCTTCACATGATCTTCCGAAGCATTAGTCTTCTGCAGAAATTAAAATAATACAGCTAGCCTTGTGGATGTGGAATTTAGTGATAGATTTAAAATTTTCATTATTCTCATATGCCATCATTTTCCATTTTATTTAGATGTAAATTTGCATGGATTTTCCCCAAGAATGCTTGATCGTTTCACGATTTACAGGTAACAGGCTATGTACCTTTTTGGAATTTTATAATTGTTGGGCATTTAAATGTTATTGAGTAATGTTATATGTATACTAACAAGCAAACATCAGATCAAAACTGAGTCGTGTAAGGAAATTTTTGGGTTGGATGTTCCAGAACATCTTGATAATCCATCAATTCTTTTAAAAGCGGTACGCGGTTTCATGTGGTCACCACACCTCGTAGCGCTTATGCGGCATAATTGGCCGCTTATGCGGTGGATTGGCCGCTTATGTGGCTTAAGCGGTACAAGGTTGGGGCACCTGTTCCTTGTATGCGGCCTTGTAAATGTTTTTTTAGAACACTGTAATCCACTATTTTGATCAGGGGGCTGATATGGTAACTGGATCCTTGTTCTAAATTAGTACCCTGTACAATCAATTTTTGTTTATTAACGTGGAATTTTTATATCCAAAGAAGGCCTCACGCAGGGCTGGTGCACCAATTTTGATGGGTAGCTGAATACCCATTTATTTTGTGTCTATGTTATATCGTGATAAAATGGAGTTTTGCTCTATTGGTTCATATATTTTCTGTATCTATGTATATAGTGAAGAAGGTGAATTTTGCTCTATTGGTTAGGCCTTGGATGCATCATTCTGGCTGTGGGTTTGATTCCCATGCTCTCCAGCCCCATGTCACCTTTTTTTCCCAGTATCTCTTGTTCGCCTCAATATCTTTGTATTGTTTCTCTCTTCCACCCGGTAAGATTTGAGAAACCTGCCATATTTTCTCAGAAATTCATCAGTTCTTTTCAAAAACAACCTATCATTGCATAAAAAAACTTGCATCTTTTCTACTGACGACATTAAATCTTTTATTTAAATACCACCACATAAGCTTCATATCTCCTGTGTTTGCCGCTGTGCCACCGCTTGTCCTAGCGCCATATGCTCCACGCTCCTCCCCTTGTGTCTTTATCTTTGCCCCATCTACTATTGTGCACTTGGGTCTTGGTCAAACAGCTCAACATGGAATCAATCGACTCAAGCCTAGCCTATCATGCAACTTGTACCTCTCCCCTACAATCAGGTTGTTACCACACTGCCATAGGCAGATTGCCACCTAGCTGCCACACATTTCCTTGCCTTGCAGCCTCCAACATGGCTCTAATCCCTGTTGAGCGGTGCAGATATGCTAATTAGGTGCATCACAAACTGTCATACTTGCCAGTTGCTTGACAAAATGATTGACTTCTTAAACTTTGAACCATTTGTGCATGTACTCTGTCCTTCTGTTGGATAAACTGTAGTGCTTGTGAGAGTGACGTGGTAATTCCATTTAACGTCAAAGGTGGAGTCTAGGGGTTGTGGGATTTCATGTCAAAGGGGAGTCCAGTTATCCTGCCATTTCAGTATTTAGCAGTTCATTATTTCCTTTTGACCATGCTCCATGCCGATAGATTATGCAACTGGGGCATTAATTGAACCATGTTACGATTTCTCTATATTCAGTCGAGTGATTGCTTATATTGCACCTGGTCTGATCATGAATGAGGTTATGAACCTGACTACTGCTTTCCAATTGCTCTTTGGGATGATATATGAATCTATGTTCTCTGAACTGCATGCTTTAGATTATTGCAAACATGTTGACCATTAAGTATAAATAATGTAGAGTTCTCAATTTGCAGTTCATTTTGATATATTTTCATTTTTCTATGTTCTTTGCAGCTGATACTTGAAGGAAATGCTTCTGATTGTTGTGTGTGCAACTGTGCATGTCACTCATTTTTCAATTTGGTTAAGTCTAATCATGGATTCCAGGTGTAGTTCCCTCTTCGCACATTCATACCTACGCAACATCCTGTTTCTGCATATGTATTGCCGTTAATTGTTGAAACTGCATCATAAACAAATTTTGCACTGAGAATATTTGACTTCTTACCTTTGTGGAGAATGCGTGGCCAGAGCATAGCTCATAACAAAATGGTAAGAGTGACTAAAGTCAATTGTCACTGGTTAGAGCATGGACTGTTTCTAAGTAAGATTTCTTTCTTCTGTAACATTTACTGGTTAACATATCTGAGTTCTGTGGGTGCTCACAAGTGAGCGTATTGTTTATGTATATTGACATATTGTTTCACTTCTAGACGATAAAGAAATCACGAATTTGTAGATAATGTGGGCCATTCCTATGGGCTTCTCCTTTTGCATCTGCATATTACATCTTTAAGTCTTCAATATGAACAAGAAATGATCTTTCTTGATTGGGAAAAAGTCAGTTATGTCAGGTCACTGGTTATTTCTTGATTGTTGAAATGGACTTTGATCATGGATCAGAACATGGTATTTTCTCCATTGAATTCTACAGGTACAGTTTCTTTTCCTTGTTACTGACCAATGCACTTTTGTCATCATCTGATTAGTGTTATCATCTGAAAACCAATCTGTATTTCAATGTGTTTTAATCTTCATCTGAAACCCATTGTACCAGCTCTGTTCCTTGACCACAAATCCAACTTGCAGAGAAGTACACTGACCTAGGATGGCTCCCAAGCAAGGACCAGGAAGTATACATCTAAAAAATAAAGCATTTTTTGTGCCCAAACATTTATGGTCTTGAACATCTTGGGTGTGTTTTGGGAGTCGTTTTTTAGCAGCGGTAGCAGCTGGAGCAGTTCAAAGTGGCTGCAGTTTGCAGCAATTTTGAACTGCCGCAGCCTCAGCAGCTGTGGCAGGTATGGCTGCTGAACAGAGCCCTTATTGTTCAATTATCACCCTGTGACAGGACTTTCTGAAGGCAAGCTTCTGCATCTAGAATTTCTATTTTGGTACTTATAGTTCTTGCGTGACATTTGTTCTGGCACAATGTACCAACAATTTTGATAGTGAATAACTGAGTACAATTTAAAAG]

[+] EMBL D87260               [GATGGCTTCTTCCGACCTCATCCTCTACAACCTCGTCCCCGCCCAACCCCTAAACCCTAGCGCCATCCCCAACCCTAACCCCGACCTCTCCATCGCCGCCGCCGAGCCCCCCTCCTCCGACGGCGCCACCCCTCGCCGCGTCAGGCCCAGGAAGTCCCCCTCCTCCTCCGACCGCCACTCCAAGGTCGCCGGCCGCGGCCGCCGCGTCCGCATCCCGGCCATGGTGGCCGCCCGCGTCTTCCAGCTCACCCGCGAGCTCGGCCACCGCACCGACGGGGAGACCATCGAGTGGCTACTCCGCCAGGCCGAGCCCTCCATCATCGCCGCCACCGGGACGGGCGTCACCCCGGAGGAGGCGCCCCCCGCCGCCGTCGCCATCGGCTCTTCCTCGGTCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGCGGGCATGGGGGCGCGTTCGTCCATGTGCCTTACTACACCGCGCTCCTCATGCAGCCGCCTAACGCGGACGAGCCCCCCATGGCATCCGCTGCCTCCGCCTCGGGCACCACCGCCGCCGACGAGAACAATAATTAATTTAGAACTGCCGCTGTTAGGTTTAGGAGCTTGGAGCGTGTTAGGGTTAGGGTTCCCCGGCGTATTTAGGAGAGGTCTCCCCCTCCTCAATAATTTAACCTCATTGTCCTTGTGGCGGTTGCGGCGGCGGCATGGATTTAGGTTATTTAGATGCCTTATTCAGGCAAGCAAATGAGGGGGTGATTCAGATGGTTTCTTAGAGAGGAGGGCAGAAAAATGGAGAGCTCTCTGTAAGTGGTGGGTGAGGACTGGAGTGAGTGGTACTGATGCTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
