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Oryza sativa
cluster # 6088 cluster # 6088       Sequences # 3       consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6088#0 length = 2635 sequences # 2  
 consensus_6088#1 length = 1511 sequences # 1  
consensusID : consensus_6088#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2635
fasta sequence 
                              [CACCGTCTCCTGCCGCCGTACGTGGTAGTGGAGGATGCTTGGTGAAGTCTCTTCTCGGCTGCTGCGCACATCCCTCCTCTCCCCATTCTCTCCTCTTCGGTTTTCTTGGGTTTCCTTCACCGTTCGGCTGCGCATTGCCTTCCCATCGGAGCTACTTGCCTCAACAGTTTGGTCGGCCGCATGTGCTCGGTCGGGAGGCCCTAGGGCCTCCACTTTATCTGCGAAGGTGATCCAATGAAAGCCTTCTAGATTACCTCCGATCCCATCGCTCCAATCCCTATTTCCATCCGACCTCTCTCATCTAGCCTTCGCCTCCTCCAAAATCCACAATATGGTGTGCCGCTGATATGATTTTCCCCTCCCTCCTCACTAGAAATCCTTTCTTCCATTGGTGACCATGGTAATCCTCACCTCCTCCACCCTTAGGTACCTTCCTGGACGCTATCCTCGCATCTTTGACCAATAGCCACGACCAGGGTCTGCATCACGGCACGGGGACCTAGCCTCACAATCTGAGGTGAAGCAACAGCCATGGCTGCTATTATGCGAGAGGACCATAGTTGTAACTGCTGAATACATCACTGCCTTGCCTTTTCTGGTATGGTAACTGCTCTGGTAATCAGAGAAAATAGGATGCAGACAGACTCAGATCGCCATCTTCTCGAGCACATGATCTACACAAGTAGCCAATTCTGCACAAAGTTAAGTAAACTCTAAACTATATACATTGAATTTTGCTTCCCAATAGCAGTGTAGAAGATAATAGATTTTCTAATTGCTTTTCTTTGTATATGCTCATTACTGTCCTTGGTTTGTGCTTATTCATAACAAGATTGTTTGCCTATCCTTTTTCTCTACAAGATGGGCACATTTAAATGAACTATTTATCATTAATCCATGATGGAGATAATGCGTTGAAAGCTCAGTTAGTCCGTTGCTTATTAATTTAAGTTAACCATTTTTCTTAGGTCAATTATTATCTTACATTAACATAATAGAGAAAAATTTTCACTTTTGAGAGGATTCAACACAATGTTTCATTCAAACAAGCGCCTTCAGCAACTGTTCATAGAAGTGCATTCTTCTTCTAGAGCAATGTACAATGATTTAGGATTTGACAAAGTAATTTTCAATTTATCAGGACTGATTTCTCATAATTACATCTTCATTTCATATTGGCCAGAGCATTGCCAGTGAGCGCGCTATAACTGTGGTATCCCAATCAGTGGCACTAAGTTTTAGGTTGACTGCAATGCTTTTTCTCTGCAGTTGCTCCTAACTGCAATTTCTTTTTGTCAAACCTCATTGATGTATTCAACAAGTATCAGTCGCTGAAGCAAGTTCTGCTGCAGCACAAATCTAACAGTGTTAGGTTCTCATGTTCTTCTGGTTATACTTAGCATTCTTTAATGTCAATTTATCACATTTCTGGTTATAGTTTCTTACTCTTTTTTTACAGCATCTGTATGAAACAACAACAGTCATTTCAGCATTCTTTCCTGCTGGTAGGAAAAATGTGGACTCATAACAAATGTCCAAAATTGGCGTGTTTCATTTGACCTAAATAGTAAAAAGATAGGCATTAGTACAGTTAGACATGGCTTGTGGGTAATTAGGCTTACCTACATGGTCATTAACTTAGCTATAAAGTTGTTGTTACTTGACAAGATCAGTTAACAGTTAATTGCCAGAACTAAGGCTTACAACTAGTACATCACTTCAGAGAACATACTTACTTAAACCCGCAATTTGCATGTACCGTATTCTTCAGATACGTTGGTTGCCCATATAAAATGGGGTCTTAATTCCTTTACATGCAATAATTCATAAAGTCTGAATTCATCTTCAACAGTGCTTTGGTCACAACCAATTGAAGCAGTAGTTGTAGATATTTCTTACCACACACATTTTTTATTGTAGTGTTCAAATAAAATAAATTCACTCTAAATATTTGCTTGACTAAAACTCAGTTACCTTTATTGCATTTCAGGATTCTGTTATAACCTGAAACATATTTATTCAACCCTTTATAAAGTTACATGTCCATATTATATATTCATATTAATATTAGTTTATTCCAAACTGCACTACAAATAAAGAATTTAACCATTTGGTAGTAATCAGTTGTTGAGCAAAGCTCCCAAATAGCATGTGTAATCAAGTTCTATTGTGTTGTATTCATGCTCTCAAATGGTGGTTACATCTTTATGCCACATTAACTTAGCTAAGCATTGACATTTGACAAGTGAAGTCCTTACATGATTACATATGATTTAATCTTTGTATAGATAAGTTATATAGCATATCCATAGGTTTTAGTTTTGACTTACACAAAGAAACTGCTATATTTAGTCACTGATTAATTCATTTATTTGTTGAGTTATTTCTCTCCTGTTGACTGCACTAATAATTGGTGCTTTATTCACTAGGTCAACATCTTCTCTGTTTATATGTACCTTACCTTACCCATCTTTACGGAATCAGTCACTGCATTGCATCTTTCCCTTTTCTCCATTGATACTATCCTCAATCTATTAGTGTGGTAACACCGGTATATGTTCTATCGAATTGTATGATAGGTGATGCCTTGCTGAATGATATTGGCACGATTGGAAGGATAATAGAGCAAATATTT]

