These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6252#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 2263 fasta sequence [GTTCTCCACTGAACCGCCGCCACCCCCCTTTCATATTGTGTAGCGGCAACGCCTCCGCCATCTCTCCTGCGCCATCGCCCCCCATCCTCGAGCTCGACGCGGTGGAGAGGCGCGCCTCCACCTTCCTTGGCTGGCGTCTTCTCTTCATCCTCTCCCTCTCCAAAGCTCCATCGCTGTCCCCTCTCCCACCCCTTTCTCTGCATTCGGCCAGATCCAGCCAATAGAAGCTATGGCCATGGCATCTGGCTCCCCTGAGCTTGGTGGAGTGGAGAGGCCAAGGAGGGGAGGCCTCCCCCAGTATCTTCCTCTCCCAAATCACCATTGCTGCCAGCTCTTCCTCCCCCTTCCGGATCCGGCCAGATCTAGGCTTCATCGAGTTGGGGACTTCCAGATCTGGAGCTCCAGTTCATGG-CTACGTGCTGCATCCACCACAACAGCAACGAAGAGGATGTGACGGGGCTCGGGAGTTCCCGTTGATGGCGGCAACATGCTGGAGAATTTCCTGGCATAAAATGCACTTTTTCTTGTTTCTGAATTTCCTGGCCTCCATGTGCACCTTCAACCGAATTTTATTTAGTTGCTATATGCAGGTCACGCAGCAATCCTGCAAATACTTAATGGTTGGTTGGCGAAATGTGCAGCCCACATTAGGAGTGCAACAATGAAGTGCTTCCATAAGTAAGCTTCAATTATCCTTCAATCTTGATAAGCTTGAATGATCTGAAGCGATATGCACATGTTCTGGGACTTTGTAAGTGGAAAAGATGGATTTTTTTTACTTTGGTCAGGCTGCTCAGGATGGAGCTGAAGAAATACATGACAAGAACTAAGAGATAAAACAGAAAATGCAGATGCAGGAAGAGCAACAGGTAGATGATGCGTTAATTATTGCCTTTATATTCATTTTAGACGATATAGGCAATTGTCAAAGTTGCATCTGCCTGCAGTTACTAAAGTAATCCCTATCACTATATTTTGTGGTTCTCCCTTTTATTTGTATTAAAAACTTCAGAGTCATTGAGAAGTGCCATCAGGCTTAGTTCTACTCGATGTCAATAAAATTCAGAGTCATCTTCCTGTTCCTCTTTTTTGTAGAGTATAAGGATATTGTGATCGGAAAGAGTTTAAACTGTGATTTGGCTTCTAAAGAGACCTCATGGTTTTGAGGCATCAAAACAAAAGGCTCATTCATTCTGTTGTGCATGAAACAAATTGGTCTAATTCCTGTGTCTCTGTAGATTCTTTAGATTCAAACTGCAGCAAAGAACGGTTTACAGTTATAGAAATGTTGGCTTCCCAGTTCCTAATTAAGATGTGAGCATCCCAGTGAACTGTACTCTCAGTGTCTTTGTAGTTTAATCTACATTGGTGGCACTGTCTACCTTATAATCTTACAAACTTCAGTAAGAAAATAATCTTACTACCTGATTTTAGGTTCAAACATTGTGTTTTTCAGAACATCCATGAATAGGAGTGAAGCATCTGTGCTGGTAATGATTGCTATACAAACTTCTTTGCAATCTCAAGACTAAAGTATTTACTTTTCCTTTTTCATTTATGCTCTTTTCAGTGTCATTGTGCCTTTTTTATTGACATTCTAAAAAGTTGCTAAAGTTACATTGTTGACTGCTCTTGACCATATTGAGATAATGAGAAATCAGAGATATAGTAATGTGTGGCTTAATTTGGCTTATATTAGAGCATTGCTACTGGTAAAAGTACCTAGCGAAAAAAATTGCTCATGGTAAACTACCTGCATAATTTCACTAGTACCTTTTGTGATGCAGTAGTTGTTTATGCACTAAATGGTGGCCTCTGTTCCTGAAGATCCAGTCCTATATTTTTGCTAGGTTGATCCAAATATGCTCATGTTCTTATTTCGATCTATATAATTGAGCATTTGGTCTTCTTTCCCATTAATTGTACTATGTTTTGGTTTAGCATGTAATATAGTCCAATCTTGATATTAATTCAGTTTCTAGCTATATTGATCTTCCAGTTTCTTACAAGCTTATCACAATTGCAGGTTTAATTATACATTCAAGCATCAACTTCAGGATCTGTACCATCTATTAATATCATCTTTCTGTTATTGATTGATCAACCAAATAATATGTTCCTAGCTATTGTAACTTTGGTTATTGCTTTAACTGTCATGAACCATGAATTGCTTGTATGCTAATTATTAATTGTAACCTCTTTACTGAAATATATATTTATGTTGGAATGTGTTGTGCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL CF322677 [GTTCTCCACTGAACCGCCGCCACCCCCCTTTCATATTGTGTAGCGGCAACGCCTCCGCCATCTCTCCTGCGCCATCGCCCCCCATCCTCGAGCTCGACGCGGTGGAGAGGCGCGCCTCCACCTTCCTTGGCTGGCGTCTTCTCTTCATCCTCTCCCTCTCCAAAGCTCCATCGCTGTCCCCTCTCCCACCCCTTTCTCTGCATTCGGCCAGATCCAGCCAATAGAAGCTATGGCCATGGCATCTGGCTCCCCTGAGCTTGGTGGAGTGGAGAGGCCAAGGAGGGGAGGCCTCCCCCAGTATCTTCCTCTCCCAAATCACCATTGCTGCCAGCTCTTCCTCCCCCTTCCGGATCCGGCCAGATCTAGGCTTCATCGAGTTGGGGACTTCCAGATCTGGAGCTCCAGTTCATGGCCTACGTGCTGta ] [+] EMBL AK100445 [ GCCGCCACCCCCCTTTCATATTGTGTAGCGGCAACGCCTCCGCCATCTCTCCTGCGCCATCGCCCCCCATCCTCGAGCTCGACGCGGTGGAGAGGCGCGCCTCCACCTTCCTTGGCTGGCGTCTTCTCTTCATCCTCTCCCTCTCCAAAGCTCCATCGCTGTCCCCTCTCCCACCCCTTTCTCTGCATTCGGCCAGATCCAGCCAATAGAAGCTATGGCCATGGCATCTGGCTCCCCTGAGCTTGGTGGAGTGGAGAGGCCAAGGAGGGGAGGCCTCCCCCAGTATCTTCCTCTCCCAAATCACCATTGCTGCCAGCTCTTCCTCCCCCTTCCGGATCCGGCCAGATCTAGGCTTCATCGAGTTGGGGACTTCCAGATCTGGAGCTCCAGTTCATGG CTACGTGCTGCATCCACCACAACAGCAACGAAGAGGATGTGACGGGGCTCGGGAGTTCCCGTTGATGGCGGCAACATGCTGGAGAATTTCCTGGCATAAAATGCACTTTTTCTTGTTTCTGAATTTCCTGGCCTCCATGTGCACCTTCAACCGAATTTTATTTAGTTGCTATATGCAGGTCACGCAGCAATCCTGCAAATACTTAATGGTTGGTTGGCGAAATGTGCAGCCCACATTAGGAGTGCAACAATGAAGTGCTTCCATAAGTAAGCTTCAATTATCCTTCAATCTTGATAAGCTTGAATGATCTGAAGCGATATGCACATGTTCTGGGACTTTGTAAGTGGAAAAGATGGATTTTTTTTACTTTGGTCAGGCTGCTCAGGATGGAGCTGAAGAAATACATGACAAGAACTAAGAGATAAAACAGAAAATGCAGATGCAGGAAGAGCAACAGGTAGATGATGCGTTAATTATTGCCTTTATATTCATTTTAGACGATATAGGCAATTGTCAAAGTTGCATCTGCCTGCAGTTACTAAAGTAATCCCTATCACTATATTTTGTGGTTCTCCCTTTTATTTGTATTAAAAACTTCAGAGTCATTGAGAAGTGCCATCAGGCTTAGTTCTACTCGATGTCAATAAAATTCAGAGTCATCTTCCTGTTCCTCTTTTTTGTAGAGTATAAGGATATTGTGATCGGAAAGAGTTTAAACTGTGATTTGGCTTCTAAAGAGACCTCATGGTTTTGAGGCATCAAAACAAAAGGCTCATTCATTCTGTTGTGCATGAAACAAATTGGTCTAATTCCTGTGTCTCTGTAGATTCTTTAGATTCAAACTGCAGCAAAGAACGGTTTACAGTTATAGAAATGTTGGCTTCCCAGTTCCTAATTAAGATGTGAGCATCCCAGTGAACTGTACTCTCAGTGTCTTTGTAGTTTAATCTACATTGGTGGCACTGTCTACCTTATAATCTTACAAACTTCAGTAAGAAAATAATCTTACTACCTGATTTTAGGTTCAAACATTGTGTTTTTCAGAACATCCATGAATAGGAGTGAAGCATCTGTGCTGGTAATGATTGCTATACAAACTTCTTTGCAATCTCAAGACTAAAGTATTTACTTTTCCTTTTTCATTTATGCTCTTTTCAGTGTCATTGTGCCTTTTTTATTGACATTCTAAAAAGTTGCTAAAGTTACATTGTTGACTGCTCTTGACCATATTGAGATAATGAGAAATCAGAGATATAGTAATGTGTGGCTTAATTTGGCTTATATTAGAGCATTGCTACTGGTAAAAGTACCTAGCGAAAAAAATTGCTCATGGTAAACTACCTGCATAATTTCACTAGTACCTTTTGTGATGCAGTAGTTGTTTATGCACTAAATGGTGGCCTCTGTTCCTGAAGATCCAGTCCTATATTTTTGCTAGGTTGATCCAAATATGCTCATGTTCTTATTTCGATCTATATAATTGAGCATTTGGTCTTCTTTCCCATTAATTGTACTATGTTTTGGTTTAGCATGTAATATAGTCCAATCTTGATATTAATTCAGTTTCTAGCTATATTGATCTTCCAGTTTCTTACAAGCTTATCACAATTGCAGGTTTAATTATACATTCAAGCATCAACTTCAGGATCTGTACCATCTATTAATATCATCTTTCTGTTATTGATTGATCAACCAAATAATATGTTCCTAGCTATTGTAACTTTGGTTATTGCTTTAACTGTCATGAACCATGAATTGCTTGTATGCTAATTATTAATTGTAACCTCTTTACTGAAATATATATTTATGTTGGAATGT ] [+] EMBL CF330578 [ TGCGCCATCGCCCCCCATCCTCGAGCTCGACGCGGTGGAGAGGCGCGCCTCCACCTTCCTTGGCTGGCGTCTTCTCTTCATCCTCTCCCTCTCCAAAGCTCCATCGCTGTCCCCTCTCCCACCCCTTTCTCTGCATTCGGCCAGATCCAGCCAATAGAAGCTATGGCCATGGCATCTGGCTCCCCTGAGCTTGGTGGAGTGGAGAGGCCAAGGAGGGGAGGCCTCCCCCAGTATCTTCCTCTCCCAAATCACCATTGCTGCCAGCTCTTCCTCCCCCTTCCGGATCCGGCCAGATCTAGGCTTCATCGAGTTGGGGACTTCCAGATCTGGAGCTCCAGTTCATGG CTACGTGCTGCATCCACCACAAAAGCAACGAAGAGGATGTGACGGGGCTCGGGAGTTCCCGTTGATGGCGGCAACATGCTGGAGAATTTCCTGGCATAAAATGCACTTTTTCTTGTTTCTGAATTTCCTGGCCTCCATGTGCACCTTCAACCGAATTTTATTTAGTTGCTATATGCAGGTCACGCAGCAATCCTGCAA ] [-] EMBL CA756048 [ CTGTTCCTGAAGATCCAGTCCTATATTTTTGCTAGGTTGATCCAAATATGCTCATGTTCTTATTTCGATCTATATAATTGAGCATTTGGTCTTCTTTCCCATTAATTGTACTATGTTTTGGTTTAGCATGTAATATAGTCCAATCTTGATATTAATTCAGTTTCTAGCTATATTGATCTTCCAGTTTCTTACAAGCTTATCACAATTGCAGGTTTAATTATACATTCAAGCATCAACTTCAGGATCTGTACCATCTATTAATATCATCTTTCTGTTATTGATTGATCAACCAAATAATATGTTCCTAGCTATTGTAACTTTGGTTATTGCTTTAACTGTCATGAACCATGAATTGCTTGTATGCTAATTATTAATTGTAACCTCTTTACTGAAATATATATTTATGTTGGAATGTGTTGTGCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||