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[+] EMBL AU180996             [                                                                                                                                                                                                                                             CTTCCAGCTCACCCGCGAGCTCGGCCACCGCACCGACGGGGAGACCATCGAGTGGCTACTCCGCCAGGCCGAGCCCTCCATCATCGCCGCCACCGGGACGGGCGTCACCCCGGAGGAGGCGCCCCCCGCCGCCGTCGCCATCGGCTCTTCCTCGGTCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGCGGGCATGGGGGCGCGTTCGTCCATGTGCCTTACTACACCGCGCTCCTCATGCAGCCGCCTAACGCGGACGAGCCCCCCATGGCATCCGCTGCCTCCGCCTCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]


>consensus_5732#0 GATGGCTTCTTCCGACCTCATCCTCTACAACCTCGTCCCCGCCCAACCCCTAAACCCTAG CGCCATCCCCAACCCTAACCCCGACCTCTCCATCGCCGCCGCCGAGCCCCCCTCCTCCGA CGGCGCCACCCCTCGCCGCGTCAGGCCCAGGAAGTCCCCCTCCTCCTCCGACCGCCACTC CAAGGTCGCCGGCCGCGGCCGCCGCGTCCGCATCCCGGCCATGGTGGCCGCCCGCGTCTT CCAGCTCACCCGCGAGCTCGGCCACCGCACCGACGGGGAGACCATCGAGTGGCTACTCCG CCAGGCCGAGCCCTCCATCATCGCCGCCACCGGGACGGGCGTCACCCCGGAGGAGGCGCC CCCCGCCGCCGTCGCCATCGGCTCTTCCTCGGTCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGCGGGCA TGGGGGCGCGTTCGTCCATGTGCCTTACTACACCGCGCTCCTCATGCAGCCGCCTAACGC GGACGAGCCCCCCATGGCATCCGCTGCCTCCGCCTCGGGCACCACCGCCGCCGACGAGAA CAATAATTAATTTAGAACTGCCGCTGTTAGGTTTAGGAGCTTGGAGCGTGTTAGGGTTAG GGTTCCCCGGCGTATTTAGGAGAGGTCTCCCCCTCCTCAATAATTTAACCTCATTGTCCT TGTGGCGGTTGCGGCGGCGGCATGGATTTAGGTTATTTAGATGCCTTATTCAGGCAAGCA AATGAGGGGGTGATTCAGATGGTTTCTTAGAGAGGAGGGCAGAAAAATGGAGAGCTCTCT GTAAGTGGTGGGTGAGGACTGGAGTGAGTGGTACTGATGCTCTGATGAAACAATGCCTGA GTTATTGTGAATGTTTAGATCTGCTGATTTATTCTCCGTGTGCGCTTTTTATGTGCTATA GTAGATGATTCCATTTGGTGTTTACCTTGACTAGGAAGTAGGAACATGGTTTGGTTGTGC