[+] EMBL AK073329             [CACCGTCTCCTGCCGCCGTACGTGGTAGTGGAGGATGCTTGGTGAAGTCTCTTCTCGGCTGCTGCGCACATCCCTCCTCTCCCCATTCTCTCCTCTTCGGTTTTCTTGGGTTTCCTTCACCGTTCGGCTGCGCATTGCCTTCCCATCGGAGCTACTTGCCTCAACAGTTTGGTCGGCCGCATGTGCTCGGTCGGGAGGCCCTAGGGCCTCCACTTTATCTGCGAAGGTGATCCAATGAAAGCCTTCTAGATTACCTCCGATCCCATCGCTCCAATCCCTATTTCCATCCGACCTCTCTCATCTAGCCTTCGCCTCCTCCAAAATCCACAATATGGTGTGCCGCTGATATGATTTTCCCCTCCCTCCTCACTAGAAATCCTTTCTTCCATTGGTGACCATGGTAATCCTCACCTCCTCCACCCTTAGGTACCTTCCTGGACGCTATCCTCGCATCTTTGACCAATAGCCACGACCAGGGTCTGCATCACGGCACGGGGACCTAGCCTCACAATCTGAGGTGAAGCAACAGCCATGGCTGCTATTATGCGAGAGGACCATAGTTGTAACTGCTGAATACATCACTGCCTTGCCTTTTCTGGTATGGTAACTGCTCTGGTAATCAGAGAAAATAGGATGCAGACAGACTCAGATCGCCATCTTCTCGAGCACATGATCTACACAAGTAGCCAATTCTGCACAAAGTTAAGTAAACTCTAAACTATATACATTGAATTTTGCTTCCCAATAGCAGTGTAGAAGATAATAGATTTTCTAATTGCTTTTCTTTGTATATGCTCATTACTGTCCTTGGTTTGTGCTTATTCATAACAAGATTGTTTGCCTATCCTTTTTCTCTACAAGATGGGCACATTTAAATGAACTATTTATCATTAATCCATGATGGAGATAATGCGTTGAAAGCTCAGTTAGTCCGTTGCTTATTAATTTAAGTTAACCATTTTTCTTAGGTCAATTATTATCTTACATTAACATAATAGAGAAAAATTTTCACTTTTGAGAGGATTCAACACAATGTTTCATTCAAACAAGCGCCTTCAGCAACTGTTCATAGAAGTGCATTCTTCTTCTAGAGCAATGTACAATGATTTAGGATTTGACAAAGTAATTTTCAATTTATCAGGACTGATTTCTCATAATTACATCTTCATTTCATATTGGCCAGAGCATTGCCAGTGAGCGCGCTATAACTGTGGTATCCCAATCAGTGGCACTAAGTTTTAGGTTGACTGCAATGCTTTTTCTCTGCAGTTGCTCCTAACTGCAATTTCTTTTTGTCAAACCTCATTGATGTATTCAACAAGTATCAGTCGCTGAAGCAAGTTCTGCTGCAGCACAAATCTAACAGTGTTAGGTTCTCATGTTCTTCTGGTTATACTTAGCATTCTTTAATGTCAATTTATCACATTTCTGGTTATAGTTTCTTACTCTTTTTTTACAGCATCTGTATGAAACAACAACAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AK101657             [                                                                     ATCCCTCCTCTCCCCATTCTCTCCTCTTCGGTTTTCTTGGGTTTCCTTCACCGTTCGGCTGCGCATTGCCTTCCCATCGGAGCTACTTGCCTCAACAGTTTGGTCGGCCGCATGTGCTCGGTCGGGAGGCCCTAGGGCCTCCACTTTATCTGCGAAGGTGATCCAATGAAAGCCTTCTAGATTACCTCCGATCCCATCGCTCCAATCCCTATTTCCATCCGACCTCTCTCATCTAGCCTTCGCCTCCTCCAAAATCCACAATATGGTGTGCCGCTGATATGATTTTCCCCTCCCTCCTCACTAGAAATCCTTTCTTCCATTGGTGACCATGGTAATCCTCACCTCCTCCACCCTTAGGTACCTTCCTGGACGCTATCCTCGCATCTTTGACCAATAGCCACGACCAGGGTCTGCATCACGGCACGGGGACCTAGCCTCACAATCTGAGGTGAAGCAACAGCCATGGCTGCTATTATGCGAGAGGACCATAGTTGTAACTGCTGAATACATCACTGCCTTGCCTTTTCTGGTATGGTAACTGCTCTGGTAATCAGAGAAAATAGGATGCAGACAGACTCAGATCGCCATCTTCTCGAGCACATGATCTACACAAGTAGCCAATTCTGCACAAAGTTAAGTAAACTCTAAACTATATACATTGAATTTTGCTTCCCAATAGCAGTGTAGAAGATAATAGATTTTCTAATTGCTTTTCTTTGTATATGCTCATTACTGTCCTTGGTTTGTGCTTATTCATAACAAGATTGTTTGCCTATCCTTTTTCTCTACAAGATGGGCACATTTAAATGAACTATTTATCATTAATCCATGATGGAGATAATGCGTTGAAAGCTCAGTTAGTCCGTTGCTTATTAATTTAAGTTAACCATTTTTCTTAGGTCAATTATTATCTTACATTAACATAATAGAGAAAAATTTTCACTTTTGAGAGGATTCAACACAATGTTTCATTCAAACAAGCGCCTTCAGCAACTGTTCATAGAAGTGCATTCTTCTTCTAGAGCAATGTACAATGATTTAGGATTTGACAAAGTAATTTTCAATTTATCAGAACTGATTTCTCATAATTACATCTTCATTTCATATTGGCCAGAGCATTGCCAGTGAGCGCGCTATAACTGTGGTATCCCAATCAGTGGCACTAAGTTTTAGGTTGACTGCAATGCTTTTTCTCTGCAGTTGCTCCTAACTGCAATTTCTTTTTGTCAAACCTCATTGATGTATTCAACAAGTATCAGTCGCTGAAGCAAGTTCTGCTGCAGCACAAATCTAACAGTGTTAGGTTCTCATGTTCTTCTGGTTATACTTAGCATTCTTTAATGTCAATTTATCACATTTCTGGTTATAGTTTCTTACTCTTTTTTTACAGCATCTGTATGAAACAACAACAGTCATTTCAGCATTCTTTCCTGCTGGTAGGAAAAATGTGGACTCATAACAAATGTCCAAAATTGGCGTGTTTCATTTGACCTAAATAGTAAAAAGATAGGCATTAGTACAGTTAGACATGGCTTGTGGGTAATTAGGCTTACCTACATGGTCATTAACTTAGCTATAAAGTTGTTGTTACTTGACAAGATCAGTTAACAGTTAATTGCCAGAACTAAGGCTTACAACTAGTACATCACTTCAGAGAACATACTTACTTAAACCCGCAATTTGCATGTACCGTATTCTTCAGATACGTTGGTTGCCCATATAAAATGGGGTCTTAATTCCTTTACATGCAATAATTCATAAAGTCTGAATTCATCTTCAACAGTGCTTTGGTCACAACCAATTGAAGCAGTAGTTGTAGATATTTCTTACCACACACATTTTTTATTGTAGTGTTCAAATAAAATAAATTCACTCTAAATATTTGCTTGACTAAAACTCAGTTACCTTTATTGCATTTCAGGATTCTGTTATAACCTGAAACATATTTATTCAACCCTTTATAAAGTTACATGTCCATATTATATATTCATATTAATATTAGTTTATTCCAAACTGCACTACAAATAAAGAATTTAACCATTTGGTAGTAATCAGTTGTTGAGCAAAGCTCCCAAATAGCATGTGTAATCAAGTTCTATTGTGTTGTATTCATGCTCTCAAATGGTGGTTACATCTTTATGCCACATTAACTTAGCTAAGCATTGACATTTGACAAGTGAAGTCCTTACATGATTACATATGATTTAATCTTTGTATAGATAAGTTATATAGCATATCCATAGGTTTTAGTTTTGACTTACACAAAGAAACTGCTATATTTAGTCACTGATTAATTCATTTATTTGTTGAGTTATTTCTCTCCTGTTGACTGCACTAATAATTGGTGCTTTATTCACTAGGTCAACATCTTCTCTGTTTATATGTACCTTACCTTACCCATCTTTACGGAATCAGTCACTGCATTGCATCTTTCCCTTTTCTCCATTGATACTATCCTCAATCTATTAGTGTGGTAACACCGGTATATGTTCTATCGAATTGTATGATAGGTGATGCCTTGCTGAATGATATTGGCACGATTGGAAGGATAATAGAGCAAATATTT]




