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Oryza sativa
cluster # 6142 cluster # 6142       Sequences # 4       consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6142#0 length = 1949 sequences # 2  
 consensus_6142#1 length = 742 sequences # 2  
consensusID : consensus_6142#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1949
fasta sequence 
                              [GAGAGAGAGAGAGAGCTTGTGGAACCCTAACCCTAACCAGGACGGACAGGAGGAGTAGATCCGTTCGATCCCCATGTCGTTCGCCGCTACAAGGATGATGGCGGCAGCCCGGCGCGCCTTCCACTCCAAGGCCGCGGAAGACGTGCGTAGACATCTCGATGCCATGGAAAAGGCCAACCTTGAAAGGTTGCCACAGCTCTTGGATCCCATCATCCGGCAGCGAGCCGCTCGAGATGTCCACCGCAATACCCACAGGATCAAGATCTATGCTAATCCTTGCATAGGGAGGCCACCGCCCGAAGGGCACATTTGGTATGATGTCGCCTGGGCAAAAAATCTTGGTCTAGTTTTTTTTGTCACCTCATTTTTTGGGATGTACGATGTTCTATTCGAGGAGACTCAACAGTCTGACCACCATATGTCCTCCTCGTTGCCAATGCCACCCTCCTAAATTATTCTGTGTAAAATCATCGCTGCCGACCGATTTTAGATTATGAAATAATAATCTCCATGTCCTGTGGTCTTACTCTATGAGGACCTTCTTAATTCTAGCCTTGTGGTCTTATAATCTATTAGTACCTCCTTAATTTAAGCCTTGTGGAAGCACCTACTTAATTTAAGCCTTGTGGGCTTGATGTATCAGCACCTACTTAATTTAAGCTTTTGTGGGCTTGATGTATCAGCACCTACTTAATTTAAGCCTTGTGTGCTTGATGATTTAAAGTAAGTACATCCTTAAACTTAAATTAAGCCTTGTCGTTGTCGTCTTGATGCAACATTACCTCCTTAATTTAAGCCTTGCTGTCCTAATGTTTTTACTACCTCCTCAATTTCATTTGTAGGCCAGTGTCACAACTTAAGAGTAACTTTCCGTGGTAACAGTACCACTATATGTTTTTCTCAACTTTAATTACTGCGTGCACCCAAAGATCCCAAACACAACTTGCTCACTTTTTTTTTCATGCTGCCTTTTGATTATCTGTTTACAATAGGGTTGTTCGGCTGCCCTGGCTGCTGCTACCATAAAATTTCAATACTAGATACTGTATTGGCTGGCTGCAAAGCGGCCATATATAGCTTTACCGAACATCCCTTATGTTGCTAAGATTACAGAAACATTTGTGGTTTAGACGCTTCTTTGTTCACTATTACCGGTACTTAATTGACGGTTTTATGAAACCTATTCTCAAACATCTTCCTAGCAAGGTGACATCATGTTTCATCTTTTCTTTTCATGGGTTAGTTAGTTACCTGTGGCGTTGTTTCAGTAAATGGTAAACTCTTTTGGTAATTCTTGAAGTGATTTGTATTTGAATGGTTTCTTCGAACTGTTTGTGATTTGGCATGTTCTGCAATCAGTTGACATTGTTGTTATTTATAATTTGCTTTCCCTTGTTCTTTCATGATTTTGTGCTGAAATATTATCAAGGTTGGGATAGTTGTTTCCGCTTGGGTTATGATGATACTTGAGCTTGGATTTGGCATATATATTATATTACTACTCTCTTACAATGAACCAGAGGGGAGTGCTTGGGTTCCAATACTGCAGAGCTGCTAGGGTGCATGTAGGCAGTGTTGCCCTTTTGCCTATAAGATGGGCTTGGTAGCCAAGCGCCTAGTCGCTCTTGTTTGCTGCCAAGCTGCATGTTTGGTGTTATTTCTGTTAAGTGATGCATAATTGCGATGAGCAGGTACTTTTGTTCATACTGCAATTTCCATCAGCAGAAATTTCAGTGCTATTAGTTATGGATTACCTGTTGTTTGTCTTTTTTGTTCAGTTTATTGATTTCTGGTTAAATTAAACTTGTGCTGCTGTTTCAATGTCGGTATGTTTGTTGATGAGACGAGTCAGATAGTGTGATACTGAGCTGAGTTACTAGCAACATTTGTACATCGGAGTCGAAGCGATGTAATATATTTGTAACACTTCAAAATTTTATGAATAAATT]

[+] EMBL AK121031             [GAGAGAGAGAGAGAGCTTGTGGAACCCTAACCCTAACCAGGACGGACAGGAGGAGTAGATCCGTTCGATCCCCATGTCGTTCGCCGCTACAAGGATGATGGCGGCAGCCCGGCGCGCCTTCCACTCCAAGGCCGCGGAAGACGTGCGTAGACATCTCGATGCCATGGAAAAGGCCAACCTTGAAAGGTTGCCACAGCTCTTGGATCCCATCATCCGGCAGCGAGCCGCTCGAGATGTCCACCGCAATACCCACAGGATCAAGATCTATGCTAATCCTTGCATAGGGAGGCCACCGCCCGAAGGGCACATTTGGTATGATGTCGCCTGGGCAAAAAATCTTGGTCTAGTTTTTTTTGTCACCTCATTTTTTGGGATGTACGATGTTCTATTCGAGGAGACTCAACAGTCTGACCACCATATGTCCTCCTCGTTGCCAATGCCACCCTCCTAAATTATTCTGTGTAAAATCATCGCTGCCGACCGATTTTAGATTATGAAATAATAATCTCCATGTCCTGTGGTCTTACTCTATGAGGACCTTCTTAATTCTAGCCTTGTGGTCTTATAATCTATTAGTACCTCCTTAATTTAAGCCTTGTGGAAGCACCTACTTAATTTAAGCCTTGTGGGCTTGATGTATCAGCACCTACTTAATTTAAGCTTTTGTGGGCTTGATGTATCAGCACCTACTTAATTTAAGCCTTGTGTGCTTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AK121072             [    GAGAGAGAGAGCTTGTGGAACCCTAACCCTAACCAGGACGGACAGGAGGAGTAGATCCGTTCGATCCCCATGTCGTTCGCCGCTACAAGGATGATGGCGGCAGCCCGGCGCGCCTTCCACTCCAAGGCCGCGGAAGACGTGCGTAGACATCTCGATGCCATGGAAAAGGCCAACCTTGAAAGGTTGCCACAGCTCTTGGATCCCATCATCCGGCAGCGAGCCGCTCGAGATGTCCACCGCAATACCCACAGGATCAAGATCTATGCTAATCCTTGCATAGGGAGGCCACCGCCCGAAGGGCACATTTGGTATGATGTCGCCTGGGCAAAAAATCTTGGTCTAGTTTTTTTTGTCACCTCATTTTTTGGGATGTACGATGTTCTATTCGAGGAGACTCAACAGTCTGACCACCATATGTCCTCCTCGTTGCCAATGCCACCCTCCTAAATTATTCTGTGTAAAATCATCGCTGCCGACCGATTTTAGATTATGAAATAATAATCTCCATGTCCTGTGGTCTTACTCTATGAGGACCTTCTTAATTCTAGCCTTGTGGTCTTATAATCTATTAGTACCTCCTTAATTTAAGCCTTGTGGAAGCACCTACTTAATTTAAGCCTTGTGGGCTTGATGTATCAGCACCTACTTAATTTAAGCTTTTGTGGGCTTGATGTATCAGCACCTACTTAATTTAAGCCTTGTGTGCTTGATGATTTAAAGTAAGTACATCCTTAAACTTAAATTAAGCCTTGTCGTTGTCGTCTTGATGCAACATTACCTCCTTAATTTAAGCCTTGCTGTCCTAATGTTTTTACTACCTCCTCAATTTCATTTGTAGGCCAGTGTCACAACTTAAGAGTAACTTTCCGTGGTAACAGTACCACTATATGTTTTTCTCAACTTTAATTACTGCGTGCACCCAAAGATCCCAAACACAACTTGCTCACTTTTTTTTTCATGCTGCCTTTTGATTATCTGTTTACAATAGGGTTGTTCGGCTGCCCTGGCTGCTGCTACCATAAAATTTCAATACTAGATACTGTATTGGCTGGCTGCAAAGCGGCCATATATAGCTTTACCGAACATCCCTTATGTTGCTAAGATTACAGAAACATTTGTGGTTTAGACGCTTCTTTGTTCACTATTACCGGTACTTAATTGACGGTTTTATGAAACCTATTCTCAAACATCTTCCTAGCAAGGTGACATCATGTTTCATCTTTTCTTTTCATGGGTTAGTTAGTTACCTGTGGCGTTGTTTCAGTAAATGGTAAACTCTTTTGGTAATTCTTGAAGTGATTTGTATTTGAATGGTTTCTTCGAACTGTTTGTGATTTGGCATGTTCTGCAATCAGTTGACATTGTTGTTATTTATAATTTGCTTTCCCTTGTTCTTTCATGATTTTGTGCTGAAATATTATCAAGGTTGGGATAGTTGTTTCCGCTTGGGTTATGATGATACTTGAGCTTGGATTTGGCATATATATTATATTACTACTCTCTTACAATGAACCAGAGGGGAGTGCTTGGGTTCCAATACTGCAGAGCTGCTAGGGTGCATGTAGGCAGTGTTGCCCTTTTGCCTATAAGATGGGCTTGGTAGCCAAGCGCCTAGTCGCTCTTGTTTGCTGCCAAGCTGCATGTTTGGTGTTATTTCTGTTAAGTGATGCATAATTGCGATGAGCAGGTACTTTTGTTCATACTGCAATTTCCATCAGCAGAAATTTCAGTGCTATTAGTTATGGATTACCTGTTGTTTGTCTTTTTTGTTCAGTTTATTGATTTCTGGTTAAATTAAACTTGTGCTGCTGTTTCAATGTCGGTATGTTTGTTGATGAGACGAGTCAGATAGTGTGATACTGAGCTGAGTTACTAGCAACATTTGTACATCGGAGTCGAAGCGATGTAATATATTTGTAACACTTCAAAATTTTATGAATAAATT]