CGCAGAAGGAACAGTCTTGGGTTGTATCATGAGAGGAGCTTGGAAGTTGGAAACATAACC AAATTGACTTGGCTGTTACTGTCAGCTGGTTATTTTTGAATCTAACCAGAATTCAGATGC AGATTAACAAAAAAGGTTTTATTTGGAAATTGCTTGGAAGGGTTTTAGTGCTCAGGACAT GTGTTCTGCGGTTGCATCTTGTCGTATTCTGAAGACGACGGTTCTGGATTGCCAAATACA TGCTTTTATTCCTACTATGCTTGTTTTGGACGTCAAATAAAATGCATGTGCTCTTCCACA AGTGGATACACATCTCATTTGGAGGATTAGGTTTCCTTTTGTTGTAACTGTTTGCTCTAT TTCTTGTTTATTACTTTTGTTTATTCTTAAATCATGTAGAAGAACTATAGTTGTAGTGGT TAATGTTTTTTGTCTGTTTGGTTTCCCTTGTCATAAAAAATTATACCTTTTGTCTTTGAG TTGGGAAACGACTTTATATGATGCTTAATTTATTTCATTGCTTTCTGGACATATTTATAT CAATAGCAATGTGTTGGTGCATTCAACTTGCTACTGAAGACCTACAGTTTGTTGACCTCA ATGCTTGGCATGGCTGCAAAGATTCAGGTATGGTGCTTTTGCTATGCTATAGTATTTTCT CTAAAAATTAGCTTCTTCACATGATCTTCCGAAGCATTAGTCTTCTGCAGAAATTAAAAT AATACAGCTAGCCTTGTGGATGTGGAATTTAGTGATAGATTTAAAATTTTCATTATTCTC ATATGCCATCATTTTCCATTTTATTTAGATGTAAATTTGCATGGATTTTCCCCAAGAATG CTTGATCGTTTCACGATTTACAGGTAACAGGCTATGTACCTTTTTGGAATTTTATAATTG TTGGGCATTTAAATGTTATTGAGTAATGTTATATGTATACTAACAAGCAAACATCAGATC AAAACTGAGTCGTGTAAGGAAATTTTTGGGTTGGATGTTCCAGAACATCTTGATAATCCA TCAATTCTTTTAAAAGCGGTACGCGGTTTCATGTGGTCACCACACCTCGTAGCGCTTATG CGGCATAATTGGCCGCTTATGCGGTGGATTGGCCGCTTATGTGGCTTAAGCGGTACAAGG TTGGGGCACCTGTTCCTTGTATGCGGCCTTGTAAATGTTTTTTTAGAACACTGTAATCCA CTATTTTGATCAGGGGGCTGATATGGTAACTGGATCCTTGTTCTAAATTAGTACCCTGTA CAATCAATTTTTGTTTATTAACGTGGAATTTTTATATCCAAAGAAGGCCTCACGCAGGGC TGGTGCACCAATTTTGATGGGTAGCTGAATACCCATTTATTTTGTGTCTATGTTATATCG TGATAAAATGGAGTTTTGCTCTATTGGTTCATATATTTTCTGTATCTATGTATATAGTGA AGAAGGTGAATTTTGCTCTATTGGTTAGGCCTTGGATGCATCATTCTGGCTGTGGGTTTG ATTCCCATGCTCTCCAGCCCCATGTCACCTTTTTTTCCCAGTATCTCTTGTTCGCCTCAA TATCTTTGTATTGTTTCTCTCTTCCACCCGGTAAGATTTGAGAAACCTGCCATATTTTCT CAGAAATTCATCAGTTCTTTTCAAAAACAACCTATCATTGCATAAAAAAACTTGCATCTT TTCTACTGACGACATTAAATCTTTTATTTAAATACCACCACATAAGCTTCATATCTCCTG TGTTTGCCGCTGTGCCACCGCTTGTCCTAGCGCCATATGCTCCACGCTCCTCCCCTTGTG TCTTTATCTTTGCCCCATCTACTATTGTGCACTTGGGTCTTGGTCAAACAGCTCAACATG GAATCAATCGACTCAAGCCTAGCCTATCATGCAACTTGTACCTCTCCCCTACAATCAGGT