>consensus_6088#0
CACCGTCTCCTGCCGCCGTACGTGGTAGTGGAGGATGCTTGGTGAAGTCTCTTCTCGGCT
GCTGCGCACATCCCTCCTCTCCCCATTCTCTCCTCTTCGGTTTTCTTGGGTTTCCTTCAC
CGTTCGGCTGCGCATTGCCTTCCCATCGGAGCTACTTGCCTCAACAGTTTGGTCGGCCGC
ATGTGCTCGGTCGGGAGGCCCTAGGGCCTCCACTTTATCTGCGAAGGTGATCCAATGAAA
GCCTTCTAGATTACCTCCGATCCCATCGCTCCAATCCCTATTTCCATCCGACCTCTCTCA
TCTAGCCTTCGCCTCCTCCAAAATCCACAATATGGTGTGCCGCTGATATGATTTTCCCCT
CCCTCCTCACTAGAAATCCTTTCTTCCATTGGTGACCATGGTAATCCTCACCTCCTCCAC
CCTTAGGTACCTTCCTGGACGCTATCCTCGCATCTTTGACCAATAGCCACGACCAGGGTC
TGCATCACGGCACGGGGACCTAGCCTCACAATCTGAGGTGAAGCAACAGCCATGGCTGCT
ATTATGCGAGAGGACCATAGTTGTAACTGCTGAATACATCACTGCCTTGCCTTTTCTGGT
ATGGTAACTGCTCTGGTAATCAGAGAAAATAGGATGCAGACAGACTCAGATCGCCATCTT
CTCGAGCACATGATCTACACAAGTAGCCAATTCTGCACAAAGTTAAGTAAACTCTAAACT
ATATACATTGAATTTTGCTTCCCAATAGCAGTGTAGAAGATAATAGATTTTCTAATTGCT
TTTCTTTGTATATGCTCATTACTGTCCTTGGTTTGTGCTTATTCATAACAAGATTGTTTG
CCTATCCTTTTTCTCTACAAGATGGGCACATTTAAATGAACTATTTATCATTAATCCATG
ATGGAGATAATGCGTTGAAAGCTCAGTTAGTCCGTTGCTTATTAATTTAAGTTAACCATT
TTTCTTAGGTCAATTATTATCTTACATTAACATAATAGAGAAAAATTTTCACTTTTGAGA
GGATTCAACACAATGTTTCATTCAAACAAGCGCCTTCAGCAACTGTTCATAGAAGTGCAT
TCTTCTTCTAGAGCAATGTACAATGATTTAGGATTTGACAAAGTAATTTTCAATTTATCA
GGACTGATTTCTCATAATTACATCTTCATTTCATATTGGCCAGAGCATTGCCAGTGAGCG
CGCTATAACTGTGGTATCCCAATCAGTGGCACTAAGTTTTAGGTTGACTGCAATGCTTTT
TCTCTGCAGTTGCTCCTAACTGCAATTTCTTTTTGTCAAACCTCATTGATGTATTCAACA
AGTATCAGTCGCTGAAGCAAGTTCTGCTGCAGCACAAATCTAACAGTGTTAGGTTCTCAT
GTTCTTCTGGTTATACTTAGCATTCTTTAATGTCAATTTATCACATTTCTGGTTATAGTT
TCTTACTCTTTTTTTACAGCATCTGTATGAAACAACAACAGTCATTTCAGCATTCTTTCC
TGCTGGTAGGAAAAATGTGGACTCATAACAAATGTCCAAAATTGGCGTGTTTCATTTGAC
CTAAATAGTAAAAAGATAGGCATTAGTACAGTTAGACATGGCTTGTGGGTAATTAGGCTT
ACCTACATGGTCATTAACTTAGCTATAAAGTTGTTGTTACTTGACAAGATCAGTTAACAG
TTAATTGCCAGAACTAAGGCTTACAACTAGTACATCACTTCAGAGAACATACTTACTTAA
ACCCGCAATTTGCATGTACCGTATTCTTCAGATACGTTGGTTGCCCATATAAAATGGGGT
CTTAATTCCTTTACATGCAATAATTCATAAAGTCTGAATTCATCTTCAACAGTGCTTTGG
TCACAACCAATTGAAGCAGTAGTTGTAGATATTTCTTACCACACACATTTTTTATTGTAG
TGTTCAAATAAAATAAATTCACTCTAAATATTTGCTTGACTAAAACTCAGTTACCTTTAT
TGCATTTCAGGATTCTGTTATAACCTGAAACATATTTATTCAACCCTTTATAAAGTTACA
TGTCCATATTATATATTCATATTAATATTAGTTTATTCCAAACTGCACTACAAATAAAGA
ATTTAACCATTTGGTAGTAATCAGTTGTTGAGCAAAGCTCCCAAATAGCATGTGTAATCA
AGTTCTATTGTGTTGTATTCATGCTCTCAAATGGTGGTTACATCTTTATGCCACATTAAC
TTAGCTAAGCATTGACATTTGACAAGTGAAGTCCTTACATGATTACATATGATTTAATCT
TTGTATAGATAAGTTATATAGCATATCCATAGGTTTTAGTTTTGACTTACACAAAGAAAC
TGCTATATTTAGTCACTGATTAATTCATTTATTTGTTGAGTTATTTCTCTCCTGTTGACT
GCACTAATAATTGGTGCTTTATTCACTAGGTCAACATCTTCTCTGTTTATATGTACCTTA
CCTTACCCATCTTTACGGAATCAGTCACTGCATTGCATCTTTCCCTTTTCTCCATTGATA
CTATCCTCAATCTATTAGTGTGGTAACACCGGTATATGTTCTATCGAATTGTATGATAGG
TGATGCCTTGCTGAATGATATTGGCACGATTGGAAGGATAATAGAGCAAATATTT