>consensus_6142#0
GAGAGAGAGAGAGAGCTTGTGGAACCCTAACCCTAACCAGGACGGACAGGAGGAGTAGAT
CCGTTCGATCCCCATGTCGTTCGCCGCTACAAGGATGATGGCGGCAGCCCGGCGCGCCTT
CCACTCCAAGGCCGCGGAAGACGTGCGTAGACATCTCGATGCCATGGAAAAGGCCAACCT
TGAAAGGTTGCCACAGCTCTTGGATCCCATCATCCGGCAGCGAGCCGCTCGAGATGTCCA
CCGCAATACCCACAGGATCAAGATCTATGCTAATCCTTGCATAGGGAGGCCACCGCCCGA
AGGGCACATTTGGTATGATGTCGCCTGGGCAAAAAATCTTGGTCTAGTTTTTTTTGTCAC
CTCATTTTTTGGGATGTACGATGTTCTATTCGAGGAGACTCAACAGTCTGACCACCATAT
GTCCTCCTCGTTGCCAATGCCACCCTCCTAAATTATTCTGTGTAAAATCATCGCTGCCGA
CCGATTTTAGATTATGAAATAATAATCTCCATGTCCTGTGGTCTTACTCTATGAGGACCT
TCTTAATTCTAGCCTTGTGGTCTTATAATCTATTAGTACCTCCTTAATTTAAGCCTTGTG
GAAGCACCTACTTAATTTAAGCCTTGTGGGCTTGATGTATCAGCACCTACTTAATTTAAG
CTTTTGTGGGCTTGATGTATCAGCACCTACTTAATTTAAGCCTTGTGTGCTTGATGATTT
AAAGTAAGTACATCCTTAAACTTAAATTAAGCCTTGTCGTTGTCGTCTTGATGCAACATT
ACCTCCTTAATTTAAGCCTTGCTGTCCTAATGTTTTTACTACCTCCTCAATTTCATTTGT
AGGCCAGTGTCACAACTTAAGAGTAACTTTCCGTGGTAACAGTACCACTATATGTTTTTC
TCAACTTTAATTACTGCGTGCACCCAAAGATCCCAAACACAACTTGCTCACTTTTTTTTT
CATGCTGCCTTTTGATTATCTGTTTACAATAGGGTTGTTCGGCTGCCCTGGCTGCTGCTA
CCATAAAATTTCAATACTAGATACTGTATTGGCTGGCTGCAAAGCGGCCATATATAGCTT
TACCGAACATCCCTTATGTTGCTAAGATTACAGAAACATTTGTGGTTTAGACGCTTCTTT
GTTCACTATTACCGGTACTTAATTGACGGTTTTATGAAACCTATTCTCAAACATCTTCCT
AGCAAGGTGACATCATGTTTCATCTTTTCTTTTCATGGGTTAGTTAGTTACCTGTGGCGT
TGTTTCAGTAAATGGTAAACTCTTTTGGTAATTCTTGAAGTGATTTGTATTTGAATGGTT
TCTTCGAACTGTTTGTGATTTGGCATGTTCTGCAATCAGTTGACATTGTTGTTATTTATA
ATTTGCTTTCCCTTGTTCTTTCATGATTTTGTGCTGAAATATTATCAAGGTTGGGATAGT
TGTTTCCGCTTGGGTTATGATGATACTTGAGCTTGGATTTGGCATATATATTATATTACT
ACTCTCTTACAATGAACCAGAGGGGAGTGCTTGGGTTCCAATACTGCAGAGCTGCTAGGG
TGCATGTAGGCAGTGTTGCCCTTTTGCCTATAAGATGGGCTTGGTAGCCAAGCGCCTAGT
CGCTCTTGTTTGCTGCCAAGCTGCATGTTTGGTGTTATTTCTGTTAAGTGATGCATAATT
GCGATGAGCAGGTACTTTTGTTCATACTGCAATTTCCATCAGCAGAAATTTCAGTGCTAT
TAGTTATGGATTACCTGTTGTTTGTCTTTTTTGTTCAGTTTATTGATTTCTGGTTAAATT
AAACTTGTGCTGCTGTTTCAATGTCGGTATGTTTGTTGATGAGACGAGTCAGATAGTGTG
ATACTGAGCTGAGTTACTAGCAACATTTGTACATCGGAGTCGAAGCGATGTAATATATTT
GTAACACTTCAAAATTTTATGAATAAATT

