cluster # 6041

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 6041 cluster # 6041 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6041#0 length = 2382 sequences # 3
consensusID : consensus_6041#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 2382
fasta sequence
                              [AAAAATCGCTCGCCCCCCTCCACCTCCACCTCGCTCCCGCCGCCTCCACCACCCATCTCCGCCCTCGTCCGCTCGCCGGCAAGCCGCTGCTGCTGCAGCTGCTTGCTCGTCTCGTCTCCCCATCCCTGGGCGGGGCGCGGTGGGAGGGGGGCGGGGGACTCGCCACCGCTCTCCGTTCCGTGGGTGTCTCTGCACTCTGCTTTGCTCCTCTTCTTCCCCCCCTCTGGTTCCACCCCCGCGCGGCGGAGCGCGGGGGAAGGGATCCACAGATGCTGTTCTGCTGCCCTGCTTCTCCTCCCCCTCCAATCCAAGCTTCTTCTCTCCCGCCGTTCCGGACGAACAGCTTGTCTCCGACCGTACGTGGCGGGAATGCCGCGCCACGACGCCCTCTCGCGCGGTCTTTCTCGGCCAAGAACCGGTCCCCGCGAGCGCGGAACCGCCACGCGGCAGCAGGTGATGGTGGTGGTTATGGGTCTCCGGAGCAAGAGGGGCGTGGGGAATCGTCCCTCCCGAACGCCGAGGCGCTCGCGTCCTCGCTGCGTGATTGCGGCGGCGCGGACGGCGTCCGGCGGGTGCACGCGGTTGCTGTCCGGTCGCTCGACAGCCTGGGGACGTTCGTCGCCAACAATTTGATCAGCGCGTATGCCAGGTTCGACGAGGTTTCGGATGCCAGGGAGGTGTTCGACGAAATGCCGGAGAGGAGTGTTGTGTCGTGGACGGCGATGATGAATGTGTATCTGAAACTAGGACACTACGGCGAGGTTGTGAGGCTCTTCTTTGATATGGTGGGAAGCGGAGTGCAAGGTAACAGCTTGACTTTTGTTTGCTTGCTGAAATCATGCGGCGAGCGTTGCGATGCTAAGCTAGGGCAGCAGGTCCACTGTTGTATTGTCAAAGGTGGGTGGAGCAATGTGATAGTGGACAGTGCTATTGCACACTTCTATGCTCAATGCGGTGATGTTGCTAGTGCTTCAGCCATATTTGATAAGATGGCCTATCGTGATGTCATCTCATGGACAACAATGATCACAGCTTATGTGCAGCATGGGCATGGGGGCCAAGCTCTTAGAATGTTTTCAGAAATGGTGTCAGAAGGATTTCGACCAAATGAGTTCACTGTGTGCAGTGTCCTCAAGGCTTGTGCAGAAGAGAAAGCTGTGAGATTTGGGAAGCAGCTGCATTGTGCTGTTTTGAAGAAAATGTACAAAAATGACATCCATATCGGCAGTGCCCTTGTCACCATGTATGCTAGATGCGGTGAAGTTTTTGATGCTCAGGCAGTGTTTGATATGATGCCACGAAGAAACACTATTACATGGACTTCTATGATCTCTGGCTATGCACAAAGTGGCCATGGAGAAAAGGCTATCTTGTTGTTCAGAAAGATGAAGATGCGCCGAGTATTTGTTAACAACCTCACCATTGTTGGTCTCCTAAGTGCCTGTGGCTCCTTACAGTCGCCTTATCTTGGAAAGGAATTGCATGCTCAGATAATAAAGAATTCTATGGAAGAAAATCTTCAAATTGGGAGTACACTTGTTTGGTTCTACTGTAAATGTGGAGAGTACACATATGCTGCAAGAATTCTTGAAGCGATGCCTGACCGTGATGCTATCTCATGGACTGCTCTGATTTCCGGCTACAATAATCTAGGTCATAATGTTGAAGCACTTAAATCATTAGATGATATGCTATGGGATGGTGTAAAACCAAATACATACACTTACTCCTCGGCTCTGAAAGCTTGTGCAAAATTGGAGGCTCTGCAATATGGAAGGAAGATCCATGGTTTTGTTAACAAGACTCAAGATTTCTCCAATGTGTTTGTGGGAAGCTCACTTATCGATATGTACATGAGGTGTGGAAAAGTCGACGAAGCCCGAAGTGTCTTTGATGCCATGCCAGAACATAACCTTGTGACATGGAAAGTGATTATTACAGGATTTGCTCAGAATGGCCTCTGTGAAGAGGCTTTGAAGTACATGTACCTAATGCAACAAGAAGGGCATGAGGTTGATGATTTTGTGCTCTCAACAGTTCTGACATCATGTGGAGATCTTCAATGGAAATCCATCTCCTTCTCTGACTCAGTTGCTGGTTCAGTTTCAGCTAGGCAGTAGATTAGTTCTCCCGTGGCAAAGAAGCTAGCACTTCTGTACAGTTACAGAGATTTGTTATTGTGCAAGATCAGAAGACATGTAGCACAAAAAGGTAACTCAAGGAGTGCATACGTGTATATGTACTTTTAAGAGTACCACTACCTTCACTAACCATTTGCCTTTTGGGTTCATTACAAACCATGCATATCTTCAGAAGAAAAATTGTGAAAACTTTAGAATGTTTTTTATGCCTGTTTTAATTCCCACTATGGTTATCTCTATC]

[+] EMBL AK073773             [AAAAATCGCTCGCCCCCCTCCACCTCCACCTCGCTCCCGCCGCCTCCACCACCCATCTCCGCCCTCGTCCGCTCGCCGGCAAGCCGCTGCTGCTGCAGCTGCTTGCTCGTCTCGTCTCCCCATCCCTGGGCGGGGCGCGGTGGGAGGGGGGCGGGGGACTCGCCACCGCTCTCCGTTCCGTGGGTGTCTCTGCACTCTGCTTTGCTCCTCTTCTTCCCCCCCTCTGGTTCCACCCCCGCGCGGCGGAGCGCGGGGGAAGGGATCCACAGATGCTGTTCTGCTGCCCTGCTTCTCCTCCCCCTCCAATCCAAGCTTCTTCTCTCCCGCCGTTCCGGACGAACAGCTTGTCTCCGACCGTACGTGGCGGGAATGCCGCGCCACGACGCCCTCTCGCGCGGTCTTTCTCGGCCAAGAACCGGTCCCCGCGAGCGCGGAACCGCCACGCGGCAGCAGGTGATGGTGGTGGTTATGGGTCTCCGGAGCAAGAGGGGCGTGGGGAATCGTCCCTCCCGAACGCCGAGGCGCTCGCGTCCTCGCTGCGTGATTGCGGCGGCGCGGACGGCGTCCGGCGGGTGCACGCGGTTGCTGTCCGGTCGCTCGACAGCCTGGGGACGTTCGTCGCCAACAATTTGATCAGCGCGTATGCCAGGTTCGACGAGGTTTCGGATGCCAGGGAGGTGTTCGACGAAATGCCGGAGAGGAGTGTTGTGTCGTGGACGGCGATGATGAATGTGTATCTGAAACTAGGACACTACGGCGAGGTTGTGAGGCTCTTCTTTGATATGGTGGGAAGCGGAGTGCAAGGTAACAGCTTGACTTTTGTTTGCTTGCTGAAATCATGCGGCGAGCGTTGCGATGCTAAGCTAGGGCAGCAGGTCCACTGTTGTATTGTCAAAGGTGGGTGGAGCAATGTGATAGTGGACAGTGCTATTGCACACTTCTATGCTCAATGCGGTGATGTTGCTAGTGCTTCAGCCATATTTGATAAGATGGCCTATCGTGATGTCATCTCATGGACAACAATGATCACAGCTTATGTGCAGCATGGGCATGGGGGCCAAGCTCTTAGAATGTTTTCAGAAATGGTGTCAGAAGGATTTCGACCAAATGAGTTCACTGTGTGCAGTGTCCTCAAGGCTTGTGCAGAAGAGAAAGCTGTGAGATTTGGGAAGCAGCTGCATTGTGCTGTTTTGAAGAAAATGTACAAAAATGACATCCATATCGGCAGTGCCCTTGTCACCATGTATGCTAGATGCGGTGAAGTTTTTGATGCTCAGGCAGTGTTTGATATGATGCCACGAAGAAACACTATTACATGGACTTCTATGATCTCTGGCTATGCACAAAGTGGCCATGGAGAAAAGGCTATCTTGTTGTTCAGAAAGATGAAGATGCGCCGAGTATTTGTTAACAACCTCACCATTGTTGGTCTCCTAAGTGCCTGTGGCTCCTTACAGTCGCCTTATCTTGGAAAGGAATTGCATGCTCAGATAATAAAGAATTCTATGGAAGAAAATCTTCAAATTGGGAGTACACTTGTTTGGTTCTACTGTAAATGTGGAGAGTACACATATGCTGCAAGAATTCTTGAAGCGATGCCTGACCGTGATGCTATCTCATGGACTGCTCTGATTTCCGGCTACAATAATCTAGGTCATAATGTTGAAGCACTTAAATCATTAGATGATATGCTATGGGATGGTGTAAAACCAAATACATACACTTACTCCTCGGCTCTGAAAGCTTGTGCAAAATTGGAGGCTCTGCAATATGGAAGGAAGATCCATGGTTTTGTTAACAAGACTCAAGATTTCTCCAATGTGTTTGTGGGAAGCTCACTTATCGATATGTACATGAGGTGTGGAAAAGTCGACGAAGCCCGAAGTGTCTTTGATGCCATGCCAGAACATAACCTTGTGACATGGAAAGTGATTATTACAGGATTTGCTCAGAATGGCCTCTGTGAAGAGGCTTTGAAGTACATGTACCTAATGCAACAAGAAGGGCATGAGGTTGATGATTTTGTGCTCTCAACAGTTCTGACATCATGTGGAGATCTTCAATGGAAATCCATCTCCTTCTCTGACTCAGTTGCTGGTTCAGTTTCAGCTAGGCAGTAGATTAGTTCTCCCGTGGCAAAGAAGCTAGCACTTCTGTACAGTTACAGAGATTTGTTATTGTGCAAGATCAGAAGACATGTAGCACAAAAAGGTAACTCAAGGAGTGCATACGTGTATATGTACTTTTAAGAGTACCACTACCT                                                                                                                       ]
[+] EMBL CB665137             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ACAAAAATGACATCCATATCGGCAGTGCCCTTGTCACCATGTATGCTAGATGCGGTGAAGTTTTTGATGCTCAGGCAGTGTTTGATATGATGCCACGAAGAAACACTATTACATGGACTTCTATGATCTCTGGCTATGCACAAAGTGGCCATGGAGAAAAGGCTATCTTGTTGTTCAGAAAGATGAAGATGCGCCGAGTATTTGTTAACAACCTCACCATTGTTGGTCTCCTAAGTGCCTGTGGCTCCTTACAGTCGCCTTATCTTGGAAAGGAATTGCATGCTCAGATAATAAAGAATTCTATGGAAGAAAATCTTCAAATTGGGAGTACACTTGTTTGGTTCTACTGTAAATGTGGAGAGTACACATATGCTGCAAGAATTCTTGAAGCGATGCCTGACCGTGATGCTATCTCATGGACTGCTCTGATTTCCGGCTACAATAATCTAGGTCATAATGTTGAAGCACTTAAATCATTAGATGATATGCTATGGGATGGTGTAAAACCAAATACATACACTTACTCCTCGGCTCTGAAAGCTTGTGCAAAATTGGAGGCTCTGCAATATGGAAGGAAGATCCATGGTTTTGTTAACAAGACTCAAGATTTCTCCAATGTGTTTGTGGGAAGCTCACTTATCGATATGTACATGAGGTGTGGAAAAGTCGACGAAGCCCGAAGTGTCTTTGATGCCATGCCAGAACATAACCTTGTGACATGGAAAGTGATTATTACAGGATTTGCTCAGAATGGCCTCTGTGAAGAGGCTTTGAAGTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CB665138             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATGCTGCAAGAATTCTTGAAGCGATGCCTGACCGTGATGCTATCTCATGGACTGCTCTGATTTCCGGCTACAATAATCTAGGTCATAATGTTGAAGCACTTAAATCATTAGATGATATGCTATGGGATGGTGTAAAACCAAATACATACACTTACTCCTCGGCTCTGAAAGCTTGTGCAAAATTGGAGGCTCTGCAATATGGAAGGAAGATCCATGGTTTTGTTAACAAGACTCAAGATTTCTCCAATGTGTTTGTGGGAAGCTCACTTATCGATATGTACATGAGGTGTGGAAAAGTCGACGAAGCCCGAAGTGTCTTTGATGCCATGCCAGAACATAACCTTGTGACATGGAAAGTGATTATTACAGGATTTGCTCAGAATGGCCTCTGTGAAGAGGCTTTGAAGTACATGTACCTAATGCAACAAGAAGGGCATGAGGTTGATGATTTTGTGCTCTCAACAGTTCTGACATCATGTGGAGATCTTCAATGGAAATCCATCTCCTTCTCTGACTCAGTTGCTGGTTCAGTTTCAGCTAGGCAGTAGATTAGTTCTCCCGTGGCAAAGAAGCTAGCACTTCTGTACAGTTACAGAGATTTGTTATTGTGCAAGATCAGAAGACATGTAGCACAAAAAGGTAACTCAAGGAGTGCATACGTGTATATGTACTTTTAAGAGTACCACTACCTTCACTAACCATTTGCCTTTTGGGTTCATTACAAACCATGCATATCTTCAGAAGAAAAATTGTGAAAACTTTAGAATGTTTTTTATGCCTGTTTTAATTCCCACTATGGTTATCTCTATC]




>consensus_6041#0
AAAAATCGCTCGCCCCCCTCCACCTCCACCTCGCTCCCGCCGCCTCCACCACCCATCTCC
GCCCTCGTCCGCTCGCCGGCAAGCCGCTGCTGCTGCAGCTGCTTGCTCGTCTCGTCTCCC
CATCCCTGGGCGGGGCGCGGTGGGAGGGGGGCGGGGGACTCGCCACCGCTCTCCGTTCCG
TGGGTGTCTCTGCACTCTGCTTTGCTCCTCTTCTTCCCCCCCTCTGGTTCCACCCCCGCG
CGGCGGAGCGCGGGGGAAGGGATCCACAGATGCTGTTCTGCTGCCCTGCTTCTCCTCCCC
CTCCAATCCAAGCTTCTTCTCTCCCGCCGTTCCGGACGAACAGCTTGTCTCCGACCGTAC
GTGGCGGGAATGCCGCGCCACGACGCCCTCTCGCGCGGTCTTTCTCGGCCAAGAACCGGT
CCCCGCGAGCGCGGAACCGCCACGCGGCAGCAGGTGATGGTGGTGGTTATGGGTCTCCGG
AGCAAGAGGGGCGTGGGGAATCGTCCCTCCCGAACGCCGAGGCGCTCGCGTCCTCGCTGC
GTGATTGCGGCGGCGCGGACGGCGTCCGGCGGGTGCACGCGGTTGCTGTCCGGTCGCTCG