consensusID : consensus_6088#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 1511
fasta sequence 
                              [TCACTGCAATTGCTTTTTGTCAAGCCTCATTGATGTATTCAACAAGTATCAGTCGCTGAAGCAAGTTCTGCTGCAGCACAAATCTAACAGTGTTAGGTTCTTATGTTCTTCTGGTTATACCTAGCATTCTTCAATGCCAATTTATCACATTTCTAGGTGCCTTTTCTGGTTATAGTTTCTTACTCTATTTTTATAGCATCTATATGAAGCAGCAATAGTCATTTCAGGATTCTTTCCTGCTGGTAGGACAGATGTGGAATCATAACAAATGTCCAAATTTGGCGTGTTTCATATGACCTAAGTAGCAAAAAGATAGGCATTAGTACAATTAGACATGGCTTGTGGGTAATAAGGCTTAGCTATATGGTCATTAACTTAGCTATAAAGTTGTTACTTGACCAGATCAGCTATCTGGCAGAACTAAGACTTACAACTGGCACATCACTTCAGAGAACATACTTGCTTAGACCTGCAACTTGCATGTACCATATTCTTCAGATACGTTGGTTGCCCATATAAAATGGGGTCTTAATTCCTTTACGTGCAATAATTCATAAAGTCTGAATTCATCTTCAACAGTGCTTTGGTCACAACCAATTGAAAGCTGTAGATATTTCTTACCACACACATTCCTTATGGTAGTGTTCAAATAAAATAAATTTACTCTAAATATTTGCTTGACTGAAAGACAATTTACCTTTATTGCATTTCAGGATTCAGTTATACCCTAAAACAGATTTATTTGACCCTTTATAAAGTTACATGTCCATATTATATATTCATATTAATATTAGTTTATTCCAAGCTACAGTCCAAATAAATAATTGAACCATTTGGTAGTAATCAGTTGTTGAGCAAAGCTCCCAAATAGCACGTGTAATCAAGTTCTATTGTGTTGTATTCATACTCTCAGATGGTGGTTAGATCTTTATGCCACATTATGACTTAATGAATGTATCCTCTTATGTGAATTAGCTAAGCATTGACAAGTGAAGTCCTTGCATGATTACATCTTATTTAATCTTTGTAAGATAAGTTAATTAGCATATCCATATGTTTTTAGTTTTGACTTACACAAAGAAACTGCTATATTTAGTCACTGGCTAATTCATTACTTCGTTGAGTTATTTCTCTCTTCTGTTGACTGCAGTAATAACTGGTGCTTTCTTCACTAGGTCAACATCTCCTTTGTTTATATATACCTTACCCATCTTTACGGAATCACATTCACTGCACTTGCATCTTTTTCCCTTTTCTCCATTGATACTATCCTCAATCTATTAGTGTGGTAACACCGGTATATATTCTGTTGAATTGTATGATAGGTGATGCCTTTCTGAATGATATTGGTACAATTGGAAGGATAATAGAGCAAAGATTTACCTTTTGTTTTTATGGTGTCCTGGCCATAGTCAAACACGGGAGATCACCATACATTAGTTGATTCTGCCTAATTCTAATACCAATGTAATTGCAAGTTGACATTGATTTCAGACACCGCTTTGTGTAAA]