consensusID : consensus_6142#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 742
fasta sequence 
                              [GAAACAGAGGAGGAGAGCTTGTTGAACCCTAACCCTAACCAGGGCGGGCCGGAGGAGTAGATCCGTTCGATCCCCATGTCGTTTGCCGCTACAAGGATGATGGCGGCAGCCCGGCGGCGCCTTCCACTCCAAGGCCGCGGAAGACGTGCGTAGACATCTCGATGCCATGGAAAAGGCCAACCTTGAAAGGTTGCCACAGCTCTTGGATCCCATCATCCGGCAGCGAGCCGCTCGAGATGTCCCCCGCAATACCCACAGGATCAAGATCTATGCTAATCCTTGCATAGGGAGGCCACCGCCCGAAGGGCACATTTGGTATGATGTCGCCTGGGCAAAAAATCTTGGTCTAGTTTTTTTTGTCACCTCATTTTTTGGGATGTACGATGTTCTATTCGAGGAGACTCAACAGTCTGACCACCATATGTCCTCCTCGTTGCCAATGCCACCCTCCTAAATTATTCTGTGTAAAATTATCGCTGCCGACCGATTTTAGATTATGAAATAATAATCTCCATGTCCTGTGGTCTTACTCTATGAGGACCTTCTTAATTCTAGCCTTGTGGTCTTATAATCTATTAGTACCTCCTTAATTTAAGCCTTGTGGAAGCACCTACTTAATTTAAGCCTTGTGGGCTTGATGTATCAGCACCTACTTAATTTAAGCTTTTGTGGGCTTGATGTATCAGCACCTACTTAATTTAAGCCTTGTGTGCTTGATGATTTAAAGTAAAAAAAAAAAAAA]