TGTTACCACACTGCCATAGGCAGATTGCCACCTAGCTGCCACACATTTCCTTGCCTTGCA GCCTCCAACATGGCTCTAATCCCTGTTGAGCGGTGCAGATATGCTAATTAGGTGCATCAC AAACTGTCATACTTGCCAGTTGCTTGACAAAATGATTGACTTCTTAAACTTTGAACCATT TGTGCATGTACTCTGTCCTTCTGTTGGATAAACTGTAGTGCTTGTGAGAGTGACGTGGTA ATTCCATTTAACGTCAAAGGTGGAGTCTAGGGGTTGTGGGATTTCATGTCAAAGGGGAGT CCAGTTATCCTGCCATTTCAGTATTTAGCAGTTCATTATTTCCTTTTGACCATGCTCCAT GCCGATAGATTATGCAACTGGGGCATTAATTGAACCATGTTACGATTTCTCTATATTCAG TCGAGTGATTGCTTATATTGCACCTGGTCTGATCATGAATGAGGTTATGAACCTGACTAC TGCTTTCCAATTGCTCTTTGGGATGATATATGAATCTATGTTCTCTGAACTGCATGCTTT AGATTATTGCAAACATGTTGACCATTAAGTATAAATAATGTAGAGTTCTCAATTTGCAGT TCATTTTGATATATTTTCATTTTTCTATGTTCTTTGCAGCTGATACTTGAAGGAAATGCT TCTGATTGTTGTGTGTGCAACTGTGCATGTCACTCATTTTTCAATTTGGTTAAGTCTAAT CATGGATTCCAGGTGTAGTTCCCTCTTCGCACATTCATACCTACGCAACATCCTGTTTCT GCATATGTATTGCCGTTAATTGTTGAAACTGCATCATAAACAAATTTTGCACTGAGAATA TTTGACTTCTTACCTTTGTGGAGAATGCGTGGCCAGAGCATAGCTCATAACAAAATGGTA AGAGTGACTAAAGTCAATTGTCACTGGTTAGAGCATGGACTGTTTCTAAGTAAGATTTCT TTCTTCTGTAACATTTACTGGTTAACATATCTGAGTTCTGTGGGTGCTCACAAGTGAGCG TATTGTTTATGTATATTGACATATTGTTTCACTTCTAGACGATAAAGAAATCACGAATTT GTAGATAATGTGGGCCATTCCTATGGGCTTCTCCTTTTGCATCTGCATATTACATCTTTA AGTCTTCAATATGAACAAGAAATGATCTTTCTTGATTGGGAAAAAGTCAGTTATGTCAGG TCACTGGTTATTTCTTGATTGTTGAAATGGACTTTGATCATGGATCAGAACATGGTATTT TCTCCATTGAATTCTACAGGTACAGTTTCTTTTCCTTGTTACTGACCAATGCACTTTTGT CATCATCTGATTAGTGTTATCATCTGAAAACCAATCTGTATTTCAATGTGTTTTAATCTT CATCTGAAACCCATTGTACCAGCTCTGTTCCTTGACCACAAATCCAACTTGCAGAGAAGT ACACTGACCTAGGATGGCTCCCAAGCAAGGACCAGGAAGTATACATCTAAAAAATAAAGC ATTTTTTGTGCCCAAACATTTATGGTCTTGAACATCTTGGGTGTGTTTTGGGAGTCGTTT TTTAGCAGCGGTAGCAGCTGGAGCAGTTCAAAGTGGCTGCAGTTTGCAGCAATTTTGAAC TGCCGCAGCCTCAGCAGCTGTGGCAGGTATGGCTGCTGAACAGAGCCCTTATTGTTCAAT TATCACCCTGTGACAGGACTTTCTGAAGGCAAGCTTCTGCATCTAGAATTTCTATTTTGG TACTTATAGTTCTTGCGTGACATTTGTTCTGGCACAATGTACCAACAATTTTGATAGTGA ATAACTGAGTACAATTTAAAAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)