[+] EMBL AK068575             [TCACTGCAATTGCTTTTTGTCAAGCCTCATTGATGTATTCAACAAGTATCAGTCGCTGAAGCAAGTTCTGCTGCAGCACAAATCTAACAGTGTTAGGTTCTTATGTTCTTCTGGTTATACCTAGCATTCTTCAATGCCAATTTATCACATTTCTAGGTGCCTTTTCTGGTTATAGTTTCTTACTCTATTTTTATAGCATCTATATGAAGCAGCAATAGTCATTTCAGGATTCTTTCCTGCTGGTAGGACAGATGTGGAATCATAACAAATGTCCAAATTTGGCGTGTTTCATATGACCTAAGTAGCAAAAAGATAGGCATTAGTACAATTAGACATGGCTTGTGGGTAATAAGGCTTAGCTATATGGTCATTAACTTAGCTATAAAGTTGTTACTTGACCAGATCAGCTATCTGGCAGAACTAAGACTTACAACTGGCACATCACTTCAGAGAACATACTTGCTTAGACCTGCAACTTGCATGTACCATATTCTTCAGATACGTTGGTTGCCCATATAAAATGGGGTCTTAATTCCTTTACGTGCAATAATTCATAAAGTCTGAATTCATCTTCAACAGTGCTTTGGTCACAACCAATTGAAAGCTGTAGATATTTCTTACCACACACATTCCTTATGGTAGTGTTCAAATAAAATAAATTTACTCTAAATATTTGCTTGACTGAAAGACAATTTACCTTTATTGCATTTCAGGATTCAGTTATACCCTAAAACAGATTTATTTGACCCTTTATAAAGTTACATGTCCATATTATATATTCATATTAATATTAGTTTATTCCAAGCTACAGTCCAAATAAATAATTGAACCATTTGGTAGTAATCAGTTGTTGAGCAAAGCTCCCAAATAGCACGTGTAATCAAGTTCTATTGTGTTGTATTCATACTCTCAGATGGTGGTTAGATCTTTATGCCACATTATGACTTAATGAATGTATCCTCTTATGTGAATTAGCTAAGCATTGACAAGTGAAGTCCTTGCATGATTACATCTTATTTAATCTTTGTAAGATAAGTTAATTAGCATATCCATATGTTTTTAGTTTTGACTTACACAAAGAAACTGCTATATTTAGTCACTGGCTAATTCATTACTTCGTTGAGTTATTTCTCTCTTCTGTTGACTGCAGTAATAACTGGTGCTTTCTTCACTAGGTCAACATCTCCTTTGTTTATATATACCTTACCCATCTTTACGGAATCACATTCACTGCACTTGCATCTTTTTCCCTTTTCTCCATTGATACTATCCTCAATCTATTAGTGTGGTAACACCGGTATATATTCTGTTGAATTGTATGATAGGTGATGCCTTTCTGAATGATATTGGTACAATTGGAAGGATAATAGAGCAAAGATTTACCTTTTGTTTTTATGGTGTCCTGGCCATAGTCAAACACGGGAGATCACCATACATTAGTTGATTCTGCCTAATTCTAATACCAATGTAATTGCAAGTTGACATTGATTTCAGACACCGCTTTGTGTAAA]




