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Oryza sativa
cluster # 6122 cluster # 6122       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6122#0 length = 990 sequences # 4  
consensusID : consensus_6122#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 990
fasta sequence 
                              [GTCGCCCCCCCTCTCCCGGCTCGCGCCGTCACGCGACGCGCCGCGCCGCGACGCCGACGCGAGCTCGCGGGGTTACAAAGACAGCTAGCTCGCCTCGCCTCGCCTCGCCGCGCCGCGCCGCCGCCACCCGCACGCCCGCATAGCGGAGGCCGGGCGGCATTCGGGCCGATTTGGCGAGCTGGGGGAGCCGGCGGATGGGAGATCTGGCGGCGGGGTTGGAGGAGGAGGAGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGTCGAGATAGTGAGCGCGGCTAGAGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGTCGAGATGGTGAGCGCGGCCTCTAGCCGCGCGGGAGGCGGCCCCGCTCGACACGCCCCGAGGGGCGGCGCGGGGCCCGGGAGCCCGCGGGTCTCTGCGCAGCGAAGGAGGTGGTGGTGGTGGGCGGCGCCGCTGCCCTCGGCCTCGGGCGCGTCGTCGCTGGAGCGCGTGGCGCTCGC-GTTCTTCCTGGCCTCCGTGGCGCTCGTGCTGTCCTGCGCGCTCTACCTCTACGTGTTCCGGTACCTCGGCCGTGGGAGCGCCGTCGCCGGCTTCGTCGGCCGGGACCTCGAGCCGTGCGACGTGTTCGACGGCGCCTGGGTGCCCGACGCCGGGTACCCGCTGTACAACAGCTCGCTGTGCCCGTTCGCGGAGCGCGGGTTCAACTGCCTGGCCAACGGGCGGAGGGACACCGGGTACCTCAAGTGGCGGTGGAAGCCGCGGCGGTGCGACGCGCCGAGGTTCACCGCCCGCGCCGCGCTGGAGCGGCTGCGCGGGAAGCGGGTCGTGTTCGTGGGGGACTCCATGAGCCGCACGCAGTGGGAGTCCTTCATCTGCATGCTCATGGCCGGCGTGGACGACCCCAAGACGGTGTA-GAGGTGAACGGGAACGAGATCACCAAGACGATACGGTCCTTGGCGGTGAGGTTCGCGTCGTTCGACCTCACCGTGGAGTTCTTCCGCTCGGTGTTCC]

[+] EMBL AK099814             [GTCGCCCCCCCTCTCCCGGCTCGCGCCGTCACGCGACGCGCCGCGCCGCGACGCCGACGCGAGCTCGCGGGGTTACAAAGACAGCTAGCTCGCCTCGCCTCGCCTCGCCGCGCCGCGCCGCCGCCACCCGCACGCCCGCATAGCGGAGGCCGGGCGGCATTCGGGCCGATTTGGCGAGCTGGGGGAGCCGGCGGATGGGAGATCTGGCGGCGGGGTTGGAGGAGGAGGAGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGTCGAGATAGTGAGCGCGGCTAGAGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGTCGAGATGGTGAGCGCGGCCTCTAGCCGCGCGGGAGGCGGCCCCGCTCGACACGCCCCGAGGGGCGGCGCGGGGCCCGGGAGCCCGCGGGTCTCTGCGCAGCGAAGGAGGTGGTGGTGGTGGGCGGCGCCGCTGCCCTCGGCCTCGGGCGCGTCGTCGCTGGAGCGCGTGGCGCTCGC GTTCTTCCTGGCCTCCGTGGCGCTCGTGCTGTCCTGCGCGCTCTACCTCTACGTGTTCCGGTACCTCGGCCGTGGGAGCGCCGTCGCCGGCTTCGTCGGCCGGGACCTCGAGCCGTGCGACGTGTTCGACGGCGCCTGGGTGCCCGACGCCGGGTACCCGCTGTACAACAGCTCGCTGTGCCCGTTCGCGGAGCGCGGGTTCAACTGCCTGGCCAACGGGCGGAGGGACACCGGGTACCTCAAGTGGCGGTGGAAGCCGCGGCGGTGCGACGCGCCGAGGTTCACCGCCCGCGCCGCGCTGGAGCGGCTGCGCGGGAAGCGGGTCGTGTTCGTGGGGGACTCCATGAGCCGCACGCAGTGGGAGTCCTTCATCTGCATGCTCATGGCCGGCGTGGACGACCCCAAGACGGTGTA GAGGTGAACGGGAACGAGATCACCAAGACGATACGGTCCTTGGCGGTGAGGTTCGCGTCGTTCGACCTCACCGTGGAGTTCTTCCGCTCGGTGTTCC]