[-] EMBL CA760225             [GAAACAGAGGAGGAGAGCTTGTTGAACCCTAACCCTAACCAGGGCGGGCCGGAGGAGTAGATCCGTTCGATCCCCATGTCGTTTGCCGCTACAAGGATGATGGCGGCAGCCCGGCGGCGCCTTCCACTCCAAGGCCGCGGAAGACGTGCGTAGACATCTCGATGCCATGGAAAAGGCCAACCTTGAAAGGTTGCCACAGCTCTTGGATCCCATCATCCGGCAGCGAGCCGCTCGAGATGTCCCCCGCAATACCCACAGGATCAAGATCTATGCTAATCCTTGCATAGGGAGGCCACCGCCCGAAGGGCACATTTGGTATGATGTCGCCTGGGCAAAAAATCTTGGTCTAGTTTTTTTTGTCACCTCATTTTTTGGGATGTACGATGTTCTATTCGAGGAGACTCAACAGTCTGACCACCATATGTCCTCCTCGTTGCCAATGCCACCCTCCTAAATTATTCTGTGTAAAATTATCGCTGCCGACCGATTTTAGATTATGAAATAATAATCTCCATGTCCTGTGGTCTTACTCTATGAGGACCTTCTTAATTCTAGCCTTGTGGTCTTATAATCTATTAGTACCTCCTTAATTTAAGCCTTGTGGAAGCACCTACTTAATTTAAGCCTTGTGGGCTTGATGTATCAGCACCTACTTAATTTAAGCTTTTGTGGGCTTGATGTATCAGCACCTACTTAATTTAAGCCTTGTGTGCTTGATGATTTAAAGTAAAAAAAAAAAAAA]
[-] EMBL CA760226             [GAAACAGAGGAGGAGAGCTTGTTGAACCCTAACCCTAACCAGGGCGGGCCGGAGGAGTAGATCCGTTCGATCCCCATGTCGTTTGCCGCTACAAGGATGATGGCGGCAGCCCGGCGGCGCCTTCCACTCCAAGGCCGCGGAAGACGTGCGTAGACATCTCGATGCCATGGAAAAGGCCAACCTTGAAAGGTTGCCACAGCTCTTGGATCCCATCATCCGGCAGCGAGCCGCTCGAGATGTCCCCCGCAATACCCACAGGATCAAGATCTATGCTAATCCTTGCATAGGGAGGCCACCGCCCGAAGGGCACATTTGGTATGATGTCGCCTGGGCAAAAAATCTTGGTCTAGTTTTTTTTGTCACCTCATTTTTTGGGATGTACGATGTTCTATTCGAGGAGACTCAACAGTCTGACCACCATATGTCCTCCTCGTTGCCAATGCCACCCTCCTAAATTATTCTGTGTAAAATTATCGCTGCCGACCGATTTTAGATTATGAAATAATAATCTCCATGTCCTGTGGTCTTACTCTATGAGGACCTTCTTAATTCTAGCCTTGTGGTCTTATAATCTATTAGTACCTCCTTAATTTAAGCCTTGTGGAAGCACCTACTTAATTTAAGCCTTGTGGGCTTGATGTATCAGCACCTACTTAATTTAAGCTTTTGTGGGCTTGATGTATCAGCACCTACTTAATTTAAGCCTTGTGTGCTTGATGATTTAAAGTAAAAAAAAAAAAAA]




>consensus_6142#1
GAAACAGAGGAGGAGAGCTTGTTGAACCCTAACCCTAACCAGGGCGGGCCGGAGGAGTAG
ATCCGTTCGATCCCCATGTCGTTTGCCGCTACAAGGATGATGGCGGCAGCCCGGCGGCGC
CTTCCACTCCAAGGCCGCGGAAGACGTGCGTAGACATCTCGATGCCATGGAAAAGGCCAA
CCTTGAAAGGTTGCCACAGCTCTTGGATCCCATCATCCGGCAGCGAGCCGCTCGAGATGT
CCCCCGCAATACCCACAGGATCAAGATCTATGCTAATCCTTGCATAGGGAGGCCACCGCC
CGAAGGGCACATTTGGTATGATGTCGCCTGGGCAAAAAATCTTGGTCTAGTTTTTTTTGT
CACCTCATTTTTTGGGATGTACGATGTTCTATTCGAGGAGACTCAACAGTCTGACCACCA
TATGTCCTCCTCGTTGCCAATGCCACCCTCCTAAATTATTCTGTGTAAAATTATCGCTGC
CGACCGATTTTAGATTATGAAATAATAATCTCCATGTCCTGTGGTCTTACTCTATGAGGA
CCTTCTTAATTCTAGCCTTGTGGTCTTATAATCTATTAGTACCTCCTTAATTTAAGCCTT
GTGGAAGCACCTACTTAATTTAAGCCTTGTGGGCTTGATGTATCAGCACCTACTTAATTT
AAGCTTTTGTGGGCTTGATGTATCAGCACCTACTTAATTTAAGCCTTGTGTGCTTGATGA
TTTAAAGTAAAAAAAAAAAAAA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_6142#0      --GAGAGAGAGAGAGAGCTTGTGGAACCCTAACCCTAACCAGGACGGACAGGAGGAGTAG 58
consensus_6142#1      GAAACAGAGGAGGAGAGCTTGTTGAACCCTAACCCTAACCAGGGCGGGCCGGAGGAGTAG 60
                         * ****   ********** ******************** *** * **********