>consensus_6088#1
TCACTGCAATTGCTTTTTGTCAAGCCTCATTGATGTATTCAACAAGTATCAGTCGCTGAA
GCAAGTTCTGCTGCAGCACAAATCTAACAGTGTTAGGTTCTTATGTTCTTCTGGTTATAC
CTAGCATTCTTCAATGCCAATTTATCACATTTCTAGGTGCCTTTTCTGGTTATAGTTTCT
TACTCTATTTTTATAGCATCTATATGAAGCAGCAATAGTCATTTCAGGATTCTTTCCTGC
TGGTAGGACAGATGTGGAATCATAACAAATGTCCAAATTTGGCGTGTTTCATATGACCTA
AGTAGCAAAAAGATAGGCATTAGTACAATTAGACATGGCTTGTGGGTAATAAGGCTTAGC
TATATGGTCATTAACTTAGCTATAAAGTTGTTACTTGACCAGATCAGCTATCTGGCAGAA
CTAAGACTTACAACTGGCACATCACTTCAGAGAACATACTTGCTTAGACCTGCAACTTGC
ATGTACCATATTCTTCAGATACGTTGGTTGCCCATATAAAATGGGGTCTTAATTCCTTTA
CGTGCAATAATTCATAAAGTCTGAATTCATCTTCAACAGTGCTTTGGTCACAACCAATTG
AAAGCTGTAGATATTTCTTACCACACACATTCCTTATGGTAGTGTTCAAATAAAATAAAT
TTACTCTAAATATTTGCTTGACTGAAAGACAATTTACCTTTATTGCATTTCAGGATTCAG
TTATACCCTAAAACAGATTTATTTGACCCTTTATAAAGTTACATGTCCATATTATATATT
CATATTAATATTAGTTTATTCCAAGCTACAGTCCAAATAAATAATTGAACCATTTGGTAG
TAATCAGTTGTTGAGCAAAGCTCCCAAATAGCACGTGTAATCAAGTTCTATTGTGTTGTA
TTCATACTCTCAGATGGTGGTTAGATCTTTATGCCACATTATGACTTAATGAATGTATCC
TCTTATGTGAATTAGCTAAGCATTGACAAGTGAAGTCCTTGCATGATTACATCTTATTTA
ATCTTTGTAAGATAAGTTAATTAGCATATCCATATGTTTTTAGTTTTGACTTACACAAAG
AAACTGCTATATTTAGTCACTGGCTAATTCATTACTTCGTTGAGTTATTTCTCTCTTCTG
TTGACTGCAGTAATAACTGGTGCTTTCTTCACTAGGTCAACATCTCCTTTGTTTATATAT
ACCTTACCCATCTTTACGGAATCACATTCACTGCACTTGCATCTTTTTCCCTTTTCTCCA
TTGATACTATCCTCAATCTATTAGTGTGGTAACACCGGTATATATTCTGTTGAATTGTAT
GATAGGTGATGCCTTTCTGAATGATATTGGTACAATTGGAAGGATAATAGAGCAAAGATT
TACCTTTTGTTTTTATGGTGTCCTGGCCATAGTCAAACACGGGAGATCACCATACATTAG
TTGATTCTGCCTAATTCTAATACCAATGTAATTGCAAGTTGACATTGATTTCAGACACCG
CTTTGTGTAAA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_6088#0      CACCGTCTCCTGCCGCCGTACGTGGTAGTGGAGGATGCTTGGTGAAGTCTCTTCTCGGCT 60
consensus_6088#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6088#0      GCTGCGCACATCCCTCCTCTCCCCATTCTCTCCTCTTCGGTTTTCTTGGGTTTCCTTCAC 120
consensus_6088#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6088#0      CGTTCGGCTGCGCATTGCCTTCCCATCGGAGCTACTTGCCTCAACAGTTTGGTCGGCCGC 180
consensus_6088#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6088#0      ATGTGCTCGGTCGGGAGGCCCTAGGGCCTCCACTTTATCTGCGAAGGTGATCCAATGAAA 240
consensus_6088#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6088#0      GCCTTCTAGATTACCTCCGATCCCATCGCTCCAATCCCTATTTCCATCCGACCTCTCTCA 300
consensus_6088#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6088#0      TCTAGCCTTCGCCTCCTCCAAAATCCACAATATGGTGTGCCGCTGATATGATTTTCCCCT 360
consensus_6088#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6088#0      CCCTCCTCACTAGAAATCCTTTCTTCCATTGGTGACCATGGTAATCCTCACCTCCTCCAC 420
consensus_6088#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6088#0      CCTTAGGTACCTTCCTGGACGCTATCCTCGCATCTTTGACCAATAGCCACGACCAGGGTC 480
consensus_6088#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6088#0      TGCATCACGGCACGGGGACCTAGCCTCACAATCTGAGGTGAAGCAACAGCCATGGCTGCT 540
consensus_6088#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6088#0      ATTATGCGAGAGGACCATAGTTGTAACTGCTGAATACATCACTGCCTTGCCTTTTCTGGT 600
consensus_6088#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6088#0      ATGGTAACTGCTCTGGTAATCAGAGAAAATAGGATGCAGACAGACTCAGATCGCCATCTT 660
consensus_6088#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6088#0      CTCGAGCACATGATCTACACAAGTAGCCAATTCTGCACAAAGTTAAGTAAACTCTAAACT 720
consensus_6088#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6088#0      ATATACATTGAATTTTGCTTCCCAATAGCAGTGTAGAAGATAATAGATTTTCTAATTGCT 780
consensus_6088#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6088#0      TTTCTTTGTATATGCTCATTACTGTCCTTGGTTTGTGCTTATTCATAACAAGATTGTTTG 840
consensus_6088#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6088#0      CCTATCCTTTTTCTCTACAAGATGGGCACATTTAAATGAACTATTTATCATTAATCCATG 900
consensus_6088#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6088#0      ATGGAGATAATGCGTTGAAAGCTCAGTTAGTCCGTTGCTTATTAATTTAAGTTAACCATT 960
consensus_6088#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6088#0      TTTCTTAGGTCAATTATTATCTTACATTAACATAATAGAGAAAAATTTTCACTTTTGAGA 1020
consensus_6088#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6088#0      GGATTCAACACAATGTTTCATTCAAACAAGCGCCTTCAGCAACTGTTCATAGAAGTGCAT 1080
consensus_6088#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6088#0      TCTTCTTCTAGAGCAATGTACAATGATTTAGGATTTGACAAAGTAATTTTCAATTTATCA 1140
consensus_6088#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6088#0      GGACTGATTTCTCATAATTACATCTTCATTTCATATTGGCCAGAGCATTGCCAGTGAGCG 1200
consensus_6088#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6088#0      CGCTATAACTGTGGTATCCCAATCAGTGGCACTAAGTTTTAGGTTGACTGCAATGCTTTT 1260
consensus_6088#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6088#0      TCTCTGCAGTTGCTCCTAACTGCAATTTCTTTTTGTCAAACCTCATTGATGTATTCAACA 1320
consensus_6088#1      ----------------TCACTGCAATTGCTTTTTGTCAAGCCTCATTGATGTATTCAACA 44
                                      * ********* *********** ********************