ACAGCCTGGGGACGTTCGTCGCCAACAATTTGATCAGCGCGTATGCCAGGTTCGACGAGG
TTTCGGATGCCAGGGAGGTGTTCGACGAAATGCCGGAGAGGAGTGTTGTGTCGTGGACGG
CGATGATGAATGTGTATCTGAAACTAGGACACTACGGCGAGGTTGTGAGGCTCTTCTTTG
ATATGGTGGGAAGCGGAGTGCAAGGTAACAGCTTGACTTTTGTTTGCTTGCTGAAATCAT
GCGGCGAGCGTTGCGATGCTAAGCTAGGGCAGCAGGTCCACTGTTGTATTGTCAAAGGTG
GGTGGAGCAATGTGATAGTGGACAGTGCTATTGCACACTTCTATGCTCAATGCGGTGATG
TTGCTAGTGCTTCAGCCATATTTGATAAGATGGCCTATCGTGATGTCATCTCATGGACAA
CAATGATCACAGCTTATGTGCAGCATGGGCATGGGGGCCAAGCTCTTAGAATGTTTTCAG
AAATGGTGTCAGAAGGATTTCGACCAAATGAGTTCACTGTGTGCAGTGTCCTCAAGGCTT
GTGCAGAAGAGAAAGCTGTGAGATTTGGGAAGCAGCTGCATTGTGCTGTTTTGAAGAAAA
TGTACAAAAATGACATCCATATCGGCAGTGCCCTTGTCACCATGTATGCTAGATGCGGTG
AAGTTTTTGATGCTCAGGCAGTGTTTGATATGATGCCACGAAGAAACACTATTACATGGA
CTTCTATGATCTCTGGCTATGCACAAAGTGGCCATGGAGAAAAGGCTATCTTGTTGTTCA
GAAAGATGAAGATGCGCCGAGTATTTGTTAACAACCTCACCATTGTTGGTCTCCTAAGTG
CCTGTGGCTCCTTACAGTCGCCTTATCTTGGAAAGGAATTGCATGCTCAGATAATAAAGA
ATTCTATGGAAGAAAATCTTCAAATTGGGAGTACACTTGTTTGGTTCTACTGTAAATGTG
GAGAGTACACATATGCTGCAAGAATTCTTGAAGCGATGCCTGACCGTGATGCTATCTCAT
GGACTGCTCTGATTTCCGGCTACAATAATCTAGGTCATAATGTTGAAGCACTTAAATCAT
TAGATGATATGCTATGGGATGGTGTAAAACCAAATACATACACTTACTCCTCGGCTCTGA
AAGCTTGTGCAAAATTGGAGGCTCTGCAATATGGAAGGAAGATCCATGGTTTTGTTAACA
AGACTCAAGATTTCTCCAATGTGTTTGTGGGAAGCTCACTTATCGATATGTACATGAGGT
GTGGAAAAGTCGACGAAGCCCGAAGTGTCTTTGATGCCATGCCAGAACATAACCTTGTGA
CATGGAAAGTGATTATTACAGGATTTGCTCAGAATGGCCTCTGTGAAGAGGCTTTGAAGT
ACATGTACCTAATGCAACAAGAAGGGCATGAGGTTGATGATTTTGTGCTCTCAACAGTTC
TGACATCATGTGGAGATCTTCAATGGAAATCCATCTCCTTCTCTGACTCAGTTGCTGGTT
CAGTTTCAGCTAGGCAGTAGATTAGTTCTCCCGTGGCAAAGAAGCTAGCACTTCTGTACA
GTTACAGAGATTTGTTATTGTGCAAGATCAGAAGACATGTAGCACAAAAAGGTAACTCAA
GGAGTGCATACGTGTATATGTACTTTTAAGAGTACCACTACCTTCACTAACCATTTGCCT
TTTGGGTTCATTACAAACCATGCATATCTTCAGAAGAAAAATTGTGAAAACTTTAGAATG
TTTTTTATGCCTGTTTTAATTCCCACTATGGTTATCTCTATC
clustalw multiple alignements is not computed in this case