consensus_6142#0      ATCCGTTCGATCCCCATGTCGTTCGCCGCTACAAGGATGATGGCGGCAGCCCGGCG-CGC 117
consensus_6142#1      ATCCGTTCGATCCCCATGTCGTTTGCCGCTACAAGGATGATGGCGGCAGCCCGGCGGCGC 120
                      *********************** ******************************** ***

consensus_6142#0      CTTCCACTCCAAGGCCGCGGAAGACGTGCGTAGACATCTCGATGCCATGGAAAAGGCCAA 177
consensus_6142#1      CTTCCACTCCAAGGCCGCGGAAGACGTGCGTAGACATCTCGATGCCATGGAAAAGGCCAA 180
                      ************************************************************

consensus_6142#0      CCTTGAAAGGTTGCCACAGCTCTTGGATCCCATCATCCGGCAGCGAGCCGCTCGAGATGT 237
consensus_6142#1      CCTTGAAAGGTTGCCACAGCTCTTGGATCCCATCATCCGGCAGCGAGCCGCTCGAGATGT 240
                      ************************************************************

consensus_6142#0      CCACCGCAATACCCACAGGATCAAGATCTATGCTAATCCTTGCATAGGGAGGCCACCGCC 297
consensus_6142#1      CCCCCGCAATACCCACAGGATCAAGATCTATGCTAATCCTTGCATAGGGAGGCCACCGCC 300
                      ** *********************************************************

consensus_6142#0      CGAAGGGCACATTTGGTATGATGTCGCCTGGGCAAAAAATCTTGGTCTAGTTTTTTTTGT 357
consensus_6142#1      CGAAGGGCACATTTGGTATGATGTCGCCTGGGCAAAAAATCTTGGTCTAGTTTTTTTTGT 360
                      ************************************************************

consensus_6142#0      CACCTCATTTTTTGGGATGTACGATGTTCTATTCGAGGAGACTCAACAGTCTGACCACCA 417
consensus_6142#1      CACCTCATTTTTTGGGATGTACGATGTTCTATTCGAGGAGACTCAACAGTCTGACCACCA 420
                      ************************************************************

consensus_6142#0      TATGTCCTCCTCGTTGCCAATGCCACCCTCCTAAATTATTCTGTGTAAAATCATCGCTGC 477
consensus_6142#1      TATGTCCTCCTCGTTGCCAATGCCACCCTCCTAAATTATTCTGTGTAAAATTATCGCTGC 480
                      *************************************************** ********

consensus_6142#0      CGACCGATTTTAGATTATGAAATAATAATCTCCATGTCCTGTGGTCTTACTCTATGAGGA 537
consensus_6142#1      CGACCGATTTTAGATTATGAAATAATAATCTCCATGTCCTGTGGTCTTACTCTATGAGGA 540
                      ************************************************************

consensus_6142#0      CCTTCTTAATTCTAGCCTTGTGGTCTTATAATCTATTAGTACCTCCTTAATTTAAGCCTT 597
consensus_6142#1      CCTTCTTAATTCTAGCCTTGTGGTCTTATAATCTATTAGTACCTCCTTAATTTAAGCCTT 600
                      ************************************************************

consensus_6142#0      GTGGAAGCACCTACTTAATTTAAGCCTTGTGGGCTTGATGTATCAGCACCTACTTAATTT 657
consensus_6142#1      GTGGAAGCACCTACTTAATTTAAGCCTTGTGGGCTTGATGTATCAGCACCTACTTAATTT 660
                      ************************************************************