consensus_6088#0      AGTATCAGTCGCTGAAGCAAGTTCTGCTGCAGCACAAATCTAACAGTGTTAGGTTCTCAT 1380
consensus_6088#1      AGTATCAGTCGCTGAAGCAAGTTCTGCTGCAGCACAAATCTAACAGTGTTAGGTTCTTAT 104
                      ********************************************************* **

consensus_6088#0      GTTCTTCTGGTTATACTTAGCATTCTTTAATGTCAATTTATCACATTTCT---------- 1430
consensus_6088#1      GTTCTTCTGGTTATACCTAGCATTCTTCAATGCCAATTTATCACATTTCTAGGTGCCTTT 164
                      **************** ********** **** *****************          

consensus_6088#0      ---GGTTATAGTTTCTTACTCTTTTTTTACAGCATCTGTATGAAACAACAACAGTCATTT 1487
consensus_6088#1      TCTGGTTATAGTTTCTTACTCTATTTTTATAGCATCTATATGAAGCAGCAATAGTCATTT 224
                         ******************* ****** ******* ****** ** *** ********

consensus_6088#0      CAGCATTCTTTCCTGCTGGTAGGAAAAATGTGGACTCATAACAAATGTCCAAAATTGGCG 1547
consensus_6088#1      CAGGATTCTTTCCTGCTGGTAGGACAGATGTGGAATCATAACAAATGTCCAAATTTGGCG 284
                      *** ******************** * ******* ****************** ******

consensus_6088#0      TGTTTCATTTGACCTAAATAGTAAAAAGATAGGCATTAGTACAGTTAGACATGGCTTGTG 1607
consensus_6088#1      TGTTTCATATGACCTAAGTAGCAAAAAGATAGGCATTAGTACAATTAGACATGGCTTGTG 344
                      ******** ******** *** ********************* ****************

consensus_6088#0      GGTAATTAGGCTTACCTACATGGTCATTAACTTAGCTATAAAGTTGTTGTTACTTGACAA 1667
consensus_6088#1      GGTAATAAGGCTTAGCTATATGGTCATTAACTTAGCTATAAAGTTG---TTACTTGACCA 401
                      ****** ******* *** ***************************   ********* *

consensus_6088#0      GATCAGTTAACAGTTAATTGCCAGAACTAAGGCTTACAACTAGTACATCACTTCAGAGAA 1727
consensus_6088#1      GATCAGCTATC-------TGGCAGAACTAAGACTTACAACTGGCACATCACTTCAGAGAA 454
                      ****** ** *       ** ********** ********* * ****************

consensus_6088#0      CATACTTACTTAAACCCGCAATTTGCATGTACCGTATTCTTCAGATACGTTGGTTGCCCA 1787
consensus_6088#1      CATACTTGCTTAGACCTGCAACTTGCATGTACCATATTCTTCAGATACGTTGGTTGCCCA 514
                      ******* **** *** **** *********** **************************

consensus_6088#0      TATAAAATGGGGTCTTAATTCCTTTACATGCAATAATTCATAAAGTCTGAATTCATCTTC 1847
consensus_6088#1      TATAAAATGGGGTCTTAATTCCTTTACGTGCAATAATTCATAAAGTCTGAATTCATCTTC 574
                      *************************** ********************************

