Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 6303 cluster # 6303       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6303#0 length = 1041 sequences # 4  
consensusID : consensus_6303#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1041
fasta sequence 
                              [GCTGCTACTGCTTTGTTAGATCTTGTTGCTGTAAGAGGGACTATCCAGTTGGTATGGAGGAACCTGCACAAGAGCAGCGTCGGCTCATGCAGATCAGGTCCAAAACGTTGCTATCTGAGGTTTTGAGAGGCATAGGCGCAAATGAGGCACGATACAGTTGCCGTGCTGTAGCAGATGGCTATGTTGGGTTTGCTGAGGCAACTGTTTATGGTGCAAGAGGAGTTGGAGAGCCTTTTGTTGTTCGTGCACAGGGTATTTCAGCTATAAGACCATGCGATGCGGAAGAAAGCGCTGCACATGCTTTAATTTCTGTTATCAAGAAAGAATGTAGTGTGGAGTTCGATGATACAAACTGGTTTGACATGAATCACTATCATGTTGAGACAGAGCGACTGAAGAGAGCTCTTGGGTGAGCTAGGAAGAAATGCAATACTCTTGCAAAGAAGGCACGGTTGCTGGAAATCGGCTGGGATAGAGCTTTAGATTCATTGGGGTTCTGTCAACCAAATATGTGATGACATATGTTCTNTTNTTCTAGGAGGTCCTGATGCTGATGATCTTAGTCANCGTGAGGTTGGAGTATTCTACGATGTGCACCGTCTTGGTGAATATGCTGAATCTTT-TGTGGACGAAGGGTTGGCTAATCTTACCAGTGTTGCTGCTAGATATATCTAAGCCTAAGGAGACCTGCATGGATTGTTTTTGGGAACTAAGCTGAGCGAAAACAACAGATGTTGTGACTGATATTATGTCCAGTATTTTATCAGTAGGGATCCTGCAGTTGATTGTAATAAGCGTCTGTTATATAGCAGCAGTTGTGTATAGCTGGGTGTGTATNCATGGAACAGCATGTAGGCATGATATATGGNGGTTATGTATTTGTCTATAGTATATAGTCAGACATATGTAATCTGTGATGGAATGGTAGTGTAAGTAGTAAAGCCCTATAATTTCTATGTATGGTGGTTAGCTATGTTTGTCGGTATCTGGAAATTCTTGAATACTATAACAGCGTGATCAATTAATATGTGCATGTAAAAA]

[+] EMBL CF324498             [GCTGCTACTGCTTTGTTAGATCTTGTTGCTGTAAGAGGGACTATCCAGTTGGTATGGAGGAACCTGCACAAGAGCAGCGTCGGCTCATGCAGATCAGGTCCAAAACGTTGCTATCTGAGGTTTTGAGAGGCATAGGCGCAAATGAGGCACGATACAGTTGCCGTGCTGTAGCAGATGGCTATGTTGGGTTTGCTGAGGCAACTGTTTATGGTGCAAGAGGAGTTGGAGAGCCTTTTGTTGTTCGTGCACAGGGTATTTCAGCTATAAGACCATGCGATGCGGAAGAAAGCGCTGCACATGCTTTAATTTCTGTTATCAAGAAAGAATGTAGTGTGGAGTTCGATGATACAAACTGGTTTGACATGAATCACTATCATGTTGAGACAGAGCGACTGAAGAGAGCTCTTGGGTGAGCTAGGAAGAAATGCAATACTCTTGCAAAGAAGGCACGGTTGCTGGAAATCGGCTGGGATAGAGCTTTAGATTCATTGGGGTTCTGTCAACCAAATATGTGATGACATATGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL OSC28871             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cntngggcAAATCGGCNGGNATAGAGCTTTAGATTCATT GGGTTCTGTCAACCAAATATGTGATGACATATNTTCTNTTNTTCTAGGAGGTCCTGATGCTGATGATCTTAGTCANCGTGAGGTTGGAGTATTCTACGATGTGCACCGTCTTGGTGAATATGCTGAATCTTTATGTGGACGNAGGGTTGGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL C27461               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CAACCAAATATGTGATGACATATGTTCTTTTGTTCTAGGAGGTCCTGATGCTGATGATCTTAGTCATCGTGAGGTTGGAGTATTCTACGATGTGCACCGTCTTGGTGAATATGCTGAATCTTT TGTGGACGAAGGGTTGGCTAATCTTACCAGTGTTGCTGCTAGATATATCTAAGCCTAAGGAGACCTGCATGGATTGTTTTTGGGAACTAAGCTGAGCGAAAACAACAGATGTTGTGACTGATATTATGTCCAGTATTTTATCAGTAGGGATCCTGCAGTTGATTGTAATAAGCGTCTGTTATATAGCAGCAGTTGTGTATAGCTGGGTGTGTATNCATGGAACAGCATGTAGGCATGATATATGGNGGTTATGTATTTGTCTATAGT                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL AU166889             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GAATCTTT TGTGGACGAAGGGTTGGCTAATCTTACCAGTGTTGCTGCTAGATATATCTAAGCCTAAGGAGACCTGCATGGATTGTTTTTGGGAACTAAGCTGAGCGAAAACAACAGATGTTGTGACTGATATTATGTCCAGTATTTTATCAGTAGGGATCCTGCAGTTGATTGTAATAAGCGTCTGTTATATAGCAGCAGTTGTGTATAGCTGGGTGTGTATGCATGGAACAGCATGTAGGCATGATATATGGTGGTTATGTATTTGTCTATAGTATATAGTCAGACATATGTAATCTGTGATGGAATGGTAGTGTAAGTAGTAAAGCCCTATAATTTCTATGTATGGTGGTTAGCTATGTTTGTCGGTATCTGGAAATTCTTGAATACTATAACAGCGTGATCAATTAATATGTGCATGTAAAAA]




>consensus_6303#0
GCTGCTACTGCTTTGTTAGATCTTGTTGCTGTAAGAGGGACTATCCAGTTGGTATGGAGG
AACCTGCACAAGAGCAGCGTCGGCTCATGCAGATCAGGTCCAAAACGTTGCTATCTGAGG
TTTTGAGAGGCATAGGCGCAAATGAGGCACGATACAGTTGCCGTGCTGTAGCAGATGGCT
ATGTTGGGTTTGCTGAGGCAACTGTTTATGGTGCAAGAGGAGTTGGAGAGCCTTTTGTTG
TTCGTGCACAGGGTATTTCAGCTATAAGACCATGCGATGCGGAAGAAAGCGCTGCACATG
CTTTAATTTCTGTTATCAAGAAAGAATGTAGTGTGGAGTTCGATGATACAAACTGGTTTG
ACATGAATCACTATCATGTTGAGACAGAGCGACTGAAGAGAGCTCTTGGGTGAGCTAGGA
AGAAATGCAATACTCTTGCAAAGAAGGCACGGTTGCTGGAAATCGGCTGGGATAGAGCTT
TAGATTCATTGGGGTTCTGTCAACCAAATATGTGATGACATATGTTCTNTTNTTCTAGGA
GGTCCTGATGCTGATGATCTTAGTCANCGTGAGGTTGGAGTATTCTACGATGTGCACCGT
CTTGGTGAATATGCTGAATCTTTTGTGGACGAAGGGTTGGCTAATCTTACCAGTGTTGCT
GCTAGATATATCTAAGCCTAAGGAGACCTGCATGGATTGTTTTTGGGAACTAAGCTGAGC
GAAAACAACAGATGTTGTGACTGATATTATGTCCAGTATTTTATCAGTAGGGATCCTGCA
GTTGATTGTAATAAGCGTCTGTTATATAGCAGCAGTTGTGTATAGCTGGGTGTGTATNCA
TGGAACAGCATGTAGGCATGATATATGGNGGTTATGTATTTGTCTATAGTATATAGTCAG
ACATATGTAATCTGTGATGGAATGGTAGTGTAAGTAGTAAAGCCCTATAATTTCTATGTA
TGGTGGTTAGCTATGTTTGTCGGTATCTGGAAATTCTTGAATACTATAACAGCGTGATCA
ATTAATATGTGCATGTAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)