consensus_6142#0      AAGCTTTTGTGGGCTTGATGTATCAGCACCTACTTAATTTAAGCCTTGTGTGCTTGATGA 717
consensus_6142#1      AAGCTTTTGTGGGCTTGATGTATCAGCACCTACTTAATTTAAGCCTTGTGTGCTTGATGA 720
                      ************************************************************

consensus_6142#0      TTTAAAGTAAGTACATCCTTAAACTTAAATTAAGCCTTGTCGTTGTCGTCTTGATGCAAC 777
consensus_6142#1      TTTAAAGTAAAAAAAAAAAAAA-------------------------------------- 742
                      **********  * *     **                                      

consensus_6142#0      ATTACCTCCTTAATTTAAGCCTTGCTGTCCTAATGTTTTTACTACCTCCTCAATTTCATT 837
consensus_6142#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6142#0      TGTAGGCCAGTGTCACAACTTAAGAGTAACTTTCCGTGGTAACAGTACCACTATATGTTT 897
consensus_6142#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6142#0      TTCTCAACTTTAATTACTGCGTGCACCCAAAGATCCCAAACACAACTTGCTCACTTTTTT 957
consensus_6142#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6142#0      TTTCATGCTGCCTTTTGATTATCTGTTTACAATAGGGTTGTTCGGCTGCCCTGGCTGCTG 1017
consensus_6142#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6142#0      CTACCATAAAATTTCAATACTAGATACTGTATTGGCTGGCTGCAAAGCGGCCATATATAG 1077
consensus_6142#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6142#0      CTTTACCGAACATCCCTTATGTTGCTAAGATTACAGAAACATTTGTGGTTTAGACGCTTC 1137
consensus_6142#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6142#0      TTTGTTCACTATTACCGGTACTTAATTGACGGTTTTATGAAACCTATTCTCAAACATCTT 1197
consensus_6142#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6142#0      CCTAGCAAGGTGACATCATGTTTCATCTTTTCTTTTCATGGGTTAGTTAGTTACCTGTGG 1257
consensus_6142#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6142#0      CGTTGTTTCAGTAAATGGTAAACTCTTTTGGTAATTCTTGAAGTGATTTGTATTTGAATG 1317
consensus_6142#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6142#0      GTTTCTTCGAACTGTTTGTGATTTGGCATGTTCTGCAATCAGTTGACATTGTTGTTATTT 1377
consensus_6142#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6142#0      ATAATTTGCTTTCCCTTGTTCTTTCATGATTTTGTGCTGAAATATTATCAAGGTTGGGAT 1437
consensus_6142#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6142#0      AGTTGTTTCCGCTTGGGTTATGATGATACTTGAGCTTGGATTTGGCATATATATTATATT 1497
consensus_6142#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6142#0      ACTACTCTCTTACAATGAACCAGAGGGGAGTGCTTGGGTTCCAATACTGCAGAGCTGCTA 1557
consensus_6142#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6142#0      GGGTGCATGTAGGCAGTGTTGCCCTTTTGCCTATAAGATGGGCTTGGTAGCCAAGCGCCT 1617
consensus_6142#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6142#0      AGTCGCTCTTGTTTGCTGCCAAGCTGCATGTTTGGTGTTATTTCTGTTAAGTGATGCATA 1677
consensus_6142#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6142#0      ATTGCGATGAGCAGGTACTTTTGTTCATACTGCAATTTCCATCAGCAGAAATTTCAGTGC 1737
consensus_6142#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6142#0      TATTAGTTATGGATTACCTGTTGTTTGTCTTTTTTGTTCAGTTTATTGATTTCTGGTTAA 1797
consensus_6142#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6142#0      ATTAAACTTGTGCTGCTGTTTCAATGTCGGTATGTTTGTTGATGAGACGAGTCAGATAGT 1857
consensus_6142#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6142#0      GTGATACTGAGCTGAGTTACTAGCAACATTTGTACATCGGAGTCGAAGCGATGTAATATA 1917
consensus_6142#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6142#0      TTTGTAACACTTCAAAATTTTATGAATAAATT 1949
consensus_6142#1      --------------------------------


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)