consensus_6088#0      AACAGTGCTTTGGTCACAACCAATTGAAGCAGTAGTTGTAGATATTTCTTACCACACACA 1907
consensus_6088#1      AACAGTGCTTTGGTCACAACCAATTGAA-----AGCTGTAGATATTTCTTACCACACACA 629
                      ****************************     ** ************************

consensus_6088#0      TTTTTTATTGTAGTGTTCAAATAAAATAAATTCACTCTAAATATTTGCTTGACTAAAACT 1967
consensus_6088#1      TTCCTTATGGTAGTGTTCAAATAAAATAAATTTACTCTAAATATTTGCTTGACTGAAAGA 689
                      **  **** *********************** ********************* ***  

consensus_6088#0      CAGTT-ACCTTTATTGCATTTCAGGATTCTGTTATAACCTGAAACATATTTATTCAACCC 2026
consensus_6088#1      CAATTTACCTTTATTGCATTTCAGGATTCAGTTATACCCTAAAACAGATTTATTTGACCC 749
                      ** ** *********************** ****** *** ***** *******  ****

consensus_6088#0      TTTATAAAGTTACATGTCCATATTATATATTCATATTAATATTAGTTTATTCCAAACTGC 2086
consensus_6088#1      TTTATAAAGTTACATGTCCATATTATATATTCATATTAATATTAGTTTATTCCAAGCTAC 809
                      ******************************************************* ** *

consensus_6088#0      ACTACAAATAAAGAATTTAACCATTTGGTAGTAATCAGTTGTTGAGCAAAGCTCCCAAAT 2146
consensus_6088#1      AGTCCAAATAAATAATTGAACCATTTGGTAGTAATCAGTTGTTGAGCAAAGCTCCCAAAT 869
                      * * ******** **** ******************************************

consensus_6088#0      AGCATGTGTAATCAAGTTCTATTGTGTTGTATTCATGCTCTCAAATGGTGGTTACATCTT 2206
consensus_6088#1      AGCACGTGTAATCAAGTTCTATTGTGTTGTATTCATACTCTCAGATGGTGGTTAGATCTT 929
                      **** ******************************* ****** ********** *****

consensus_6088#0      TATGCCACATTA--ACTTAGCTAA-GCATTGACAT------------------TTGACAA 2245
consensus_6088#1      TATGCCACATTATGACTTAATGAATGTATCCTCTTATGTGAATTAGCTAAGCATTGACAA 989
                      ************  *****   ** * **   * *                  *******

consensus_6088#0      GTGAAGTCCTTACATGATTACATATGATTTAATCTTTGTATAGATAAGTTATATAGCATA 2305
consensus_6088#1      GTGAAGTCCTTGCATGATTACATCTTATTTAATCTTTGTA-AGATAAGTTAATTAGCATA 1048
                      *********** *********** * ************** **********  *******

consensus_6088#0      TCCATAGGTTTT-AGTTTTGACTTACACAAAGAAACTGCTATATTTAGTCACTGATTAAT 2364
consensus_6088#1      TCCATATGTTTTTAGTTTTGACTTACACAAAGAAACTGCTATATTTAGTCACTGGCTAAT 1108
                      ****** ***** *****************************************  ****

consensus_6088#0      TCATTTATTTGTTGAGTTATTTCTCTC--CTGTTGACTGCACTAATAATTGGTGCTTTAT 2422
consensus_6088#1      TCATTACTTCGTTGAGTTATTTCTCTCTTCTGTTGACTGCAGTAATAACTGGTGCTTTCT 1168
                      *****  ** *****************  ************ ****** ********* *

consensus_6088#0      TCACTAGGTCAACATCTTCTCTGTTTATATGTACCTTACCTTACCCATCTTTACGGAATC 2482
consensus_6088#1      TCACTAGGTCAACATCTCCTTTGTTTATATATACCTT-----ACCCATCTTTACGGAATC 1223
                      ***************** ** ********* ******     ******************

consensus_6088#0      AG--TCACTGCA-TTGCATCTTT--CCCTTTTCTCCATTGATACTATCCTCAATCTATTA 2537
consensus_6088#1      ACATTCACTGCACTTGCATCTTTTTCCCTTTTCTCCATTGATACTATCCTCAATCTATTA 1283
                      *   ******** **********  ***********************************

consensus_6088#0      GTGTGGTAACACCGGTATATGTTCTATCGAATTGTATGATAGGTGATGCCTTGCTGAATG 2597
consensus_6088#1      GTGTGGTAACACCGGTATATATTCTGTTGAATTGTATGATAGGTGATGCCTTTCTGAATG 1343
                      ******************** **** * ************************ *******

consensus_6088#0      ATATTGGCACGATTGGAAGGATAATAGAGCAAATATTT---------------------- 2635
consensus_6088#1      ATATTGGTACAATTGGAAGGATAATAGAGCAAAGATTTACCTTTTGTTTTTATGGTGTCC 1403
                      ******* ** ********************** ****                      

consensus_6088#0      ------------------------------------------------------------
consensus_6088#1      TGGCCATAGTCAAACACGGGAGATCACCATACATTAGTTGATTCTGCCTAATTCTAATAC 1463
                                                                                  

consensus_6088#0      ------------------------------------------------
consensus_6088#1      CAATGTAATTGCAAGTTGACATTGATTTCAGACACCGCTTTGTGTAAA 1511


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)