[+] EMBL CB669792             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GCCTCTATCCGTGCGGGAGGCGGCCCCGCTCGACACGCCCCGAGGGGCGGCGCGGGGCCCGGGAGCCCGCGGGTCTCTGCGCACCGAAGGAGGTGGTGGTGGTGGGCGGCGCCGCTGCCCTCGGCCTCGGGCGCGTCGTCGCTGGAGCGCGTGGCGCTCGCTGTTCTTCCTGGCCTCCGTGGCGCTCGTGCTGTCCTGCGCGCTCTACCTCTACGTGTTCCGGTACCTCGGCCGTGGGAGCGCCGTCGCCGGCTTCCTCGGCCGGGACCTCGAGCCGTGCGACGTGTTCGACGGCGCCTGGGTGCCCGACGCCGGGTACCCGCTGTACAACAGCTCGCTGTGCCCGTTCGCGGAGCGCGGGTTCATCTGCCTGGCCAACGGGCGGAGGGACACCGGGTACCTCAAGTGGCGGTGGAATCCGCGGCGGTGCGACGCTCCGATGTTCACCGCCCGCGCCGCGCTGGAGCGGCTGCTCGGGAAGCGGGTCTTGTTCGTGGGGGACTCCATGAGCCGCACGCAACGGGAGTCCTTCATCTGCATGCTCATGGCCGGCG                                                                                                                        ]
[+] EMBL CB667327             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GCCGCGCGGGAGGCGGCCCCGCTCGACACGCCCCGAGGGGCGGCGCGGGGCCCGGGAGCCCGCGGGTCTCTGCGCAGCGAAGGAGGTGGTGGTGGTGGGCGGCGCCGCTGCCCTCGGCCTCGGGCGCGTCGTCGCTGGAGCGCGTGGCGCTCGC GTTCTTCCTGGCCTCCGTGGCGCTCGTGCTGTCCTGCGCGCTCTACCTCTACGTGTTCCGGTACCTCGGCCGTGGGAGCGCCGTCGaaca                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CB671759             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CCCCGCTCTACACGCCCCGAGGGGCGGCGCGGGGCCCGGGAGCCCGCGGGTCTCTGCGCAGCGAAGGAGGTGGTGGTGGTGGGCGGCGCCGCTGCCCTCGGCCTCGGGCGCGTCGTCGCTGGAGCGCGTGGCGCTCGC GTTCTTCCTGGCCTCCGTGGCGCTCGTGCTGTCCTGCGCGCTCTACCTCTACGTGTTCCGGTACCTCGGCCGTGGGAGCGCCGTCGCCGGCTTCGTCGGCCGGGACCTCGAGCCGTGCGACGTGTTCGACGGCGCCTGGGTGCCCGACGCCGGGTACCCGCTGTACAACAGCTCGCTGTGCCCGTTCGCGGAGCGCGGGTTCAACTGCCTGGCCAACGGGCGGAGGGACACCGGGTACCTCAAGTGGCGGTGGAAGCCGCGGCGGTGCGACGCGCCGAGGTTCACCGCCCGCGCCGCGCTGGAGCGGCTGCGCGGGAAGCGGGTCGTGTTCGTGGGGGACTCCATGAGCCGCACGCAGTGGGAGTCCTTCATCTGCATGCTCATGGCCGGCGTGGACGACCCCAAGACGGTGTACGAGGTGAACGGGAACGAGATCACCAAGACGATACGGTCCTTGGCGGTGAGGTTCGCGTCGTTCGACCTCACCGTGGAGTTCTTCCGCTCGGTGTTCC]




>consensus_6122#0
GTCGCCCCCCCTCTCCCGGCTCGCGCCGTCACGCGACGCGCCGCGCCGCGACGCCGACGC
GAGCTCGCGGGGTTACAAAGACAGCTAGCTCGCCTCGCCTCGCCTCGCCGCGCCGCGCCG
CCGCCACCCGCACGCCCGCATAGCGGAGGCCGGGCGGCATTCGGGCCGATTTGGCGAGCT
GGGGGAGCCGGCGGATGGGAGATCTGGCGGCGGGGTTGGAGGAGGAGGAGGTGGTGGTGG
TGGTGGTGGTGGCGTCGAGATAGTGAGCGCGGCTAGAGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGC
GTCGAGATGGTGAGCGCGGCCTCTAGCCGCGCGGGAGGCGGCCCCGCTCGACACGCCCCG
AGGGGCGGCGCGGGGCCCGGGAGCCCGCGGGTCTCTGCGCAGCGAAGGAGGTGGTGGTGG
TGGGCGGCGCCGCTGCCCTCGGCCTCGGGCGCGTCGTCGCTGGAGCGCGTGGCGCTCGCG
TTCTTCCTGGCCTCCGTGGCGCTCGTGCTGTCCTGCGCGCTCTACCTCTACGTGTTCCGG
TACCTCGGCCGTGGGAGCGCCGTCGCCGGCTTCGTCGGCCGGGACCTCGAGCCGTGCGAC
GTGTTCGACGGCGCCTGGGTGCCCGACGCCGGGTACCCGCTGTACAACAGCTCGCTGTGC
CCGTTCGCGGAGCGCGGGTTCAACTGCCTGGCCAACGGGCGGAGGGACACCGGGTACCTC
AAGTGGCGGTGGAAGCCGCGGCGGTGCGACGCGCCGAGGTTCACCGCCCGCGCCGCGCTG
GAGCGGCTGCGCGGGAAGCGGGTCGTGTTCGTGGGGGACTCCATGAGCCGCACGCAGTGG
GAGTCCTTCATCTGCATGCTCATGGCCGGCGTGGACGACCCCAAGACGGTGTAGAGGTGA
ACGGGAACGAGATCACCAAGACGATACGGTCCTTGGCGGTGAGGTTCGCGTCGTTCGACC
TCACCGTGGAGTTCTTCCGCTCGGTGTTCC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)